• 한국미생물·생명공학회지
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• 제37권2호
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• pp.147-152
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• 2009

Bacillus sp. A-6의 배양액의 상등액으로부터 한외여과와 5 mM sodium acetate, pH 5.0 용액으로 평형화된 SP-Sepharose column을 사용한 이온교환 크로마토그래피에 의해 xylanase를 정제하였다. Column에 흡착된 xylanase는 0.05 M NaCl 이하의 농도에서 용출되었다. 용출된 xylanase가 SDS-PAGE에서 단일 펩티드 밴드로 분리되어 순수함을 확인하였으며 oat spelt xylan을 기질로한 zymogram에서 xylan을 분해하는 밴드로 나타났다. Xylanase의 분자량은 SDS-PAGE에서 15,000이었고 겔여과 크로마토그래피에서 14,100 이었다. 박층막 크로마토그래피에서 xylanase가 oat spelt xylan을 xylobiose와 xylooligosaccharide로 분해함을 보였다. Xylanase를 가열할 때에 상대활성도가 $40^{\circ}C$에서 7시간 후에 80%로 감소하였으며 $60^{\circ}C$에서는 1시간 후에 40% 이하로 감소하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권8호
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• pp.1210-1214
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• 2010

Many bacteria are involved in the fermentation of doenjang, and Bacillus species are known to perform significant roles. Although SDS-PAGE has been frequently used to classify and identify bacteria in various samples, the microbial diversity in doenjang has not yet been investigated. This study aims to determine the identity and distribution of dominant Bacillus species in doenjang using SDS-PAGE profiles of whole-cell proteins and 16S rRNA gene sequencing. Reference Bacillus strains yielded differential SDS-PAGE banding patterns that could be considered to be highly specific fingerprints. Grouping of bacterial strains isolated from doenjang samples by whole-cell protein patterns was confirmed by analysis of their 16S rRNA gene sequences. B. subtilis was found to be the most dominant strain in most of the samples, whereas B. licheniformis and B. amyloliquefaciens were less frequently found but were also detected in several samples. The results obtained in this study show that a combined identification method using SDS-PAGE profiles of whole-cell proteins and subsequent 16S rRNA gene sequence analysis could successfully identify Bacillus species isolated from doenjang.

• Preventive Nutrition and Food Science
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• 제12권2호
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• pp.103-110
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• 2007

The protein profiles among Korean rice cultivars were assessed by total protein determination, solubility fractionation, SDS-PAGE analysis and scanning densitometry. In the extraction of protein, the SDS/urea system at a neutral pH was more efficient than that at alkaline pH. The determination of total protein showed that the protein content was similar among cultivars, ranging from 87.9 to 92.7 mg/g dry weight. Additionally, the water/NaCl-soluble protein fraction, containing 14${\sim}$16 kDa albumin and 22 kDa globulin ${\alpha}$-globulin, was also similar among cultivars, with a range of 9.94 to 11.98 mg/g dry weight. The SDS-PAGE/densitometry of total protein showed that there was no discernable difference in proteins of higher molecular weights among various cultivars, whereas the amount of lower molecular weight proteins (14${\sim}$16 kDa) is somewhat variable among cultivars. Furthermore, SDS-PAGE analysis of water/NaCl-soluble and propanol-soluble fractions indicates that there is a discernible change in the content of albumin, globulin or prolamin among cultivars. Thus, the PAGE/densitometry method, preceded by solubility fractionation, is useful for examining differences in protein profiles of rice cultivars.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제31권9호
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• pp.2493-2496
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• 2010

Erythropoietin (EPO) is mainly produced in kidney and stimulates erythropoiesis. The use of recombinant EPOs for doping is prohibited because of its performance enhancing effect. This study investigated whether biosimilar EPOs could be differentiated from endogenous one by iso-electro-focusing plus double blotting and SDS-PAGE for antidoping analysis. The established method was validated with positive control urine. The band patterns were reproducible and meet the criteria, which was made by world anti doping agency (WADA). Isoelectric focusing was conducted in pH range 2 to 6. Recormon (La Roche), Aropotin (Kunwha), Epokine (CJ Pharm Co.), Eporon (Dong-A), Espogen (LG Life Sciences), and Dynepo (Shire Pharmaceuticals) were detected in basic region. All biosimilars showed discriminative isoelectric profiles from endogenous EPO profiles, but they showed different band patterns with the reference one except Epokine (CJ Pharm Co.). Next, SDS-PAGE of biosimilar EPOs resulted in different molecular weight patterns which were distributed higher than endogenous EPO. Commercial immune assay kit as an immune affinity purification tool and immobilized antibody coated magnetic bead were tested for the purification and concentration of EPO from urinary matrix. The antibody-coated magnetic bead gave better purification yield. The IEF plus double blotting and SDS-PAGE with immunoaffinity purification method established can be used to discriminate biosimilar EPOs from endogenous EPO.

• 분석과학
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• 제8권2호
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• pp.117-124
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• 1995

지속적인 음주로 인하여 간경변증으로 사망한 human 간에서 ethanol에 의해서 유도되는 것으로 추측되는 hemoprotein들을 확인 및 부분정제하였다. 이 hemoprotein을 정제하기 위하여 Mohamed 등의 방법을 변형하여 단백질을 정제하였고, SDS-PAGE 및 spectrum 양상을 관찰하였다. Triton N-101을 처리한 crude extract를 준비하여 CO gas를 bubbling시킨 후 Octyl-Sepharose CL-4B column chromatography에서 0.06% Lubrol PX로 용출한 다음 0.25% Lubrol PX로 용출하였다(Fig. 2). 0.06% Lubrol PX로 용출한 active fraction을 Hydroxyapatite와 DEAE-Sephadex A-25 column으로 정제하였다(Fig. 3, 4). 정제한 단백질을 12.5% SDS-PAGE를 실시한 결과 분자량은 대조군으로 사용한 흰쥐 간에서 정제한 단백질의 분자량은 55 KDa와 52 KDa였고, 돌연사한 사람의 간에서 정제한 단백질의 분자량은 62 48KDa이며, 간경변증으로 사망한 사람의 간에서 정제한 단백질의 분자량은 54KDa였고(Fig. 5). Cytochrome P450 함량은 20.8nmol/mg protein이며 회수율은 약 4.1%이고, 이들의 최대흡수 파장은 446nm이었다(Fig. 6).

• 한국응용곤충학회지
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• 제28권3호
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• pp.105-112
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• 1989

누에(Bombyx mori)와 흰불나방(Hyphantria cunea)으로 부터 분리된 핵다각체병바이러스(nuclear polyhedrosis virus: NPV)를 동정하기 위하여 전자현미경 관찰한 결과, BmNPV 다각체의 크기는 $3 \mu\textrm{m}$ 정도의 18면체로 외형이 균일하였으나, HcNPV는 1.5-$2 \mu\textrm{m}$ 정도이며 부정형이었다. Alkaline protease를 부활화시킨 후 SDS-PAGE한 다각체 단백질의 分子물은 BmNPV가 30 KD, HcNPV는 31 KD인 major band와 이들의 중합체(polymer)로 생각되는 57 KD, 112 KD의 minor band들이 관찰되었다. 또한 virion 단백질을 SDS-PAGE한 후 은염색한 결과, BmNPV는 분자량 9.6~112 KD인 47개의 band, HcNPV 경우는 분자량 9.4~l11 KD인 48개는 band가 관찰되었다. BmNPV와 HcNPV DNA의 제한효소 처이에 의한 전기영동 패턴을 관찰했으며, 각각의 genome 크기는 BmNPV가 약 116.4 Kb, HcNPV의 약 114.6 Kb였다.

• Applied Biological Chemistry
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• 제32권3호
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• pp.209-215
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• 1989

숙주나물의 수분함량, 신장도, 질소함량 및 각 단백질 분획들의 전기영동 패턴과 아미노산조성을 비교 분석하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 숙주나물의 신장도는 재배방법에 의해 약간 달라질 수 있으나 온도가 높을수록 신장도는 커지고 온도가 낮으면 신장도는 작아지나 우리가 섭취할 수 있는 가식부는 크게 나타난다. Weber 변법에 의한 숙주나물의 분회별 단백질 함량은 glutelin량이 가장 많고 globulin, albumin 순이었다. 발아중에 추출율의 차이는 있었으며 대체로 단백질량은 감소하는 것으로 나타났다. 단백질 분획들을 전기영동하여 관찰한 결과 모든 녹두단백질들이 발아기질로 이용되어 발아기간이 늘어날수록 단백질량의 감소를 확인할 수 있었으며, 발아시간에 의한 숙주나물의 신장도와 단백질변화를 비교해 볼 때 상품적 가치로서는 발아 4일이 최적조건임을 알 수 있었다. 아미노산 조성은 Asp, Glu을 월등히 많이 함유하였으며, 전반적으로 발아가 진행됨에 따라 산성 아미노산은 감소하고 염기성 아미노산은 증가하는 경향을 나타냈으며 다른 아미노산들은 발아중 유의할 만한 변화는 없었다.

• 미생물학회지
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• 제33권4호
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• pp.242-246
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• 1997

Synechococcus sp. cyanophage의 SDS-PAGE 수행 결과 구조단백질은 두 개의 major protein(97 kDa, 52 kDa)과 최소 일곱 개의 minor protein(70 kDa, 65 kDa, 60 kDa, 40 kDa, 35 kDa, 28 kDa, 6 kDa)으로 구성되어 있는 것으로 나타났다. Subunit들은 서로 disulfide bond로 연결되어 있지는 않지만 비공유적 결합으로 multimer를 형성하여 phage particle을 구성하고 있는 것으로 보인다. 또한 heat-killed Micrococcus luteus cell을 기질로 이용한 renaturing SDS-PAGE 방법으로 phage particle내의 세포벽 분해능을 살표본 결과 52 kDa 부근에서 세포벽 분해활성이 발견되었다. 이러한 세포벽 분해활성은 최적 pH가 9~10 사이이며 EDTA에 대한 낮은 저해를 나타내었다.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2005년도 생물공학의 동향(XVI)
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• pp.158-162
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• 2005

정어리에서 분리한 5개의 균주를 이용하여 antiangiogenesis 효과가 가장 뛰어난 균주를 ${\lambda}-28$이라 명명하고 이를 대량 배양하여 단백질 추출법인 염석과 투석, 동결건조를 통해 시료를 제조하여 이를 SEC를 통해 fraction별로 분리한 후 SDS-PAGE와 antiangiogenesis, cytotoxcity test를 수행하여 ${\lambda}-28$번의 76 fraction에서 control군에 비해 82.7%의 높은 antiangiogenesis 효과를 보였고, 세포독성 실험에서도 낮은 독성을 보였다.

• 한국동물학회지
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• 제36권2호
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• pp.238-244
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• 1993

We identified juvenile hormone binding protein (JHBP) from last instar larval hemollvnph of Hvphantria cunea using gel filtration and non-SDS PAGE. Two kinds of JHBP in hemollnnph were found at two peaks by gel filtration (Sephadex G-100) and also at Rm values of 0.13 and 0.57 by non-SDS PAGE. JHBP was partially purified using anion exchange chromatosraphv, preparative gel filteration, and preparative PAGE. Dextrin coated charcoal (DCC) binding assay was employed to monitor the location of JHBP in chromatographic profile during the purification process. Purity of JHBP was checked by silver staining of 1091 SDS-Polyacrvlamide.