• 제목/요약/키워드: Shannon diversity index

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cpcBA-Intergenic Spacer Region을 이용한 Cyanobacteria의 다양성 분석 (Cyanobacterial Diversity Analysis Using cpcBA-Intergenic Spacer Region)

  • 최강국;박용하;안치용;배명숙;오희목
    • 미생물학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.287-292
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    • 2005
  • 대청호에서 수화 발생이 빈번한 추소리 수역에서 2005년 3월 15일에 채취한 시료를 대상으로 유전자 분식에 의한 cyanobacteria의 다양성을 조사하였다. rpcBA-Intergenic Spacer (IGS)는 cyanobacteria에 특징적 색소인 phycocyanin을 합성하는 유전자와 유전자 사이의 부분으로, 환경시료에서 cyanobacteria의 다양성을 조사하기에 매우 유용한 기능 유전자이다. cpcBA-IGS를 이용하여 restriction fragment length polymorphism (RELP)으로 cyanobacteria의 다양성을 분석한 결과 Phomidium 속은 58 clones, Anabaena 속은 14 clones, Microcyxtis 속은 4 clones, Spirulina 속은 1 clone 그리고 uncultured cyanobacteria 2 clones가 존재하였다. 전반적으로 Phormidium 속이 우점하였으며, 여름철에 수화를 일으키는 Anabaena 속과 Microcystis 속도 많이 분포하였다. 따라서 cyanobacteria는 cpcBA-IGS와 같은 기능 유전자에 의한 종 동정 및 군집분석이 가능함을 보였다.

개발에 따른 탄천유역의 파편화 및 이질성분석 (Analysis of Fragmentation and Heterogeneity of Tancheon Watershed by Land Development Projects)

  • 이동근;이현이;김은영
    • 한국환경복원기술학회지
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    • 제10권6호
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    • pp.120-129
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    • 2007
  • Rapid urbanization has transformed the spatial pattern of urban land use or cover. This paper concentrates that changed characteristics of landscape structure in the Tancheon Watershed, from 1995 to 2003 were investigated using land cover map. We used FRAGSTATS software to calculate landscape indices to characterize the landscape structure. We found that built up area has been increased rapidly during the study period, while cultivated area and forest area have been decreased rapidly in the same period. From 1995 to 2003, built up area was increased from 19.73% to 39.62% and cultivated area and forest area was decreased 17.60% to 5.97% and 58.31% to 49.41%. Number of patches, mean euclidean nearest-neighbor distance, contagion index, Shannon's diversity index increased considerably from 1995 to 2003, also suggesting the landscape in the study area became more fragmented and heterogeneous. but because of continuously fragmentation, landscape became homogeneity. The study demonstrates that landscape metrics can be a useful indicator in landscape monitoring and landscape assessment.

통영해역의 자치어 종조성과 계절변동 (Seasonal Variation of Abundance and Species Composition of Ichthyoplankton in the Coastal Water off Tongyoung, Korea)

  • 박경동;명정구;강용주;김용억
    • 한국수산과학회지
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    • 제38권6호
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    • pp.385-392
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    • 2005
  • Seasonal variation of abundance and species composition of ichthyoplankton were studied in the coastal water off Tongyoung, Korea. Monthly samples were collected using a ring net which were towed horizontally at 4 different stations from March, 1998 to February, 1999. A total of 74 species representing 35 families and 8 orders were found. Of these species 40 species (17 families) were Perciformes. Of the fish larvae couected Engraulis japonicus, Repomucenus sp., Parablennius yatabei, Synechogobius hasta, and Tridentiger sp. were the dominant species representing $80.6\%$ in total number of individuals. The number of species was highest in August and lowest in December; number of individuals was highest in May and lowest in November. The diversity index (Shannon and Wiener Index) was highest in march, and lowest in December.

천마산 동부릉선 남북사면의 삼림식생의 구조적 특성에 관한 비교 연구 (A Comparative Study on the Structural Characteristics of the Forest Vegetation at the Southern and Northern Slopes of the Eastern Ridge in Mt. Cheonma, Central Korea)

  • Lee, Nam-Ju;Yang-Jai Yim
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제11권4호
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    • pp.213-225
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    • 1988
  • The plant communities of the eastern ridge in Mt. Cheonma, Central Korea, Quercus mongolica, Q mongolica-Acer pseudo-sieboldianum, and Q. mongolica-Rhododendron schlippenbachii communities in the northern slope and Q. variabilis and Q. cutissima communities in the southern slope were detected by Zurich-Montpellier method. The undergrowth of Q mongolica community in the northern slope was dominated by Ainsliaea acerifolia, Carex siderosticta, Astilbe chinensis var. davidii, Heloniopsis orientalis, Pseudostellaria palibiniana, ranging 3.3 to 2.2 in dominance-sociability, while the those of Q variabilis and Q acutissima in the southern slope were dominated by Spodiopogon cotulifer, Artemisia keiskeana, Carex humilis, Atractylodes japonica, Lysimachia clethroides and Disporum smilacinum with similar degree in dominance-sociability to that of Q mongolica community. The two communities were considered as regenerating forest after severe disturbance judging by their age structure. The relationship between Shannon's diversity index (H') and Simpson's dominance index (i) was in reciprocal proportion in both two communities. The Q. mongolica and Q. variabilis communities were showed 13 and 12 m respectively. Seasonal changes of undergrowth coverage in the two communities were seemed to be affected especially with soil moisture among environmental factors such as temperature, light intensity, relative humidity and organic matter.

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용문사 계곡 소나무림의 식물군집구조 및 22년간(1988~2010년) 변화 분석 (Plant Community Structure and Change of Pinus densiflora S. et Z. Forest for Twenty-two Years (1988~2010) in Yongmun-sa (Temple) Valley, Yangpyeong-gun, South Korea)

  • 장재훈;한봉호;최태영;이경재
    • 한국환경생태학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.369-380
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    • 2013
  • 본 연구는 용문사 계곡의 소나무림을 대상으로 식물군집구조를 규명하고 22년간의 식생구조 변화를 비교 분석하여 천이경향 예측과 효율적인 소나무림의 보전관리방안 수립을 위한 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 현존식생 분석결과 능선과 사면에 소나무군락(51.3%)이 넓게 분포하였고, 계곡부에 졸참나무-굴참나무군락(15.5%), 졸참나무군락(7.1%), 용문사 동측 사면에 졸참나무-소나무군락(7.2%)이 분포하였다. 19개 조사구(단위면적: $400m^2$)를 설정하여 TWINSPAN에 의한 classification 분석을 실시한 결과, 아교목층에서 졸참나무와 당단풍나무가 우점하는 소나무-졸참나무군집(I), 아교목층에서 서어나무와 까치박달이 우점하는 소나무군집(II), 아교목층에서 졸참나무와 서어나무가 우점하고 있는 소나무-졸참나무군집(III), 아교목층에서 서어나무와 당단풍나무가 우점하고 있는 소나무군집(IV)의 4개 유형으로 분류되었다. Shannon의 종다양도지수(H')는 0.5110~1.3101, 소나무 수령 48~89년생, 졸참나무 31~63년생, 서어나무 26~61년생이었다. 22년간 변화를 분석한 결과 소나무는 세력 유지 또는 약화되었고, 경쟁관계에 있는 졸참나무, 서어나무, 까치박달의 세력이 증가하였다. 용문사 계곡 소나무림의 천이 경향은 소나무림${\rightarrow}$졸참나무${\rightarrow}$까치박달, 서어나무로 예측되었으며, 지속적인 소나무림 유지관리를 통한 소나무 보존이 필요하였다.

대나무 산림토양으로부터 수집한 Streptomyces 속 방선균의 계통학적 다양성 (Biodiversity and Phylogenetic Analysis of Streptomyces Collected from Bamboo Forest Soil)

  • 이효진;황경숙
    • 미생물학회지
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    • 제46권3호
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    • pp.262-269
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    • 2010
  • 국내 자생하는 왕대, 분죽, 조릿대, 호마죽과 같은 다양한 대나무 산림토양의 낙엽층, 부식층, 근권토양 내 방선균 밀도 측정 결과, $2.7{\times}10^6-2.7{\times}10^8$ CFU/g로 계수되었으며, 특히 조릿대 낙엽층 내에는 $2.7{\times}10^8$ CFU/g의 매우 높은 밀도로 분포하였다. 본 연구에서는 대나무림 낙엽층으로부터 100균주, 부식층으로부터 70균주 그리고 근권토양으로부터 160균주로 총 330균주의 방선균을 수집하였다. 이들 분리된 균주들의 기균사, 기중균사 및 색소형성 등을 관찰한 결과 36개 방선균 군집으로 분류되었다. 각 그룹으로부터 대표 방선균 50균주를 선발하여 16S rRNA 유전자 염기서열을 해석하고 계통학적 위치를 검토한 결과, 94%가 Streptomyces 속에 속하였으며, cluster I (2균주), II (35균주), III (6균주), 그리고 IV (7균주)에 속하는 특징을 나타내었다. 대나무 산림토양으로부터 수집된 Streptomyces 속 방선균 50균주를 Shannon-Wiener법에 의해 다양성 지수를 산출한 결과, 대나무림 낙엽층으로부터 수집된 방선균의 다양도는 3.33으로 부식층과 근권토양 보다 높게 나타났으며, 근권토양으로부터 수집된 방선균의 88%가 cluster II에 속하는 특징을 나타내었다. 본 연구에서 수집한 방선균을 Botrytis cinerea, Xanthomonas campestris 그리고 Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria에 대해 항균활성능을 검토한 결과, 각 74균주, 16균주, 25균주 그리고 24균주가 항균활성능을 나타내었다.

용문산 상원사계곡 식물군집구조 분석 (A Study for Plant Community Structure Analysis in Sangwonsa(Temple) Valley, Yongmunsan(Mt.))

  • 김종엽;기경석;민건영
    • 한국환경생태학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.758-769
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    • 2012
  • 본 연구는 용문산 상원사계곡의 식생구조 특성을 분석하여 온대 중부지방 대규모 산림의 연구 및 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 상원사계곡 현존식생 조사결과 참나무류림이 75.0%로 넓게 분포하였다. 낙엽활엽수군집 내에 설정한 17개 조사지(단위면적: $400m^2$)의 평균상대우점치를 통한 군집분류 결과 5개 유형으로 구분되었다. 5개 유형은 서어나무와 졸참나무가 우점하는 군집, 졸참나무와 굴참나무가 우점하는 군집, 신갈나무와 졸참나무가 우점하는 군집, 졸참나무가 우점하는 군집, 고로쇠나무가 우점하는 군집이었다. 서어나무, 고로쇠나무 등과 경쟁하는 참나무류림은 향후 낙엽활엽수림으로 천이가 예측되었다. 샤논의 종다양도지수(H')는 0.3708~1.3083이었다.

Plant Species Assemblages and Vegetation Composition of Wetlands Within an Upland Forest

  • Huh, Man-Kyu;Lee, Hak-Young;Moon, Sung-Gi
    • 환경생물
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    • 제28권1호
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    • pp.1-7
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    • 2010
  • Small wetlands in an upland matrix can support diverse vegetation composition that increase both local and regional species richness. In this study we characterize the full range of wetland vegetation in an upland forest landscape at Dumyeong-ri, Gijang-gun, Busan. This wetland index can be calculated with species data, or with community type data as performed. Classified community types were used to describe vegetation at three wetlands and adjacent areas. The communities contained 28 species of vascular plants and 28 species were identified four plant community types. The Pinus densiflora type was dominated by Pinus densiflora and contained only four species. None of the plots had high proportion of standing water. The Carpinus laxiflora type had high obligate upland species (OU) and facultative upland species (FU). The Rhododendron mucronulatum type grew in over half of the plots included Pinus densiflora and Alnus japonica. Some species bother swampy areas adjacent to site C. The Miscanthus sacchariflorus type consisted of seasonal wetlands. The three sites contained nine species with the strongest indicator species being Miscanthus sinensis var. purpurascens, Miscanthus sinensis, Echinochloa crus-galli, and Sagittaria aginashi. This type had the highest proportions of obligate wetland species. Plant species richness averaged 5.069. Shannon-Weaver index of diversity also varied among the community types (F=22.7, df=4, 115), with the types FU having significantly higher value (2.746) than the others (1.057 for type FW and 1.600 for type OU). Regional plans including all of the diverse types of wetland vegetation in upland forests will contribute substantially to the conservation of plant diversity.

Population structure and regeneration of Zanthoxylum armatum DC. in Salyan, Nepal

  • Phuyal, Nirmala;Jha, Pramod Kumar;Raturi, Pankaj Prasad;Rajbhandary, Sangeeta
    • Journal of Ecology and Environment
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    • 제46권2호
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    • pp.111-125
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    • 2022
  • Background: Zanthoxylum armatum is one of the 30 prioritized medicinal plants for economic development of Nepal with a high trade value. Understanding the ecology of individual species is important for conservation and cultivation purposes. However, relation of ecological factors on the distribution and populations of Z. armatum in Nepal remain unknown. To address this knowledge gap, an attempt has been made to study the population structure, distribution, and regeneration potentiality of Z. armatum. Vegetation sampling was conducted at six different localities of Salyan district along the elevation range of 1,000 m to 2,000 m. Results: Altogether 50 plant species belonging to 44 genera under 34 families were found to be associated with Z. armatum. Significantly higher species richness was found at Rim (1,400-1,700 m) and Chhatreshwori (1,800-2,000 m) and lower at Kupinde (1,600-1,800 m). The highest population density of Z. armatum was at Kupinde (1,600-1,800 m) with a total of 1,100 individuals/ha. and the lowest at Chhatreshwori (1,800-2,000 m) with 740 individuals/ha. Based on the A/F value (Whitford index), it can be said that Z. armatum has random distribution in the study area. The plants were categorized into seedlings, saplings and adults based on plant height and the status of natural regeneration category determined. The regeneration potentiality of Z. armatum in the study area was fair with the average seedlings and saplings densities of 150 and 100 individuals/ha. Respectively. A Shannon-Weinner index mean value of 2.8 was obtained suggesting high species diversity in the study area. Conclusions: The natural distribution and regeneration of Z. armatum is being affected in the recent years due to anthropogenic disturbances. Increasing market demand and unsustainable harvesting procedures are posing serious threat to Z. armatum. Thus, effective conservation and management initiatives are most important for conserving the natural population of Z. armatum in the study area.

PCR-RFLP 방법을 이용한 활성 슬러지의 세균군집 분석 (Molecular Characterization of the Bacterial Community in Activated Sludges by PCR­RFLP)

  • 이현경;김준호;김치경;이동훈
    • 미생물학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.307-312
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    • 2004
  • 폐수처리에 중요한 역할을 담당하고 있는 세균 군집의 다양성과 폐수종류에 따른 군집차이를 알아보기 위해 분자생물학적 분석방법을 사용하였다. 국내 폐수처리장 슬러지 시료로부터 16S rDNA 클론 라이브러리를 구축하였고, HaeIII RFLP pattern과 염기서열을 분석하였다. 하수처리장 시료에서는 총 1,151개의 클론에서 699개의 서로 다른 RFLP pattern이, 화학산업 폐수처리장 시료에서는 총 1,228개의 클론에서 300개의 서로 다른 RFLP pattern이 관찰되었다. Shannon-Weiner diversity index의 계산결과 하수처리장 슬러지 시료는 8.7,화학산업 폐수처리장 슬러지 시료는 6.1로 하수처리장시료가 더 다양한 군집을 구성하고 있었다. 두 시료에서 우점하는 RFLP pattern에 해당되는 40개의 클론을 선정하여 염기서열 분석과 상동성 검색을 수행하였다. 분석된 서열의 $70\%$인 28개의 클론은 배양이 보고되지 않은 균주의 16S rRNA와 유사도가 높았고, 두 시료 모두 ${\beta}-Proteobacteria$가 우점하였다. 그러나, 하수처리장의 경우 활성슬러지에서 분리된 균주들과 유사한 군집이 많았던 반면, 화학산업 페수처리장의 경우 고온이며, 혐기성이고,탄화수소나 황이 많이 존재하는 환경에서 분리된 균주들과 유사한 군집이 많았다. 이러한 결과는 유입수의 조성에 따른 차이로 생각된다.