• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권2호
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• pp.937-943
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• 2014

Polymorphisms in miRNA binding sites have been shown to affect miRNA binding to target genes, resulting in differential mRNA and protein expression and susceptibility to common diseases. Our purpose was to predict SNPs (single nucleotide polymorphisms) within miRNA binding sites of inflammatory genes in relation to gastric cancer. A complete list of SNPs in the 3'UTR regions of all inflammatory genes associated with gastric cancer was obtained from Pubmed. miRNA target prediction databases (MirSNP, Targetscan Human 6.2, PolymiRTS 3.0, miRNASNP 2.0, and Patrocles) were used to predict miRNA target sites. There were 99 SNPs with MAF>0.05 within the miRNA binding sites of 41 genes among 72 inflammation-related genes associated with gastric cancer. NF-${\kappa}B$ and JAK-STAT are the two most important signaling pathways. 47 SNPs of 25 genes with 95 miRNAs were predicted. CCL2 and IL1F5 were found to be the shared target genes of hsa-miRNA-624-3p. Bioinformatic methods could identify a set of SNPs within miRNA binding sites of inflammatory genes, and provide data and direction for subsequent functional verification research.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제25권1호
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• pp.107-116
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• 2018

본 연구의 목적은 블루베리 잎의 용매별 추출물에 따른 약리활성에 대한 검증 및 효능 평가이다. 블루베리 잎의 항산화, 항염증에 대한 효과를 확인하였다. 염증 반응은 자극이 가해지면 histamine, serotonin, prostaglandin과 같은 혈관 활성물질에 의해 혈관 투과성이 증대되어 염증을 유발하고 cytokine, free radical, lysosomal enzyme 등 다양한 매개 인자가 관여한다. 자극에 의한 macrophage cell의 염증반응은 tumor necrosis factor-${\alpha}$(TNF-${\alpha}$), interleukin-6(IL-6), interleukin-$1{\beta}$(IL-$1{\beta}$)와 같은 pro-inflammatory cytokine의 발현이 유도되고, inducible nitric oxide synthase(i-NOS)와 cyclooxygenase-2(COX-2)에 영향을 받는 유전자의 발현을 자극하게 되어 nitric oxide(NO) 및 $PGE_2$등의 염증 인자가 생성된다. 이에 따라 블루베리 잎 추출물의 항염증에 대한 연구를 위해 이에 영향을 주는 인자인 i-NOS, COX-2의 단백질 발현억제 작용을 확인 하였다. 그 결과 BLA > BLE > BLW 순서로 높은 효능을 확인 할 수 있었다. 가장 효과가 좋은 BLA 처리군에서 $PGE_2$ 분비량 및 다양한 염증성 인자의 mRNA 발현량을 확인하였다. 측정 결과, BLA($100{\mu}g/mL$)는 $PGE_2$ 분비량을 85.3% 억제하였으며 i-NOS, COX-2, IL-$1{\beta}$, IL-6, TNF-${\alpha}$ 단백질과 mRNA 발현이 각각 86.8%, 85.7%, 62.7%, 77%, 32.2% 억제되는 효과를 확인할 수 있었다. 결론적으로 블루베리 70% 아세톤 추출물(BLA)의 항염증 효과가 가장 높았으며, 블루베리 잎은 세포의 mRNA 및 단백질 수준에서 염증인자들의 억제를 통해 대식세포에서 항염증 효과가 명백히 확인되었다. 더 나아가, nuclear factor kappa B(NF-${\kappa}B$), signal transducer and activator of transcription(STAT-1), mitogen-activated protein kinases(MAPKs) 등의 세포 내 염증관련 중간기전을 연구해볼 가치가 있다고 사료된다.