• 통합자연과학논문집
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• 제11권2호
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• pp.93-100
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• 2018

Caspases, a family of cysteinyl aspartate-specific proteases plays a central role in the regulation and the execution of apoptotic cell death. Caspase-3 has been proven to be an effective target for reducing the amount of cellular and tissue damage because the activation of caspases-3 stimulates a signalling pathway that ultimately leads to the death of the cell. In this study, Hologram based Quantitative Structure Activity Relationship (HQSAR) models was generated on a series of Caspase-3 inhibitors named 3, 4-dihydropyrimidoindolones derivatives. The best HQSAR model was obtained using atoms, bonds, and hydrogen atoms (A/B/H) as fragment distinction parameter using hologram length 61 and 3 components with fragment size of minimum 5 and maximum 8. Significant cross-validated correlation coefficient ($q^2=0.684$) and non cross-validated correlation coefficients ($r^2=0.754$) were obtained. The model was then used to evaluate the eight external test compounds and its $r^2_{pred}$ was found to be 0.559. Contribution map show that presence of pyrrolidine sulfonamide ring and its bulkier substituent's makes big contributions for improving the biological activities of the compounds.

• 통합자연과학논문집
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• 제7권4호
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• pp.241-252
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• 2014

A series of N-benzoylated ligands incorporating three different benzoyl groups 2,2'-(benzoyliminodiethylene)-4-substituted phenols ($L^{1,4,7}$), 2,2'-(4-nitrobenzoyliminodiethylene)-4-substituted phenols ($L^{2,5,8}$) and 2,2'-(3,5-dinitrobenzoyliminodiethylene)-4-substituted phenols ($L^{3,6,9}$) were synthesized and characterized by IR, $^1H$ NMR, $^{13}C$ NMR and mass spectroscopy. The In vitro antibacterial activity of investigated ligands were tested against human pathogenic bacteria such as four Gram (-) Enterococcus faecalis, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Vibrio cholera, Vibrio harveyi and two Gram (+) Staphylococcus aureus, Streptococcus mutans. Furthermore, docking studies were undertaken to gain insight into the possible binding mode of these compounds with the binding site of the topoisomerase II (PDB: 4FM9) enzyme which is involved in DNA superhelicity and chromosome seggregation. The N-benzoylated derivatives $L^{5,7,8}$ have significant anticancer activity as Topoisomerase inhibitors. The ligands $L^5$ and $L^8$ were tested for their anticancer activity against human liver adenocarcinoma (HepG2) cell line with the MTT assay.

• 통합자연과학논문집
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• 제16권4호
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• pp.123-131
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• 2023

Breast cancer continues to pose a substantial worldwide health challenge, thereby requiring the development of innovative strategies to discover new therapeutic interventions. Signal Transducer and Activator of Transcription 3 (STAT-3) has been identified as a significant factor in the development of several types of cancer, including breast cancer. This is primarily attributed to its diverse functions in promoting tumour formation and conferring resistance to therapeutic interventions. This study presents an in silico drug repositioning approach that focuses on identifying specific inhibitors of STAT-3 for the purpose of treating breast cancer. We initially examined the structural and functional attributes of STAT-3, thereby elucidating its crucial involvement in cellular signalling cascades. A comprehensive virtual screening was performed on a diverse collection of drugs that have been approved by the FDA from zinc15 database. Various computational techniques, including molecular docking, cross docking, and cDFT analysis, were utilised in order to prioritise potential candidates. This prioritisation was based on their predicted binding energies and outer molecular orbital reactivity. The findings of our study have unveiled a Dihydroergotamine and Paritaprevir that have been approved by the FDA and exhibit considerable promise as selective inhibitors of STAT-3. In conclusion, the utilisation of our in silico drug repositioning approach presents a prompt and economically efficient method for the identification of potential compounds that warrant subsequent experimental validation as selective STAT-3 inhibitors in the context of breast cancer. The present study highlights the considerable potential of employing computational strategies to expedite the drug discovery process. Moreover, it provides valuable insights into novel avenues for targeted therapeutic interventions in the context of breast cancer treatment.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제30권1호
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• pp.109-121
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• 2023

본 연구에서 식품 중 비타민 D 주요 급원으로 선정한 버섯류(3종), 어패류(10종), 알류(1종), 육류(7종), 두류(1종), 유류(4종), 가공식품(3종), 유지류(1종)로, 총 30종에 대표 조리법을 포함한 148건에 대해 LC-MS/MS를 이용하여 분석하였다. 우리 국민 평균 총식이섭취량의 90% 이상을 포괄하는 대상 식품을 선별 후 식생활에서 활용되는 조리법 선정을 통해 조제된 실제 섭취 상황에 가까운 한국형 총식이조사를 기반한 '대표 식품×대표 조리법'으로서 새송이버섯(굽기), 가다랭이(그대로) 등 53종으로 6개의 지역별 시료를 불검출의 경우 1건만 분석하였고, 검출된 경우 6건 전부 분석하여 총 148건에 대해 비타민 D 함량 및 섭취량을 추정하였다. 분석은 유효성검증 및 국제 분석 관리프로그램인 FAPAS를 참여하여 숙련도 테스트 결과, Z-score 2 이하의 만족하는 결과를 얻어 신뢰도를 검증하였다. 본 연구에서 분석한 '대표 식품×대표 조리법'의 비타민 D 결과는 어류에서는 멸치(볶기)에서 124.0 ㎍/kg의 농도로 가장 높게 검출되었고, 두 번째로 고등어(굽기)에서 120.2 ㎍/kg의 농도로 검출이 되었다. 달걀의 경우 달걀(끓이기)은 검출되지 않았고, 달걀(부치기)에서 최고 33.1 ㎍/kg의 농도로 검출이 되었다. 육류에서는 닭고기와 쇠고기는 전부 검출되지 않았고, 돼지고기의 경우 굽기에서 12.2 ㎍/kg으로 검출되었다. 유제품의 경우 요구르트(액상)에서 136.9 ㎍/kg, 가공식품 중 시리얼의 경우, 155.1 ㎍/kg의 농도로 비타민 D가 검출이 되었는데, 이는 비타민 D 강화 제품으로 보인다. 생표고버섯을 햇빛에 12시간 노출 시에 비타민 D 함량이 303.4 ㎍/kg으로 높았으며, 건조형태에 따라 갓이 위로 향할 때보다, 주름부분을 위로 향하였을 때 비타민 D₂의 함량이 높음을 확인하였다. 비타민 D 함량 분석 결과를 토대로 섭취량을 추정한 결과, 우리 국민의 1인 1일 평균 비타민 D 섭취량은 0.99 ㎍/day이었으며, 비타민 D 섭취량에 기여한 중요 3가지 식품은 요구르트, 액상(31.3%), 달걀(28.1%), 시리얼(11.4%) 순이었다. 보건복지부와 한국영양학회에서 제공하는 한국인 영양소 섭취기준(2020년) 중 비타민 D의 1일 충분 섭취량(영양소의 필요량을 추정하기 위한 과학적 근거가 부족할 경우, 대상 인구집단의 건강을 유지하는 데 충분한 양을 설정한 수치)은 영유아 5 ㎍/day, 남녀 6세부터 75세 이상 5-15 ㎍/day로 본 연구에서 추정한 1인 1일 평균섭취량과 비교하였을 때, 우리 국민의 비타민 D 섭취가 부족하다는 것을 확인할 수 있었다. 비타민 D 부족을 개선하기 위해 생활양식이나 식습관을 통해 비타민 D를 증가시킬 수 있는 식품을 섭취하고, 부족한 부분은 보충제를 통한 비타민 D 섭취가 필요할 것으로 보인다. 버섯의 경우 햇빛 또는 자외선에 노출시키면 비타민 D 섭취량을 높일 수 있다. 식습관을 통해 비타민 D 부족을 개선할 수 있는 다양한 연구가 필요하다고 생각된다.