• Journal of Microbiology
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• 제41권1호
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• pp.1-6
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• 2003

The genetic relatedness of multidrug-resistant pneumococcal isolates of serotypes 19F and 23F was investigated. The DNA fragments digested with Sma I were resolved by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). PFGE analysis of 365. pneumoniae isolates showed 13 different patterns. Among 22 isolates of serotype 19F, 9 different PFGE patterns were present and 14 isolates of serotype 23F isolates represented 5 distinct PFGE patterns. Two isolates of serotype 19F and six isolates of serotype 23F shared the same PFGE pattern (Pattern I). Based on the genetic relatedness within the strains (one genetic cluster was defined as having more than 85% homology), we divided the pneumococcal strains into genefic clusters (Ⅰ, II, III, IV, V, and VI). The 22 strains of serotype 19F belonged to five distinct genetic clusters (I, II, III, IV, V and VI) and 14 strains of serotype 23F represented two genetic clusters (I and II ). These results showed that strains of serotype 19F are genetically more diverse than those of serotype 23F, Serotype 19F isolates with PFGE patterns H and I appeared to be less related to those of the remaining PFCE patterns (A to G) (less than 60% genetic relatedness), but those strains were genetically closely related with serotype 23f. These results suggest that the latter isolates originated from horizontal transfer of the capsular type 19F gene locus to 23F pneumococcal genotypes. In conclusion, the multidrug-resistant pneumococcal isolates of serotype 19f and 23F isolated in Korea are the result of the spread of a limited number of resistant clones.

• 대한수의학회지
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• 제42권4호
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• pp.495-504
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• 2002

Streptococcus suis is an important swine pathogen in nearly all countries with an extensive pig industry. It is associated with meningitis, arthritis, endocarditis, septicaemia, bronchopneumonia and sudden death. Attempts to control the disease are still hampered the lack of effective vaccines and sensitive diagnostic tools. A PCR method which can be used for the detection of virulent strains of serotype 2, which is most prevalent serotype, and serotype 1 was developed. However, serotype 1, 2, 7 and 9 strains are frequently isolated from diseased pigs. In European countries, S suis serotype 2 is the most prevalent type isolated from diseased pigs, followed by serotype 9 and 1. In Japan, capsular serotype 2 was also the most prevalent serotype, followed by capsular serotype 7. Most of S suis isolated from diseased pigs belong to a limited number of capsular serotype, often those between 1 and 9. We investigated the distribution of S suis serotype 1, 2, 7 and 9 from 740 pig lungs at abattoir in Jeolla and Chungcheong by rapid multiplex PCR assay. Fifty of 740 lung samples, 6.8%, were S suis postitive and identified S suis were divided by 38% (19/50) in serotype 2, 2% (1/50) in serotype 7 and 4% (2/50) in serotype 9. The distribution of S suis serotype in Korea was similar to other countries. Moreover, the multiplex PCR assay may be an useful diagnostic tool for the detection of pigs carrying serotype 1, 2, 7, 1/2, 9 and 14 strains in epidemiological and transmission studies and facilitate control and eradication programs.

• 미생물학회지
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• 제27권3호
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• pp.231-236
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• 1989

The larger segment of double stranded RNA genome from a new serotype of Infectious Pancreatic Necrosis Virus (IPNV), DRT, has been partially cloned at Sma I site in pUC19 and compared with the restriction maps of VR-299 and Sp. Restrction sites found in DRT was distinct and hence a new serotype. The cDNA clones of DRT were about 800, 850, and 1, 400 bp long each and do not share any common restiction site. It is not clear yet if there exist any overlapping sequences among them. This partial cloning, however, was sufficient for the comparison of restriction maps with the other serotypes.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제52권4호
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• pp.508-511
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• 2009

폐구균(Streptococcus pneumoniae)은 소아, 특히 어린 영아에서 심한 침습성 질병을 일으키는 중요한 원인균이다. 2003년부터 우리나라에서 접종하기 시작한 7가 폐구균백신(PCV7)은 소아에서 침습성 폐구균성 폐렴과 수막염을 예방하는 것으로 알려져 왔다. 그러나 최근 7가 폐구균백신을 접종한 이후부터 비7가 폐구균 혈청형(non-PCV7 serotype) 감염 발생률이 증가하고 있다. 14개월 된 여아가 내원 3일 전부터 열과 구토가 있었으나 증상 치료만 하고 있던 중 갑작스런 의식불명과 기면(lethargy)으로 응급실로 내원하였다. 입원 후 즉각적인 진단과 치료를 시행했음에도 불구하고 환자는 빠르게 혼수와 뇌사 상태로 진행하였다. 환자는 이전에 3회의 7가 폐구균백신을 접종하였으나 최종 진단은 비7가 폐구균 혈청형인 폐구균 19A 수막염이었고, 입원 20일째 사망하였다. 이는 한국에서 문헌상 보고된 적이 없는, 폐구균 19A 혈청형 수막염으로 사망한 첫번째 증례이므로 이에 보고하는 바이다.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제13권2호
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• pp.89-98
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• 2006

목 적 : 폐구균 단백 결합 백신이 개발되었지만 이에 포함되는 혈청형은 7가지로 한정되어 있어, 지역별 주요 폐구균 혈청형의 분포에 따라 백신의 유용성에 차이가 있을 수 있다. 본 연구에서는 우리나라 소아에서 분리된 폐구균의 혈청형의 분포를 분석하고 지난 15년간 시기에 따른 변화 양상을 분석하고자 하였다. 방 법 : 1991년 1월부터 2005년 5월까지 서울대학교 어린이병원 소아 환자의 각종 임상 검체에서 분리된 폐구균 465균주의 혈청형을 quellung reaction으로 결정하였고, penicillin 감수성은 oxacillin 디스크 확산법으로 검사하였다. 연구기간은 1991~1995년(I분기), 1995~2000년(II분기), 2001~2005년(III분기) 등 3개의 분기로 나누어 분석하였다. 결 과 : 465균주의 주된 혈청형은 19F(22%), 23F(18%), 19A(10%), 6B(8%), 14(7%), 6A(7%), 9V(5%) 등이었고, 전체 균주의 79%이었다. 60개월 미만 연령군의 침습성 감염 검체에서 분리된 101균주에서의 주된 혈청형은 혈청형 23F(21%), 14(17%), 19F(15%), 19A(11%), 6B(10%), 6A(7%), 9V(7%) 등으로 총 70%이었다. 전체 균주에서 I, II, III의 각 분기별 혈청형 분포는 백신 혈청형에 포함된 혈청형 19F, 14가 감소하는 추세이었고, 교차 반응 혈청형에 포함된 혈청형 6A, 19A가 증가하는 추세이었다. 침습성 감염 균주에서 폐니실린 내성률은 백신 혈청형에서 92.6%, 교차 반응 혈청형에서 75.0%로 높았으나, 비백신 혈청형에서는 34.4%로 낮았다. 결 론 : 최근 15년간 소아의 임상 검체에서 분리된 폐구균의 혈청형은 주로 19F, 23F, 19A, 6B, 14, 6A, 9V 등이 가장 흔하였고, 최근에 혈청형 19A, 6A가 증가하는 추세이고, 혈청형 19F와 14가 감소하였다. 향후 백신 사용과 관련하여 국내 폐구균 혈청형의 분포에 관한 지속적인 관찰이 필요하다고 생각된다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제54권4호
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• pp.163-168
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• 2011

Purpose: The purpose of this study was to evaluate the immune response to serotype 19A in children aged 12-23 months after immunization of the 19F containing 7-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV7). Methods: Blood samples from a total of 45 subjects (age 12-23 months) were included in the study. Subjects were categorized according to immunization status into three groups as follows: 18 subjects with 3 primary doses and 1 booster dose of PCV7 (booster group), 21 subjects with 3 primary doses before 12 months of age (primary group), and 6 subjects with no vaccination history of PCV7 (control group). An ELISA and opsonophagocytic killing assay (OPKA) was done to evaluate the immune responses against serotypes 19F and 19A. Results: According to the ELISA, all subjects had antibody titers ${\geq}0.35{\mu}g/mL$ for serotypes 19F and 19A in the booster and primary group and 83.0% and 66.7% in the control group, respectively. According to the OPKA, subjects with opsonic activity (${\geq}20$) against serotypes 19F and 19A were 100% and 61.1% of the subjects in the booster group and 66.7% and 19.0% in the primary group, respectively. No subjects in the control group had opsonic antibodies against both serotypes. Conclusion: In conclusion, in children 12-23 months age who were previously vaccinated with PCV7, a cross-reactive immune response is elicited against serotype 19A after a primary series of 3 doses in a small proportion of subjects, and this response is amplified after booster vaccination.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제15권1호
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• pp.45-51
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• 2008

목 적 : 국내의 소아에서의 폐구균 혈청형의 분포양상 및 변화를 알아보는 것은 중이염의 예방과 치료 계획을 수립하는 데 있어 매우 중요하다. 단일기관에서의 경험을 토대로 중이염에서의 폐구균의 혈청형 분포양상을 알아보고자 하였다. 방 법 : 2001년 1월부터 2006년 12월까지 세브란스병원에서 중이염으로 진단받은 15세 미만의 소아 중 동반된 이루의 배양검사에서 폐구균이 분리된 경우를 대상으로 혈청형과 항생제 감수성을 알아보았다. 결 과 : 모두 54명의 환아로부터 54개의 검체를 얻었으며 이 들의 연령의 중앙값은 13개월이었고 5세 미만의 환아가 차지하는 비율은 81%였다. 혈청형 빈도는 19A(44%), 19F(28%), 6B(7%), 6A(4%), 9V(4%), 1(4%) 등의 순이었다. 전체 혈청형 중 19A와 19F가 차지하는 비율이 72%이었으며, 특히 5세 미만의 소아에서는 84%나 차지하여 5세 이상 소아에서의 20%에 비해 높은 비율을 보였다.(P<0.001) 연도별 19A나 19F이 차지하는 비율은 차이가 없었으며, 7가 단백결합 폐구균백신 도입 이전과 이후 시기 사이에도 차이가 없었다. 전체 폐구균 중 백신혈청형이 차지하는 비율은 43%이었다. 진단 이전 7가 단백결합 폐구균백신을 접종한 3명의 환아에서 동정된 혈청형은 모두 19A였다. 혈청형 별 항생제 비감수성 폐구균의 비율에서 19A는 다른 비백신혈청형에 비해 페니실린, erythromycin, trimethoprim-sulfamethoxazole 등에 비감수성 비율이 더 높았다. 다제 내성률도 다른 비백신혈청형에서 29%인데 반해 19A에서는 96%였다.(P=0.001) 결 론 : 5세 미만의 중이염 환아의 이루에서 분리된 폐구균 중 19A가 가장 흔한 혈청형이었고 매우 높은 다제 내성률을 보였다.

• 한국어병학회지
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• 제33권2호
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• pp.119-125
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• 2020

2013년부터 2020년까지 제주지역 양식 넙치로 부터 연쇄구균 470 균주를 분리하였다. 분리된 균주를 대상으로 multiplex PCR방법을 이용한 종 동정결과 S. iniae가 92균주(19.6%), S. parauberis가 378균주(80.4%)로 조사되었다. 연도별 경향을 보면 2003년에는 S. iniae와 S. parauberis 분리비율이 각각 56.9%와 43.1%로 조사되었으나 이후 지속적으로 S. iniae의 분리율이 감소하고 S. parauberis 분리율이 증가하기 시작하여 2015년부터는 전체 분리주가 모두 S. parauberis로 확인되었다. S. parauberis로 동정된 균주들에 대하여 PCR을 통한 serotype 분석 결과 subserotype Ia 34.9%, subserotype Ib/Ic 46.3%, serotype II 18.8% 순으로 조사되었다. S. parauberis에 대한 serotype 분포변화 조사 결과에서는 2003년과 2004년에는 serotype II가 각각 59.1%, 50.0%로 가장 많았으나, 2005년부터 2009년 사이에는 subserotype Ib/Ic가 가장 많았으며(각각 57.6%, 86.0%, 84.6%, 57.9%, 83.3%), 2010년부터 이후에는 2015년을 제외하고는 subserotype Ia가 가장 높은 비율로 분리되었고, 최근 3년(2018년부터 2020년)동안을 보면 subserotype Ia가 가장 많은 약 70% 내외이며, subserotype Ib/Ic가 약 16~30%, serotype II는 2018년에는 분리되지 않았으나 2019년과 2020년에 각각 3.4%와 16.7%로 다시 증가하는 경향을 보였다. 넙치의 연쇄구균병은 성어에 발생하여 큰 경제적 피해를 유발하므로 이에 대한 대책연구를 위해서는 지속적인 모니터링 연구가 필요하다고 생각된다.

• 대한수의학회지
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• 제34권1호
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• pp.85-91
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• 1994

A study on the isolation of Yersiniae from the feces of wild animals(mammals 376, birds 19 and reptiles 13) in zoo and the biotype and serotype and susceptibility of 12 antibiotics was carried. Out of 408 animals, Yersiniae were isolated from 28 animals(6.9%). Of 28 isolates, 27 isolates(96.4%) were Y. enterocolitica and 1(3.6%) was Y. kristensenii. According to the species, 25(6.6%) of Y. enterocolitica and 1(0.3%) of Y. kristensenii were isolated from 376 mammals, 2(15.4%) of Y. enterocolitica from 13 reptiles but not isolated from 19 birds. According to the eating pattern, 8(5.2%) of Y. enterocolitica were isolated from 155 carnivora, 13(10%) of Y. enterocolitica from 123 herbivora, and 6(4.9%) of Y. enterocolitica and 1(0.8%) of Y. enterocolitica from 123 omnivora. Out of 27 isolates of Y. enterocolitica, all were biotype 1. And predominant serotype was 0:21(40.7%), and 0:5(37.0%), 0:6(11.1%), 0:1(3.7%), 0:9(3.7%) and untypable(3.7%). Yersiniae isolated from zoo animals were resistant to cephalothin(100%), ampicillin(96.4%), carbenicillin(96.4%) and tetracycline(14.3%) and streptomycin(3.6%) and susceptible to chloramphenicol(100%), colistin(100%), gentamicin(100%), kanamycin(100%), nalidixic acid(100%), polymyxin B(100%) and tobramycin(100%). The predominant multiple resistance pattern was Am-Cf-Cb(82.1%), and Am-Cf-Cb-Te(10.7%) and Am-Cf-Cb-Te-Sm(3.7%).

• 미생물학회지
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• 제42권4호
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• pp.257-264
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• 2006

한국의 임상검체와 자연환경에서 분리된 Cryptococcus neoformans 58주에 대한 혈청형과 세포외효소 생성능에 관한 셍물학적 특성을 조사하였다. 환자로부터 분리된 임상균주 51주 중 48주는 혈청형 A (94.1%) 였으며 2주는 혈청형 B (3.92%),그리고 나머지 1주는 혈청형 D (1.96%)였다. 자연환경에서 분리된 7주는 비둘기 분변에서 분리된 것들이며 모두 혈정형 A였다. 모든 균주는 proteinase와 phnospholipase를 생성하였고, 또한 API-ZYM system을 이용한 19종류의 효소생성능 시험에서는 alkaline phosphatase, esterase (C4), esterase lipase (C8), leucine arylamidase, acid phosphatase, naphthol-AS-BI-phosphohydrolase, $\alpha$-glucosidase, 그리고 $\beta$-glucosidase를 생성하였으나, N-acetyl-$\beta$-glucosarninidase는 39주 (67.2%)에서만 생성하였다. 혈청형 B로 동정된 2주와 혈청형 A로 동정된 균주중 1주는$\beta$-glucuronidase를 생성하였다. 본 연구에 사용된 총21종류의 효소 생성능 시험을 기초로 하여 생물형을 구분하였는데, 모두 4가지의 유형을 나타내었고, 또한 임상과 환경균주에서 혈정형과 생물형 특성간의 유의한 상관성를 나타내었다.