• 제목/요약/키워드: Repressor gene

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일반 E.coli에서 tac Promoter에 의한 온도감수성 $cI_{857}$ Repressor의 대량생산 (Therrnosensitive $cI_{857}$ Repressor Overproduction by tac Promoter in General E. coli)

  • 강상모;권태종;정호권
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.45-51
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    • 1991
  • $cI_{857}$ repressor 단백질을 대량으로 얻기위해 tac promoter 하류에 $cI_{857}$ 구조 유전자를 삽입하는 것을 검토하였다. $cI_{857}$ 유전자를 포함하는 DNA 단편을 plasmid PUC12를 이용하여 대량생산후, HphI으로 부분 분해하여 $cI_{857}$ 구조 유전자만을 취하고, tac promoter 하류에 삽입시켰다. 그리고 $\lambda$ phage $cI_{90}$에 의해 $30^{\circ}C$에서는 용원성을, $42^{\circ}C$에서는 용균성을 보이는 균주를 선택함으로 tac promoter 하류에 cI857 구조 유전자가 삽입된 pDR540-$cI_{857}$을 선택할 수가 있었다. 이 plasmid는 $lacI^q$ JM103 뿐만 아니라 각종 E.coli에서 $cI_{857}$-repressor 단백질을 균체 단백질당 약 17까지 생산하였다.

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Cloning and Sequencing Analysis of the Repressor Gene of Temperate Mycobacteriophage L1

  • Sau, Subrata;Chattoraj, Partho;Ganguly, Tridib;Lee, Chia Yen;Mandal, Nitai Chandra
    • BMB Reports
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    • 제37권2호
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    • pp.254-259
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    • 2004
  • The wild-type and temperature-sensitive (ts) repressor genes were cloned from the temperate mycobacteriophage L1 and its mutant L1cIts391, respectively. A sequencing analysis revealed that the $131^{st}$ proline residue of the wild-type repressor was changed to leucine in the ts mutant repressor. The 100% identity that was discovered between the two DNA regions of phages L1 and L5, carrying the same sets of genes including their repressor genes, strengthened the speculation that L1 is a minor variant of phage L5 or vice versa. A comparative analysis of the repressor proteins of different mycobacteriophages suggests that the mycobacteriophage-specific repressor proteins constitute a new family of repressors, which were possibly evolved from a common ancestor. Alignment of the mycobacteriophage-specific repressor proteins showed at least 7 blocks (designated I-VII) that carried 3-8 identical amino acid residues. The amino acid residues of blocks V, VI, and some residues downstream to block VI are crucial for the function of the L1 (or L5) repressor. Blocks I and II possibly form the turn and helix 2 regions of the HTH motif of the repressor. Block IV in the L1 repressor is part of the most charged region encompassing amino acid residues 72-92, which flanks the putative N-terminal basic (residues 1-71) and C-terminal acidic (residues 93-183) domains of L1 repressor.

Characterization of tTA and Its Functional Domain in Tetracycline Repressor-mediated Gene Repression System

  • Kim, Hong-Jin;Kim, Ki-Ho
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제21권3호
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    • pp.320-325
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    • 1998
  • To elucidate of role(s) of tTA as a repressor in the tTA-mediated gene repression system, we introduced mutations into the acidic domain of VP16 and examined the effects of such various mutations. In the transient repression experiment, a region containing 34 amino acids of the activation domain of VP16 (412-456) which interacts with TFIIB was found to be necessary and sufficient for the tTA-mediated repression of gene expression. However, in the experiment to investigate the fact that tTA-regulated repression is related to the activation function of VP16, we found that the repression abilities of tTA derivatives did not correlate exactly with their activation abilities. Therefore, we conclude that increased mass of VP16 in tTA might be also important for efficient repression in addition to functional domain of VP16.

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대장균에서 한국형 B형 간염바이러스 내면항원 유전자의 발현 (Expression of Hepatitis B Viral Core Antigen Gene in Excherichia coli)

  • 최수근;이원상;김성기;노현모
    • 미생물학회지
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    • 제29권2호
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    • pp.80-84
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    • 1991
  • We cloned and expressed hepatitis B viral core antigen (HBcAg) gene in E. coli using $P_{L}$ promoter system. For optimal expression of the gene, we undertook the studies on the effects of the distance between Shine-Dalgarno (SD) sequence and start codon, copy number of repressor gene, induction temperature, and the stability of the core antigen. The results demonstrated that the induction at 37.deg.C was more efficient than at 42.deg.C, and the 11 base pairs (bp) distance between SD sequence and start codon of HBcAg gene was more efficient than the 15 bp distance in E. coli. The copy number of cI857 repressor gene did not influence on the expression of HBcAg, and the expression level of HBcAg in mutant type (low protease activity) and wild type strains was almost the same. The produced core antigen appeared to be HBcAg not HBeAg judged by two different radioimmunoassat (RIA) kits. This result suggested that the antigen was stable in E. coli.i.

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역전사효소(逆轉寫酵素) 유전자(遺傳子)의 cloning 에 관(關)한 연구(硏究) (Cloning of Reverse Transcriptase Gene of Avian Sarcoma Virus)

  • 김용웅;김광식;서용택
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제31권3호
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    • pp.219-225
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    • 1988
  • Avian Sarcoma Virus의 plasmid DNA중(中)의 역 이사효소의 유전자(遺傳子)를 온도의존성(溫度依存性) 발현(發現) vector인 pPL-lambda에 cloning하여 온도(溫度)에 민감한 phage ${\lambda}$의 repressor인 cI857 gene을 갖고 있는 bacteriophage lysogen인 N4830에 transformation시켰다. transformant를 pL promoter의 발현(發現)을 억제(抑制)하는 저온(低溫)$(28^{\circ}C)$에서 배양(培養)시킨 뒤, 이 repressor를 억제(抑制)하여 transcription을 촉진(促進)하게 하는 고온(高溫)$(42^{\circ}C)$에서 배양(培養)시킨 다음 균체(菌體)를 회수(回收)하여 RNA를 추출(抽出)하고 분석(分析)을 한 결과(結果) 도입(導入)된 역전사 효소 유전자(遺傳子)의 전사(轉寫)가 고온(高溫)에서 증대(增大)되었다.

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표고균사 갈변과 관련된 BCR (Brown Color Repressor) 유전자 분리 (BCR (Brown Color Repressor) gene isolation related to mycelial browning of Lentinus edodes)

  • 김영호;박수철;전창성;유창현;성재모;공원식
    • 한국버섯학회지
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    • 제10권3호
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    • pp.120-128
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    • 2012
  • 표고균사에서 갈변시기를 조절하고 확인할 수 있는 유전공학적 시스템을 개발하여 톱밥재배용 표고균주를 조기에 선별할 수 있도록 표고균사가 갈변되는 동안 균사상태에서 특이적으로 발현되는 유전자를 분리하기 위하여 갈변되지 않은 균사와 갈변이 완전히 이루어진 균사에서 differential display를 실시하였다. 그 결과 이들 균사로부터 특이적으로 발현되는 두 개의 1.6kb와 1.2kb의 cDNA clone을 선발하여 염기서열을 분석하였다. 이 중 1.6kb의 cDNA단편은 Dugenia polichroa로부터 분리된 microsatellites 유전자와 100%의 상동성을 나타냈다. 그러나 1.2kb의 cDNA 단편은 3'부위에 poly A tail과 5 부위에 partial open reading frame를 가지고 있어 이를 primer로 제작한 후 갈변되지 않은 균사와 갈변이 이루어진 균사에서 RT-PCR을 실시하여 본 결과 갈변이 되지 않은 백색의 균사에서 발현이 확인되었다. 1.2kb의 cDNA 단편의 5' 부위의 염기서열 분석은 110개의 아미노산으로 구성된 partial open reading frame으로 나타났다. 이 유전자를 DNASIS database에서 상동성을 비교해 본 결과 Arabidopsis thaliata에서 분리된 dTDP-glucose 4,6-dehydratases 유전자와 DNA 수준에서는 66.7%, 아미노산 수준에서는 69.2%의 높은 상동성을 나타내었다. 갈변에 관련된 특이 유전자(BCR gene)를 확인하였다. 이 유전자는 산화 stress에 대해 저항성을 나타내는 기능을 가진 것으로 알려져 있어 표고 균사가 갈변될 때 repressor로서 작용할 것으로 생각된다. 따라서 이 유전자를 BCR (Brown Color Repressor) 유전자라고 명명하였다.

The PcG protein hPc2 interacts with the N-terminus of histone demethylase JARID1B and acts as a transcriptional co-repressor

  • Zhou, Wu;Chen, Haixiang;Zhang, Lihuang
    • BMB Reports
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    • 제42권3호
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    • pp.154-159
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    • 2009
  • JARID1B (jumonji AT rich interactive domain 1B) is a large nuclear protein that is highly expressed in breast cancers and is proposed to function as a repressor of gene expression. In this paper, a phage display screen using the N-terminus of JARID1B as bait identified one of the JARID1B interacting proteins, namely PcG protein (Polycomb group) hPc2. We demonstrated that the C-terminal region, including the COOH box, was required for the interaction with the N-terminus of JARID1B. In a reporter assay system, co-expression of JARID1B with hPc2 significantly enhanced the transcriptional repression. These results support a role for hPc2 acting as a transcriptional co-repressor.

KLF4에 의한 CCSP 발현 억제 (Repression of CCSP Expression by KLF4)

  • 곽인석
    • 생명과학회지
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    • 제28권12호
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    • pp.1432-1437
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    • 2018
  • 클라라 세포에 의해 생산되는 클라라 세포 분비 단백질(CCSP)은 폐를 염증으로부터 보호하는데 중요한 역할을 한다. 이 연구는 CCSP 유전자 발현에 관여하는 프로모터 부위에서 repressor에 결합할 수 있는 cis-element를 밝히는데 있다. DNaseI footprinting법을 사용하여 mCCSP 프로모터의 -812에서 -768 bp (45 bp) 사이에서 3 개의 보호된 motif를 찾았고, 그 중 하나인 D3 모티프(GCCTGGGAA)는 다른 3 가지 동물들과 염기서열이 100% 일치하였다. 45 bp를 사용한 EMSA 분석에서 D3 모티프(GGCCTGGGAA)는 45 bp에 높은 경쟁을 보였으나, 변이된 D3 모티프가 ($G{\underline{AA}}TG{\underline{TT}}AA$)를 사용되었을 때, 경쟁은 상당히 감소되었다. 이는 mCCSP 프로모터의 45 bp의 D3 모티프가 단백질과 DNA 상호 작용을 위한 중요한 element임을 시사한다. -756-Luc과 -812-Luc을 이용한 transient transfection 분석 결과, -756-Luc은 -812-Luc보다 CCSP의 발현이 현저하게 감소되었다. 이는 mCCSP 프로모터의 45 bp부위가 repressor의 결합 부위로서 기능을 할 수 있음을 의미한다. -812-Luc에 KLF4를 co-transfection 한 결과, KLF4는 CCSP 발현을 현저하게 저해(repression)함을 밝혔다. 그러나 -768-Luc이 사용되었을 때 KLF4에 의한 repression은 관찰되지 않았다. 이것은 KLF4가 CCSP 유전자의45 bp에 결합할 수 있고, 전사 억제자 역할을 하여 mCCSP 발현을 억제 할 수 있음을 명확히 보여 준다. 또한 이는 45 bp 중, D3 모티프가 KLF4의 결합에 강하게 관여 함을 시사한다. 이 반응에 KLF4에 대한 항체가 첨가되었을 때는 super-shifted 밴드가 관찰되었으나, SP1에 대한 항체가 사용되었을 때는 관찰되지 않았다. 이는 KLF4가 CCSP 프로모터의 45 bp 영역에 결합하여 repressor기능 할 수 있고, D3 모티프가 KLF4의 특이적 결합에 관여 할 수 있음을 시사한다.

한우 등심부위 근육 내 조지방함량에 따른 inducible cAMP early repressor (ICER) 유전자발현 분석 (Gene Expression Analysis of Inducible cAMP Early Repressor (ICER) Gene in Longissimus dorsi of High- and Low Marbled Hanwoo Steers)

  • 이승환;김남국;김성곤;조용민;윤두학;오성종;임석기;박응우
    • 생명과학회지
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    • 제18권8호
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    • pp.1090-1095
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    • 2008
  • 근내지방 축적이 왕성하게 진행되는 12개월 및 27개월령 사이에 유전자발현이 증가하는 inducible cAMP early repressor (ICER) 유전자의 클로닝 및 유전자발현 특성을 규명하기 위하여 한우조직별, 근육 내 조지방 함량에 따라 마블링 high- 및 low 한우 각 4두와 3두씩을 공시하였다. ddRT-PCR 분석을 통하여 증폭된 300 bp PCR 산물 및 EST 서열을 중심으로 1.5 kb 한우 ICER cDNA를 염기서열 분석하였으며, 조직별 유전자발현분석결과, 식이지방이 흡수되는 소장 조직에서 ICER 유전자의 발현량이 가장 높았다. 아울러, 같은 근육타입인 등심 및 우둔조직 사이에서 ICER 유전자발현은 등심조직에서 2.5배 많이 발현하였다. 한우 마블링 high, low 두 그룹 간 유전자발현 분석 결과, high 그룹에서 ICER 유전자발현이 4배 이상 증가하는 것으로 분석되었다. 따라서, ICER 유전자는 가축의 마블링과 밀접한 관련이 있는 유전자임이 사료된다.