• 제목/요약/키워드: RNA I

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Cucumber mosaic virus Paf 계통의 약독 병징과 관련된 satellite RNA의 유전자 해석 (Genomic Analysis of Satellite RNA of Cucumber mosaic virus-Paf Related with Mild Symptoms)

  • 성미영;정민영;이상용;류기현;최장경
    • 식물병연구
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    • 제10권4호
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    • pp.241-247
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    • 2004
  • Cucumber mosaic virus(CMV)-Paf 계통에 포함된 satellite RNA(Paf-satRNA)는 CMV의 병징을 완화시키는 약독병징 관련 유전자로 작용하였다(Choi 등, 2001). 이 연구는 Paf-satRNA의 약독병징 관련 유전자의 도메인을 확인하기 위하여, 고추에서 chlorosis 병징을 발현하는 PepY-satRNA와 키메라 satRNA를 구축하여 분석하였다. 두 종의 satRNA의 염기서열을 비교한 결과, 분자크기가 큰 PepY-satRNA에서 10염기의 삽입이 발견되기는 하였지만, 양 말단영역의 염기는 비교적 안정된 conserved sequence를 보였다. 그러나 이들 satRNA의 중간영역에 존재하는 염기서열, 즉 5' 말단의 81번째 염기로부터 113번째, 그리고 183번째 염기부터 265번째 염기까지의 영역에서는 많은 변화를 나타냈다. 약독병징과 관련된 도메인을 확인하기 위하여 구축한 각 satRNA 및 키메라 satRNA의 cDNA로부터 transcript RNA를 전사시키고, 전사된 각 satRNA transcript를 CMV-Fny의 게놈RNA1, RNA2 및 RNA3의 transcript와 혼합한 후 N. benthamiana에 접종하였다. 그 결과 RT-PCR에 의해서 모든 satRNA-cDNA로부터 전사된 transcript의 감염성이 확인되었으며, Paf-satRNA 및 키메라 Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 N. benthamiana에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였다. 이와는 대조적으로 PepY-satRNA 및 키메라 PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이들 각 키메라 satRNA에 감염된 N. benthamiana를 접종원으로 고추에 접종한 결과, Paf-satRNA와 혼합한 CMV-Fny를 접종한 고추에서는 무병징에 가까운 약한 모자이크 증상이 발현되었고, PepY-satRNA를 접종한 고추는 뚜렷한 chlorosis의 모자이크 증상이 발현되었다. 한편 이들 두 종 satRNA의 키메라, Paf(H/N)-satRNA와 PepY(N/A)-satRNA를 접종한 고추에서는 모두 약한 모자이크 또는 무병징 감염의 특성을 보였고, PepY(H/N)-satRNA와 Paf(N/A)-satRNA를 접종한 식물에서는 전형적인 chlorosis의 모자이크 증상과 식물체의 위축을 동반하였다. 이와 같은 결과를 종합해 보았을 때, N. benthamiana에서와 마찬가지로 Paf-satRNA의 약독병징과 관련된 유전자의 도메인은 HpaI-NarI 영역에 존재한다는 것을 나타냈다.

Changes of the Level of G Protein ${\alpha}-subunit$ mRNA by Withdrawal from Morphine and Butorphanol

  • Oh, Sei-Kwan
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제4권4호
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    • pp.291-299
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    • 2000
  • Morphine or butorphanol was continuously infused into cerebroventricle (i.c.v.) with the rate of $26\;nmol/{\mu}l/h$ for 3 days, and the withdrawal from opioid was rendered 7 hrs after the stopping of infusion. The expression of physical dependence produced by these opioids was evaluated by measuring the naloxone-precipitated withdrawal signs. The withdrawal signs produced in animals dependent on butorphanol (kappa opioid receptor agonist) were similar to those of morphine (mu opioid receptor agonist). Besides the behavioral modifications, opioid withdrawal affected G protein expression in the central nervous system. The G-protein ${\alpha}-subunit$ has been implicated in opioid tolerance and withdrawal. The effects of continuous infusion of morphine or butorphanol on the modulation of G protein ${\alpha}-subunit$ mRNA were investigated by using in situ hybridization study. In situ hybridization showed that the levels of $G\;{\alpha}s$ and $G\;{\alpha}i$ were changed during opioid withdrawal. Specifically, the level of $G\;{\alpha}s$ mRNA was decreased in the cortex and cerebellar granule layer during the morphine and butorphanol withdrawal. The level of $G\;{\alpha}i$ mRNA was decreased in the dentate gyrus and cerebellar granule layer during the morphine withdrawal. However, the level of $G\;{\alpha}i$ mRNA was significantly elevated during the butorphanol withdrawal. These results suggest that region-specific changes of G protein ${\alpha}-subunit$ mRNA were involved in the withdrawal from morphine and butorphanol.

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Effects of long double-stranded RNAs on the resistance of rock bream Oplegnathus fasciatus fingerling against rock bream iridovirus (RBIV) challenge

  • Kosuke, Zenke;Kim, Ki-Hong
    • 한국어병학회지
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    • 제23권3호
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    • pp.273-280
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    • 2010
  • To determine whether rock bream Oplegnathus fasciatus can be protected from rock bream iridovirus (RBIV) infection by intramuscular injection of long double-stranded RNAs (dsRNAs), we compared protective effect of virus-specific dsRNAs corresponding to major capsid protein (MCP), ORF 084, ORF 086 genes, and virus non-specific green fluorescent protein (GFP) gene. Furthermore, to determine whether the non-specific type I interferon (IFN) response was associated with protective effect, we estimated the activation of type I IFN response in fish using expression level of IFN inducible Mx gene as a marker. As a result, mortality of fish injected with dsRNAs and challenged with RBIV was delayed for a few days when comparing with PBS injected control group. However, virus-specific dsRNA injected groups exhibited no significant differences in survival period when compared to the GFP dsRNA injected group. Semi-quantitative analysis indicated that the degree of antiviral response via type I IFN response is supposedly equal among dsRNA injected fish. These results suggest that type I IFN response rather than sequence-specific RNA interference might involve in the lengthened survival period of fish injected with virus-specific dsRNAs.

버섯에서 분리한 형광성 Pseudomonas spp. 의 ITS I 영역 분석에 의한 계통 분류 (Phylogeneitc Analysis of Fluorescent Pseudomonas spp. Isolated from the Cultivated Mushrooms on the Basis of ITS I Region)

  • 고승주;고승주;강희완;전명숙;류진창
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.350-357
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    • 1998
  • A total of 12 strains of fluorescent Pseudomonas isolated from the cultivated mushrooms such as Agaricus bisporus and Pleurotus ostreatus were collected. They consisted of pathogenic Pseudomonas spp. and epiphytic Pseudomonas spp. of the cultivated mushroom. To analyze the phylogenetic relationship of these strains, ITS I region, the 16S-23S intergenic spacer region in the ribosomal RNA (rRNA) operon, was cloned and sequenced. The spacer regions of these strains were 495∼527 nucleotides in length and contained the genes encoding isoleucine-tRNA (tRNAIle) and alanine-tRNA (tRNAAla). The reciprocal homologies of each ITS I sequence among these strains were in the range of 84.2%∼98.8%. According to the analysis of ITS I sequences, the fluorescent Pseudomonas spp. were phylogenetically classified into three clusters. Cluster I consisted of Pseudomonas fluorescens, P. tolaasii, P. gingeri’, and P.‘reactans’(WLRO). Cluster II comprised Pseudomonas fluorescens biovar C and F. Cluster III composed P. agarici. Cluster I and II could be classified into P. fluorescens complex. P. agarici formed an independent taxon clearly separable from P. florescens complex.

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Effect of Testosterone on the mRNA Levels of Gonadotropin Subunits in the Immature Rainbow Trout Pituitary

  • Kim Dae-Jung;Aida Katsumi
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제3권2호
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    • pp.135-142
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    • 2000
  • In order to clarify the role of gonadal sex steroids in the synthesis of gonadotropin (GTH) subunits in immature rainbow trout, we examined in vitro and in vivo effects of testosterone (T) on the pituitary mRNA levels of GTH I $\beta$, GTH II$\beta$ and a subunits by Northern blot analysis and on the pituitary content levels of GTH I$\beta$ and GTH II$\beta$by radioimmunoassay (RIA). The mRNA levels of the a subunit in T-treated fish were not changed more dramatically than those in control fish both in vivo and in vitro. Interestingly, the mRNA levels of GTH I$\beta$ in T-treated fish were shown to be slightly lower than those in the control fish under these experimental conditions, but no differences were observed in pituitary GTH I$\beta$ contents. In contrast, the mRNA levels and pituitary contents of GTH II$\beta$ subunit were strongly increased by T both in vivo and in vitro. These results demonstrate that the expressions of GTH I$\beta$ and II$\beta$ subunit genes in immatue rainbow trout pituitary are subjected to differential regulation by T.

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소 바이러스성 설사병 바이러스의 유전자 재조합 DNA clone의 작성에 관한 연구 (Construction of recombinant DNA clone for bovine viral diarrhea virus)

  • 여상건
    • 대한수의학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.389-398
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    • 1992
  • Molecular cloning was carried out on the Danish strain of bovine viral diarrhea virus(BVDV) to construct strategy for the diagnostic tools and effective vaccine of BVD afterwards. A recombinant DNA clone(No. 29) was established successfully from cDNA for viral RNA tailed with adenine homopolymer at 3'-end. $^{32}P$-labeled DNA probes of 300~1,800bp fragments, originating from the clone 29, directed specific DNA-RNA hybridization results with BVDV RNA. Recombinant DNA of the clone 29 was about 5,200bp representing 41.6% of the full length of Danish strain's RNA, and restriction sites were recognized for EcoR I, Sst I, Hin d III and Pst I restriction enzymes in the DNA fragment.

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범가자미에 대한 유전학적 동정 (Genetic Stock Identification of Spotted Flounder, Verasper variegatus from Yeocheun, Korea)

  • 김경길;김윤;남윤권;김동수
    • 한국양식학회지
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    • 제6권3호
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    • pp.221-233
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    • 1993
  • 범가자미, Verasper variegatus에 대한 유전학적 동정을 위하여 세포 크기, DNA함량, 염색체수 및 핵형분석 등의 세포유전학적 조사와 PCR 기법을 이용한 mtDNA 125 ribosomal RNA gene의 분석을 실시하였다. 본 종의 적혈구와 핵의 평균 부피는 각각 $211.10{\mu}m^3$$23.03{\mu}m^3$였으며, haploid DNA content는 0.79 pg/cell로서 잉어의 $46.5\%$, 포유류의 $22.6\%$로 나타났다. 염색체 수는 46개로 모두 acrocentric 염색체로 구성되어 있었으며, heteromorphic한 성 염색체는 관찰되지 않았다. PCR 기법을 이용하여 증폭된 범가자미 mtDNA의 12S rRNA gene segment는 대략 390bp로 나타났고, 12S rRNA gene의 PCR product를 제한 효소로 처리 결과, Ava I, Mae II, Sma I, Xba I는 1개의 restriction site가, Mae I는 2개의 restriction site가 관찰되었다. 범가자미 mtDNA의 12S rRNA gene segment의 염기 서열을 인간과 차넬메기와 비교한 결과, identity가 차넬메기 와는 $81.8\%$, 인간과는 $67.7\%$였다.

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Variations of Gonadotropin Subunits mRNA Levels at Different Stages of Ovarian Development in Masu Salmon, Oncorhynchus masou

  • Kim Dae-Jung;Han Chang-Hee;Aida Katsumi
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제2권2호
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    • pp.176-181
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    • 1999
  • The variations of gene expression and pituitary contents of GTH subunits during the ovarian development of masu salmon, Oncorhynchus masou, were investigated. The pituitary GTHs contents was measured by radioimmunoassays (RIAs) using purified GTH subunits and their antibodies. Pituitary contents of GTH $I\beta$ gradually increased from April through August, and reached the maximum in October. On the other hand, pituitary contents of GTH $II\beta$ remained low until August, but they rapidly increased in October. Total RNAs were prepared from pooled pituitaries and the GTH subunits mRNA in pituitaries was quantified by Northern blot hybridization using masu salmon cDNA probes for each GTH subunit. GTH $I\beta$ mRNA level increased with the progression of ovarian maturity. However, GTH $II\beta$ mRNA was detected only at a more advanced stage, and were extremly high at ovulation. A high levels for GTH a mRNA was detected only at ovulation stage. The synchronous increase in pituitary contents and mRNA levels suggested that ovarian maturity in masu salmon was regulated by both GTH I and GTH II.

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C2C12 myotube에서 insulin-like growth factor-I이 plectin과 MACF1 발현에 미치는 영향 (Insulin-like Growth Factor-I Induces Plectin and MACF1 Expression in C2C12 Myotubes)

  • 김혜진;황지선;곽이섭;이원준
    • 생명과학회지
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    • 제22권12호
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    • pp.1651-1657
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    • 2012
  • 본 연구에서는 C2C12 근육 세포에서 IGF-I이 세포골격 연결 단백질인 plectin과 MACF1 유전자 발현에 미치는 영향에 대해 알아보았다. 그 결과 IGF-I이 plectin 유전자의 단백질과 mRNA 발현을 증가시켰으며, MACF1 mRNA 발현을 증가시켰음을 알 수 있었다. 이는 운동에 의해 근육에서 분비가 증가하는 IGF-I이 근육 관련 유전자들의 발현을 조절하여 근부피 유지에 영향을 미친다는 기존의 연구 결과들에서 더 나아가 골격근 구조 안정화 및 근수축 기전에 기여하는 plectin과 MACF1 유전자 발현에도 영향을 미친다는 사실을 증명하였다는데 의의가 있다고 사료된다. 향후 근수축 기전에 있어, 운동 형태, 근섬유의 종류에 따른 세포 골격 단백질의 역할 규명 및 조절자에 관한 연구가 더 수행된다면 운동이 골격근의 생리적 변화에 미치는 영향에 대한 추가적 정보를 제공할 수 있을 것이다.

LPS로 자극한 돼지 말초혈액 단핵구세포의 Nitric Oxide (NO) 생산 및 Activator Protein-1 (AP-1) 활성화에 있어 Fucoidan의 효과 (Effects of Fucoidan on Nitric Oxide Production and Activator Protein-1 Activation in Lipopolysaccharide-Stimulated Porcine Peripheral Blood Mononuclear Cells)

  • 박종찬;안창환;강병택;강지훈;정의배;양만표
    • 한국임상수의학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.289-294
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    • 2015
  • Fucoidan은 갈조류로부터 추출되는 황산다당류로 다양한 생리학적 활성을 갖고 있다. 본 연구의 목적은 LPS로 자극한 돼지 말초혈액 단핵구세포(PBMCs)의 NO 생산에 있어 fucoidan의 효과를 검토하고, 이러한 효과가 iNOS의 발현과 AP-1의 활성화와 관련이 있는지를 조사하는데 있다. LPS 무처치 돼지 PBMCs에서 fucoidand의 처리는 NO 생산과 AP-1활성에 대해 효과를 보이지 않았다. 또한 iNOS와 AP-1의 mRNA 발현도 fucoidan 처치에 의해 영향을 받지 않았다. 그러나 LPS로 자극한 PBMCs에서는 NO 생산과 AP-1의 활성 그리고 iNOS와 AP-1의 mRNA 발현이 현저하게 증가하였다. 이와 같은 LPS에 의한 돼지 PBMCs의 NO 생산과 AP-1 활성증가는 fucoidan 첨가에 의해 감소되었다. 또한 fucoidan은 LPS에 의한 iNOS와 AP-1의 mRNA 발현증가도 억제시켰다. 이상의 결과는 fucoidan이 LPS 자극 돼지 PBMCs에서 iNOS 발현과 AP-1 활성의 억제와 함께 NO 생산을 하향 조절함으로써 항염증효과를 나타내는 것으로 사료되었다.