• 분석과학
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• 제19권6호
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• pp.529-534
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• 2006

SDS-PAGE를 이용한 일반적인 단백질 분리는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 방법이며 가장 보편적이고, 간단한 방법 중의 하나이다. 본 연구는 SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis)를 두 번에 걸쳐 동일한 분리 원리로 이차원으로 전개하는 방법의 전기영동을 시도하여 기존의 일차원 전기영동 분석법과 비교하였으며, 그 결과 향상된 분리능이 본 연구의 이차원 전기영동법에서 확인되었다. Gel에서 분리된 단백질들은 MALDI TOF MS를 이용하여 동정하여 서로 다른 단백질임이 확인되었으며, 이러한 duplex SDS-PAGE 분리법은 상대적으로 적은 비용으로 단백질 분리능을 용이하게 향상시킬 수 있는 경제적인 분석법으로 이용될 수 있을 것이다.

• 한국잠사곤충학회지
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• 제33권1호
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• pp.1-5
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• 1991

누에알의 배자발율 단계별 가용성 단백질과 불용성 단백질에 대한 native-PAGE와 SDS-PAGE 분석을 하였다. 가용성 단백질의 대부분은 ESP, vitellin, 30K 단백질로 구성되어 있었고 배자발육 시기별 난황단백질의 변화는 native-PAGE와 SDS-PAGE에서 일치하였다. 배자발생의 후기에는 난황단백질의 분해산물로 보이는 수개의 peptides가 검출되었고 침산처리 후 1일된 알에서 1개의 특이한 단백질이 출현하였다. 누에알 마쇄물의 원심침전물에 대한 SDS-FAGE 분석결과 수종의 peptides가 배자발육의 진전과 함께 새로이 검출되었다.

• 한국양식학회지
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• 제10권3호
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• pp.301-310
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• 1997

황해서식 두족류 (class Cephalopoda)의 가용성 단백질에 대한 연구를 위해, 인천 및 목포 연근해에서 채집된 두족류 3목 5종의 (오징어목 : 참갑오징어 (Sepia esculenta) 및 쇠갑오징어 (Sepiella japonica), 살오징어목 : 한치꼴뚜기 (Loligo chinensis) 및 참꼴뚜기 (Loligo beka), 문어목 : 낙지 (Octopus minor)의 안구단백질, 근육단백질 및 간조직을 추출하여, 각종 전기영동 (Davis-PAGE 및 SDS-PAGE, Exponential gradient SDS-PAGE, 등전점 전기영동, 2차원 전기영동) 방법에 의한 단백질 분리 양상을 통해 두족류 종사이의 유전적 근연관계를 분석하였다. 시료의 안구 및 근육 단백질에 대한 exponential gradient SDS-PAGE 전기영동 결과 대략 분자량 35-50 KDa 사이에서 단백질 분리 양상의 차이를 볼 수 있었으며, 등전점 전기영동 방법(IEF)에 의해서는 pI값 7.5-8.5 사이에서 종간 특이성을 갖는 단백질 분리 양상을 볼 수 있었다. 특히 유의성이 있다고 판단된 시료의 안구 단백질을 2차원 전기영동 방법에 의해 분리 해 본 결과 대부분 분자량 30-50 KDa 사이에 분포하고 있어 exponential gradient SDS-PAGE 전기 영동에 의한 결과와 일치함을 알 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제15권2호
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• pp.388-394
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• 2005

In order to investigate the distribution of dominant Bifidobacterium species in intestinal microflora of Korean adults and seniors, SDS-PAGE profiles of whole cell proteins were used for the identification of bifidobacteria. To confirm the reliability of SDS-PAGE, the Bifidobacterium species identified by SDS-PAGE of whole cell proteins were validated by using 16S rDNA sequencing analysis. The results of SDS­PAGE corresponded well with those determined by the analysis of 16S rDNA sequencing. Based on the analysis of SDS-PAGE patterns on unidentified fecal strains which showed positive in fructose-6-phosphate phosphoketolase activity, B. adolescentis, B. longum, and B. bifidum were identified in the feces of adults, and B. adolescentis, B. longum, B. bifidum, B. breve, and B. dentium were identified in those of seniors. In most of the fecal samples tested, the predominant Bifidobacterium species consisted of only a few species, and differences in the distribution and numbers of Bifidobacterium species were observed between adults and seniors. B. adolescentis and B. longum were found to be the most common species in feces of adults, but not in seniors. Accordingly, the distribution and abundance of bifidobacteria in the human intestinal microflora varied depending on the age of hosts.

• 한국식품과학회지
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• 제31권6호
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• pp.1488-1494
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• 1999

감마선 조사가 상업적 등급의 SPI와 WPC의 SDS-PAGE 헝태와 이차구조 함량, 용해도 등 이화학적 변화에 미치는 영향을 조사하였다. 감마선이 조사된 SPI와 WPC의 SDS-PAGE 형태은 SPI 용액의 경우 5 kGy 이상 조사에서 단백질의 degraded pattern과 아울러 중합이 나타난 반면에 WPC 용액에서는 단백질이 절단된 형태로 나타났다. 반면에 감마선이 조사된 SPI와 WPC 분말의 경우 분자량 분포에는 큰 변화가 없었다. Circular dichroism 연구에서 감마선이 조사된 SPI와 WPC용액의 이차구조의 변화는 감마선 조사에 의하여 단백질의 구조 변화를 나타내는 random coil함량이 증가하였다. 또한, SPI와 WPC 분말의 경우에는 감마선 조사에 의한 용해도의 차이가 있었다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제35권5호
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• pp.594-599
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• 2006

이전의 연구에서, 우육중의 주된 알레르겐은 우육추출물 중의 BSA, BGG라고 보고하였다. 본 연구에서는 이들 단백질의 열처리와 초고압처리와 같은 물리적 처리에 따른 SDS-PAGE상의 변화와 우육알레르기 환자의 혈청을 이용한 알레르겐성의 변화를 Western blots로 관찰하였다. 우육추출물에 대한 열처리에 의한 알레르겐 단백질의 변화에서, $100^{\circ}C$ 가열처리군에서 BSA band는 큰 감소를 보였으나, BGG band는 완전히 제거되지 못하고 남아 있었고, 항원성 역시 대조군에 비하여 감소는 하였으나 여전히 유지되고 있었다. $120^{\circ}C$이상의 열처리는 추출물중의 BSA와 BGG band 의 소실과 이에 따른 항원성의 큰 감소를 가져왔다. 우육추출물중의 BSA단백질은 열처리에서와 달리 초고압처리에 의하여 전기영동상에 거의 변화를 보이지 않았다. 그러나 BGG 단백질은 400 MPa 가압처리군부터 전기 영동상 band가 감소하였고, 항원성 역시 유의적으로 감소하였다. 이는 초고압처리 정도에 따른 우육추출물중의 BSA와 BGG를 포함한 여러 분자의 SDS-PAGE상의 특이적 변화가 최초로 시사된 결과이다. 이러한 BGG 단백질의 고압처리에 의한 변화는 추출물중의 어떤 효소에 의한 것으로 추측되었고, 고압처리 후 $37^{\circ}C$숙성 실험으로 이러한 가설이 확인되었다. 우육추출물에 존재하고 초고압처리로 활성화되어 BGG분자에 특이적으로 관여하는 효소 및 이와 관련된 메커니즘에 대한 연구가 앞으로 필요할 것으로 보인다.

• 한국식품과학회지
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• 제17권1호
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• pp.1-4
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• 1985

연근별로 인삼 단백질의 생화학적 특성을 체계적으로 규명하기 위하여 polyacrylamide gel 전기영동, SDS-PAGE, gel filteration 및 아미노산 자동분석기에 의한 실험결과는 다음과 같다. 인삼의 수용성 단백질을 Sephadex G-200으로 분획하여 얻은 2개의 peak 중주 단백질은 SDS-polyacrylamide gel 전기영동에 의해 분자량은 43,000으로 추정되었다. Polyacrylamide gel 전기영동 및 SDS-PAGE에 의한 band의 수는 연근에 따라 별 차이 없이 각각 8 및 $7{\sim}11$개 확인되었다. 인삼의 수용성 단백질과 그의 주 단백질을 아미노산 분석한 결과 arginine이 각각 45.17과 57.36%로 최대의 함량을 나타내었고 methionine과 cystine의 함량은 매우 낮았다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제15권2호
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• pp.324-327
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• 2006

The food-borne pathogen Listeria monocytogenes is commonly associated with meats and unpasteurized dairy products. To identify this pathogen in meats more efficiently than has been done in the past, we purchased meats from Korean markets and performed sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and serotyping analysis on Listeria organisms isolated from meat samples. Each Listeria species showed specific protein band patterns on SDS-PAGE. Whole-cell protein SDS-PAGE profiles indicated that the organisms isolated from meats sold in local Korean markets were L. monocytogenes with the serotypes 1/2a, 1/2b, 1/2c, and 4b. We suggest that it is possible to carry out molecular subtyping of L. monocytogenes using SDS-PAGE.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권1호
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• pp.119-124
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• 2003

This study was conducted to evaluate the practical usefulness of the sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PACE) fingerprinting of whole cell proteins far the identification of lactic acid bacteria in Kimchi. SDS- PACE of whole cell proteins of the reference strains and lactic acid bacteria isolated from Kimchi yielded differential banding patterns that were highly specific fingerprints, thus making it possible to identify. Identification of the isolates from Kimchi was achieved by comparing the SDS-PAGE fingerprints of isolates to those of reference strains. In addition, the reliability of SDS-PAGE was examined by comparing the results with those of the APL 50 CHL system assay and 16S rRNA gene sequence. SDS-PACE assay showed a different identity to reference strains, while the APL 50 CHL system and 16S rRNA gene sequence could not distinguish a few strains. Therefore, SDS-PAGE of the whole cell proteins is a specific and a reliable method that will be useful for the identification of lactic acid bacteria in Kimchi to the species level, and can be used as an alternative or complementary identification method.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권7호
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• pp.2063-2066
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• 2013

While many eukaryotic and some prokaryotic proteins show a phosphorylation-dependent mobility shift (PDMS) on SDS-PAGE, the molecular mechanism for this phenomenon had not been elucidated. We have recently shown that the distribution of negatively charged amino acids around the phosphorylation site is important for the PDMS of some proteins. Here, we show that replacement of the phosphorylation site with a negatively charged amino acid results in a similar degree of the mobility shift of a protein as phosphorylation, indicating that the PDMS is due to the introduction of a negative charge by phosphorylation. Compared with a protein showing no shift, one showing a retarded mobility on SDS-PAGE had a decreased capacity for SDS binding. The elucidation of the consensus sequence (${\Theta}X_{1-3}{\Theta}X_{1-3}{\Theta}$, where ${\Theta}$ corresponds to an acidic function) for a PDMS suggests a general strategy for mutagenizing a phosphorylatable protein resulting in a PDMS.