• 제목/요약/키워드: SYBR Green real-time PCR

검색결과 52건 처리시간 0.018초

한우 비육 전·후기의 등심조직에 있어서 지방합성 유전자 발현 (Lipogenesis Gene Expression Profiling in Longissimus dorsi on the Early and Late Fattening stage of Hanwoo)

  • 이승환;박응우;조용민;김경훈;오영균;이지혜;이창수;오성종;윤두학
    • Journal of Animal Science and Technology
    • /
    • 제48권3호
    • /
    • pp.345-352
    • /
    • 2006
  • 지방합성이 왕성하게 진행되는 비육후기의 근육내 지방합성에 있어서, 지방산 및 당의 이용경로 및 이에 따른 근육내 지방합성과정을 규명하기 위해서 지방산 및 당 운반 유전자인 FABP4, GLUT4와 근육내 지방대사 주요유전자인 ACL, ACC, LPL 및 SCD 유전자의 mRNA 발현양상을 분석하였다. 한우 비육전기 및 후기 각 3두를 공시하여 total RNA 추출 및 1st cDNA 합성하여 SYBR green을 이용하여 real-time PCR 분석을 각 유전자별로 3반복씩 수행하였다. FABP4 유전자는 비육전기에 비해 비육후기에 있어서, 3배 이상 유전자 발현이 증가함을 확인할 수 있었고, GLUT4 유전자는 비육전기 및 비육후기에서 큰 차이를 보이지 않았다. 또한 근육내 지방합성 주요유전자인 ACL, ACC, LPL 및 SCD 유전자의 발현량은 비육후기에서 ACL 유전자가 3.8배, ACC 유전자는 2.7배, LPL 유전자는 3.5배, 그리고 SCD 유전자는 7.5배 발현량이 증가하였다. 따라서 본 연구를 통하여 한우의 비육후기에서 근육내 지방합성은 FABP4에 의한 지방산 유입의 증가와 더불어 ACL 유전자에 의해서 지방산 합성의 중간대사물인 acetyl-CoA가 합성되고, 이 중간 대사물을 이용하여 ACC 및 SCD 유전자에 의해서 긴 사슬 지방산 합성이 왕성하게 일어남을 알 수 있었다.

Establishment of a Tm-shift Method for Detection of Cat-Derived Hookworms

  • Fu, Yeqi;Liu, Yunqiu;Abuzeid, Asmaa M.I.;Huang, Yue;Zhou, Xue;He, Long;Zhao, Qi;Li, Xiu;Liu, Jumei;Ran, Rongkun;Li, Guoqing
    • Parasites, Hosts and Diseases
    • /
    • 제57권1호
    • /
    • pp.9-15
    • /
    • 2019
  • Melting temperature shift ($T_m-shift$) is a new detection method that analyze the melting curve on real-time PCR thermocycler using SYBR Green I fluorescent dye. To establish a $T_m-shift$ method for the detection of Ancylostoma ceylanicum and A. tubaeforme in cats, specific primers, with GC tail of unequal length attached to their 5' end, were designed based on 2 SNP loci (ITS101 and ITS296) of the internal transcribed spacer 1 (ITS1) sequences. The standard curve of $T_m-shift$ was established using the standard plasmids of A. ceylanicum (AceP) and A. tubaeforme (AtuP). The $T_m-shift$ method stability, sensitivity, and accuracy were tested with reference to the standard curve, and clinical fecal samples were also examined. The results demonstrated that the 2 sets of primers based on the 2 SNPs could accurately distinguish between A. ceylanicum and A. tubaeforme. The coefficient of variation (CV) of $T_m$- values of AceP and AtuP was 0.07% and 0.06% in ITS101 and was 0.06% and 0.08% in ITS296, respectively. The minimum detectable DNA concentration was $5.22{\times}10^{-6}$ and $5.28{\times}10^{-6}ng/{\mu}l$ samples of AceP and AtuP, respectively. The accuracy of $T_m-shift$ method reached 100% based on examination of 10 hookworm DNA samples with known species. In the clinical detection of hookworm in 69 stray cat fecal sample, the $T_m-shift$ detection results were consistent with the microscopic examination and successfully differentiated between the 2-hookworm species. In conclusion, the developed method is a rapid, sensitive and accurate technique and can provide a promising tool for clinical detection and epidemiological investigation of cat-derived hookworms.