• 제목/요약/키워드: Rep protein

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Complete Genomic Characterization of Two Beet Soil-Borne Virus Isolates from Turkey: Implications of Comparative Analysis of Genome Sequences

  • Moradi, Zohreh;Maghdoori, Hossein;Nazifi, Ehsan;Mehrvar, Mohsen
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제37권2호
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    • pp.152-161
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    • 2021
  • Sugar beet (Beta vulgaris L.) is known as a key product for agriculture in several countries across the world. Beet soil-borne virus (BSBV) triggers substantial economic damages to sugar beet by reducing the quantity of the yield and quality of the beet sugars. We conducted the present study to report the complete genome sequences of two BSBV isolates in Turkey for the first time. The genome organization was identical to those previously established BSBV isolates. The tripartite genome of BSBV-TR1 and -TR3 comprised a 5,835-nucleotide (nt) RNA1, a 3,454-nt RNA2, and a 3,005-nt RNA3 segment. According to sequence identity analyses, Turkish isolates were most closely related to the BSBV isolate reported from Iran (97.83-98.77% nt identity). The BSBV isolates worldwide (n = 9) were phylogenetically classified into five (RNA-coat protein read through gene [CPRT], TGB1, and TGB2 segments), four (RNA-rep), or three (TGB3) lineages. In genetic analysis, the TGB3 revealed more genetic variability (Pi = 0.034) compared with other regions. Population selection analysis revealed that most of the codons were generally under negative selection or neutral evolution in the BSBV isolates studied. However, positive selection was detected at codon 135 in the TGB1, which could be an adaptation in order to facilitate the movement and overcome the host plant resistance genes. We expect that the information on genome properties and genetic variability of BSBV, particularly in TGB3, TGB1, and CPRT genes, assist in developing effective control measures in order to prevent severe losses and make amendments in management strategies.

젖소의 주요경제형질에 대한 국내생산 및 수입 정액의 능력비교 (Performance Comparison of Local and Imported Dairy Semen Used in Rep. of Korea)

  • 박병호;김시동;조광현;최재관;이영창;서강석
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제48권1호
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    • pp.15-20
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    • 2006
  • 국내에서 사용한 젖소 정액을 네 가지(한국형 보증종모우 정액, 농협 수입 보증종모우 정액, 미국산 수입 정액, 카나다산 수입 정액)로 분류하여 표현형 능력 및 유전능력을 비교하였다. 유전능력의 경우 농촌진흥청 축산연구소에 수행하고 있는 국가단위 젖소유전능력평가 결과를 이용하였다. 유량, 유지량 및 유단백량의 표현형 능력의 경우 미국산 수입 정액이 가장 우수하였고, 한국형 보증종모우 정액은 미국산 수입 정액과 유의한 차이를 보였다. 1991년 이후 태어난 보증종모우의 경우 유지량은 네 종류의 정액 사이에 유의한 차이가 없었다. 유량, 유지량, 유단백량, 유단백율 유전능력의 경우 네 종류 사이에 유의한 차이가 없었으며, 유지율의 경우 한국형 보증종모우 정액이 가장 우수하였다. 선형심사 최종점수 및 유방종합지수의 경우 카나다산 수입정액이 가장 우수하였으며, 한국형 보증종모우 정액과 유의한 차이를 보였다. MFP 및 KTPI의 경우 네 종류 사이에 유의한 차이가 없었다. 1991년 이후에 태어난 보증종모우의 유량 및 유단백량의 경우 네 종류 사이에 유의한 차이가 없었으나, 유지량, 유지율 및 유단백율의 경우 한국형 보증종모우 정액이 가장 우수하였고, 나머지 정액과 유의한 차이를 보였다. 선형심사 최종점수의 경우 한국형 보증종모우 정액, 미국산 수입정액 및 카나다산 수입정액 사이에 통계적으로 유의한 차이가 없었다. 유방종합지수의 경우 카나다산 수입정액이 가장 우수하였고, 한국형 보증종모우 정액과 유의한 차이가 났다. MFP의 경우 한국형 보증종모우 정액이 가장 우수하였고, 나머지 정액과 유의한 차이를 보였다. KTPI의 경우 한국형 보증종모우 정액, 미국산 수입정액 및 카나다산 수입정액 사이에 통계적으로 유의한 차이가 없었다.

임간초지의 개량 및 이용에 관한 연구 III. 임간초지에서 계절별 목초생산성 및 이용성 (Studies on the improvement and Utilization of Pasture on the Forest III. Seasonal herbage production and utilization of pasture on the forest)

  • 이형석;이인덕
    • 한국초지조사료학회지
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    • 제9권1호
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    • pp.7-14
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    • 1989
  • 林間混播草地 (비음도 30%)의 月別 목초생산성과 이용성을 구명하고자 면양을 공시하여 단구제(3 반복)로 配置하여 1987年부터 1988年까지 충남대학교 農科大學 試驗포장에서 試驗을 수행하였다. 초고, 엽면적지수, 건물생산량과 수절분포, 식생체화학성분,' 건물소화율, 초목이용율 및 저장효율등이 조사되었는데 그 결과는 다음과 같다. 1. 초고와 엽면적지수는 5월이 35cm와 4.89로 가장 높았고 다음이 4월 28.0cm, 4.23이었으며 10월이 13.0cm 및 0.49로가장 낮았다. 2. 건물수량은 5月이 2.040kg/ha로 가장 높았는데 年간건물수량(7.240kg/ha)의 28.2%를 차지하였다. 4월, 5월 및 6월의 봄철 건물수량은 年間건물수량의 58.3%였고 7월과 8월의 건물수량은 24.2% 9月과 10월은 17.5%였다. 그러나 6月, 7월, 8월 및 9월의 건물수량은 월별로 큰 차이가 없었다. 3. 일당 건물생산량은 5월이 65.8kg/ha으로 가장 높았고 다음이 6월 (28.7kg/ha)순 이었으며 10월은 16. 5kg/ha으로 가장 낮았다.(P<0.01) 4. 목초의 化學적성분 및 건물소화율은 4월, 5월, 6월의 봄철 목초가 7월 8월의 여름철 목초보다 조필자질합량과 건물소화율이 높은 반면에 粗織雄, ADF. 및 NDF함량은 낮았고 10월의 가을목초는 중간정도였다. 채식한 목초는 채식전 목초나 殘草보다 조회분함량과 건물소화율이 다소 높은 반면 粗鐵錯, ADF 및 NDF함량은 낮았다. 5. 代:謝體중당 건물섭취량과 4月이 68.9g 으로 가장 높았고 다음이 10月로 66.7g 이었으며 8月이 52.5g으로 가장 낮았는데 건물섭취량과 건물消化率 간에는 정의 相關(P<0.05)關係가 있었다. 6. 목초이용율은 4月이 83.4%로 가장 높았고 다음이 10月로 80.9% 이었으며 8月 은 64.0%로 가장 낮았는데 年평균 救草flJ用率은 75.5%이었다. 7. 반환 및 저장效率은 4月이 가장 높았고 다음이 10월이었으며 8월이 가장 낮았다.

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