The complete chloroplast genome of Zoysia macrostachya Franch. & Sav. isolated in Korea is 135,902 bp long (GC ratio is 38.4%) and has four subregions; 81,546 bp of large single-copy (36.3%) and 12,586 bp of small single-copy (32.7%) regions are separated by 20,885 bp of inverted repeat (44.1%) regions, including 130 genes (83 protein-coding genes, eight rRNAs, and 39 tRNAs). Thirty-nine single nucleotide polymorphisms and 11 insertions and deletion (INDEL) regions were identified from two Z. macrostachya chloroplast genomes, the smallest among other Zoysia species. Phylogenetic trees show that two Z. macrostachya chloroplast genomes are clustered into a single clade. However, we found some incongruency with regard to the phylogenetic position of the Z. macrostachya clade. Our chloroplast genome provides insights into intraspecific variations and species delimitation issues pertaining to the Zoysia species.
Compactin and pravastatin are competitive cholesterol biosynthesis inhibitors of 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase and belong to the statin drugs; however, the latter shows superior pharmacokinetic characteristics. Previously, we reported that the bacterial P450, CYP105D7, from Streptomyces avermitilis can catalyze the hydroxylation of 1-deoxypentalenic acid, diclofenac, and naringenin. Here, we demonstrate that CYP105D7 could also catalyze compactin hydroxylation in vitro. In the presence of both bacterial and cyanobacterial redox partner systems with an NADPH regeneration system, the reaction produced two hydroxylated products, including pravastatin (hydroxylated at the C6 position). The steady-state kinetic parameters were measured using the redox partners of putidaredoxin and its reductase. The $k_m$ and $k_{cat}$ values for compactin were $39.1{\pm}8.8{\mu}M$ and $1.12{\pm}0.09min^{-1}$, respectively. The $k_{cat}/K_m$ value for compactin ($0.029min^{-1}{\cdot}{\mu}M^{-1}$) was lower than that for diclofenac ($0.114min^{-1}{\cdot}{\mu}M^{-1}$). Spectroscopic analysis showed that CYP105D7 binds to compactin with a $K_d$ value of $17.5{\pm}3.6{\mu}M$. Molecular docking analysis was performed to build a possible binding model of compactin. Comparisons of different substrates with CYP105D7 were conclusively illustrated for the first time.
한국산 제비꽃속 노랑제비꽃절 (Viola section Chamaemelanium) 식물에 대해 광학현미경 및 전자현미경을 사용하여 형태 분류학적 연구를 수행하였다. 지하경과 지상경의 특징, 자방 돌기 그리고 주두의 모양과 돌기 등의 특징에 의해 V. orientalis와 V. brevistipulata가 구별되었다. 나아가 후자는 잎의 특징에 따라 3 변종 즉 var. brevistipulata, var. minor 그리고 var. laciniata 등으로 세분되었다. Viola brevistipulata var. laciniata는 거치 수가 가장 많고, 불규칙한 치상의 복거치를 갖는다. 그러나 다른 두 변종은 규칙적인 파상 또는 치상의 거치를 갖는다. 세 변종간 잎의 크기는 V. brevistipulata var. brevistipulata가 가장 크고 V. brevistipulata var. minor가 가장 작다. 이들 중 V. brevistipulata var. laciniata는 한국 미기록 종이다. 또한 자방과 주두에 발달된 돌기물의 모양 및 배열양상은 본 절내 종을 동정할 때 중요한 표징형질로 확인되었다.
가압 경수로의 노심 설계에 있어서 제한된 우라늄 자원의 효율적인 이용을 위한 다양한 방안으로 장주기 운전, 고연소도 및 저누출 장전 모형 통을 강구하고 있는 추세이다. 이러한 노심들은 원자로 운전 주기 전반에 걸친 공간적 출력 분포 제어와 잉여 반응도 제어를 위해 가연성 독물질을 사용하고 있다. 이와 관련하여 가연성 독물질 관리의 최적화 연구가 다각도로 진행되고 있다. 본 연구에서는 1990년도부터 국내 가압 경수로에 국산 핵연료가 장전되기 시작하면서 가도리니아 독봉을 사용하고 있으며 장차 주된 가연성 독물질로 쓰일 예정이므로 이에 대해서 분석을 수행하였다. 분석 결과 가도리니아 독봉은 열중성자 흡수 단면적이 매우 큰데서 기인한 특이한 연소 특성을 보이고 있다. 특히 집합체 내에서의 가도리니아 독봉의 위치에 따라 매우 다양한 출력 분포를 보이고 있다. 이러한 다양한 출력 분포 중에서 노심의 반경 방향 첨두 출력을 가능한 낮게하는 집합체 내에서의 가도리니아봉 위치 최적 선정을 위한 방법론을 제시하였다.
This study is to offer the raw data for conservation and restoration of national park by surveying and analysing the vascular plants in the Gayasan national park. The flora were summarized as 102 families, 328 genera, 469 species, 4 subspecies, 59 varieties and 9 forms. The endangered plants designated by Ministry of Environment were 2 taxa; Pedicularis hallaisanensis Hurus. and Gymnadenia conopsea for. albiflora Y.N.Lee. The rare plants designated by Korea Forest Service were 13 taxa; Crypsinus hastatus (Thunb.) Copel., Ligusticum tachiroei (Franch. & Sav.) M. Hiroe & Constance, Primula modesta var. fauriae (Franch.) Takeda, Lilium distichum Nakai ex Kamibay and so forth. The korean endemic plants were 15 taxa; Betula ermanii Cham., Carpinus laxiflora (Siebold & Zucc.) Blume, Stewartia pseudocamellia Maxim., Galium koreanum (Nakai) Nakai, Heloniopsis koreana Fuse, N.S. Lee & M.N. Tamura and so forth. The specific plants by floristic region were 66 taxa; Betula chinensis Maxim., Spiraea fritschiana Schneid., Vaccinium hirtum var. koreanum (Nakai) Kitam., Cimicifuga heracleifolia Kom., Adoxa moschatellina L. and so forth. The plants with approval for delivering oversea were 22 taxa; Salix hallaisanensis H.L$\acute{e}$v., Sanguisorba argutidens Nakai, Viola albida Palib., Weigela subsessilis (Nakai) L.H.Bailey and so forth. The naturalized plants were 30 taxa; Chenopodium album L., Lepidium apetalum Willd., Trifolium pratense L., Bidens frondosa L., Helianthus tuberosus L. and so forth.
제주도에서 한국 미기록과인 빌레나무과 (Maesaceae)의 빌레나무 (Maesa japonica)와 십자화과의 꼬마냉이 (Cardamine tanakae)가 채집되었다. 빌레나무과는 Maesa, 1 속으로 구성된 과로서 소화경에 한 쌍의 소포엽이 있으며, 가웅예가 없고, 준자방하위이며, 다수의 종자를 갖는 폐과인 점 등으로 자금우과와 앵초과 식물과 구별된다. 빌레나무는 엽신, 화관 및 소포엽의 형태, 엽연부의 거치의 유무, 화통과 화관열편의 길이의 비율, 과실 표면의 특성 및 색깔에 의해 각각 중국, 대만 및 일본에 분포하는 M. salicifolia와 M. montana var. formosana와 뚜렷하게 구별되었다. 꼬마냉이는 경생엽의 소엽 수 및 정소엽의 크기, 한 화서에 붙는 꽃의 수, 자방 및 열매의 백색 연모의 유무의 특징에 의해 국내 고유종인 벌깨냉이 (C. glechomifolia)와 명백히 구분되었다.
경상북도 울릉군에서 바늘꽃과 바늘꽃속의 신종인 울릉바늘꽃(Epilobium ulleungensis J. M. Chung)을 발견하여 기재 및 도해하였다. 울릉도에 분포하는 바늘꽃속 4분류군(바늘꽃, E. pyrricholophum; 돌바늘꽃, E. amurense subsp. cephalostigma; 큰바늘꽃, E. hirsutum; 울릉바늘꽃, E. ulleungensis)중에서 울릉바늘꽃의 주두는 4각형으로서 곤봉형인 바늘꽃 또는 두상형인 돌바늘꽃과 4개로 깊게 갈라지는 큰바늘꽃의 중간 형태를 보이고 있다. 중요하게도, 울릉바늘꽃은 200 cm 이상의 큰 키와 비스듬히 누운 줄기, 잎의 형태, 식물체 전체의 짧은 밀모, 그리고 꽃의 크기와 진분홍색 또는 붉은 자주색의 꽃 색은 울릉도에 분포하는 다른 3분류군과 명확하게 구별된다. 주두의 형태와 다른 분류학적 형질들에 의해 울릉바늘꽃은 큰바늘꽃과 바늘꽃 또는 돌바늘꽃과의 잡종으로 추정되었다. 신종의 자생지가 울릉도인 점을 고려하여 'ulleungensis'이라 신칭하였다.
Ghimeray, Amal Kumar;Lee, Hyun Woo;Lee, Bo-Duk;Sharma, Pankaja;Shim, Ie Sung;Park, Cheol Ho
한국자원식물학회지
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제27권3호
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pp.263-270
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2014
Loranthus tanakae (Franch. & Sav.) is an endangered species of mistletoe, distributed in Korean peninsula. The objective of our research is to determine the effect of storage duration and conditions [air flow (AF) and air tight (AT)] at different temperatures for survivability and germination of mistletoe seeds, and also to monitor the effect of seed scarification on germination in vitro. The result revealed that the seeds stored in natural conditions (no stratification) showed highest survival rate of 100% and retained up to 93.3% even after two months of storage in natural conditions and showed higher germination percentage (90%) compare to after ripened seeds. However, the seed stored at $0^{\circ}C$ decreased the germination percentage (ranged from 63 to 73%). Therefore, it can be confirmed that mistletoe does not need after ripened treatment to promote germination. Our research also showed that the storage of L. tanaka seeds in freezing temperatures of $-20^{\circ}C$ and in room temperature for long time either in AT or AF conditions caused the loss of survival and germination rate. On the other hand, the chemical scarification (0.01N HCl incubation for 12 hrs. at $38^{\circ}C$) method was proven more effective to enhance germination percentage of L. tanakae. Regarding the temperature regime, $22^{\circ}C$ showed early germination of mistletoe seeds in vitro.
This study is carried out to survey and analyse the vascular plants distributed around the Jusan Reservoir, Juwangsan national park. The results are as follows. The numbers of vascular plants were 377 taxa; 85 families, 253 genera, 332 species, 3 subspecies, 37 varieties and 5 forma. The endangered plants designated by Ministry of Environment were 2 taxa; Berchemia berchemiaefolia (Makino) Koidz. and Iris odaesanensis Y.N.Lee. The rare plants designated by Korea Forest Service were 6 taxa; Eranthis stellata Maxim., Aristolochia contorta Bunge, Aristolochia manshuriensis Kom., Berchemia berchemiaefolia (Makino) Koidz., Scopolia japonica Maxim. and Iris odaesanensis Y.N.Lee. The endemic plants were 4 taxa; Carpinus laxiflora (Siebold & Zucc.) Blume, Pseudostellaria coreana (Nakai) Ohwi, Philadelphus schrenkii Rupr. and Weigela subsessilis (Nakai) L.H.Bailey. The specific plants by floristic region were 38 taxa; Juglans mandshurica Maxim., Salix chaenomeloides Kimura, Hylomecon vernalis Maxim., Lonicera praeflorens Batalin, Erythronium japonicum (Baker) Decne., Potentilla dickinsii Franch. & Sav., Celtis aurantiaca Nakai, Anemone reflexa Steph. & Willd., Cimicifuga heracleifolia Kom. and so forth. The naturalized plants were 20 taxa; Fallopia dumetorum (L.) Holub, Chenopoidum album L., Lepidium apetalum Willd., Veronica persica Poir., Conyza canadensis (L.) Cronquist, Taraxacum officinale Weber and so forth.
Streptomyces avermitilis produces clinically useful drugs such as avermectins and oligomycins. Its genome contains approximately 33 cytochrome P450 genes and they seem to play important roles in the biosynthesis of many secondary metabolites. The SAV_7130 gene from S. avermitilis encodes CYP158A3. The amino acid sequence of this enzyme has high similarity with that of CYP158A2, a biflaviolin synthase from S. coelicolor A3(2). Recombinant S. avermitilis CYP158A3 was heterologously expressed and purified. It exhibited the typical P450 Soret peak at 447 nm in the reduced CO-bound form. Type I binding spectral changes were observed when CYP158A3 was titrated with myristic acid; however, no oxidative product was formed. An analog of flaviolin, 2-hydroxynaphthoquinone (2-OH NQ) displayed similar type I binding upon titration with purified CYP158A3. It underwent an enzymatic reaction forming dimerized product. A homology model of CYP158A3 was superimposed with the structure of CYP158A2, and the majority of structural elements aligned. These results suggest that CYP158A3 might be an orthologue of biflaviolin synthase, catalyzing C-C coupling reactions during pigment biosynthesis in S. avermitilis.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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