• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제24권11호
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• pp.1483-1503
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• 2011

To advance the effectiveness of the current Hanwoo improvement system, we developed a general simulation that compared a series of breeding schemes under realistic user circumstances. We call this system the Integrated General Model (IGM) and it allows users to control the breeding schemes and selection methods by manipulating the input parameters. The Current Hanwoo Performance and Progeny Test (CHPPT) scheme was simulated with a Modified Hanwoo Performance and Progeny Test (MHPPT) scheme using a Hanwoo Breeding Farm cow population of the Livestock Improvement Main Center (LOMC) of the National Agricultural Cooperatives Federation (NACF). To compare the two schemes, a new method, the Simple Hanwoo Performance Test (SHPT), which uses ultrasound technology for measuring the carcass traits of live animals, was developed. These three models, including the CHPPT, incorporated three types of selection criteria: phenotype (PH), true breeding value (TBV), and estimated breeding value (EBV). The simulation was scheduled to mimic an actual Hanwoo breeding program; thus, the simulation was run to include the years 1983-2020 for each breeding method and was replicated 10 times. The parameters for simulation were derived from the literature. Approximately 642,000 animals were simulated per replication for the CHPPT scheme; 129,000 animals were simulated for the MHPPT scheme and 112,000 animals for the SHPT scheme. Throughout the 38-year simulation, all estimated parameters of each simulated population, regardless of population size, showed results similar to the input parameters. The deviations between input and output values for the parameters in the large populations were statistically acceptable. In this study, we integrated three simulated models, including the CHPPT, in an attempt to achieve the greatest genetic gains within major economic traits including body weight at 12 months of age (BW12), body weight at 24 months of age (BW24), average daily gain from 6 to 12 months (ADG), carcass weight (CWT), carcass longissimus muscle area (CLMA), carcass marbling score (CMS), ultrasound scanned longissimus muscle area (ULMA), and ultrasound scanned marbling score (UMS).

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제27권11호
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• pp.1600-1607
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• 2014

A total of 120 finishing pigs ([Yorkshire${\times}$Landrace]${\times}$Duroc) with an average body weight (BW) of $49.72{\pm}1.72kg$ were used in 12-wk trial to evaluate the effects of protected organic acids on growth performance, nutrient digestibility, fecal micro flora, meat quality and fecal gas emission. Pigs were randomly allotted to one of three dietary treatments (10 replication pens with 4 pigs per pen) in a randomly complete block design based on their initial BW. Each dietary treatment consisted of: Control (CON/basal diet), OA1 (basal diet+0.1% organic acids) and OA2 (basal diet+0.2% organic acids). Dietary treatment with protected organic acid blends linearly improved (p<0.001) average daily gain during 0 to 6 week, 6 to 12 week as well as overall with the increase in their inclusion level in the diet. The dry matter, N, and energy digestibility was higher (linear effect, p<0.001) with the increase in the dose of protected organic acid blends during 12 week. During week 6, a decrease (linear effect, p = 0.01) in fecal ammonia contents was observed with the increase in the level of protected organic acid blends on d 3 and d 5 of fermentation. Moreover, acetic acid emission decreased linearly (p = 0.02) on d7 of fermentation with the increase in the level of protected organic acid blends. During 12 weeks, linear decrease (p<0.001) in fecal ammonia on d 3 and d 5 and acetic acid content on d 5 of fermentation was observed with the increase in the level of protected organic acid blends. Supplementation of protected organic acid blends linearly increased the longissimus muscle area with the increasing concentration of organic acids. Moreover, color of meat increased (linear effect, quadratic effect, p<0.001, p<0.002 respectively) and firmness of meat showed quadratic effect (p = 0.003) with the inclusion of increasing level of protected organic acid in the diet. During the 6 week, increment in the level of protected organic acid blends decreased (linear effect, p = 0.01) Escherichia coli (E. coli) counts and increased (linear effect, p = 0.004) Lactobacillus counts. During 12-wk of experimental trial, feces from pigs fed diet supplemented with organic acid blends showed linear reduction (p<0.001) of E. coli counts and the tendency of linear increase (p = 0.06) in Lactobacillus count with the increase in the level of organic acid blends. In conclusion, 0.2% protected organic acids blends positively affected growth performance, nutrient digestibility, fecal gas emission and meat quality in finishing pigs without any adverse effects on blood parameters.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제59권12호
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• pp.28.1-28.8
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• 2017

Background: Major amino acids in pig diets are Lys, Met, Thr, and Trp, but little is known about the requirements for the other essential amino acids, especially on odorous compounds and microbial characteristics in feces of growing-finishing pigs. To this end, different levels of amino acid composition added to diets to investigate the effects of amino acid composition on microbial characteristics and odorous compounds concentration. Methods: A total eight (n = 8) barrows (Landrace ${\times}$ Yorkshire ${\times}$ Duroc) with an average bodyweight of $89.38{\pm}3.3kg$ were individually fed diets formulated by Korean Feeding Standards 2007 (old version) or 2012 (updated with ideal protein concept) in metabolism crates with two replication. After 15-day adaptation period, fresh faecal samples were collected directly from pigs every week for 4 weeks and analysed for total volatile fatty acids (VFA), phenols and indoles by using gas chromatography. The nitrogen was determined by Kjeldahl method. Bacterial communities were detected by using a 454 FLX titanium pyrosequencing system. Results: Level of VFA tended to be greater in 2012 than 2007 group. Among VFAs, 2012 group had greater (p < 0.05) level of short chain fatty acids (SCFA) than control.Concentration of odorous compounds in feces was also affected by amino acid composition in pig diet. Levels of ammonium and indoles tended to be higher in 2012 group when compared with 2007 group.Concentration of phenols, p-cresol, biochemical oxygen demand, and total Kjeldahl nitrogen, however, were lower (P < 0.05) in 2012 treatment group compare to 2007. The proportion of Firmicute phylum were decreased, while the Bacteriodetes phylum proportion increased and bacterial genera includingCoprococcus, Bacillus, and Bacteroides increased (p < 0.05) in 2012 compare to 2007 group. Conclusion: Results from our current study indicates that well balanced amino acid composition reduces odor by modulating the gut microbial community. Administration of pig diet formulated with the ideal protein concept may help improve gut fermentation as well as reduce the odor causing compounds in pig manure.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제46권7호
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• pp.679-686
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• 2003

목 적 : AT는 드물게 발생하는 상염색체성 열성질환으로, 소뇌의 퇴화에 의한 운동장애와, 암 발생의 소인이 증가하는 등 많은 임상적 징후가 보인다. AT 질환을 유발하는 ATM 유전자는 DNA 손상시 세포주기 정지를 유도시키지 못하며, 방사선 조사 후 세포 생존력을 유지시키지 못하여 세포자멸사를 유도하게 된다. 따라서 암세포에 DN-ATM 유전자를 발현시켜 AT 세포의 표현형으로 변화시킨다면, 이러한 암세포는 방사선에 의해 유도되는 세포자멸사가 훨씬 더 증가된다. 그러나 지금까지 ATM 세포에서 방사선에 의해 야기되는 세포자멸사 경로는 밝혀져 있지 않다. 그러므로 본 연구에서는 DN-ATM이 발현되는 CT-26 대장암 세포를 이용하여 방사선 조사 후에 유도되는 세포자 멸사 경로를 구명하고자 하였다. 방 법 : DN-ATM 아데노바이러스(Ad/DN-ATM)와 표식 유전자 GFP만을 함유한 대조 아데노바이러스(Ad/GFP)를 제작하여 CT-26 세포에 감염시켰다. DN-ATM이 발현되는 CT-26세포에서 방사선 조사로 유도되는 세포자멸사 경로는 [$^3H$]-thymidine assay, DNA fragmentation, 및 Western immunoblot analysis으로 실험하였다. 결 과 : 실험 결과에서 방사선 조사 후 세포의 성장이 감소하는 것으로 보아 CT-26 대장암 세포가 AT 환자에서 보여지는 표현형으로 변화되었다는 것을 보여주었고, 방사선 조사에 의한 세포자멸사가 유도되었다. 방사선 조사 후 시간이 지날수록 Bcl-2의 발현이 감소되고, Bax의 발현이 증가하며, caspase 9, caspase 3 및 PARP가 활성화되었다. 결 론: 이러한 실험 결과들은 DN-ATM이 발현되고 있는 CT-26 세포에서 방사선 조사 후 야기되는 세포자멸사 경로는 미토콘드리아를 통하여 caspase 9, caspase 3와 PARP의 활성에 의해 일어나는 세포자멸사임을 시사한다.

• 한국대기환경학회지
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• 제12권3호
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• pp.255-262
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• 1996

다양하고 복잡한 환경요인에 의해 발생된 산림쇠퇴에 대한 회복책의 하나로 1990년 11월부터 1993년 8월까지 3년에 걸쳐 서울시 중심에 위치한 남산과 광릉지역의 소나무 우점종인 군집에 석회, 마그네슘, 석회+마그네슘+ 복합비료를 시용한 후 소나무잎의 왁스함량, 접촉각 및 무기양이온 함량, 토양의 산도를 분석하여 시비처리의 효과를 알아보고자 실시한 연구 결과는 다음과 같다. 1. 남산, 광릉지역 소나무잎의 왁스함량 및 접촉각값은 토양시비에 따라 증가하였고, 엽령이 증가함에 따라 접촉각값은 작아졌다. 2. 소나무잎의 K, Ca 함량은 남산에서 높았으나, Mg 함량은 광릉지역에서 높았다. 소나무잎의 K, Mg 함량은 남산과 광릉 모두 시비가 계속됨에 따라 증가하여 시비의 효과가 나타났다. 3. 토양산도는 남산지역이 pH 4.2$\sim$4.3, 광릉지역이 pH 4.6$\sim$4.9이였고, 토양시비처리에 따른 토양 산도는 변화가 없었다. 그러나 토양시비처리 기간이 경과함에 따라 무시비구에 비하여 시비처리구의 토양 pH가 상대적으로 높아지는 경향을 보였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권5호
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• pp.1023-1031
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• 2017

The conformational change of cellular prion protein ($PrP^C$) to its misfolded counterpart, termed $PrP^{Sc}$, is mediated by a hypothesized cellular cofactor. This cofactor is believed to interact directly with certain amino acid residues of $PrP^C$. When these are mutated into cationic amino acid residues, $PrP^{Sc}$ formation and prion replication halt in a dominant negative (DN) manner, presumably due to strong binding of the cofactor to mutated $PrP^C$, designated as DN PrP mutants. Previous studies demonstrated that plasminogen and its kringle domains bind to PrP and accelerate $PrP^{Sc}$ generation. In this study, in vitro binding analysis of kringle domains of plasminogen to Q167R DN mutant PrP (PrPQ167R) was performed in parallel with the wild type (WT) and Q218K DN mutant PrP (PrPQ218K). The binding affinity of PrPQ167R was higher than that of WT PrP, but lower than that of PrPQ218K. Scatchard analysis further indicated that, like PrPQ218K and WT PrP, PrPQ167R interaction with plasminogen occurred at multiple sites, suggesting cooperativity in this interaction. Competitive binding analysis using $\small{L}$-lysine or $\small{L}$-arginine confirmed the increase of the specificity and binding affinity of the interaction as PrP acquired DN mutations. Circular dichroism spectroscopy demonstrated that the recombinant PrPs used in this study retained the ${\alpha}$-helix-rich structure. The ${\alpha}$-helix unfolding study revealed similar conformational stability for WT and DN-mutated PrPs. This study provides an additional piece of biochemical evidence concerning the interaction of plasminogen with DN mutant PrPs.

• 전자공학회논문지T
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• 제36T권4호
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• pp.71-81
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• 1999

시간제약 조건하에서 순차회로를 위한 새로운 CPLD(Complexity Programmable Logic Device) 기술 매핑 알고리즘을 제안한다. 본 기술매핑 알고리즘은 주어진 순차회로의 궤환을 검출한 후 궤환이 있는 변수를 임시 입력 변수로 분리한 후 조합논리 부분을 DAG(Directed Acyclic Graph)로 표현한다. DAG의 각 노드를 검색한 후, 출력 에지의 수가 2이상인 노드를 분할하지 않고 노드만을 복제(replication)하여 팬 아웃 프리 트리로 재구성한다. 이러한 구성 방법은 주어진 시간 조건 안에서 최소의 면적을 가질 수 있으며 처리 시간을 고려하기 위한 것이다. 기존의 CPLD 기술 매핑 알고리즘인 TEMPLA의 경우 팬 아웃 프리 트리를 구성할 때 출력 에지의 수가 2이상인 노드를 서브 그래프로 분할함으로서 매핑 결과 시간 제약 조건을 초과할 수 있다. 또한, TMCPLD(Technology Mapping for CPLD)의 경우는 출력 에지의 수가 2 이상인 노드를 포함한 트리를 복제하여 전체의 노드수가 증가되어 전체 수행시간이 길어지는 단점을 가지고 있다. 이러한 단점을 보완하기 위해 노드만을 복제한 팬 아웃 프리 트리의 구성방법을 제안한다. 시간제약 조건과 조사의 지연시간을 이용하여 그래프 분할이 가능한 다단의 수를 정하고, 각 노드의 OR 텀수를 비용으로 하는 초기비용과 노드 병합 후 생성될 OR 텀수인 전체비용을 계산하여 CPLD를 구성하고 있는 CLB(Configurable Logic Block)의 OR텀수보다 비용이 초과되는 노드를 분할하여 서브그래프를 구성한다. 분할된 서브그래프들은 collapsing을 통해 노드들을 병합하고, 주어진 소자의 CLB안에 있는 OR텀 개수에 맞게 Bin packing를 수행하였다. 제안한 기술매핑 알고리즘을 MCNC 논리합성 벤치마크 회로들에 적용하여 실험한 결과 기존의 CPLD 기술 매핑 툴인 TEMPLA에 비해 CLB의 수가 15.58% 감소되었다.

• 대한바이러스학회지
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• 제30권1호
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• pp.39-49
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• 2000

The genome of Hantaan virus, the prototype of the hantavirus genus, is composed of three segmented, single stranded negative sense RNA genome. The 5' and 3' termini of the Hantaan virus RNA genome contain noncoding regions (NCRs) that are highly conserved and complementary to form panhandle structures. There are some reports that these NCRs seems to control gene expression and viral replication in influenza virus and vesicular stomatitis virus. In this study, we examined whether NCRs in Hantaan virus playa role in expression of the viral nucleocapsid protein (Np) and foreign (luciferase) gene. The 5' and/or 3' NCR-deleted mutants were constructed and analysed. The Np expression of 5' NCR-deleted clone was similar to that of the clone containing full S genome. In the case of 3' NCR-deleted clone, it showed 40% reduction. To investigate the role of NCR in foreign gene expression, the clones which are replaced ORF of Hantaan viral Np gene with that of luciferase gene were constructed. The results were similar to those of the experiments using Np gene. These results suggest that 3' NCR is more important than 5' NCR in protein expression. To find out a critical region of 3' NCR in protein expression, several clones with a deleted part of 3' NCR were constructed and analyzed. The deletion of the conserved region in 3' NCR showed $20{\sim}30%$ decrease in Np expression. However there were no change in luciferase activities between clones with or without non-conserved region of 3' NCR. These results suggest that the 3' NCR of Hantaan virus S genome, especially conserved region in 3' NCR, plays an important role in the expression of Hantaan viral Np and foreign genes.

• 생명과학회지
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• 제30권4호
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• pp.402-409
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• 2020

신경괴사증바이러스(NNV)는 25 nm의 작은 입자 크기에 RNA1 (3.4 kb, RdRp), RNA2 (1.4 kb, capsid protein) 두 가닥의 RNA를 유전정보를 가진다. NNV는 1980년대 말 처음 보고된 이후 전 세계적으로 120여종의 어류에 감염을 일으키며 심각한 피해를 일으키고 있는 바이러스이다. NNV 감염에 의한 피해를 최소화하고 효율적인 백신들을 개발하기 위해서는 무엇보다 NNV 감염에 따른 세포내 신호전달체계를 이해할 필요가 있다. NNV는 세포내 감염 이후 숙주가 가진 바이러스 복제에 필요한 요소들을 이용할 수 있도록 숙주세포의 cell cycle arrest 등의 기작을 이용하는 것으로 알려졌다. 반면에 숙주 세포는 NNV와 감염된 세포를 제어하기 위해 RIG-1-like receptor signaling pathway 등을 통해 NNV 감염을 인지한 다음 IFN signaling pathway를 통해 항바이러스 작용에 필요한 ISG들을 발현시킨다. 또한 감염된 세포들을 사멸시키기 위해 ER stress를 통한 unfolded protein response (UPR), mitochondria-mediated cell death 작용을 통해 감염된 세포의 apoptosis를 유발한다. NNV 감염 기작에 대한 세포신호전달연구는 아직 초기단계이며 검증해야 할 pathway들이 아직도 많이 남아있는 상황이다. 따라서 NNV 감염과 연관된 다양한 세포신호전달체계를 탐색하고 질병 특이적인 세포신호전달체계를 이해함으로써 신속하고 정확한 진단법 및 백신 개발에 많은 도움이 될 것으로 생각된다.

• 한국가금학회지
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• 제31권2호
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• pp.79-84
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• 2004

적색 carotenoid인 canthaxanthin의 급여가 산란계육과 난황의 착색도 변화에 미치는 효과를 알아보고자 63주령 갈색 산란계(ISA Brown) 225수를 가지고 5주 동안 사양실험을 실시하였다. Canthaxanthin을 5수준으로 사료에 첨가하여 5처리(0, 50, 100, 200, 300mg/kg)로 하였으며, 처리당 3반복, 반복당 15수를 사용하였다. 산란계에서 날개피부 및 다리피부의 적색도는 200mg/kg 이상을 급여하였을 때, 그리고 황색도의 경우 날개피부는 50mg/kg 이상, 다리피부는 200mg/kg 이상을 급여하였을 때 유의적으로 높았다(P＜0.05). 그러나 명도는 날개, 가슴 및 다리피부에서 차이가 없었다. 한편, 날개육과 가슴육의 명도는 300mg/kg 이상을 사료에 첨가(canthaxanthin)시 무첨가구와 유의적인 차이를 보였으나(P＜0.05), 적색도와 황색도는 첨가구간에 차이가 없었다. 난황색(Roche color fan score)은 canthaxanthin 급여 1일에는 차이가 없었으나, 첨가수준에 관계없이 2일째부터 첨가구가 무첨가구보다 유의적으로 높았다(P＜0.05).