• 한국식물병리학회지
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• 제12권2호
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• pp.191-196
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• 1996

위축, 황화, 총생 증상 등 전형적인 병징을 나타내는 phytoplasma에 감염된 식물에서 phytoplasma만을 특이적으로 검출하기 위하여 polymerase chain reaction(PCR) 방법을 이용하였다. Phytoplasma의 16S rRNA gence의 DNA 단편을 증폭하기 위하여 1.4 kb primers (forward, 5` -GTTGATCCTGGCTCAGGATT-3` 와 reverse, 5` -AACCCCGAGAACGTATTCACC -3`)를 사용하여 증폭한 결과, phytoplasma에 이병된 오동나무, 라일락 및 미역취에서는 약 1.4 kbp의 위치에서 특이 band가 검출되었으나 control로 사용한 건전주에서는 어떠한 band 검출되지 않았다. 위의 결과를 재확인 하기 위하여 약 0.5 kb의 primers(forward, 5` -ACGAAAGCGTGGGGAGCAAA-3` 와 reverse, 5` -GAAGTCGAGTTGCAGACTTC-3`)를 사용하여 증폭한 결과, 0.5 kb의 위치에서 특이 band가 검출되었으나 control로 사용한 건전주에서는 어떠한 band도 검출되지 않았다. Phytoplasma에 이병된 식물의 PCR 반응산물을 제한효소인 AluI으로 처리하 sruf과, 오동나무와 라일락에서는 동일한 band pattern을 나타내어 서로 유연관계가 가까운 phytoplasma인 것으로 생각되며, 미역취에서는 이들과는 다른 band pattern을 나타내어 오동나무와 라일락의 phytoplasma와는 유연관계가 먼 것으로 추측된다.

• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 2001년도 Proceedings of 2001 International Symposium
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• pp.179-182
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• 2001

Two intracellular enzymes, cellobiose phosphorylase (CBP) and cellodextrin phosphorylase (CDP) are involved in the phosphorolytic pathway in cellulose degradation. Those enzymes are considered to be useful in syntheses of oligosaccharides because the reactions are reversible. CBP from Cellvibrio gilvus and CDP from Clostridium thermocellum YM-4 were cloned and over-expressed in Escharichia coli. Both the enzyme reactions showed ordered bi bi mechanism. Acceptor specificity of CBP in the reverse reaction was determined. Several $\beta$-l,4-glucosyl disaccharides were synthesized by using the reaction. A new substrate inhibition pattern, competitive substrate inhibition, was also found in the reverse reaction of CBP Cellobiose was produced from sucrose at a high yield by a combined action of three enzymes including CBP

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제24권1호
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• pp.86-90
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• 2003

Reverse-Water-Gas-Shift reaction (RWGSR) was carried out over the ZnO, $Al_2O_3,\;and\;ZnO/Al_2O_3$ catalysts at the temperature range from 400 to 700 ℃. The ZnO showed good specific reaction activity but this catalyst was deactivated. All the catalysts except the $ZnO/Al_2O_3$ catalyst (850 ℃) showed low stability for the RWGSR and was deactivated at the reaction temperature of 600 ℃. The $ZnO/Al_2O_3$ catalyst calcined at 850 ℃ was stable during 210 hrs under the reaction conditions of 600 ℃ and 150,000 GHSV, showing CO selectivity of 100% even at the pressure of 5 atm. The high stability of the $ZnO/Al_2O_3$ catalyst (850 ℃) was attributed to the prevention of ZnO reduction by the formation of $ZnAl_2O_4$ spinel structure. The spinel structure of $ZnAl_2O_4$ phase in the $ZnO/Al_2O_3$ catalyst calcined at 850 ℃ was confirmed by XRD and electron diffraction.

• Genomics & Informatics
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• 제20권4호
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• pp.46.1-46.7
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• 2022

Influenza A virus (IAV) is the most widespread pathogen causing human respiratory infections. Although polymerase chain reaction (PCR)-based methods are currently the most commonly used tools for IAV detection, PCR is not ideal for point-of-care testing. In this study, we aimed to develop a more rapid and sensitive method than PCR-based tools to detect IAV using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) technology. We designed reverse-transcriptional (RT)-LAMP primers targeting the hemagglutinin gene. RNAs from reference H1N1 and H3N2 showed specific RT-LAMP signals with the designed primers. We optimized the reaction conditions and developed universal reaction conditions for both LAMP assays. Under these conditions, the detection limit was 50 copies for both RT-LAMP assays. There was no non-specific signal to 19 non-IAV respiratory viruses, such as influenza B virus, coronaviruses, and respiratory syncytial viruses. Regarding the reaction time, a positive signal was detected within 25 min after starting the reaction. In conclusion, our RT-LAMP assay has high sensitivity and specificity for the detection of the H1 and H3 subtypes, making it suitable for point-of-care IAV testing.

• BMB Reports
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• 제35권2호
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• pp.248-250
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• 2002

Discrimination between the amplification of mRNA and contaminating genomic DNA is a common problem when performing a reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Even after treatment of the samples with DNAse, it is possible that negative controls (samples in which no reverse transcriptase was added) will give positive results. This indicates that there was amplification of DNA, which was not generated during the reverse transcriptase step. The possibility exists that Taq DNA polymerase acts as a reverse transcriptase, generating cDNA from RNA during the PCR step. In order to test this hypothesis, we incubated samples with a DNAse-free RNAse after the cDNA synthesis. Comparison of the results that were obtained from these samples (incubated with or without DNAse-free RNAse) confirms that the reverse transcriptase activity of Taq DNA polymerase I is a possible source of false positive results when performing RT-PCR from intronless genes. Moreover, we describe here a simple and rapid method to overcome the false positive results that originate by this activity of Taq polymerase.

• 대한화학회지
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• 제50권3호
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• pp.247-255
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• 2006

이 연구의 목적은 고등학생들의 화학반응속도 개념과 화학평형 개념을 조사하여 이들간의 상관관계를 알아보고자 하는 것이었다. 연구대상은 경기도 K시 소재의 인문계 고등학교 자연계열 3학년 학생 120명이었다. 이 연구를 위하여 화학반응속도와 화학평형에 관한 학습내용에서 서로 관련이 있는 것들을 선정하여 개념 검사지를 개발하였고, 문항별 응답 내용을 분석하였다. 연구결과, 화학반응속도에 관한 객관식 문항에 대한 정답률은 높게 나타났으나, 응답 이유를 묻는 문항에 대한 정답률은 상대적으로 낮아서 화학반응속도에 대한 과학적 개념 형성이 잘 되어 있지 않음을 알 수 있었다. 대부분의 고등학생들은 정반응 속도에 관한 문항의 정답률은 높았으나 역반응 속도에 관한 문항의 정답률은 낮았다. 화학평형에 관한 개념의 형성 정도에 있어서는 한쪽 반응만 생각해도 이해할 수 있는 평형개념에 대한 정답률은 높게 나타났으나 정반응과 역반응을 동시에 생각해야 하는 문항에 대한 정답률은 낮게 나타났다. 고등학생들의 화학반응속도 개념과 화학평형 개념간의 상관관계에서 전체적인 상관관계가 다소 높은 것으로 나타났다. 특히, 역반응에 관한 화학반응속도 개념이 부족한 고등학생들은 화학평형이 동적 평형 상태라는 것을 잘 이해하지 못하는 것으로 나타났으며, 화학반응 메커니즘을 충돌론으로 잘 이해하지 못하는 고등학생들은 농도와 촉매가 화학평형 이동에 미치는 영향에 대한 이해도 부족한 것으로 나타났다. 그리고 농도와 촉매에 관련된 화학반응 개념과 화학평형 개념간에 상관관계가 있으나 낮은 것으로 나타났다. 따라서 화학평형의 선개념으로 중요한 부분인 화학반응속도에 관한 과학적 개념형성이 화학평형에 대한 오개념을 줄일 수 있는 방안이 될 수 있다. 그리고 한쪽 반응에만 국한된 화학반응속도에 관한 교수-학습 방법은 동적 평형과 관련된 화학평형 개념 형성에 어려움을 초래하므로, 화학반응속도론에 근거하여 정반응과 역반응을 모두 언급할 수 있도록 하는 교수-학습 방법을 개발하여 학습지도하는 것이 화학평형 개념 형성에 효과적일 것이다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제12권8호
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• pp.3517-3522
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• 2011

수인성 병원성 미생물에 의한 공중목욕탕의 오염은 질병발생의 원인이 된다. 본 연구에서는 공중목욕탕내에 존재하는 수인성 병원성미생물들을 확인하고자 하였다. 서울지역내의 30 곳 공중목욕탕에서 욕조수 시료를 채수하여 진행하였다. 수인성 병원성미생물의 검출은 0.45 ${\mu}m$의 여과막을 이용하여 전통적인 배양방법으로 분리 및 동정하였다. 분자생물학적 기법을 사용하기 위해 미생물학적인 배양을 하지 않고 핵산을 추출하여 16S rRNA유전자를 표적으로 polymerase chain reaction-reverse blot hybridization (PCR-REBA)을 실시하였다. 미생물학적 배양방법에서는 지표세균인 Escherichia coli와 Shigella spp.가 검출되었으며, 분자생물학적 기법인 PCR-REBA을 수행한 결과 E. coli, Shigella spp., Salmonella spp., Pseudomonas spp., Mycobacterium spp. 등의 수인성 병원성미생물이 7곳에서 검출되었다. 본 연구결과를 토대로 공중목욕탕의 욕조수내에 수인성병원성미생물에 의한 감염을 줄이기 위해 적절한 위생관리과 E. coli를 포함한 유해미생물을 선정하여 지속적인 모니터링이 필요할 것으로 사료된다.

• 한국식품과학회지
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• 제24권2호
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• pp.111-116
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• 1992

역마이셀-효소반응계에서 팜유와 스테아르산으로부터 Rhizopus arrhizus 리파제의 에스테르교환 반응에 의한 코코아 버터 대용지 생산을 위한 연구를 실시하였다. HPLC를 이용하여 각 트리글리세리드의 정성 및 정량분석을 행하였다. 트리올레인과 스테아르산의 모델반응에서 Aerosol OT에 대한 물의 몰비율을 변화시켰을 때 그 비가 10일 때, 30mM 트리올레인에 대하여 3배의 스테아르산을 첨가했을 때 최대의 전환율을 보였다. 또 pH는 7.5, 온도는 $50^{\circ}C$에서 최대의 전환율을 보였다. 팜유와 스테아르산을 기질로 이용하였을 때는 팜유내의 POP, POO, SOO가 줄어든 반면 POS와 SOS가 생성, 증가되는 경향을 보였다. 본 연구에서 얻은 코코아 대용지의 POP. POS, SOS 등 트리글리세리드 조성은 시판되는 코코아 대용지보다 천연코코아 버터의 조성과 더욱 유사하였다.

• 한국동물위생학회지
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• 제39권2호
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• pp.107-116
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• 2016

In the study, we developed and evaluated a uracil N-glycosylase (UNG)-supplemented single-tube nested reverse transcription-polymerase chain reaction (UsnRT-PCR) assay that can carried out first-round RT-PCR and second-round nested PCR in a reaction tube without reaction tube opening and can simultaneously detect EU- and NA-PRRSV. The UsnRT-PCR confirmed to have a preventing ability of mis-amplification by contamination of pre-amplified PRRSV DNA from previous UsnRT-PCR. Primer specificities were evaluated with RNAs extracted from 8 viral strains and our results revealed that the primers had a high specificity for both genotypes of PRRSV. The sensitivity of the UsnRT-PCR was 0.1 $TCID_{50}$/0.1 mL for EU- or NA-PRRSV, respectively, which is comparable to that of previously reported real time RT-PCR (RRT-PCR). Clinical evaluation on 110 field samples (60 sera and 50 lung tissues) by the UsnRT-PCR and the RRT-PCR showed that detection rates of the UsnRT-PCR was 70% (77/110), and was relatively higher than that of the RRT-PCR (69.1%, 76/110). The percent positive or negative agreement of the UsnRT-PCR compared to RRT-PCR was 96.1% (73/76) or 90.9% (30/33), showing that the test results of both assays may be different for some clinical samples. Therefore, it is recommend that diagnostic laboratory workers use the two diagnostic assays for the correct diagnosis for the relevant samples in the swine disease diagnostic laboratories. In conclusion, the UsnRT-PCR assay can be applied for the rapid, and reliable diagnosis of PRRSV without concerns about preamplified DNA carryover contamination that can occurred in PCR process in the swine disease diagnostic laboratories.

• 한국식품과학회지
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• 제32권2호
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• pp.454-460
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• 2000

지용성 물질은 물에 용해되지 않아 수용액 효소반응계에서의 특정효과를 평가하기가 어렵다. 생체내에서 멜라닌을 합성하는 효소인 tyrosinase의 지용성 저해제를 탐색하고자 유기용매, 계면활성제 및 물로 구성된 광학적으로 투명한 RM을 도입하였다. Tyrosinase의 겉보기 반응이 물에서와 유사한 RM의 형성조건 중 유기용매는 isooctane, 계면활성제는 100 mM의 dioctyl sulfosuccinate(AOT)가 적절하였다. RM에서 물과 AOT의 몰 농도 비율이 15일 때 tyrosinase(103.5 units)는 기질인 3,4-dihydroxy-L-phenylalanine(0.18 mM)에 대하여 수용액에서와 유사한 거동을 나타내었다. 또한 tyrosinase 저해제인 cinnamic acid 존재 하에서도 tyrosinase 촉매 반응의 반응 생성물이 반응 시간에 비례하여 형성됨이 확인되어 지용성 물질도 RM에서는 tyrosinase 저해활성이 가능함을 시사하였다. 따라서 RM은 수용성인 효소와 기질 그리고 지용성인 저해제를 모두 하나의 상(phase)에 용해시킬 수 있어 지용성 물질의 tyrosinase 저해 효과를 분석할 수 있는 중요한 수단으로 활용할 수 있을 것으로 판단되었다.