• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권2호
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• pp.226-229
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• 2012

Bacterial hemoglobin from Vitreoscilla (VHb) is recognized as a good fusion protein for the soluble expression of foreign protein. In this study, we generated a monoclonal antibody (MAb) against VHb for its detection. For the rapid screening of MAb, a protein chip technology based on the Alexa-488 (A488) dye labeling method was introduced. In order to fabricate the chip, the VHb protein was chemically coupled to the chip surface and then the culture supernatants of 84 hybridoma cell lines were spotted onto the VHb chip. The bound MAbs were measured by A488-modified anti-mouse IgG. A single spot (MAb A10) exhibited significantly high signal intensity. The immunoblot analysis evidenced that the MAb A10 can detect VHb-fused proteins with high specificity.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제63권2호
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• pp.405-416
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• 2021

The aim of the study was to determine the effect of whole milk powder (WMP) as heterologous proteins on chicken breast emulsion-type sausages. The quality properties of WMP on such chicken breast emulsion-type sausages were investigated by measuring the proximate composition, pH, color, cooking yield, protein solubility, and by applying other methods, such as texture profile analysis (TPA), microphotograph, sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), and electronic nose. The crude fat, protein, and ash contents of 15% WMP samples were significantly higher than the control samples (p < 0.05). The redness of the cooked samples significantly increased with an increase in the WMP contents (p < 0.05). The cooking yield of WMP treated samples was significantly higher than the control sample (p < 0.05). Additionally, the hardness, gumminess, and chewiness of WMP treated samples were significantly higher than the control sample (p < 0.05). The sarcoplasmic and myofibrillar proteins of samples containing 15% WMP were significantly higher than the control samples (p < 0.05). The result of SDS-PAGE showed that the C protein, sarcoplasmic protein, actin, and tropomyosin increased with an increase in the WMP contents. The principal component analysis plot of WMP-treated samples was clearly different from that of the control samples. Based on these results, it was predicted that WMP could be useful as heterologous protein on emulsion-type sausage.

• 한국자기공명학회논문지
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• 제6권2호
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• pp.94-102
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• 2002

An interesting recent application of intermolecular NOE experiment is the saturation transfer difference NMR(STD-NMR) method that is useful in screening compound libraries to identify bio-active ligands. This technique also identifies the group epitopes of the bound ligand in a reversibly forming protein-ligand complex. We present here a complete relaxation and conformational exchange matrix (CORCEMA) theory (Moseley et al., J. Magn. Reson. B, 108, 243-261 (1995)) applicable for the STD-NMR experiment. Using some ideal model systems we have analyzed the factors that influence the STD intensity changes in the ligand proton NMR spectrum when the resonances from some protons on the receptor protein are saturated. These factors will be discussed and some examples of its application in some model systems will be presented. This CORCEMA theory for STD-NMR and the associated algorithm are useful in a quantitative interpretation of the STD-NMR effects, and are likely to be useful in structure-based drug design efforts. They are also useful in a quantitative characterization of protein-protein (or protein-nucleic acid) contact surfaces from an intermolecular cross-saturation NMR experiment.

• 한국해양생명과학회지
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• 제3권1호
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• pp.1-8
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• 2018

Myosin is considered as the vital motor protein in vertebrates and invertebrates. Our present study was conducted to decipher the occurrence of myosin in dog fish (Squalus mitsukurii). We isolated one clone containing 979 bp cDNA sequence, which consisted of a complete coding sequence of 453 bp and a deduced amino acid sequence of 150 amino acids from the open reading frame with molecular weight, isoelectric point and aliphatic index are 16.72 Kda, 4.49 and 78.00, respectively. It contained 428 bp long 3' UTR with single potential polyadenylation signals (AATAAA). The predicted EF CA²⁺ binding domains were identified in residue 6-41, 83-118 and 133-150. A BLAST search indicates this protein exhibits a strong similarity to whale shark (Rhincodon typus) MLC3 (91% identical) and also house mouse (Mus musculus) MLC isoform 3f (81% identical). Phylogenetic analysis revealed that this protein is a MLC 3 isoform like protein. This protein also demonstrates highly conserved region with other myosin proteins. Homology modeling of S. mitsukuri was performed using crystal structure of Gallus gallus skeletal muscle myosin II based on high similarity. Reverse transcription-polymerase chain reaction (PCR), quantitative PCR results exhibits dogfish myosin protein is highly expressed in muscle tissue.

• 대한의생명과학회지
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• 제2권1호
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• pp.41-48
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• 1996

환자의 복수와 늑막액으로부터 p-diazonium phenylphosphorylcholine(DPPC) coupled Separose-4B affinity chromatography와 hydroxylapatite chromatography를 실시하여 C-reactive protein (CRP)를 분리, 정제하였다. 정제된 CRP를 토끼에게 면역화하여 항혈청을 얻고 affinity chromatography를 하여 면역항체(IgG)를 분리하였다. 분리된 면역항체를 미립자에 감작시킨 후 미립자 응집반응에 의하여 3분내에 CRP를 측정할 수 있는 간이 면역 측정법을 개발하였다. 본 연구에서 개발된 CRP측정법의 검출범위는 0.5~20mg/㎗이며, 임상 시험 결과 0.7~2.9mg/㎗에서는 강한 응집 반응을, 5.O~l3.2mg/㎗에서는 약한 응집반응을 보였고 28mg/dl이상에서는 항원 과잉으로 인한(zone of Ag excess phenomenon) 위음성을 나타냈다. 74명의 환자 혈청을 대상으로 CRP의 농도를 조사한 결과 평균치는 3.8mg/dl이었으며 대부분의 환자에서는 10mg/dl 이하의 농도로 존재하였다. 그러므로 1차 판정시 음성을 나타낸 시료라도 혈청을 5~10배정도 희석하여 재분석한다면 오차없이 CRP 를 검출할 수 있었다. 환자 혈청을 검체로 하여 본 연구에서 개발한 면역측정법과 현재 수입 시판 중인 프랑스의 B사 제품과 일본의 I사 제품을 비교한 결과 좋은 상관관계를 보였다. 이와 같은 평가 분석을 통하여 볼 때 본 연구에서 개발한 간이 면역 측정법은 사용이 비교적 간편하며 신빙성이 있어 CRP를 스크리닝하는데 효과적임을 알 수 있었다.

• 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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• 제34권10호
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• pp.474-492
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• 2007

단백질 상호작용 네트워크는 생체 내에서 특정 역할을 담당하는 패스웨이나 복합체와 같은 중요한 의미의 많은 기능 모듈들을 포함하고 있다. 본 논문에서는 이 기능 모듈들과 정합될 수 있는 개념 모듈을 정의하고 이를 기반으로 원하는 기능 모듈들을 개념적으로 표현하고 효율적으로 탐색할 수 있는 새로운 방법을 제안한다. 개념 모듈은 트리플들과 이들 사이의 연산자로 이루어진 표현 규칙에 의해 정의 되며 탐색하고자 하는 기능 모듈들의 구조를 개념적으로 표현한다. 이 표현 규칙에서의 트리플은 한 기능 모듈을 구성하는 단백질들 사이의 구체적인 상호작용 관계를, 연산자는 트리플들 사이의 구조적인 연관 관계를 각각 개념적으로 정의한다. 또한, 사용자는 사전에 표현 규칙에 의해 잘 정의된 개념들을 조합하여 새로운 의미의 복합 개념 모듈을 정의할 수도 있다. 복합 개념 모듈은 복잡한 기능 모듈들의 개념적 구조를 보다 정교하게 표현할 수 있기 때문에, 사용자 탐색 질의의 의미적 표현력을 획기적으로 높일 수 있다. 정의된 규칙들은 XML로 관리될 수 있어 다른 종류의 단백질 상호작용 네트워크에서 사용자가 유사한 모듈들을 탐색하기 위해 쉽게 적용 가능하다. 본 논문에서는 또한, 구조적으로 복잡한 규칙들을 직관적으로 표현하고 효율적으로 탐색하기 위한 시각화된 질의 환경도 구현하였다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제17권11호
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• pp.640-647
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• 2016

형광 간섭 현상을 최소화시켜 상대적으로 민감한 측정이 가능한 aequorin기반 luminescence기술은 $G_{{\alpha}16}$ 단백질 도입을 통해 세포 내부의 칼슘 이동 신호를 감지하여 G 단백질 결합 수용체(G protein-coupled receptor, GPCR)의 기능 분석을 가능하게 하는 세포 기반 분석 기술로 수용체 및 G 단백질 유전자 전달의 최적화 과정이 필수적이다. 본 연구를 위해 corticotropin releasing factor receptor subtype 2(CRF2) 수용체를 모델 시스템으로 CRF2와 $G_{{\alpha}16}$ 단백질이 구축된 세 가지 안정화 세포주를 제작하였고, 이들을 이용한 서로 다른 세 가지 조건의 임시 발현 세포주에서 작용제(sauvagine)와 길항제(K41498)의 반응성을 분석하여 최적의 유전자 전달 방법을 도출하고자 하였다. 그 결과 sauvagine 및 K41498의 농도에 따른 반응에서 CRF2-$G_{{\alpha}16}$ 안정화 세포주가 임시 발현 세포주보다 10배 이상의 유효신호 비율을 나타내었고(z'=0.77) 임시 발현 세포주의 경우 $G_{{\alpha}16}$의 안정화 발현 이후에 CRF2를 전달하는 경우가 다른 임시 발현 조건보다 2배 이상 높은 효율을 보였다(z'=0.84). 따라서 임시 유전자 전달 기술을 GPCR 세포 기능 분석 시스템에 활용할 경우 $G_{{\alpha}16}$ 단백질에 대한 안정화 세포주를 우선적으로 구축하고, 목표하는 다양한 수용체들을 단계적으로 발현시키는 것이 최선의 방법이라 판단된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제17권10호
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• pp.1727-1732
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• 2007

Phenylacetic acid (PAA) is produced by many bacteria as an antifungal agent and also appears to be an environmentally toxic chemical. The object of this study was to detect PAA using Pseudomonas putida harboring a reporter plasmid that has a PAA-inducible promoter fused to a green fluorescent protein (GFP) gene. Pseudomonas putida KT2440 was used to construct a green fluorescent protein-based reporter fusion using the paaA promoter region to detect the presence of PAA. The reporter strain exhibited a high level of gfp expression in minimal medium containing PAA; however, the level of GFP expression diminished when glucose was added to the medium, whereas other carbon sources, such as succinate and pyruvate, showed no catabolic repression. Interestingly, overexpression of a paaF gene encoding PAA-CoA ligase minimized catabolic repression. The reporter strain could also successfully detect PAA produced by other PAA-producing bacteria. This GFP-based bioreporter provides a useful tool for detecting bacteria producing PAA.

• 한국식품과학회지
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• 제2권2호
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• pp.1-7
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• 1970

1) 고구마의 경제적 활용과 이유식품의 개발을 목적을 고구마 대두분 및 기타 영양소를 사용하여 단백함량이 20%되는 이유식품을 드럼건조법에 의하여 제조하는 방법을 설정하였다. 2) 이 제품의 단백효율(PER)은 2.63 으로서 고구마 대신 옥수수전분을 사용한 제품의 PER(3.30)보다 낮았는데, 이는 드럼건조중 가용태 라이신의 파괴에 의함을 알았다. 3) 본 이유식품의 전체영양가 (사료효율, 체성분의 조성, 단백질보유율)는 우유식품이나 고구마 대신 옥수수전분을 사용한 이유식품과 비슷하였다.

• 대한영양사협회학술지
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• 제12권4호
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• pp.369-377
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• 2006

Data from the 2001 Korea Health and Nutrition Examination Survey, a nationally representative, cross-sectional survey, were analyzed to assess prevalence of health intended food use overall and in relation to socio-demographic and lifestyle characteristics. Health intended food were classified into four broadly defined categories: vitamin and mineral supplements, health aid food, animal protein based restorative food and medicinal plants. Thirty three percent of adults aged 20 years or older reported taking health intended food in the past year : twenty four percent took vitamin or mineral supplements and medicinal plants were taken by 17 % of adults, health aid food by 15% and animal protein based restorative food by 6%. In multivariate logistic regression, female gender, older age, more education, regular exercise and non smoking were associated with greater use of vitamin or mineral supplements. Dietary quality was significantly associated with use of vitamin or mineral supplements or health aid food but not with use of medicinal plants or animal protein based restorative foods. Obese persons were less likely to take vitamin or mineral supplements. These findings suggest that epidemiologic studies of diet, demographic or lifestyle and health take health intended food use into account because of high prevalence of use of the food by the population and differential use of the food by socio-demographic and lifestyle characteristics.