• 대한수의학회지
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• 제63권2호
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• pp.16.1-16.6
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• 2023

Salmonella spp. are pathogens involved in most salmonellosis in rabbits. This study examined Salmonella disease in rabbits raised in Thua Thien Hue, Vietnam. Two hundred and 56 rectal swabs of rabbits were taken, and a carrier rate of 33.98% was found. In addition, all the isolated Salmonella spp. strains were 100% motile; positive for H₂S, catalase, Voges Proskauer, coagulase, citrate, maltose, and dextrose; and negative for indole, methyl red, urease, oxidase, sucrose, and lactose. The Kirby-Bauer method showed that these Salmonella strains were susceptible to doxycycline (93.2%), tetracycline (84.1%), and levofloxacin (65.9%). On the other hand, they were highly resistant to streptomycin (95.5%), ampicillin (93.2%), colistin (40.9%), and gentamicin (34.1%). Furthermore, polymerase chain reaction used to screen for virulence and specific genes of Salmonella strains showed that all Salmonella strains isolated carried InvA, fimA, and Stn.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제7권2호
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• pp.137-142
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• 2004

목적: 우리 나라 소아에 감염된 H. pylori에서 PCR RFLP를 이용하여 clarithromycin 내성의 원인으로 알려진 23S rRNA의 돌연변이를 찾아내고, cagA, vacA 유전형과 clarithromycin 내성 돌연변이 사이에 연관이 있는지 알아보고자 하였다. 방법: 서울대학교병원 소아과에서 위내시경검사를 통해 H. pylori 위염으로 진단 받은 환아 27명의 내시경 생검 조직에서 H. pylori cagA, vacA 유전자를 증폭하여 유전형을 조사하였다. H. pylori의 23 rRNA V domain을 조사하기 위해 증폭한 후, PCR 산물은 BsaI과 MboII 제한효소로 처리하여 PCR RFLP를 이용하여 돌연변이 여부를 판정하였다. 결과: A2143G 돌연변이가 1명에서, A2144G 돌연변이가 4명에서 발견되어 18.5%가 clarithromycin 내성으로 관찰되었다. cagA 양성이 25명(93%)이었고, vacA s1a/m1이 6명(22%), s1a/m2가 3명(11%), s1c/m1이 16명(59%), s1c/m2가 1명(4%)이었다. clarithromycin 내성 돌연변이를 보이는 경우는 모두 cagA 양성이었고 s1a/m1이 2명, s1c/m1이 2명으로 특정 유전형이 clarithromycin 내성 돌연변이와 연관성을 보이지 않았다. 결론: 위점막 조직에서 PCR-RFLP를 이용한 H. pylori의 clarithromycin 내성 검사는 항생제를 선택하는데 유용하다고 생각된다. Clarithromycin 내성 돌연변이는 cagA, vacA 유전형과 연관성이 없었다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제48권2호
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• pp.94-101
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• 2016

Acinetobacter species는 중요한 기회감염균으로 빈번하게 원내감염을 일으킨다. 뿐만 아니라 다제내성을 보이는 경우가 많아 치료를 위한 항균제 선택이 매우 제한적이다. 본 연구에서는 Acinetobacter species 68균주를 대상으로 하여 다양한 carbapenemase 유전자를 조사했다. 디스크확산법으로 항균제 감수성 양상을 조사했으며 다중 중합효소연쇄반응을 통해 carbapenemase 유전자를 포함하고 있는 균주를 선별하였고 PCR과 염기서열분석을 통해 최종적으로 carbapenemase 유전형을 확인했다. 한편 REP-PCR 방법으로 균주간의 clonality를 분석했다. 본 연구에서 A. baumannii 균주는 분석된 모든 항균제에 대해 높은 내성을 나타냈으나 non-A. baumannii 균주는 분석된 항균제 중 aztreonam과 cefotaxime을 제외한 항균제에 모두 감수성을 보였다. A. baumannii 51 균주는 $bla_{OXA-51}$ 유전자를 가지고 있었으며 그 중 37(72.5%)균주는 $bla_{OXA-23}$ 유전자도 동시에 가지고 있었다. 본 연구에서 39 균주의 다제내성 A. baumannii 가 분리되었는데 그 중 37균주가 $bla_{OXA-23}$ 유전자를 가지고 있었다. $bla_{OXA-23}$ 유전자를 포함하고 있는 균주들은 I (n=22) 형 또는 II (n=15) 형의 REP-PCR band 패턴을 보였는데 이는 대전에 위치한 일개의 대학병원에 $bla_{OXA-23}$ 유전자를 포함하고 있는 다제내성 균주들이 수평 확산 되어 있음을 의미한다. 다제내성 A. baumannii 균주에 의한 감염 및 집락화를 막기 위해서는 지속적으로 내성을 유발하는 인자를 조사하고 MDR균주의 출현 및 확산을 감시할 필요가 있을 것으로 사료된다.

• Molecules and Cells
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• 제25권3호
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• pp.407-416
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• 2008

Thirteen near-isogenic lines (NILs) of japonica rice were developed via a backcross method using the recurrent parent Chucheong, which is of good eating quality but is susceptible to Magnaporthe grisea, and three blast resistant japonica donors, Seolak, Daeseong and Bongkwang. The agro-morphological traits of these NILs, such as heading date, culm length, and panicle length, were similar to those of Chucheong. In a genome-wide scan using 158 SSR markers, chromosome segments of Chucheong were identified in most polymorphic regions of the 13 NIL plants, and only a few chromosome segments were found to have been substituted by donor alleles. The genetic similarities of the 13 NILs to the recurrent parent Chucheong averaged 0.961, with a range of 0.932-0.984. Analysis of 13 major blast resistance (R) genes in these lines using specific DNA markers showed that each NIL appeared to contain some combination of the four R genes, Pib, Pii, Pik-m and Pita-2, with the first three genes being present in each line. Screening of nine M. grisea isolates revealed that one NIL M7 was resistant to all nine isolates; the remaining NILs were each resistant to between three and seven isolates, except for NIL M106, which was resistant to only two isolates. In a blast nursery experiment, all the NILs proved to be more resistant than Chucheong. These newly developed NILs have potential as commercial rice varieties because of their increased resistance to M. grisea combined with the desirable agronomic traits of Chucheong. They also provide material for studying the genetic basis of blast resistance.

• Current Research on Agriculture and Life Sciences
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• 제32권3호
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• pp.111-117
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• 2014

고추 역병은 그 병원균의 토양전염성 때문에 약제에 의한 방제효과가 낮아 저항성 품종의 개발이 기대되어 왔다. 고추 역병에는 CM334, AC2258, PI201234 등 다수의 저항성 유전자원이 보고되었으며, 이들의 저항성의 유전에 관한 연구로 진행되었다. 그러나 저항성의 유전양식은 실험에 사용한 재료와 연구자에 따라 1개, 2개, 혹은 3개 이상의 유전자, 다수의 유전자에 의한 양적 유전 등 다양하였다. 최근에는 분자적 방법으로 양적형질유전자좌(QTL)를 구명하는 연구가 보고되고 있으며, 분자표지를 이용한 선발 기술도 이미 육종 현장에서 활용되고 있다. 최근 저항성 품종이 다수 출시됨에 따라 새로운 병원형(pathotype), 즉, 레이스(race)의 출현에 관심이 높아지면서 이에 대한 연구가 보고되고 있다. 모두 품종과 병원균주간에 특이적 변이가 있으며, 이를 토대로 몇 개의 병원형(race)으로 분류할 수 있었다. 그러나 판별품종이 통일되지 않았고 시험에 사용한 품종들의 저항성 유전자의 조성도 달라 세계적으로 통일된 레이스분류체계는 아직 없는 실정이다. 이러한 배경에서 보다 안정된 저항성 품종의 육성을 위해서는 한 가지 저항성 재료보다는 다수의 저항성 유전자원에서 저항성을 도입하고, 육성과정에 육성품종의 보급 대상지역의 여러 균주를 사용하여 선발하는 것이 필요할 것이다.

• Journal of Yeungnam Medical Science
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• 제14권1호
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• pp.67-76
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• 1997

항암제에 대한 내성은 내인성 또는 획득한 내성 모두가 암의 치료에 장애가 된다. P-당단백질을 encode하고있는 mdr1 유전자의 발현이 항암제에 대해 내성을 가지고 있는 암세포에서 많이 관찰되고 있으며, 최근에는 시험관적으로 항암제에 대한 내성이 유도된 암세포주들에서 mdr1 유전자가 발현되지 않는 암세포들이 보고되고 있다. 다제내성에 관계하는 또 하나의 유전자인 MRP 발현정도를 L1210세포와 내성인 L1210변이주들에서 조사하였으며, c-myc과 c-fos 유전자의 발현변화를 관찰하였다. RT-PCR을 시행하여 L1210, L1210AdR, L1210VcR에서 MRP 유전자발현을 확인하였으며, Northern hybridization한 결과 L1210세포에 비하여 L1210AdR은 유전자 발현이 40% 정도 감소하였으며, L12l0Cis는 90% 정도의 유전자 발현감소가 관찰되었다. c-myc과 c-fos유전자의 Northern hybridization한 결과 L1210에 비하여 L1210AdR은 발현감소가 나타났으나, L1210VcR과 L1210Cis의 경우는 오히려 발현증가가 관찰되었다.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.67.1-67
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• 2003

Phytophthora blight is a devastating disease of pepper and occurs almost anywhere peppers are grown. Phytophthora blight is caused by Phytophthora capsici and this pathogen can infect every part of the plant by moving inoculum in the soil, by infecting water on surface, by aerial dispersal to sporulating lesions. Management of Phytophthora blight currently relies on cultural practices, crop rotation, and use of selective fungicides. Since these treatments are a short-term management, a classical breeding for development of resistant pepper against the Phytophthora is an alternative. So far some of the resistant cultivars have been on the market, but those are limited regionally and commercially. Therefore, ultimately an elite line resistant against this disease should be developed, if possible, by biotechnology. We have set out a series of work recently in order to develop Phytophthora resistant pepper cultivar. For the first time, the cDNA microarray analysis was peformed using an EST chip that holds around 5000 pepper EST clones to identify genes responsive to Phytophthora infection. Total RNA samples were obtained from Capsicum annuum PI201234 after inoculating P. capsici to roots and soil and exposed to the chip. .Around 900 EST clones were up-regulated and down-regulated depending on the two RNA sample tissues, leaf and root. From those, we have found 55 transcription factors that may be involved in gene regulation of the disease defense mechanism. Further and in detail information will be provided in the poster.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제22권1호
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• pp.43-51
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• 2018

Although cisplatin is one of the most effective antitumor drugs for ovarian cancer, the emergence of chemoresistance to cisplatin in over 80% of initially responsive patients is a major barrier to successful therapy. The precise mechanisms underlying the development of cisplatin resistance are not fully understood, but alteration of DNA methylation associated with aberrant gene silencing may play a role. To identify epigenetically regulated genes directly associated with ovarian cancer cisplatin resistance, we compared the expression and methylation profiles of cisplatin-sensitive and -resistant human ovarian cancer cell lines. We identified ${\alpha}$-N-acetylgalactosaminidase (NAGA) as one of the key candidate genes for cisplatin drug response. Interestingly, in cisplatin-resistant cell lines, NAGA was significantly down-regulated and hypermethylated at a promoter CpG site at position +251 relative to the transcriptional start site. Low NAGA expression in cisplatin-resistant cell lines was restored by treatment with a DNA demethylation agent, indicating transcriptional silencing by hyper-DNA methylation. Furthermore, overexpression of NAGA in cisplatin-resistant lines induced cytotoxicity in response to cisplatin, whereas depletion of NAGA expression increased cisplatin chemoresistance, suggesting an essential role of NAGA in sensitizing ovarian cells to cisplatin. These findings indicate that NAGA acts as a cisplatin sensitizer and its gene silencing by hypermethylation confers resistance to cisplatin in ovarian cancer. Therefore, we suggest NAGA may be a promising potential therapeutic target for improvement of sensitivity to cisplatin in ovarian cancer.

• 대한수의학회지
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• 제43권1호
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• pp.103-112
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• 2003

A multiplex PCR assay, which allows simultaneous detection of vancomycin resistant genotypes and Enterococcus species-specific genes, was developed. Vancomycin resistant enterococci (VRE) from chickens and humans could be detected for vanA, vanB, vanC-1, vanC-2, $ddl_{E.faecium}$ and $ddl_{E.faecalis}$ by multiplex PCR. Eight isolates of VRE from humans (n=11) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 3 isolates of the VRE had $ddl_{E.faecium}$ and vanB. One isolate of VRE from chickens (n=6) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 5 isolates of the VRE had only vanA. E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum and E. casseliflavus were also confirmed for the species-specific gene by multiplex PCR. This multiplex PCR could detect E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum, E. casseliflavus, vanA, vanB, vanC-1 and vanC-2, simultaneously. The PCR assay established in the present study can be an alternative to time-consuming biochemical tests and antibiotic susceptibility tests of Enterococcus spp.

• 한국습지학회지
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• 제13권1호
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• pp.117-127
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• 2011

본 연구의 목적은 하수처리장의 공간적 그리고 운전인자에 따른 테트라싸이클린 내성균(TRB) 및 테트라싸이클린 내성 유전자(TRG)들의 거동을 파악하는데 있다. 이를 위한 노력으로, 세 개의 실제 다른 하수처리장내에서 7개월 이상 각각의 반응조별로 시료를 채취하여 TRB 및 TRG가 분석되었다. 통계 기법은 주성분분석(PCA)을 통해 이들 간에 어떠한 일반적 관계식이 성립하는지 알아보려 노력하였다. 통계 분석결과, 활성슬러지내에 TRB 농도는 1차 침전 유입수에 있는 TRB 농도에 많은 영향을 받는 것을 알 수 있었다. 또한, 본 연구를 통해 TRB와 TRG의 내거동이 하수처리장 SRT 조건에 많이 영향을 받는 것을 알 수 있었다.