• Title/Summary/Keyword: SDC4

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Biochemical Characterization of Phospholipase C$\delta$from liver of Mud loach (Misgurnus mizolepis) (미꾸라지 간으로부터 포스포리파아제 C델타 단백질의 생화학적 특성)

  • Seo, Jung-Soo;Lim, Sang-Uk;Kim, Na-Young;Lee, Sang-Hwan;Oh, Hyun-Suk;Lee, Hyung-Ho;Chung, Joon-Ki
    • Journal of fish pathology
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    • v.18 no.1
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    • pp.67-80
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    • 2005
  • Phosphoinositide-specific phospholipase $C\delta$ $PLC\delta$) plays an important role in many cellular responses and is involved in the production of second messenger. The present study was conducted to obtain the biochemical characteristics of the expressed recombinant $PLC\delta$ in E. coli cloned from Misgurnus mizolepis and partially purified $PLC\delta$ enzymes from liver tissues of M. mizolepis (wild ML-$PLC\delta$). The ML $PLC\delta$ gene was cloned and expressed under the previous report (Kim et al., 2004), and purified the recombinant protein by successive chromatography using $Ni^{2+}$-NTA affinity column and gel iltration FPLC column. The wild ML-$PLC\delta$ protein was solublized with 2 M KCI and purified by successive chromatography on open heparin-Sephagel and analytical TSKgel heparin-5PW. Both the recombinant and wild ML-$PLC\delta$ form of protein showed a concentration-dependent PLC activity to phosphatidylinositol 4,5-bis-phosphate (PIP$_2$) or phosphatidylinositol (PI). Its activity was absolutely $Ca^{2+}$- dependant, which was similar to mammalian $PLC\delta$ isozymes. Maximal PI-hydrolytic activations of recombinant and wild ML- TEX>$PLC\delta$ was at pH 7.0 and pH 7.5, respectively. In addition, the enzymatic activities of recombinant and wild ML-$PLC\delta$ were increased in concentration-dependent manner by detergent, such as sodium deoxycholate SDC), phosphatidylethanolamine (PE) and phosphatidylcholine (PC). The activities decreased in contrast by a polyamine, such as spermine. Western blotting showed that several types of $PLC\delta$ isozymes exist in various organs. Taken together our results, it suggested that the biochemical characteristics of ML-$PLC\delta$ are similar with those of mammalian $PLC\delta1$ and ${\delta}3$ isozymes.

Effect of Air Ejection on the Behaviors of Sows and their Piglets Related to the Crushing of Piglets by Sows (공기분사가 모돈과 포유자돈의 압사 관련 행동에 미치는 영향)

  • Jeon, J.H.;Yeon, S.C.;Chang, H.H.
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • v.47 no.4
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    • pp.691-696
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    • 2005
  • Suckling piglets must avoid positions with high air velocity because they don’t have hypodermic fat. Therefore this study examined the effects of air ejection on the behaviors of sows and their piglets. Compressed air was released for 5s at 5s intervals between floor and udder of sows only when they were standing or sitting. Sixteen multiparous crossbred(Landrace×Yorkshire) sows and their piglets were used. Behaviors of sixteen sows and their piglets were recorded for 4 days postpartum, using the LED lamp(wavelength:950nm), CCD camera(Samsung SDC-411), multiplexer(Samsung SDM-080), and time lapsed VCR(Samsung SRV-30). The videotapes were scanned every 30s to obtain an instantaneous behavioral sample. The sow’s standing and sitting rates between control group(CG) and air ejection group(AEG) were not significantly different(P>0.05). This means that air ejection does not affect the behavior of sows. Frequency of the suckling piglets’ behaviors closely related to the crushing by sows was lower in AEG than in CG(P<0.05). These results suggest that air ejection may be available for reduction of the crushing of suckling piglets by sows.

Identification of Specific Gene Modules in Mouse Lung Tissue Exposed to Cigarette Smoke

  • Xing, Yong-Hua;Zhang, Jun-Ling;Lu, Lu;Li, De-Guan;Wang, Yue-Ying;Huang, Song;Li, Cheng-Cheng;Zhang, Zhu-Bo;Li, Jian-Guo;Xu, Guo-Shun;Meng, Ai-Min
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • v.16 no.10
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    • pp.4251-4256
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    • 2015
  • Background: Exposure to cigarette may affect human health and increase risk of a wide range of diseases including pulmonary diseases, such as chronic obstructive pulmonary disease (COPD), asthma, lung fibrosis and lung cancer. However, the molecular mechanisms of pathogenesis induced by cigarettes still remain obscure even with extensive studies. With systemic view, we attempted to identify the specific gene modules that might relate to injury caused by cigarette smoke and identify hub genes for potential therapeutic targets or biomarkers from specific gene modules. Materials and Methods: The dataset GSE18344 was downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) and divided into mouse cigarette smoke exposure and control groups. Subsequently, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) was used to construct a gene co-expression network for each group and detected specific gene modules of cigarette smoke exposure by comparison. Results: A total of ten specific gene modules were identified only in the cigarette smoke exposure group but not in the control group. Seven hub genes were identified as well, including Fip1l1, Anp32a, Acsl4, Evl, Sdc1, Arap3 and Cd52. Conclusions: Specific gene modules may provide better understanding of molecular mechanisms, and hub genes are potential candidates of therapeutic targets that may possible improve development of novel treatment approaches.

문헌검색(文獻檢索)에 있어서 Chemical Abstracts와 CA Condensates의 비교(比較)

  • Robert, B.E.
    • Journal of Information Management
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    • v.9 no.1
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    • pp.21-25
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    • 1976
  • 1975년(年) 3월(月), 4년반(年半) 동안의 Chemical Abstracts 색인(索引)과 온-라인이 가능(可能)한 CA Condensates를 비교(比較)하였다. 두가지 데이터 베이스를 함께 이용(利用)하여 검색(檢索)하는 방법(方法)이 가장 효율적(效率的)이지만 실예(實例)에서 보는 바와 같이 CA Condensates를 검색(檢索)하는 것이 보다 실용적(實用的)이다. System Development Corp 사(社) (SDC)에 설치(設置)되어 있는 온-라인 형태(形態)인 CHEMCON과 CHEM7071을 Chemical Abstracts 색인(索引)과 비교(比較)하였다. 대부분(大部分)의 Chemical Abstracts 이용자(理容者)들은 Chemical Abstracts 책자나 우가색인(累加索引)에는 친숙(親熟)하지만 CA Condensates는 아마도 그리 친숙(親熟)하지 못할 것이다. CA Condensates는 서지적 사항을 기계(機械)로 읽을 수 있는 형태(形態)로 되어 있고 Chemical Abstracts에 따라서 색인(索引)되므로 매주 발행되는 Chemical Abstracts 책자의 뒷 부분이 있는 색인(索引)과 같이 우리에게 가장 친숙(親熟)한 형태(形態)로 되어 있다. Chemical Abstracts가 현재(現在) 사용(使用)하고 있는 데이터 데이스이지만 본고(本稿)에서는 Index와 Condensates를 둘 다 데이터 베이스로 정의(定義)한다. Condensates가 미국(美國)의 Chemical Abstracts Service 기관으로부터 상업적(商業的)으로 이용(利用)할 수 있게 되자 여러 정보(情報)센터에서는 이용자(利用者)들의 프로 파일을 뱃취방식(方式)으로 처리(處理)하여 매주 나오는 자기(磁氣)테이프에서 최신정보(最新情報)를 검색(檢索)하여 제공(提供)하는 서어비스 (SDI)를 시작하였다. 어떤 정보(情報)센터들은 지나간 자기(磁氣)테이프들을 모아서 역시 뱃취방식(方式)으로 소급(遡及) 문헌검색(文獻檢索) 서어비스를 한다. 자기(磁氣)테이프를 직접 취급(取扱)하는 사람들을 제외(除外)하고는 대부분(大部分) Condensates를 아직 잘 모르고 있다. 소급(遡及) 문헌검색(文獻檢索)은 비용이 다소 비싸고 두서없이 이것 저것 문헌(文獻)을 검색(檢索)하는 방법(方法)은 실용적(實用的)이 못된다. 매주 나오는 색인(索引)에 대해서 두 개나 그 이상의 개념(槪念)이나 물질(物質)을 조합(組合)하여 검색(檢索)하는 방법(方法)은 어렵고 실용적(實用的)이 못된다. 오히려 주어진 용어(用語) 아래에 있는 모든 인용어(引用語)들을 보고 초록(抄錄)과의 관련성(關連性)을 결정(決定)하는 것이 때때로 더 쉽다. 상호(相互) 작용(作用)하는 온-라인 검색(檢索)을 위한 Condensates의 유용성(有用性)은 많은 변화를 가져 왔다. 필요(必要)한 문헌(文獻)만을 검색(檢索)해 보는 것이 이제 가능(可能)하고 어떤 항목(項目)에 대해서도 완전(完全)히 색인(索引)할 수 있게 되었다. 뱃취 시스팀으로는 검색(檢索)을 시작해서 그 결과(結果)를 받아 볼 때 까지 수시간(數時間)에서 며칠까지 걸리는 번거로운 시간차(時間差)를 이제는 보통 단 몇 분으로 줄일 수 있다. 그리고 뱃취 시스팀과는 달리 부정확하거나 불충분한 검색방법(檢索方法)은 즉시 고칠 수가 있다. 연속적인 뱃취 형태의 검색방법(檢索方法)에 비해서 순서(順序)없이 온-라인으로 검색(檢索)하는 방법(方法)이 분명(分明)하고 정확(正確)한 장점(長點)이 있다. CA Condensates를 자주 이용(移用)하게 되자 그의 진정한 가치(價値)에, 대해 논의(論義)가 있었다. CA Condensates의 색인방법(索引方法)은 CA Abstract 책자나 우가색인(累加索引)의 방법(方法)보다 확실히 덜 체계적(體系的)이고 철저(徹底)하지 못하다. 더우기 두 데이터 베이스는 중복(重複)것이 많으므로, 중복(重複)해서 검색(檢索)할 가치(價値)가 없는지를 결정(決定)해야 한다. 다른 몇 개의 데이터 베이스와 CA Condensates를 비교(比較)한 논문(論文)들이 여러 번 발표(發表)되어 왔는데 일반적(一般的)으로 CA Condensates는 하위(下位)의 데이터 베이스로 나타났다. Buckley는 Chemical Abstracts의 색인(索引)이 CA Condensates 보다 더 좋은 문헌 (데라마이신의 제법에 관해서)을 제공(提供)한 실례(實例)를 인용(引用)하였다. 죠오지대학(大學)의 Search Center는 CA Condensates가 CA Integrated Subject File 보다 기능(機能)이 못하다는 것을 알았다. CA Condensates의 다른 여러 가지 형태(形態)들을 또한 비교(比較)하였다. Michaels은 CA Condensates를 온-라인으로 검색(檢索)한 것과 매주 나오는 Chemical Abstracts 책자의 색인(索引)은 수작업(手作業)으로 검색(檢索)한 것을 비교(比較)한 논문(論文)을 발표(發表)하였다. 그리고 Prewitt는 온-라인으로 축적(蓄積)한 두 개의 상업용(商業用) CA Condensates를 비교(比較)하였다. Amoco Research Center에서도 CA Condensates와 Chemical Abstracts 색인(索引)의 검색결과(檢索結果)를 비교(比較)하고 CA Condensates의 장점(長點)과 색인(索引)의 장점(長點), 그리고 사실상(事實上) 서로 동등(同等)하다는 실례(實例)를 발견(發見)하였다. 1975년(年) 3월(月), 적어도 4년분(年分)의 CA Condensates와 색인(索引)(Vols 72-79, 1970-1973)을 비교(比較)하였다. 저자(著者)와 일반(一般) 주제(主題) 대한 검색(檢索)은 Vol 80 (Jan-June, 1974)을 사용(使用)하여 비교(比較)하였다. CA Condensates는 보통 세분화(細分化)된 복합물(複合物)을 검색(檢索)하는 데 불편(不便)하다. Buckly가 제시(提示)한 실례(實例)가 그 대표적(代表的)인 예(例)이다. 그러나, 다른 형태(形態)의 검색실예(檢索實例)(단체저자(團?著者), 특허수탁저(特許受託著), 개인저자(個人著者), 일반적(一般的)인/세분화(細分化)된 화합물(化合物) 그리고 반응종류(反應種類)로 실제적(實際的)인 검색(檢索)을 위한 CA Condensates의 이점(利點)을 예시(例示)하였다. 다음 실례(實例)에서 CHEMCON과 CHEM7071은 CA Condensates를 온-라인으로 입력(入力)시킨 것이다.

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