This study describes an efficient approach to the development of DNA markers for use in distinguishing the Scrophularia species that have been used as useful medicinal crops. In order to distinguish Scrophularia species, DNA sequences of rpl-5 region in mitochondrial DNA of Scrophularia species were analysed for detecting sequence variations, and the PCR-RFLP method was applied for developing practicable DNA marker patterns. Several DNA variations were detected by the sequence comparison of rpl-5 region among Scrophularia species. Genetic relationship analysis of Scrophularia species was carried out based on these DNA variations. DNA variations of rpl-5 region were revealed that it was significantly efficient in genetic relationship analysis of Scrophularia species. In addition, Scrophularia species tested in this study were completely discriminated by four polymorphic genotypes by PCR-RFLP combined with Tsp509 I (^AATT) restriction enzyme. Our results suggested that DNA sequence variations of rpl-5 region were sufficiently useful for genetic relationship analysis of Scrophularia species. Polymorphic genotypes by PCR-RFLP using the Tsp509 I enzyme will be useful for discrimination of Scrophularia species as a practicable DNA markers.
Objectives : This study was performed to prove the hypotensive effect of 70% MeOH extracts from Scrophularia buergeriana (SB) on rat's femoral artery. Methods : We observed hypotensive effect of SB on rat's femoral artery. Scrophularia buergeriana Miquel, S. kakudensis, S. koraiensis and S. ningpoenesis Hemsl. were used by the RFLP method and sequence analysis of ITS regions, in order to compare and discriminate. Results : SB 70% MeOH Ex., Water fraction, 40% MeOH fraction, 100% MeOH fraction didn't show significantly hypotensive effect. 20% fraction of SB 70% MeOH Ex. showed significantly hypotensive effect. The size of ITS region on Scrophularia sp. is 589${\sim}$590bp and amount of G+C is 59.3% to 59.7%, and it showed the similar of ITS parts on Scrophularia sp. Conclusions : We concluded that SB Ex. have hypotensive activity, and it's more efficient when separated. And Scrophularia sp. showed the similar of DNA analysis.
Journal of the Korean Society of Environmental Restoration Technology
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v.13
no.1
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pp.24-31
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2010
This study was carried out to analyze vegetation and soil characteristic, and ordination of Scrophularia takesimensis population, Ulleung Island. The Scrophularia takesimensis population was classified into Aster spathulifolius for. oharai dominant population, Vitis amurensis dominant population and Scrophularia takesimensis typical population. The Scrophularia takesimensis population was located in elevation of 1m to 6m, in Ulleung Island. In the study sites, soil organic matter, nitrogen, available phosphorous, exchangeable potassium, exchangeable calcium, exchangeable magnesium and exchangeable sodium concentration, and cation exchange capacity, and soil pH were 9.1~19.1%, 0.19~0.52%, 87.1~196.7mg/kg, 2.0~2.8cmol+/kg, 5.4~5.9cmol+/kg, 5.9~8.8cmol+/kg, 4.4~4.8cmol+/kg, 20.3~26.7cmol+/kg, and 6.8~8.0, respectively. The Vitis amurensis dominant population was mainly found in the high percentage of total nitrogen, organic matter, CEC in comparison with Aster spathulifolius for. oharai dominant population.
According to Article 9.3 of the International Code of Nomenclature for algae, fungi, and plants(Shenzhen Code), a lectotype may be selected as the nomenclatural type from the original material, if the name was published without a holotype. While reviewing the genus Scrophularia collected in Northeast Asia, we found that two species, S. alata A. Gray and S. kakudensis Franch., were still untypified. S. alata has three specimens considered as syntypes in two herbaria, Harvard University and the Smithsonian Institution. For S. kakudensis, two specimens considered as syntypes at the Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris were classified as normal specimens, not type specimens. Therefore, two species of Scrophularia L. namely, S. alata A. Gray and S. kakudensis Franch., are lectotypified. The lectotypes are kept in the Harvard University and the Muséum National d'Histoire Naturelle, Paris, respectively. Furthermore, some nomenclatural issues related to these names are discussed, and the photographs of the selected lectotypes are provided.
Objective : The study was done to investigate Scrophularia buergeriana Miquel's effects in the genomic level, by measuring gene expression in hyperthyroid induced rats using cDNA micro array. Methods : Spargue-Dawley rats were separated into three groups(each with 10 rats). Except normal group, the other two groups were treated with Sodium levothyroxine $160{\mu}g$/kg/days for 5 days by oral administration. After 2 hours of the last intake of Sodium levothyroxine on two experimental group, one group was treated Scrophularia buergeriana Miquel extract 1.0g/kg/days for 3 days. The other groups(normal group, administration group) was treated normal saline 1.0g/kg/days for 3 days. Gene expression of hyperthyroid rats were measured after medication of solid extract of Scrophularia buergeriana Miquel with cDNA microarray. Results : In thyroid tissue, the numbers of the genes showed over twice increase and decrease in the control group compared to the normal group were 296, in the Scrophularia buergeriana Miquel administration group compared to the normal group were 859 and in the hypothalamus, the numbers of the genes showed over twice increase and decrease in the control group compared to the normal group were 416, in the Scrophularia buergeriana Miquel administration group compared to the normal group were 391. Conclusion : According to the above results, it is suggested that Scrophulari buergeriana Miquel suppress hyperthyroidism effectively and regulate the gene expression in the thyroid and brain.
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.21
no.5
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pp.135-139
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2016
Scrophularia ningpoensis hemsl has been traditionally used in China and Vietnam for treatment of bacteria, atopy, pimple, tonsillitis, angina and encephalitis for a long time. The main objectives of this study were to evaluate the antibacterial activity of the Scrophularia ningpoensis hemsl extract on biofilm formation of Klebsiella pneumoniae. Antibacterial activity was conducted using disc diffusion assay and minimum inhibitory concentration (MIC), and minimum bactericidal concentration (MBC) were determined using the broth micro dilution method in accordance to Clinical and Laboratory Standards Institute guidelines(CLSI). Furthermore, cytotoxicity on L929 were assessed using animal cell culture for the proliferation test(MTT cell assay) and the biofilm forming capacity of the K. pneumoniae were determined using the colony forming unit (CFU) assay. The extract exhibited considerable antibacterial activity. K. pneumoniae was susceptible to the extract with the MIC and MBC of 0.1875 and $1.5mg/m{\ell}$ respectively. Cytoxicity test in L929 showed no sign of toxicity at the concentration of $0.75mg/m{\ell}$ and at the same concentration the extract caused inhibition of bacterial biofilm formation. The extract of Scrophularia ningpoensis hemsl possesses an in vitro antibacterial antibiofilm activities against K. pneumoniae, with no sign of cytoxicity on L929.
The genus Scrophularia L. (Scrophulariaceae) comprises 200-270 species worldwide and is a taxonomically challenging lineage, displaying morphological diversity and hybridization. S. kakudensis is morphologically similar to the closely related taxa S. kakudensis var. microphylla, S. pilosa, and S. cephalantha. Therefore, the purpose of this study was to sequence the chloroplast (cp) genome of S. kakudensis using next-generation sequencing and compare it to those of related taxa. The complete cp genome sequence of Scrophularia kakudensis was found to be 152,355 bp long, consisting of a pair of inverted repeats of 25,485 bp that separate a large single-copy (LSC) of 83,479 bp from small single-copy regions of 17,909 bp. The cp genome contained 78 protein-coding genes, 30 tRNAs, and four rRNAs. A phylogenetic analysis based on 78 protein-coding genes from six Scrophularia species showed S. kakudensis and S. cephalantha formed with 100% bootstrap values. We compared the complete cp genomes of S. kakudensis and S. cephalantha and identified seven sequence divergence regions: matK/rps16, rps16/trnQ, trnS/trnG, rpoB/trnC, trnS/trnG, rpl32/trnL, and ndhD/psaC. These regions may be useful for determining the phylogenetic relationships among S. kakudensis-related species.
Inter-specific relationships among six species and two varieties, belonging to Scrophularia (Scrophulariaceae), in Korea were re-examined based on both morphological and molecular data. Scrophularia takesimensis, a Korean endemic species, should be separated from S. grayana as an independent species based upon unique morphological characters such as non-winged stems, thickened leaves and glabrous surfaces of leaves, even though they share a lot of other features. It was found that S. grayana is distributed in Sokcho in Korea and along the coast of the East Sea north to far eastern Russia. Although some morphologies of three taxa, S. cephalantha, S. koraiensis var. velutina and S. kakudensis var. microphylla appeared to differ from each other, their ITS DNA sequence data was similar to that of S. kakudensis, suggesting that they might better be designated with the later species. The taxonomic position of S. koraiensis, only found in Korea, has been ambiguous, but ITS DNA sequence data in this study revealed that this species is distinct from S. kakudensis. Consequently, we conclude that the genus Scrophularia in Korea includes five species.
Background: This study was conducted to investigate the effects of germination temperature, storage container and storage temperature on Scrophularia buergeriana and Scrophularia takesimensis seeds. Methods and Results: Seed lengths of both species were 0.8 mm, while seed width differed, with S. buergeriana measuring 0.5 mm and S. takesimensis measuring 0.4 mm. The seeds of S. buergeriana were packaged in paper containers under room temperature ($15^{\circ}C$), cold temperature ($4^{\circ}C$), and freeze temperature ($-20^{\circ}C$). These seeds exhibited around 80% germination rate at temperatures between $15^{\circ}C$ and $30^{\circ}C$. The germiantion rate of S. takesimensis, on the other hand, differed significantly at different germination temperatures. Seeds of S. takesimensis which were packaged in vinyl and paper containers and stored under room and cold temperatures, exhibited around 80% germination rate at $15^{\circ}C$. However, the germination rate of freeze-stored seeds were decreased to lower than 20% at germination temperatures of $15^{\circ}C$, $25^{\circ}C$ and $30^{\circ}C$ germiantion conditions. The rate of germination showed a low positive to a significantly negativie correlation with the other factor that were determined to evaluate the germination performance. Conclusions: This study elucidates the most suitable germination and storage conditions to increase the germination rate for the two species of Scrophularia buergeriana and Scrophularia takesimensis needs to be stored in paper containers under cold temperature and requires a temperature of $20^{\circ}C$ for germination. On the other hand, S. takesimensis in vinyl containers need to be stored at room temperature and those in paper containers at cold temperature, and a temperature of $15^{\circ}C$ is required for germination.
Kim, Dae-Hyun;Park, Jin-Ho;Kim, Young-Choong;Sung, Sang-Hyun;Kim, Seung-Hyun
Natural Product Sciences
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v.17
no.3
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pp.225-229
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2011
A new approach for similarity analysis of chemical profiles of Scrophularia buergeriana was developed. The roots of S. buergeriana collected in Andong, Korea were analyzed using HPLC-DAD and the peak areas of the chromatograms were used to construct the chemical profiles of S. buergeriana. The analytical conditions were validated for specificity, precision and repeatability. The standard chemical profiles were established from the chromatograms of nine standard analytical extracts from three batches. The correlation coefficients of peak areas of characteristic compounds between the chromatograms of the standard and test samples were calculated for quantitative expression of the chemical profiles. The results showed that the HPLC chemical profiles of the samples of same geographic origin were relatively consistent. This new approach could be applied to the quality assessment of herbal medicines with complex chemical compositions.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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