Optimal biodegradation kinetics models to the initial nonylphenol ethoxylates-30 concentration were investigated and had been fitted by the linear regression. Microorganisms capable of degrading nonylphenol ethoxylates-30 were isolated from sewage near Ulsan plant area by enrichment culture technique. Among them, the strain designated as EL-10K had the highest biodegradability and was identified as Pseudomonas from results of taxonomical studies. The optimal conditions for the biodegradation were 1.0 g/ι of nonylphenol ethoxylates-30 and 0.02 g/ι of ammonium nitrate at pH 7.0 and 3$0^{\circ}C$. The highest degradation rate of nonylphenol ethoxylates-30 was about 89% for 30 hours incubation on the optimal condition. Biodegradation data were fit by linear regression to equations for 3 kinetic models. The kinetics of biodegradation of nonylphenol ethoxylates was best described by first order model for 0.1 $\mu\textrm{g}$/ι nonylphenol ethoxylates-30 ; by Monod no growth model and Monod with growth model for 0.5 $\mu\textrm{g}$/mι and 1.0, 5.0 $\mu\textrm{g}$/mι, respectively.
For the selection of powerful antagonistic bacterium for biological control of soil borne Eminia carotovora subsp. carotovora causing rot of vegetable, excellent strains (S4, S14, 565) were selected from 1,196 strains of bacteria which were isolated from rhizosphere in vegetable root rot-suppresive soil. Strains were identified to be Pseudomonas species with Api 20NE kit. Antagonistic substance was produced in 523 synthetic broth medium at pH 7~8 and $30^{\circ}C$ during 3 days culture. The substance was stable in the pH range of 6 to 9. When the basal medium was supplemented with mannitol and sorbitol as carbon source and calcium chloride as metal salt, the production of the inhibitory substance was increased. The inhibitory acitivity was increased by the addition of fertilizer in soil. The isolated strains were resistant to the agricultural chemical such as benomyl and fosethyl-Al-folpet, and the antibiotics such as penicillin and lincomycin. We had found that Pseudomonas sp. S14 strain had a single plasmid. After treated with acridin orange for curing, we confirmed the existence of antagonistic gene in the chromosomal DNA.
238 strains of bacteria were isolated from sewage and soil samples collected mainly in Seoul and its suburbs by enrichment culture on crude oil or hydrocarbon minimal medium. Of the isolates, 68 strains were tentatively identified as the genus Pseudomonas, 11 strains as Alcaligenus, and 10 strains as Acinetobacter. Of the 68 strains of Pseudomonas sp., 35 strains were identified as P. aeruginosa, 5 strains as P. fluorescence, 10 strains as P. putida, and 2 strains as P. mendocina.
The purpose of this work was to investigate the relationships between acrylamide degradation by Pseudomonas sp. JK-7 and several relevant physicochemical environment parameters. In initial experiments, the bacterial culture, strain JK-7 isolated from paddy soil sample was developed to grow aerobically with acrylamide as the sole source of carbon and nitrogen. The bacterium was identified as genus Pseudomonas in the basis of use BIOLOG test, and designated as Pseudomunas sp. JK-7. Strain JK-7 could degrade 50 mM acrylamide completely within 72 hours of incubation. Major intermediates resulting from acrylamide degradation were not detected with the HPLC methodology except acrylic acid which appeared to accumulate transiently in the growth medium. The pH increased from 7.0 to 8.7 with complete degradation of the initial 50 mM acrylamide within 72 hours of incubation. pH control in the range of 5 to 9 influenced the growth of JK-7 and acrylamide degradation, whereas it was not examined the growth and degradation at pH 3 or pH 11, respectively. The effect of supplemented carbons (e.g., glucose, fructose, citrate, succinate) on the acrylamide degradation by the test culture of JK-7 was evaluated. The results indicated that the addition of carbons accelerated the bacterial growth and acrylamide degradation compared to those in the absence of supplemented carbons. The effect of supplemented nitrogens on the degradation was monitored. Increasing concentrations of yeast extract resulted in higher growth yield, based on the turbidity measurement, and complete degradation of acrylamide. However, acrylamide degradation was essentially uninfluenced by the addition of $(NH_{4})_{2}SO_{4}$, $NH_4Cl$ or urea. Addition of $AgNO_3$, $CuSO_4$ or $HgCl_2$ except $ZnSO_4$ in the test culture inhibited the degradation of acrylamide and growth of JK-7.
For the production of D-lactic acid from DL-2-chloropropionic acid, about 80 strains of bacteria capable of assimilating DL-2-chloropropionic acid as a sole carbon and energy source were isolated from the soil. JH-007 strain that showed the higest productivity of D-lactic acid and didn't produce L-lactic acid from DL-2-chloropropionic acid was selected from them and identified as Pseudomonas sp. The optimal conditions for the production of D-lactic acid from DL-2-chloropropionic acid were examined. The resting cells of JH-007 cultured in LB medium containing 3 g/l of DL-2-chloropropionic acid were used as an enzyme source. The reaction mixtures for the maximal production of D-lactic acid were consist of 10 g/l of resting cells and 3 g/l of DL-2-chloropropionic acid in 125 mM sodium carbonate buffer. The optimal pH for the reaction was 10.0 and the optimal temperature was 30$\circ$C. When 1 g/l of DL-2-chloropropionic acid was added intermittently to the reaction mixture under the above condition, 5.72 g/l of D-lactic acid was produced after incubation of 5 hrs. This amount of D-lactic acid corresponded to a 98.4% yields and the optical purity was 99.8%.
An alkalophilic bacterium, the strain AC-711 as a potent producer of alkaline cellulase, was selected among many isolates from soil environments. Morphological, physiological and chemical characteristics of the strain AC-711 suggested that it belongs to the genus Pseudomonas according to the Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, however the G+C mol% (54.43) of its chromosomal DNA is lower than the normal values of the genus. The major cell wall fatty acids were determined as 15:0 and 17:0 anteiso. The production of alkaline CMCase by the strain was maximal when grown on the mediun containing 1% carboxymethyl cellulose, 0.1% $KH_2PO_4$, 0.02% $CoCl_2$, 0.02% Tween 80, 0.5% $Na_2CO_3$, 0.8% yeast extract, pH 10.3 at $30^{\circ}C$ for 3 days, and the most of enzyme was excreted into culture mediun.
The cellulase components were partially purified from the culture filtrate of the alkalophilic bacterium Pseudomonas sp. AC-711 and its enzymatic properties were characterized. The specific activity of the purified major enzyme component was 3.5 units/mg protein as carboxymethyl cellulase and the yield was 23% of the total activity of the culture broth. The molecular weight of the component was 46,000 and the Km and Vmax on CMC were determined as $15.4mg\;mL^{-1}$ and $4.17{\mu}moles\;mL^{-1}\;min^{-1}$, respectively. The enzyme was stable at the temperatures below $60^{\circ}C$ and at the pH range of 4.0~11.0, and the optimal temperature and pH were $60^{\circ}C$ and pH 8.0, respectively. The enzyme activity was not significantly affected by the common surfactants (concentration: 0.05%) such as ${\alpha}$-olefin sulfonate, linear alkylbenzene sulfonate, sodium dodecyl sulfonate, hexadecyltrimethylammonium bromide and Tween 80. The enzyme was activated by the metal ions such as $Ca^{2+}$, $Cu^{2+}$, $Co^{2+}$, whereas inhibited by $Hg^{2+}$ and $Zn^{2+}$. The enzyme exhibited relatively high activity toward amorphous CMC as compared with crystalline substrates such as filter paper and avicel.
A bacterial glutathione S-transferase from Pseudomonas sp. DJ77 has been crystallized. The crystals diffract to at least $2.3\;\AA$ resolution, and belong to the orthorhombic space group $P2_{1}2_{1}2_{1}$, with cell parameters $a=97.4\;\AA,\;b=100.3\;\AA$, and $c=46.0\;\AA$. There is one dimer molecule of pGST per crystallographic asymmetric unit. with the crystal volume per protein mass of $2.34\;\AA^3/dalton$ and a solvent content of about 47% (v/v).
The cellular responses of RDX-degrading bacterium, Pseudomonas sp. HK-6 to explosive hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine (RDX) were examined. Strain HK-6 grown at different RDX concentrations was found to demonstrate the survival rate in proportional to the rate of the stress shock proteins produced in this bacterium. Analysis of total cellular fatty acid acids showed that lipids 10:0 iso and 14:1 $\omega$5c/$\omega$5t increased approx three times in strain HK-6 grown on RDX media than TSA media. SDS-PAGE and Western blot using anti-DnaK and GroEL revealed that several stress shock proteins including 70 kDa DnaK and 60 kDa CroEL were newly synthesized in strain HK-6 exposed to different RDX concentrations in exponentially growing cultures. 2-D PAGE of soluble protein fractions from the culture of HK-6 exposed to RDX demonstrated that approximately 300 spots were observed on the silver stained gel ranging from pH 3 to pH 10. As a result, 10 spots were significantly induced and expressed in response to RDX. Scanning electron microscopy fur the cells treated with 0.135 mM RDX for 12 hrs showed the presence of perforations and irregular rod shapes with wrinkled surfaces.
An aniline-utilizing microorganism identified as a species of Pseudomonas was isolated from soil contaminated highly with aniline and urea-herbicide. This strain was able to utilize aniline as the sole source of carbon and energy, and was shown to harbor a single large plasmid mediating the aniline assimilation. Subsequent plasmid-curing of this bacterium resulted in the abolishment of the aniline utilizing phenotype and the loss of catechol-C2,3O-oxygenase. The reestablishment of the plasmid, denoted pB10, in cured Pseudomonas sp. via filter surface mating, resulted in restoration of the aniline assimilation abilities and enzyme activity.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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