The rare edible and medicinal fungus Antrodia cinnamomea has a substantial potential for development. In this study, Illumina HiSeq 2000 was used to sequence its transcriptome. The results were assembled de novo, and 66,589 unigenes with an N50 of 4413 bp were obtained. Compared with public databases, 6,061, 3,257, and 2,807 unigenes were annotated to the Non-Redundant, Gene Ontology, and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes databases, respectively. The genes related to terpene biosynthesis in the mycelia of A. cinnamomea were analyzed, and acetyl CoA synthase (ACS2 and ACS4), hydroxymethylglutaryl CoA reductase (HMGR), farnesyl transferase (FTase), and squalene synthase (SQS) were found to be upregulated in XZJ (twig of C. camphora) and NZJ (twig of C. kanehirae). Moreover, ACS5 and 2,3-oxidized squalene cyclase (OCS) were highly expressed in NZJ, while heme IX farnesyl transferase (IX-FIT) and ACS3 were significantly expressed in XZJ. The differential expression of ACS1, ACS2, HMGR, IX-FIT, SQS, and OCS was confirmed by real-time quantitative reverse transcription PCR. This study provides a new concept for the additional exploration of the molecular regulatory mechanism of terpenoid biosynthesis and data for the biotechnology of terpenoid production.
Vascular plants of Oruem in region of Jeju-City were investigated 454 taxa totally; 116 families, 301 genera, 359 species, 3 subspecies, 78 varieties and 14 forms. In the studied Oruems in region of Jeju-City within altitude 800m, evergreen tree forests does not range and a lot of Pines thunbergii forest and Cryptomeria japonica and Chamaecyparis obtusa plantation forest were. The endemic species of Oruem in region of Jeju-City were 14 taxa such as Asarum maculatum, Hepatica insularis, Cardamine glechomifolia etc. The floristics degree categorized by the specific distribution of plant species were total 116 Taxa, that is, V grade species Magnolia kobus, Aconitum japonicum subsp. napiforme, Ligularia taquetii etc, 6 kinds be, IV grade species Rubus ribisoideus, Ligustrum salicinum, Carex macrandrolepis etc, 16 kinds be, III grade species Illicium anisatum, Hydrangea petiolaris, Rubus schizostylus etc, 37 kinds be, II grade species Pseudostellaria coreana, potentilla dickinsii, Euonymus pauciflorus etc, 6 kinds and I grade species Sphenomeris chinensis, Pteris multifida, Machilus thunbergii etc, be. 51 kinds were confirmed. Rare and Endemic Plant Species of Korea Forest Service were 11 taxa such as Asarum maculatum, Aconitum japonicum subsp. napiforme and Magnolia kobus etc. Naturalized plant were confirmed 31 taxons with Rumex acetosella, Hypochaeris radicata and Sisyrinchium atlanticum etc.
Lee, Su Gwang;Lee, Dong Jun;Kim, Hyo Yun;Ku, Ja Jung
Korean Journal of Plant Resources
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v.27
no.2
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pp.174-182
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2014
This study was carried out to investigated the effects of soil type and light condition on seedling quality of rare and endemic plants Orostachys iwarenge and Orostachys iwarenge for. magnus. The best seedling quality of O. iwarenge and O. iwarenge for. magnus seedling were shown in Klasmann soil at non-shading or LED (Red+Blue) condition, 50% shading or LED (Red+Blue) condition, respectively. Survival of O. iwarenge seedling was not influenced by the period of experiment but survival of O. iwarenge for. magnus seedling in sandy soil conditions decreased significantly. Results of correlation analysis of seedling quality and survival rate, indicated that O. iwarenge showed a correlation of 0.8 or more at plant height, leaf length and fresh weight. O. iwarenge for. magnus showed a correlation of 0.8 or more at plant height, leaf width and leaf length. Especially, seedling survival of O. iwarenge and O. iwarenge for. magnus showed a correlation of 0.8 or more at first seedling survival and second seedling survival. It was important to manage the early seedling stages of O. iwarenge and O. iwarenge for. magnus. Therefore, seedlings with plant height (over 2.5~4 cm) and root length (over 3~5 cm) were grown vigorously at 35 days after the seedling was transplanted in mid-April in Klasmann soil of 72 plug cell tray at LED (Red+Blue) conditions.
Lee, Su Gwang;Chung, Jae Min;Kim, Sung Sik;Woo, Su Young;Kang, Ho Duck
Journal of Korean Society of Forest Science
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v.102
no.3
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pp.428-436
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2013
To obtain biological basic data for the conservation strategies establishment of a rare mistletoe species, Loranthus tanakae(Loranthaceae) in Korea, the distribution range, habitat characteristics and an assessment of the conservation status on the natural populations of L. tanakae were investigated. As a result, the natural populations of L. tanakae were distributed in Bakdudaegan from Mt. Chiri to Mt Seorak in Korea penninsula, and 97.8% of surveyed individuals of the mistletoe species were found in Gangwon province. In natural populations, 1,385 individuals of L. tanakae were parasitic on 480 host trees, and distributed in sunshiny ridges of mountains of altitude range of 353 m to 1,250 m. The range of host trees of L. tanakae were composed of 5 families, 6 genera, 9 species, 1 subspecies, and of these, Quercus mongolica was preferred with 81.5% (389 trees among 480 host trees). As a result of assessing the conservation status through IUCN, L. tanakae was evaluated as Vulnerable (VU). It was considered that Mt. Seorak, Mt. Taegi and Mt. Odae population as habitats with the highest density of distribution of natural populations of L. tanakae should be designated as the protected areas. Thus, conservation strategies and related methods of the natural populations of L. tanakae were also discussed for the sustainable conservation.
Ha, Young-Ho;Yoon, Chang-Young;Kim, Sang-Chul;Kim, Joo-Hwan
Korean Journal of Plant Resources
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v.29
no.1
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pp.90-109
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2016
This study aims to investigate the flora of Mt. Cheonma (Namyangju-si, Gyeonggi-do, Korea), including Korean endemic, rare and endangered plants. To support the biodiversity and usefulness of this investigation, we checked the red list plants, floristic regional indicator plants, climate change adaptation target plants and naturalized plants, and compared composition of plant species in Mt. Cheonma with nearby mountains. Totally, we performed 22 field investigations from April 2012 to October 2014. The number of vascular plants in this region is 433 taxa and comprised of 94 families, 266 genera, 378 species, 2 subspecies, 46 varieties, and 7 forms. Among them, there are 13 endemic plants designated by Korean Forest Service, whereas only 10 taxa are endemic species by Korean Ministry of Environment (KME). According to the IUCN criteria, there are 12 rare and endangered plants composed of 9 Least Concerned (LC), 2 Vulnerable species (VU), and one Endangered species (EN) found by Korea National Arboretum (KNA). Meanwhile, 8 taxa including 7 Least Concerned (LC) were found in Red List of KME. The floristic regional indicator plants designated by KME were 49 taxa. In addition, there are 14 taxa in The Adaptable to Climate Change Plant List designated by KNA, while only 19 taxa are naturalized plants. Generally, there are 190 common taxa in Gwangju Mountains area, and only 51 taxa are distributed in Mt. Cheonma.
Jun Hyuk Lee;Jeong Eun Lee;Jun Gi Byeon;Jong Bin An;Ho Jin Kim;Chung Weon Yun
Journal of Wetlands Research
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v.26
no.3
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pp.254-265
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2024
This study was conducted to investigate the vascular flora of two outstanding forest wetlands(OFW) in Goheung-gun, Jeollanam-do, and to prepare an efficient management plan for forest wetlands through comparison with previous studies. Fieldwork was conducted seasonally from May to October 2023, The flora in the two OFW located in Goheung-gun, Jeollanam-do, consisted of 117 taxa such as 55 families, 92 genera, 108 species, 7 variants, 1 variety and 1 hybrid. The endemic plants were 4 taxa and rare plants were 7 taxa. Floristic target plants were V class 2 taxa, IV class 6 taxa, III class 8 taxa, II class 4 taxa and Iclass 21 taxa. Climate change adaptation plants were 10 taxa and naturalized plants was 1 taxa. Obligate wetland plants were 16 taxa, Facultative wetland plants 10 taxa and Facultative plant 4 taxa. OFW functioning a typical wetland ecosystem in Goheung-gun had been providing habitats for a variety of rare plants, such as the Habenaria radiata and Drosera rotundifolia. But those ecosystems would be suffering a critical disturbance such as human interference, the invasion of naturalized plants, and change of wetland function through landization for a short future. Therefore we suggest those OFWs should be designated as a Forest Genetic Resource Reserve in order to keep the ecosystems permanently and to manage them more soundly and efficiently.
The representative research institutes in North Korea are the Academy of Science and the laboratories of major universities. The National Academy of Science consists of headquarters, Academy of Medicinal Science, Academy of Forestry Science, and Academy of Agricultural Science. Under the authority of the National Academy of Science, Central Information Agency for Science and Technology (CIAST) has built up a database system integrating all the science technology data to provide scientific and technological information. The major universities of North Korea include Kim Il-sung University, Kim Chaek University of Technology, Pyongyang Agricultural College, and Wonsan Agricultural College, and an agricultural college is situated in each province. Out of 3,860 plant species in North Korea, 158 species which amounts to approximately 4% of the total are rare and endangered, and deforestation is under a critical situation. The Oriental Medicine (Koryo Medicine) has been well developed using medicinal plants, and practical researches on biotic pesticide are largely conducted as an alternative to tackle the shortage of farming materials. Hereafter, a South-North joint research on the amount of plant resources and the methods of its conservation is needed and the North Korean research areas of biotic pesticide are worth adopting to the South Korean eco-friendly organic agriculture.
Rare earth elements fertilizer and Ca were sprayed on eight-year-old 'Fuji'/M.9 apple trees during two consecutive seasons, and fruit quality was quantified at harvest and 5-month long storing in a commercial cooling house at $4^{\circ}C$ and 80~85% RH. In the first season, single-sprayed of rare earth elements fertilizer showed appreciable accumulations of its elements (La, Pr, Gd, and Nd) in the fruit. In the following season, application of higher doses accumulated higher amount, indicating that the accumulation of rare earth elements was dose-dependent. However, rare earth elements did not affect the accumulations of Ca, Mg, and K in 'Fuji' apple fruit showed that there was no interaction between rare earth elements and these macronutrients. Double-spray of 0.2% rare earth elements increased fruit redness at harvest and had exhibited better color. Although at harvest it did not show significant effects on fruit weight, pulp firmness and titratable acidity (TA), but had pronounced effects on inhibiting fruit softness and retarded decrease of TA during storing. Furthermore, it reduced respiration rate and inhibited ethylene production during storing indicated that rare earth elements may be an alternative for prolonging the shelf life of 'Fuji'/M.9 apple fruit.
Kim, Yeong-Su;Kim, Sang Jin;Kang, Dong Wook;Park, Chang-Su
Journal of Life Science
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v.28
no.12
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pp.1545-1553
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2018
The International Society of Rare Sugars (ISRS) defines rare sugars as monosaccharides and their derivatives that rarely occur in nature. Rare sugars have recently received much attention because of their many uses including low-calorie sweeteners, bulking agents, and antioxidants, and their various applications including as immunosuppressants in allogeneic rat liver transplantation, as potential inhibitors of various glycosidases and microbial growth, in ischemia-reperfusion injury repair in the rat liver, and in segmented neutrophil production without detrimental clinical effects. Because they rarely exist in nature, the production of rare sugars has been regarded as one of the most important research areas and, generally, they are produced by chemical synthesis. However, the production of rare sugars by bioconversion using enzymes from microorganisms has been receiving increased attention as an environmentally friendly alternative production method. In particular, D-allulose, D-allose, and D-tagatose are of interest as low-calorie sweeteners in various industries. To date, D-tagatose 3-epimerase, D-psicose 3-epimerase, and D-allulose 3-epimerase have been reported as D-allulose bioconversion enzymes, and L-rhamnose isomerase, Galactose 6-phosphate isomerase, and Ribose 5-phosphate isomerase have been identified as D-allose production enzymes. Elsewhere, D-tagatose has been produced by L-arabinose isomerase from various microorganisms. In this study, we report the production of D-allulose, D-allose, and D-tagatose by microorganism enzymes.
This study was performed to investigate the flora and plant resources of Mt. Woosanbong (537.8 m) from April to October 2002. The collected vascular plants were composed of all 389 taxa including cultivated species, and classified into 329 species, 2 subspecies, 53 varieties, and 5 forms of 248 genera under 81 families. Six taxa of the Korean endemic plants and 4 taxa of the rare and endangered plants were also distributed in this mount. Resource plants were categorized into edible 181, pasturing 160, medicinal 136, stainable 94, ornamental 77, timber 22, fiber 5 and industrial 4 taxa, respectively. Floristic geography of the investigated area was regarded as the boundary between middle and southern parts in floristic pattern of the Korean Peninsula.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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