• Genomics & Informatics
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• 제18권2호
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• pp.23.1-23.6
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• 2020

The Human Phenotype Ontology (HPO) is the de facto standard ontology to describe human phenotypes in detail, and it is actively used, particularly in the field of rare disease diagnoses. For clinicians who are not fluent in English, the HPO has been translated into many languages, and there have been four initiatives to develop Japanese translations. At the Biomedical Linked Annotation Hackathon 6 (BLAH6), a rule-based approach was attempted to determine the preferable Japanese translation for each HPO term among the candidates developed by the four approaches. The relationship between the HPO and Mammalian Phenotype translations was also investigated, with the eventual goal of harmonizing the two translations to facilitate phenotype-based comparisons of species in Japanese through cross-species phenotype matching. In order to deal with the increase in the number of HPO terms and the need for manual curation, it would be useful to have a dictionary containing word-by-word correspondences and fixed translation phrases for English word order. These considerations seem applicable to HPO localization into other languages.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제16권2호
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• pp.75-92
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• 2013

The vascular plants of Thuja orientalis community in Seokmun-bong, Danyang were listed 222 taxa (4.5% of all 4,881 taxa of vascular plants); 67 families, 150 genera, 163 species, 2 subspecies, 43 varieties and 14 forms. Limestone plants, 29 taxa; Asplenium rutamuraria, Celtis koraiensis, Goodyera coreana, etc. So, Based on the legal protection species, endangered wild plants II, were recorded; Thalictrum coreanum (EN) and rare plants, 8 taxa; Thuja orientalis (LC), Exochorda serratifolia var. serratifolia (LC), Diarthron linifolium (EN), Bupleurum falcatum (VU), Lithospermum erythrorhizon (LC), Dracocephalum argunense (EN), Polygonatum robustum (EN), etc. and endemic plants, 3 taxa; Populus tomentiglandulosa (Planted plant), Thalictrum actaefolium var. brevistylum, Asperula lasiantha, etc. Based on the list of specific plants, 29 taxa; Thalictrum coreanum in class V, 7 taxa (Neillia uyekii for. uyekii, Prunus sibirica, Abelia coreana, etc.) in class IV, 8 taxa (Spiraea trichocarpa, Polygala tatarinowi, Asparagus oligoclonos, etc.) in class III, 2 taxa (Potentilla dickinsii var. dickinsii, Weigela florida) in class II, 11 taxa (Morus cathayana, Buxus microphylla var. koreana, Zizyphus jujuba var. jujuba, etc.) in class I. Based on the list of naturalized plants, 10 taxa (Robinia pseudoacacia, Oenothera biennis, Festuca arundinacea, etc.), naturalization rate (NR) was 4.5% of all 222 taxa of vascular plants and urbanization index (UI) was 3.1% of all 321 taxa of naturalized plants.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제11권3호
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• pp.12-19
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• 2008

This study was conducted to investigate the draft data for the habitat environment and massive propagation method of Miscanthus changii, which is classified as rare species. The in-site analysis of the native soil give a indication of pH 5.24~5.48, electric conductivity (EC)0.03~0.02 $dS{\cdot}m^{-1}$, organic matter (OM) 1.13~1.15%, Ca 3.4 $mg{\cdot}kg^{-1}$, K 0.25 $mg{\cdot}kg^{-1}$, Mg 0.53 $mg{\cdot}kg^{-1}$, N 0.23%, P 2.15 $mg{\cdot}kg^{-1}$ showed low and 0.33~9.12 $cmol{\cdot}kg^{-1}$ CEC. Growth and tiller number in rhizome propagation of Miscanthus changii showed that horticulture media (perlite 1+vermiculate 1+peat moss 1) is the most suitable soil to habitat. As for seed propagation, germination percentage is 0% (0/20) at first seeding, 2% (1/50) at second seeding and 2.1% (6/280) at third seeding. The average germination percentage was below 2%. This is the reason why Miscanthus changi disappear at habitat of poor soil environment and low germination. We gained 61 plants that 60 rhizome propagation and 1 by seed propagation, renatural to habitat.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제20권5호
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• pp.15-41
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• 2017

The purpose of this study is to present the basic data for conservation of forest ecosystem by surveying and analysing the flora distributed in Nakdong-Jeongmaek Mountains, Korea. The numbers of flora were 901 taxa including 116 families, 433 genera, 790 species, 4 subspecies, 90 varieties, 15 forms and 2 hybrids. The threatened species was Pedicularis ishidoyana. The rare plants were 33 taxa including Pseudostellaria sylvatica, Cimicifuga heracleifolia var. bifida, Isopyrum mandshuricum, Paeonia japonica, Syringa patula var. kamibayshii, Lilium distichum, Iris odaesanensis and so forth. The Korean endemic plants were 35 taxa including Salix koriyanagi, Thalictrum actaefolium var. brevistylum, Corydalis maculata, Lespedeza maritima, Cirsium setidens, Carex okamotoi and so forth. The specific plants by floristic region were 155 taxa including 55 taxa of grade I, 41 taxa of grade II, 36 taxa of grade III, 18 taxa of grade IV and 5 taxa of grade V. The naturalized plants were 62 taxa including Rumex obtusifolius, Amaranthus lividus, Medicago sativa, Geranium carolinianum, Malva sylvestris var. mauritiana, Foeniculum vulgare, Sonchus oleraceus, Tradescantia reflexa and so forth. The invasive alien plants were 5 taxa including Rumex acetocella, Solanum carolinense, Ambrosia artemisiifolia, Aster pilosus and Lactuca scariola.

• 한국자원식물학회지
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• 제17권2호
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• pp.122-134
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• 2004

미동산의 자원식물상 조사는 2002년 3월부터 2003년 10월까지 20개월동안 수행하였고 관속식물상은 85과 266속 349종 48변종 3품종 등 총 400종류의 식물이 확인되었다. 자원식물상 조사결과 관상용 식물은 162종(40.5％), 식용 식물은 250종(62.5％), 약용식물은 257종(64.3％), 기타 용도 식물은 167종(41.8％)으로 확인되었다. 한국 특산식 물은 매미꽃, 터리풀, 자란초, 병꽃나무, 고려엉겅퀴, 분취 등 6종류로 조사되었고 산림청 지정 희귀 및 멸종위기식물은 매미꽃과 층층둥굴레가 확인되었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제50권
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• pp.108-114
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• 2023

In vitro conservation is one of the most effective strategies for rare plant protection, especially for orchid species. To maximize the success rates of in vitro explant establishment (stage I) in conservation programs, the application of tissue culture additives such as Plant Preservative Mixture^TM (PPM^TM) should be emphasized. In this study, we used Dendrobium thyrsiflorum Rchb.f. (1875) seeds and seedlings as a model for the evaluation of PPM^TM's phytotoxicity in the meristematic tissues of epiphytic orchids. PPM^TM had no observable inhibitory effect on protocorm, shoot, or root development when it was supplemented at 0.1%. PPM^TM supplementation caused adverse effects on D. thyrsiflorum explants at concentrations > 0.2%. At high concentrations, young in vitro seedlings showed damage, especially at the root tissue level. Based on this model, supplementation of 0.1-0.2% PPM^TM to culture media was successfully implemented to establish in vitro cultures of other rare orchid species in our conservation program.

• 한국환경복원기술학회지
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• 제27권4호
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• pp.45-66
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• 2024

This study aims to examine and analyze the diverse vascular plants in Maisan Provincial Park, with the objective of establishing fundamental data for the systematic preservation and efficient management of plant resources. A total of 23 field surveys were conducted from February 2022 to March 2023, and a total of 733 taxa were identified, including 120 families, 410 genera, 644 species, 17 subspecies, 52 varieties, 13 formas, 2 cultivars, and 5 hybrids. Among the surveyed taxa, 20 taxa were identified as rare plants designated by the Korea Forest Service. Additionally, one taxa of Cyrtosia septentrionalis, a grade II endangered species designated by the Ministry of Environment, was recognized. There were 26 taxa categorized as Korean endemic plants, and a total of 101 taxa represented floristic regional indicator plants. Moreover, a total of 53 taxa were identified as naturalized plants and 5 taxa were classified as ecosystem-disturbing plants. The urbanization index and naturalized plant index were calculated to be 16.5% and 7.2%, respectively.

• 한국환경생태학회지
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• 제8권2호
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• pp.183-192
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• 1995

본 연구는 주왕산 국립공원을 대상으로 서식 조류군집을 파악하고, 이의 보호 및 관리 방안을 제시하기 위하여, 2개의 조사구역을 선정하고, 1994년 봄, 여름, 가을에 걸쳐 야생 조류 군집을 선조사법에 의해 조사하였다. 조사기간 동안 관찰된 야생조류는 총 42종으로, 봄에는 33종, 여름에는 32종, 가을에는 26종이 관찰되어 온대 조류군집의 전형적인 형태를 보였으며, 천연기념물 및 희귀 조류는 검독수리, 붉은배새매, 수리부엉이, 큰오색딱다구리 등 7종이었다. 번식기 영소길드는 종 수에 있어서는 수관층 영소길드가 높았으나 ha당 서식 밀도는 수동 영소길드의 비율이 가장 높았으며, 채이길드는 봄, 여름에는 수관층 채이길드가 우점하였으나 가을에는 관목층 채이길드가 증가하는 경향을 보였다. 관찰된 천연기념물 및 희귀 조류의 서식지는 자연보존지구와 일치하는 경향을 보여 이들의 보호를 위해서는 이들 조류의 계속적 연구와 보호.관리가 필요하며 자연보존지구의 재설정 및 이 지역의 철저한 보호가 필요한 것으로 생각된다. 또한 관목층 길드의 보호를 위해서 등산로 주변에 관목을 조성하거나 등산객의 통제가 필요하며, 겨울의 야생조류 관리를 위하여 먹이 식물을 식재하거나 인공먹이를 제공하고, Cover자원을 위해서 관목층, 인공새집의 제공이 필요하다. 최근 야생 고양이의 피해가 증가되고 있으므로 이의 철저한 구제가 필요하다고 생각된다.

• 한국자원식물학회지
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• 제18권2호
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• pp.285-301
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• 2005

본 조사는 식물상을 밝힘으로서 체계적이고 효율적인 보존관리대책을 마련하데 필요한 정보를 제공하고 우리나라 최남단에 속하는 도서에 있어서 식물자원의 분포특성을 파악하고자 수행하였다. 관속식물은 65과 140속 162종 2변종으로 총 164분류군이었는데 그 중 양치식물은 6과 13속 15종, 나자식물은 1과 1속 1종, 피자식물에 있어서는 쌍자엽식물이 49과 97속 114종 1변종으로 115분류군, 단자엽식물은 10과 29속 32종 1변종으로 33분류군이 출현하여 계 59과 126속 146종 2변종으로 계 148종이었다. 미기록 종은 양치식물 중 점고사리, 쇠고비, 큰족제비고사리, 사다리고사리 등 4종, 단자엽식물 중 강아지풀, 줄, 송이고랭이, 꽃토란, 개구리밥, 부채마 등 6종, 쌍자엽식물 중 큰사방오리, 개모시풀, 애기싱아, 미국자리공, 갯장구채, 새머루, 누리장나무, 보리장나무. 진득찰 등 9종 총 16과 19속 19종이었다. 희귀식물로서는 국내 거문도와 제주도에만 분포하는 것으로 알려진 박달목서가 자생하고 있으며, 바위연꽃의 자생지도 확인되었다. 또한 귀화식물은 총 20과 33속 34종 1변종으로 총 35분류군이었다.

• 한국환경생태학회지
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• 제37권5호
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• pp.392-402
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• 2023

본 연구는 천관산도립공원의 식물사회 특성을 파악하고 지속가능한 식생관리와 도립공원 연구에 필요한 기초자료를 구축하기 위해 수행되었다. 천관산도립공원을 대상으로 126개의 방형구를 설치하여 출현한 목본수종을 조사하였고 희소종을 제외한 종을 중심으로 종간결합분석을 실시하였다. 그 결과를 Gephi 0.10 프로그램을 이용하여 소시오그램으로 작성하였으며, 인접한 노드 간 그룹을 나누어주는 모듈화 분석과 네트워크 중심성 및 구조분석을 실시하였다. 분석 결과, 조사된 방형구 내 출현빈도는 청미래덩굴이 가장 높게 나타났고, 졸참나무, 사스레피나무, 때죽나무, 조릿대 등의 순으로 높게 나타났다. 희소종을 제외한 69종에 대해 종간결합분석을 실시하였고, 양성결합을 토대로 식물사회네트워크를 시각화하였다. 식물사회네트워크는 69개의 노드와 396개의 연결선으로 구성되어 있으며, 한 수종이 평균 약 17.9종과 종간결합을 맺으며 2.3단계 만에 서로 간 연결되었다. 69종은 모듈화 분석을 통해 3개의 그룹으로 나뉘었으며, 1그룹은 주로 상록활엽수 및 난온대 지역에서 출현하는 수종으로 이루어졌으며, 2그룹은 낙엽활엽수 위주로 이루어졌다. 3그룹은 주로 햇빛이 잘 들고 건조한 양지에서 잘 자라는 수종으로 나뉘었다.