• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제15권12호
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• pp.1070-1079
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• 1994

Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) studies are performed for the sets of 40 quinolones and 47 naphthyridines. Net charge, van der Waals volume, polarizability, and dipole moment are empolyed as theoretical descriptors(independent variables) to find the relationship between activity and physicochemical properties such as electrostatic effect, steric effect, and transferability. The results are analyzed by the regression and the factor analysis. It is found that for Gram-negative bacteria, the QSAR of quinolone and naphthyridine are substantially different: to describe the activity, the electrostatic effect is the most important for quinolone, and the steric effect and the transferability for naphthyridine.

• 통합자연과학논문집
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• 제9권1호
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• pp.1-9
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• 2016

Leucine rich repeat kinase 2 (LRRK2) is a highly promising target for Parkinson's disease (PD) that affects millions of people worldwide. A three-dimensional quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) analysis was performed on a series of pyrrolopyrimidine-based selective LRRK2 kinase inhibitors. This study was performed to rationalize the structural requirements responsible for the inhibitory activity of these compounds. A reliable 3D-QSAR model was developed using comparative molecular field analysis (CoMFA) technique. The model produced statistically acceptable results with a cross-validated correlation coefficient ($q^2$) of 0.539 and a non-cross-validated correlation coefficient ($r^2$) of 0.871. Robustness of the model was further evaluated by bootstrapping and progressive scrambling analysis. This work could assist in designing more potent LRRK2 inhibitors.

• 대한화학회지
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• 제54권1호
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• pp.77-87
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• 2010

40여년전에 보고된 이래 병원에서 유래한 메치실린-저항 Staphylococcus aureus (MRSA) 은 세계적으로 큰 문제가 되어왔다. 항균성의 가능성을 가지는 새로운 약품을 개발하기 위하여 N'-[(-3-substituted-4-oxo-1,3-thiazolidin-2-ylidene]-4-hydroxy benzohydrazide (4a-4.i)와 N'-[-(3,4-disubstituted)-1,3-thiazolidin-2ylidene)]-4-hydroxybenzohydrazide (5.a-5.i)~(10.a-10.i)을 적절한 합성방법을 사용하여 합성하였다. 이들 합성된 화합물들은 s. aureus 균주에 대해 생체외 조건에서 분석하였다. 시료 화합물과 표준 화합물에 대해 최소억제농도(MIC)를 결정하였다. 시험한 모든 화합물들은 2000 ${\mu}g$/mL 투여량까지는 독성이 없었고, 사용한 균주에 대해 상당한 항균성을 보였다. 특히 6.f, 7.g, 9.f 와 10.f, 10 i 들이 가장 항균성이 컸다. 이것으로 미루어 파라-히드록시벤조히드라자이드 고리와 치환된 싸이아졸린 고리는 항균성에 필수적임을 알 수 있었다. 3D-QSAR 분석결과로 파라-히드록시벤조히드라자이드의 활성자리에 대한 결합방식을 알게되었다.

• 농약과학회지
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• 제2권2호
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• pp.16-21
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• 1998

비스 방향족 ${\alpha},{\beta}$-불포화 케톤 유도체의 헤테로 방향족고리($R_{1}$) 치환체중 치환 phenyl backbone($R_{2}$)들의 구조변환에 따른 벼도열병균(Pyricularia oryzae)과 토마토역병균(Phytophthora irifestans)에 대한 in vivo에서의 항균활성 관계(SAR)를 3-D QSAR 방법인 비교분자장 분석(CoMFA)으로 해석하였다. 두 식물병원균에 대한 항균활성을 설명하는 CoMFA결과는 2-D QSAR에서 검토된 결과와 유사한 경향이었으며 입체효과(Es)와 전자효과(${\sigma}$)로 설명할 수 있었다. 즉, 벼도열병균은 aryl group에 bulky한 치환기(Es>0)가 도입되어야 하며 ${\beta}$탄소원자의 양하전이 증가할수록 강한 항균활성을 나타낼것으로 기대되었다. 반면, 토마토역병균의 경우에는 aryl group에 체적이 작은 치환기가 도입될수록, 그리고 ${\beta}$ 탄소원자의 양하전이 감소할수록 강한 항균활성을 나타낼 것으로 기대 되었다. 또한, 입체효과와 전자효과를 등 고도로 나타낸 CoMFA결과가 기존의 2-D QSAR보다 항균활성에 미치는 화합물의 구조적 요인을 보다 구체적으로 제시할 수 있었다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2008년도 한국컴퓨터종합학술대회논문집 Vol.35 No.1 (A)
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• pp.43-44
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• 2008

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제28권7호
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• pp.1231-1234
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• 2007

• 약학회지
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• 제46권4호
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• pp.219-225
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• 2002

We have performed a 3D-QSAR/CoMFA analysis of the cytotoxic activities of thirty-five 3-arylisoquinoline derivatives against SK-OV-3 tumor cell line. The results suggested that the electrostatic, steric and hydrophobic factors of 3-arylisoquinolines were strongly correlated with the antitumor activity. Considerable predictive ability (cross-validated r2 as high as 0.841) was obtained through CoMFA.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제31권12호
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• pp.3838-3841
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• 2010

• 한국환경성돌연변이발암원학회:학술대회논문집
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• 한국환경성돌연변이발암원학회 2004년도 춘계학술대회
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• pp.61-61
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• 2004

• 대한약학회:학술대회논문집
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• 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2
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• pp.357.1-357.1
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• 2002

Three-dimensional quantitative activity relationship (3D-QSAR) study for a series of arylsulfonylimidazolidinone derivatives with antitumor activity was conducted using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices anaysis (CoMSIA). The in vitro cytotoxicity against human lung carcinoma (A549) exhibited a strong correlation with steric and electrostatic factors of the molecules. (omitted)