Talaromyces flavus mediates the transmission of Apple stem grooving virus (ASGV) to several host plants. The ASGV-F carried by T.flavus was partially purified from the fungus. Based on sequence analysis and homology searches, this is closely related to other ASGV strains isolated from host plants. The partially purified viral coat protein (CP) was separated on a 12% SDS-polyacrylamide gel and analyzed by Western blotting with an ASGV anti-serum. A single band at 28 kDa reacted with the ASGV anti-serum. The deduced amino acid sequence of the ORF-l showed conserved domains, including an NTP-binding helicase motif, GFAGSGKT. The amino acid sequences of the helicase and CP showed strong homology to other ASGV strains (98%). All ASGV isolated from plants and fungi had salt bridges composed of the CP and the GFAGSGKT motif of the helicase, which are commonly conserved in plant viruses. These results suggest that ASGV-F is one of ASGV strains isolated from T.flavus based on sequence similarity as well as the serological analysis of CP.
The purpose of this study was to investigate the changes of vitamin C and lactic acid bacteria count in Dongchimi used different kinds of water (distilled water, purified water, Cho Jung Carbonated Natural water). Dongchimi used different kinds of water was fermented at $10^{\circ}C$ for 46 days. The changes of pH on Dongchimi used different kinds of water decreased in all samples during fermentation period, and then showed a slow decrease after 12 days of fermentation. The total acidity of Dongchimi used Cho Jung Carbonated Natural water arrived slowly at best tasting condition(0.3~0.4 point) compared with other conditions. The changes of salt content were ranked high one by one , Cho Jung Carbonated Natural water>purified water>distilled water during fermentation period. At early stage of fermentation, the changes of turbidity of Dongchimi used Cho Jung Carbonated Natural water showed highly as compared with other test conditions for 12 days of fermentation. Vitamin C content was measured high in Dongchimi used Cho Jung Carbonated Natural water during the fermentation period. Because calcium content was high in carbonated natural water, carbonated natural water had the highest calcium content during the fermentation period. The changes of lactic acid bacteria count showed the highest price at all experimental groups in 15 days of fermentation, but those of Dongchimi used Cho Jung Carbonated Natural water showed the highest price in 19 days of fermentation.
대장균의 RNase P의 RNA 성분인 M1 RNA는 대장균 rnpB 유전자의 주요한 일차전사물인 선구-M1 RNA로부터 3'가공으로 생성된다. 이 가공 활성을 가지고 있는 효소 분획을 부분 정제하고 그 특성을 조사하였다. 이 활성 분획을 높은 염농도에 노출시키면 가공 활성이 불활성화하는 것으로 보아, 가공효소는 여러 효소로 이루어진 효소 복합체인 것으로 추정된다. 이 효소 분획은 화학적 핵산 가수분해효소인 납(II) 이온으로 처리하면 효소 활성을 잃지만, 효소 분획 자체에서 추출한 RNA를 가하면 효소 활성을 되찾는다. 이 결과는 효소 활성에는 RNA 분자가 필요하다는 것을 시사한다. 부분 정제한 효소로 형성되는 절단자리들의 분석 결과도, 3'가공과정이 여러 효소에 의하여 일어나고, 적어도 두 가지 다른 경로로 일어난다는 것을 암시한다.
미생물이 생산하는 생물 고분자의 기능성 당색 및 용도 재발 연구의 일환으로. Bacillus sp.의 알카리 발효에 의해 생합성된 점성의 생물 분자의 리올로지 특성을 다른 미생들 다당 및 식뮬 다당류와 비교하면서 검토하였다. 1% 정제 고분자 용액은 xanthan gum 및 guar gum과 마찬가지로 항복응럭을 갖는 의가소성 유체의 거동을 널었다. 유동지수(n)값은 0.41 - 0.75로 전단속도 의존성을 보였으며, 점조도지수(K)값은 0.87 Pa $s^n$으로 guar gum보다는 작고 xanthan gum 보다는 컸다. 그러나 항복응력 (${\tau}_y$)값은 2.28Pa로 xanthan gum이나 guar gum보다 크게 낮았다. 또 정제고분자의 점조도지수(K)값은 지수 함수식에 따르는 농도 및 온도 의존성을 나타내었다. 농도 의존성은 기울기가 서로 달라지는 두 개의 직선관계를 나타냈으며, 농도가 증가에 따라 의가소성은 강해졌다. 시료 용액은 온도 의존성이 매우 낮은 특징을 나타내었고, 유동의 활성화에너지지는 1.16kcal/g mol이었다. 겉보기 점도는 pH와 염의 변화에 매우 불안정함을 나타내었으나 유기용매에 대하여는 어느 정도 안정함을 보였고, 점증제를 첨가하였을 때 겉보기 점도의 상승효과는 관찰되지 않았다.
Peptidylprolyl cis-trans isomerase (PPlase) catalyzes the cis-trans isomerization of prolyl peptide and facilitates the folding of cellular proteins and peptides. PPlase consists of two distinct immunophilins, each specifically binding to the immunosupressive drug cyclosporin A (CsA) or FK506, respectively. A PPlase was isolated and partially purified from porcine spleen. The molecular weight of porcine spleen PPlase was determined to be ~14,000 on the basis of SDS-PAGE. The purified enzyme was strongly inhibited by FK506, but not by CsA. The inhibition constant and the true concentration of enzyme preparations were determined by active site titration using the tight binding inhibitor FK506: $K_{i}=18.7$ nM and $E_{t}=172$ nM. The equilibrium ratio of conformer. [cis]/[trans], of prolyl peptide substrates (N-Suc-Ala-Xaa-Pro-Phe-p-NA) in anhydrous trifluoroethanol/LiCl solvent system varied from 0.24 to 0.85 depending on the nature of Xaa. Overall. in this solvent-salt system, the populations of the cis conformer of substrates in equilibrium are higher than in an aqueous solution so that the substantial error caused by high background absorption can be reduced. The reactivities of porcine spleen PPlase are shown to be highly sensitive to changes in the structure of substrates. Thus, $k_{cat}/K_m$ value for the most reactive substrate (Xaa Leu) is $4.007+10^{6}M^{1}s^{1}$ and, is 2,636 fold higher than that for the least reactive peptide substrate tested, Xaa=Glu.
고염에서 자라는 원시 박테리아인 Halococcus agglomeratus에서 Thiol-specific antioxidant 활성을 보이는 분자량이 22-kDa인 향산화 단백질을 순수 분리 정제하여 향산화 활성의 특성을 조사하였다. 그 결과 진핵 세포의 Thiol-specific antioxidant protein (TSA of TPx)과 유사한 활성을 갖는 것을 확인 할 수 있었다. 정제된 Thiol-specific antioxidant protein 은 환원제로 thiol 성분을 갖는 비효소적 금속 촉매 산화계( $Fe^{3+}$, $O^2$, DTT 또는 2-mercatoethanol : thiol- MCO system)에 의하여 Glutamine Synthetase (GS)의 불활성화를 방어하고 Ascorbate 같은 nonthiol 성환원제를 갖는 금속 촉매 산화계 ( $Fe^{3+}$, $O^2$, Ascorbatenol: nonthiol- MCO system)에 의해서는 GS의 불활성화를 방어하지 못하였다. 이것은 환원형 thiol성분이 항산화 단백질의 항산화 활성에 전자 공여체로 요구되어 지기 때문이라고 판단된다. 이 단백질은 다른 TPx와는 다르게 100%의 활성을 나타내려면 NaCl의 농도가 500mM이상이 되어야 한다. 이상의 결과는 원시 박테리아에도 TPx가 존재하여 활성 산소종을 제거하는 생화학적 역할을 수행함을 시사하고 있다.
본 연구에서는 수율과 protease 제거정도 그리고 분리정제 비용을 고려하여 암모늄 설페이트 침전과 Monoplus S100 수지로 처리한 효소를 밀가루에 적용하여 반죽 형성 시 물리적 특성개선 효과를 조사하였다. 암모늄설페이트 침전, 이온 교환수지, 겔 크로마토그래피를 통한 정제된 효소의 분자량은 SDS-PAGE상에서 38,000으로 판정되었고 단일밴드로 나타나 정제도가 높음을 알 수 있었다. Farinograph를 이용하여 측정한 밀가루 반죽의 특성변화에서 저항성의 지표가 되는 안정도는 대조구가 4분, 조효소는 대조구보다 짧은 3.5분, 정제된 효소는 대조구보다 길게 측정되었다. 반죽의 약화도는 조효소의 경우 대조구보다 높게 측정되었고, 정제된 효소의 경우 대조구보다 낮은 값을 나타냈다. 이 결과로부터 조효소의 경우 protease 존재로 인하여 반죽의 분해가 진행됨을 알 수 있었고, 정제된 효소 첨가로 인하여 물성이 향상됨을 알 수 있었다. 대조군의 밀가루 반죽의 valorimeter 값은 52로 측정되었고, 정제된 효소첨가에 의해 증가되었다. S. mobaraensis가 분비하는 transglutaminase의 정제단계를 조절하고 최적화 시킬 경우 국내산 밀가루의 반죽특성의 효과를 기대할 수 있다고 판단된다.
Zhang, Qing;Wang, Jie;Sun, Qing;Zhang, Shu-Ming;Sun, Xiang-Yang;Li, Chan-Yuan;Zheng, Miao-Xin;Xiang, Wen-Liang;Tang, Jie
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제31권8호
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pp.1144-1153
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2021
A released exopolysaccharide (rEPS)-producing strain (LM187) with good acid resistance, bile salt resistance, and cholesterol-lowering properties was isolated from Sichuan paocai and identified as Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides. The purified rEPS, designated as rEPS414, had a uniform molecular weight of 7.757 × 105 Da. Analysis of the monosaccharide composition revealed that the molecule was mainly composed of glucose. The Fourier transform-infrared spectrum showed that rEPS414 contained both α-type and β-type glycosidic bonds. 1H and 13C nuclear magnetic resonance spectra analysis showed that the purified rEPS contained arabinose, galactose, and rhamnose, but less uronic acid. Scanning electron microscopy demonstrated that the exopolysaccharide displayed a large number of scattered, fluffy, porous cellular network flake structures. In addition, rEPS414 exhibited strong in vitro antioxidant activity. These results showed that strain LM187 and its rEPS are promising probiotics with broad prospects in industry.
This study was performed to screen the antimicrobial activities of the extract from the Pacific oyster Crassostrea gigas against skin pathogens and to purify the relevant antibacterial peptide. The acidified extract showed potent antibacterial activities against gram-positive and gram-negative bacteria but showed no activity against Candida albicans and no significant cell toxicity. Among acne-causing pathogens, the acidified extract showed potent antibacterial activity only against Staphylococcus aureus, and its antibacterial activity was completely abolished by treatment with trypsin or chymotrypsin, and was inhibited by salt treatment. The acidified extract showed strong DNA-binding ability but did not show bacterial membrane permeabilizing ability. Based on antimicrobial activity screening and cytotoxic effects, a novel antibacterial peptide was purified from the acidified gill extract using solid-phase extraction, cation-exchange, and reversed-phase HPLC. The resulting peptide had a molecular weight of 4800.8 Da and showed partial sequence homology with the carbonic anhydrase 4 (CA4) protein in the hard-shelled mussel. Overall, we purified a novel antibacterial peptide, named cgCAFLP, which is related to carbonic anhydrase 4 (CA4) protein, against skin pathogens. Our results suggest that the Pacific oyster extract could be used as an additive to control some acne-related skin pathogens (S. aureus).
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[게시일 2004년 10월 1일]
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