Species of the genus Orobanche are parasitic flowering plants, holoparasites, which cling to the roots of green plants. Their tiny seeds (200 x $250\mu\textrm{m}$) germinate in response to chemical stimuli produced by host and some non-host plants. Successful contact with their host leads to development of haustoria for obtaining water and food. The shoots above the ground expose flowers and disseminate seeds. Several samples of Orobanche ramosa, O. crenata, O. cernua, and O. egyptiaca were collected from different localities in Jordan. These samples showed one of the following disease symptoms: dry rot at the base of the stem; general deterioration and expanded lesion from base upward; soft tissue maceration of stem; and black rot of flower parts with incomplete maturation of the ovary and seeds. Isolation from diseased stems and seeds was made on three different mycological media. Several fungi were isolated, mainly, Fusarium spp., Alternaria alternata, Rhizoctonia sp., Dendrophora sp., Chaetomium sp., and an ascomycetus fungus with a perithecium. Pathogenicity tests showed that Fusarium spp. and Alternaria alternata attacked healthy living tissue of Orobanche spikes. These fungi caused lesions of black soft rot and complete deterioration within 5-7 days. They also attacked Orobanche seeds, arresting their germination and causing maceration of non-germinated and germinated seeds after 5-7 days of incubation. Meanwhile, Dendrophora sp. and Chaetomium sp. caused limited lesion at first, but were able to colonize the tissue as it aged and senesced. This study showed the presence of a potential endogenous pathogenic fungi in Jordan, which can be investigated as a biological control for Orobanche.
Plasmodiophora brassicae is an obligate parasite, a causal organism of clubroot disease in crucifers that can survive in the soil as resting spores for many years. P. brassicae causes great losses in susceptible varieties of crucifers throughout the world. In this present study, an in planta molecular marker for the detection of P. bassicae was developed using an oligonucleotide primer set foam the small subunit gene (18S like) and internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA. The specific primer sequences determined were TCAGCTTGAATGCTAATGTG (ITS5) and CTACCTCATTTGAGATCCTTTGA (PB-2). This primer set was used to specifically detect p. bassicae in planta. The amplicon using the specific primer set was about 1,000 bp. However, the test plant and other soil-borne fungi including Fusarium spp. and Rhizoctonia app., as well as bacteria such as Pseudomonas app. and Erwinia sup. did not show any reaction with the primer set.
The objective was to examine the antifungal activity of Pinus densiflora extract for the control of turfgrass fungal diseases. Antifungal activities of the various fractions of n-hexane, methylene chloride (Ch), ethyl acetate (EtOAc), and n-butanol from P. densiflora were evaluated against Rhizoctonia solani AG1-1B, R. solani AG2-2IV, Sclerotinia homoeocarpa, R. cerealis, Pythium spp., and Colletotrichum graminicola. The Ch and EtOAc fractions showed antifungal activity against Pythium sp. and C. graminicola in paper disc assay. The effective concentration to produce 50% mycelial inhibition ($EC_{50}$) using five discriminatory concentrations of pinosylvin (1) from the Ch fraction of P. densiflora was evaluated on R. solani AG1-1B, R. solani AG2-2IV, R. cerealis, and S. homoeocarpa. S. homoeocarpa showed the highest sensitivity with the lowest mean $EC_{50}$ value ($8.426{\mu}g/mL$) among the four pathogens. Among the three Rhizoctonia pathogens, R. cerealis had the highest mean $EC_{50}$ value ($99.832{\mu}g/mL$) and R. solani AG2-2IV, with the lowest sensitivity, had the lowest $EC_{50}$ value ($39.696{\mu}g/mL$). These results suggested that pinosylvin (1) from P. densiflora could be a valuable lead compound in the improvement of a novel antifungal agent.
본 연구에서 우리나라 미곡종합처리장의 가공단계별 7종의 쌀 시료에 대한 곰팡이 오염 정도를 조사하였다. 곰팡이독소를 생산하는 곰팡이인 Aspergillus spp., Fusarium spp., Penicillium spp., Alternaria spp.가 우점하고 있었고, 포장곰팡이인 Fusarium과 Alternaria는 남부지방에 저장곰팡이인 Aspergillus와 Penicillium는 중부지방에 오염이 많았다. 또한 원료벼에서 가공단계가 진전될수록 Fusarium과 Alternaria와 같은 포장곰팡이의 오염 정도는 낮아졌으나 심하게 오염된 전라도 시료에서는 크게 낮아지지 않는 경향을 보였다. Aspergillus와 Penicillium과 같은 저장 곰팡이의 오염 정도는 가공단계가 진전될수록 높은 경향을 보였다. 또한 7종의 쌀 시료에는 총 35종의 곰팡이 속(genus)이 오염되어 있었으며 이 중 Myrothecium spp.는 우리나라 쌀 시료에서 처음으로 검출되었다. 이러한 결과는 우리나라의 주식인 쌀의 수확 후 저장, 가공과정의 곰팡이독소의 오염을 종합적으로 관리하기 위한 기초 자료가 될 것이다.
전국에서 분리한 세균으로부터 항균력이 있는 길항세균들을 먼저 분리한 다음 그중 배양배지 속으로 강력한 항균력을 나타내는 peptide를 분비하는 A405균주를 선발, Biolog System 및 rDNA 염기서열을 이용하여 Bacillus subtilis로 동정하고 이 균주가 생성하는 항균 peptide의 항균력을 조사한 바 Botrytis cinerea, Cercospora sp., Fusarium oxysporum, Penicillium digitatum, Celletotrichum gloeosporioides, Rhizoctonia solani, Pythium ultimum, Pyricularia oryzae등의 식물병원균과 Escherichia coli, Pseudomonas spp. 등의 세균 및 효모인 Candida albicans의 성장도 억제하는 강력한 항균력을 보였다. 또한 이 균주가 생산하는 항균 peptide는 알콜, 아세톤과 같은 유기용매에 내성을 가지고 있었으며 proteinase K와 phenol 처리시에는 항균력이 감소되거나 소실되는 특성을 가지고 있었다. 이 항균 peptide를 SDS-PAGE, Native-PAGE 및 Tris-Tricine 전기영동으로 분자량이 3kDa인 작은 peptide임을 확인하였고 aspartic acid, glycine, serine, glutamine, valine, leucine, isoleucine, proline, tyrocine 등의 9가지 아미노산으로 구성되어 있음을 Amino Acid Analyzer로 확인하였으며 냉동건조한 항균 peptide 50 ug/ml을 체리토마토에 처리하여 과일의 선도유지를 조사한 결과 대조구에 비하여 월등한 선도유지 효과가 있음을 입증하였다.
서양금혼초의 군락 형성에 따른 경쟁적 우세원인을 규명하고 친환경농자재 개발을 위한 기초자료로 제공하고자 생육특성과 Allelopathy 효과를 알아보았다. 서양금혼초의 생육특성은 예초지역과 비예초지역간의 묘조(苗條) 수, 지상부 직경과 화주 수를 비교한 결과 예초지역의 묘조(苗條) 수, 지상부의 직경과 화주수가 비예초지역보다 높은 것으로 조사되었고, 서양금혼초의 수용성 추출액에 대한 레드클로버(Trifolium pratense), 들묵새(Festuca myuros), 도깨비바늘(Bidens bipinnata) 등 실험식물 14종 대해 발아와 생장 실험 결과 일반적으로 수용성 추출액의 농도가 증가함에 따라 검정식물의 발아율, 유식물의 뿌리털, shoot, root의 생장이 억제되었고 검정식물의 종류와 부위에 따라 억제정도에 있어서 차이를 보였다. 또한 서양금혼초의 수용성 추출액에 대한 실험곰팡이의 생장에 있어서는 Pythium속, Phytophthora속은 수용성 추출액의 농도가 높아짐에 따라 성장이 억제되는 경향을 보인 반면, Rhizoctonia속인 경우에는 농도가 높아짐에 따라 생장억제 현상이 뚜렷하지 않았다. 이와 같은 결과를 종합하여 보면 서양금혼초의 예초는 서양금혼초의 Split현상을 유도하여 더 많은 영양번식과 종자번식을 일으켜 군락을 형성하고, 서양금혼초에 함유된 allelochemicals에 의해 타 식물체의 발아와 생장, 미생물의 생장 등에 관여하기 때문에 제주도내 생태계에서 경쟁적 우위를 점하고 있으며, 친환경농자재로서의 활용 가능성이 있는 것으로 판단되었다.
답전윤환토양(畓田輪換土壤)에서 작부형태(作付形態)를 달리하여 작물을 재배했을 때 토양미생물상(土壤微生物相)의 경시적변화(輕時的變化)와 토양화학성분(土壤化學成分)과의 관계를 조사한 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 작물재배 기간 중 미생물상의 변화는 휴한지(休閑地)와 수도 및 대두 연속재배지(連續栽培地)에서 세균과 방선균수는 5월부터 8월까지 현저한 증가를 보였으나 사상균수는 감소되었다. 2. 대두연속재배구에서 Gram 음성균(陰性菌)인 Pseudomonas- 및 Rhzobium속 세균수가 그리고 Gram 양성균(陽性菌)인 Bacillus subtilis의 증가를 보였으며, 휴한지(休閑地)에서는 Agrobacterium속 세균수의 증가를 보였다. 3. 감자 및 배추 연속(連續) 재배구(栽培區)에서 Fusarium-, Rhizoctonia-, Phoma속의 토양(土壤) 병원성(病源性) 사상균(絲狀菌) 수(數)가 증가되었으며, 특히 전(全) 사상균(絲狀菌) 수(數)에 대한 토양(土壤) 병원성(病源性) 사상균(絲狀菌)의 비율이 현저히 증가되었다. 4. 토양(土壤) 미생물(微生物) 분석(分布) 중 세균 및 방선균 수는 토양 양이온 중(Ca+Mg)/K 비율과 정(正)의 상관관계(相關關係)를 그리고 사상균(絲狀菌) 수(數)와의 부(負)의 상관관계(相關關係)를 보였다.
남부지방(南部地方)에 재배(栽培)되는 고추, 오이, 배추, 딸기 등(等)의 근권토양(根圈土壤)에서 분리(分離), 선발(選拔)된 길항미생물(拮抗微生物)을 이용(利用)하여 Rhizoctonia병(病)의 생물적(生物的) 방제(防除)를 검토(檢討)한 결과(結果)는 다음과 같다. 근권토양(根圈土壤)에서 분리(分離), 선발(選拔)된 길항균(拮抗菌)은 Trichoderma viride, T. harzianum, T. hamatum, T. polysporum, Gliocladium sp., Pseudomonas fluorescens, P. stutzeri, P. cepacia, Enterobacter sp., Serratia sp., Erwinia herbicola 등(等)으로 동정(同定)되었고, in vitro에서 우수(優秀)한 길항균(措抗菌)은 T. viride, T. harzianum, Gliocladium sp., P. stutzeri, P. cepacia, Serratia sp. 등(等)이었다. In vivo에서의 길항효과(拮抗效果)는 기주(寄主)와 균주(菌株)에 따라 다소 차이(差異)가 있었고, 살균토(殺菌土)에서 비살균토(非殺菌土)보다 길항효과(拮抗效果)가 더 좋은 경향(傾向)을 보였다. 재선발(再選拔)된 6가지 길항균(拮抗菌)을 토양내(土壤內)에 접종(接種)($10^6cfu/g\;soil$) 했을 때, 길항효과(拮抗效果)가 가장 우수(優秀)한 것은 T. viride 이었다. 병원성(病原性)이 가장 강(强)한 오이 뿌리에서 분리(分離)된 균주(菌株)(AG 1)를 오이, 배추, 무우등(等)에 처리(處理)하여 길항균(拮抗菌)을 접종(接種)하였을 때는, 병원성(病原性)이 강(强)하여 길항효과(拮抗效果)가 약(弱)한 경향(傾向)(40%)이었으나, 고추(AG 1), 고추(AG 2-1), 수도(AG 1)에서 분리(分離)된 균주(菌株)에 대해서는 전반적(全般的)으로 무처리(無處理)에 비해 각각(各各) 70% 정도의 발병(發病) 억제효과(抑制效果)가 있었다.
International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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제31권2호
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pp.107-114
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2015
Endophytes provide multifarious benefits such as promotion of plant growth and yield, suppression of phyto-pathogens, phosphate solubilising and fixation nitrogen. A study has been carried out to explore growth promotion and antifungal activities of endophytes of mulberry (Morus spp.). Endophytic bacteria were isolated from mulberry plants and studied their cultural, morphological characters, growth promotion as well as their antifungal activity against Rhizoctonia bataticola and Fusarium oxysporum , two mulberry root rot associated pathogens. Except two isolates, all bacteria were colourless and the colony size of eight isolates was small. The margin of five isolates was irregular and the consistency of three isolates was creamy, six isolates was slimy and one was mucoid. Texture of seven isolates was convex and others were flat. Eight isolates were gram positive and the rest Gram negative, five were cocci and others were bacilli (rod shaped). Four isolates were motile and all were catalase positive and only three isolates were oxidase positive. Spore staining was positive only for two isolates. The growth promotion study showed that there was significant difference in root length and seedling length. The antagonistic effect of the bacterial isolates was tested against R. bataticola showed significant (p <0.05) influence of the bacteria, days after inoculation and their interaction on the inhibition of fungal growth. The isolate En-7 completely inhibited the fungus followed by En-5 (66.67%). The bacterial isolates significantly (p <0.05) inhibited growth of F. oxysporum in PDA. The mean inhibition was higher (70.45%) in case of En-7 followed by En-8 (68.65%) and En-10 (66.44%). The study reveals that some endophytic bacteria associated with mulberry have growth promotion and antifungal activity and could be explored for promotion of mulberry growth and managing root rot disease.
BACKGROUND: Some microorganisms extant in nature have ability to suppress various plant pathogens, and also can promote plant growth. Thus microorganisms are such great source of antimicrobial agents to develop antagonistic microorganism production and eco-friendly crop management. We isolated the microorganisms in various eco-friendly formulations. The suppressive abilities against plant pathogens have been characterized in vitro level. METHODS AND RESULTS: The indigenous microorganisms have been isolated from Cooked rice, Black sugar, Rice Bran, and Red clay using dilution plating method. Population of bacteria and fungi were above 107 in the all formulations. We isolated and pure cultured the microorganisms based on morphological characteristics. Three major plant pathogens (Fusarium oxysporum, Rhizoctonia solani, Phytophthora capsici) have been used to select antagonistic microorganisms. Total 20 bacteria and 9 fungi showed the pathogen growth suppression ability in vitro condition. The selected microorganisms were identified by ITS sequence similarity. CONCLUSION: All tested eco-friendly formulations contained high-density of the microorganisms. Among the isolated microorganisms, Bacillus spp. and Streptomyces spp. showed the most effective antifungal activity against the plant pathogens such as F. oxysporum, R. solani, and P. capsici. Among the selected fungi Trichoderma sp. demonstrated antifungal activity. Our results suggest that the currently adapted eco-friendly formulations might useful for sustain agricultural system.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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