Pyruvate dehydrogenase phosphatase (PDP) is a mitochondrial protein serine/threonine phosphatase that catalyzes the dephosphorylation and concomitant reactivation of the pyruvate dehydrogenase component of the pyruvate dehydrogenase complex (PDC). PDP consists of a catalytic subunit (PDPc, Mr 52,600) and regulatory subunit (PDPr, Mr 95,600). In the presence of $Ca^{2+}$, PDPc binds to the dihydrolipoamide acetyltransferase (E2) component of the pyruvate dehydrogenase complex in proximity to its substrate, the phosphorylated E1 component, thereby increasing the rate of dephosphorylation. PDPc possesses and intrinsic $Ca^{2+}$ binding site and a second $Ca^{2+}$ site is generated in the presence of E2. Using the unique interaction, highly pure PDPc was produced by the GSH-Sepharose-GST-L2 matrix with a specific activity of approx. 1000 U/mg and a yield of about 80%.
Kang, NaNa;Koo, JaeHyung;Wang, Sen;Hur, Sun Jin;Bahk, Young Yil
BMB Reports
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v.49
no.6
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pp.319-324
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2016
RNA polymerase II C-terminal domain phosphatases are newly emerging family of phosphatases that contain FCPH domain with Mg+2-binding DXDX(T/V) signature motif. Its subfamily includes small CTD phosphatases (SCPs). Recently, we identified several interacting partners of human SCP1 with appearance of dephosphorylation and O-GlcNAcylation. In this study, using an established cell line with inducible CTDSPL2 protein (a member of the new phosphatase family), proteomic screening was conducted to identify binding partners of CTDSPL2 in nuclear extract through immunoprecipitation of CTDSPL2 with its associated. This approach led to the identification of several interacting partners of CTDSPL2. This will provide a better understanding on CTDSPL2.
Kim, Young-Ok;Park, In-Suk;Nam, Bo-Hye;Kong, Hee-Jeong;Kim, Woo-Jin;Lee, Sang-Jun;Kim, Kyung-Kil
Fisheries and Aquatic Sciences
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v.13
no.1
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pp.49-55
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2010
A bacterial strain with phytase and glucose-1-phosphatase activity was isolated from seawater. The colony was identified as an Enterobacter cloacae strain and named E. cloacae B11. A gene, agpEnB11, coding for an intracellular acid glucose phosphatase was cloned from the strain and sequenced. It comprised 1,242 nucleotides and encoded a polypeptide of 413 amino acids. Recombinant glucose-1-phosphatase (AgpEn) was overexpressed in Escherichia coli and purified using Ni-NTA column under native conditions. Purified protein displayed a single band of 47 kDa on SDS-PAGE. AgpEn hydrolyzed a wide variety of phosphorylated compounds, with high activity for glucose-1-phosphate and glucose-6-phosphate. Optimum pH and temperature for enzyme activity were pH 5.0 and $50^{\circ}C$, respectively. Enzyme activity was stimulated by $Ca^{2+}$ and $Co^{2+}$, and inhibited by $Cu^{2+}$.
This study was performed to evaluate the effect of dietary protein source and sulfur amino acid content on bone metabolism in ra. Thirty male rats (body weight 145$\pm$2g) were divided into three groups. The rats in the first group were fed on casein 20% diet as animal protein source and those in the second group were fed on soy 20% diet as plant protein source. Sulfur amino acid ratio of these group was 1.07:1. The rats in the third group were fed on soy 20% diet and the sulfur amino acid were supplemented with the amount contained as much in the soy 20% diet. All rats were fed on experimental diet and deionized water ad libitum for 9 weeks, The total body, spine, femur bone mineral density and bone mineral content were measured using Dual Energy X-ray Absorptiometry Calcium, phosphate, pyridinoline, creatinine in urine and calcium, phosphate, alkaline phosphatase, osteocalcin in serum were measured. During the experimental period, plant protein (soy protein) group had a lower urinary Ca excretion, urine pyridinoline & crosslinks value and had a higher Ca efficiency in total bone and femur bone mineral density than animal protein (casein) group. There were no significant differences in serum calcium, phosphate, alkaline phosphatase and osteocalcin among the three groups of the rats. The findings from this study demonstrated that plant protein (soy protein) is beneficial of bone mineral density because it had a higher Ca efficiency in total bone and femur bone mineral density than animal protein (casein). However, the supplementation of sulfur amino acid on soy results were consistent with prior studies that dietary sulfur amino acid load had a negative effect on calcium balance. The rats fed sulfur amino acid supplementation diet increased urinary calcium excretion and decreased calcium efficiency for total and femur mineral density. Therefore, dietary protein source and sulfur amino acid content influence bone metabolism. (Korean J Nutrition 37(2): 100-107, 2004)
Park, Young Jae;Lee, Jong Min;Shin, Soon Young;Kim, Young Ho
BMB Reports
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v.47
no.12
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pp.685-690
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2014
The Ras/Raf/MEK/Erk signaling pathway is important for regulation of cell growth, proliferation, differentiation, survival, and apoptosis in response to a variety of extracellular stimuli. Lack of Erk MAPK activation is observed in several cancer cells despite active activation of Ras. However, little is known about the modulation of Erk1/2 activity by active Ras. Here, we show that overexpression of active H-Ras (H-RasG12R) in NIH3T3 fibroblasts impaired FGF2-induced Erk1/2 phosphorylation, as compared to wild-type cells. Northern blot analysis revealed that prolonged expression of active Ras increased MAP kinase phosphatase 3 (MKP3) mRNA expression, a negative regulator of Erk MAPK. Inhibition of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K)/Akt pathway abrogated active Ras-induced up-regulation of MKP3 expression, leading to the rescue of Erk1/2 phosphorylation. Our results demonstrated that the Ras/Raf/MEK/Erk signaling cascade is negatively regulated by the PI3K/Aktdependent transcriptional activation of the MKP3 gene.
Kim, Ji Soo;Kim, Won Kon;Oh, Kyoung-Jin;Lee, Eun-Woo;Han, Baek Soo;Lee, Sang Chul;Bae, Kwang-Hee
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.29
no.4
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pp.645-650
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2019
Brown adipocytes have an important role in the regulation of energy balance through uncoupling protein-1 (UCP-1)-mediated nonshivering thermogenesis. Although brown adipocytes have been highlighted as a new therapeutic target for the treatment of metabolic diseases, such as obesity and type II diabetes in adult humans, the molecular mechanism underlying brown adipogenesis is not fully understood. We recently found that protein tyrosine phosphatase receptor type B (PTPRB) expression dramatically decreased during brown adipogenic differentiation. In this study, we investigated the functional roles of PTPRB and its regulatory mechanism during brown adipocyte differentiation. Ectopic expression of PTPRB led to a reduced brown adipocyte differentiation by suppressing the tyrosine phosphorylation of VEGFR2, whereas a catalytic inactive PTPRB mutant showed no effects on differentiation and phosphorylation. Consistently, the expression of brown adipocyte-related genes, such as UCP-1, $PGC-1{\alpha}$, PRDM16, $PPAR-{\gamma}$, and CIDEA, were significantly inhibited by PTPRB overexpression. Overall, these results suggest that PTPRB functions as a negative regulator of brown adipocyte differentiation through its phosphatase activity-dependent mechanism and may be used as a target protein for the regulation of obesity and type II diabetes.
IgE-dependent histamine-releasing factor(HRF) was initially described as a secretagogue for secretion of histamine from IgE+ basophils from a subset of allergic donors. Previously, we identified that S98 residue of HRF was phosphorylated using anti-HRFpS98 antibody which specifically recognizes the phosphorylated serine residue of HRF and HRFS98A mutant construct. In vitro kinase assay, only wild type HRF was phosphorylated by PKC, and S98A HRF was not affected by PKC. In this study, we attempted to characterize the phosphatase which specifically dephosphorylates HRF by immunoprecipitation and pull-down assay. In RBL-2H3 cells, HRF interacted only with calcineurin (also called as PP2B, calcium/calmodulin-dependent phosphatase) but not with PP1 or PP2A. The results suggest that HRF is most likely dephosphory-lated by calcineurin.
The cloning and expression of Phosphotyrosine Protein Phosphatase into E. coli provides important tools of understanding of its functions and signal transduction mechanisms. The abundant soluble protein of the Phosphotyrosine Protein Phosphatase A (PtpA) and the active site mutant PtpA(C9S) were produced using the expression vector pET26 in E. coli and pIJ6021 with the thiostrepton in S. lividans. The enzyme activity of both proteins extracted by Ni-NTA column had same results from the expression vector pET26 and pIJ6021. The enzyme activity of phosphatase was found in the protein of PtpA, but not in that of C9S. The western blot detected by penta His-tag antibody resulted in the inducer, thiostrepton was not a good trigger to induce a large amount of PtpA protein. The overexpression of both proteins had no significantly different effect on the A factor cascade related to the secondary metabolite and mycelium formation between PtpA and C9S. However, overproduction of PtpA protein using pIJ6021 in S. lividans brought about a dramatic decrease in the amount of phosphotyrosine proteins (p200, p90, and p65), but no significantly phenotypic variation in S. lividans. This indicates that PtpA has an important proteome role in signal transduction mechanism of producing massive amount of phosphotyrosine protein in Streptomyces sp.
An ascorbic acid phosphorylating enzyme, which catalyzes the formation of ascorbic acid-2-phosphate from ascorbic acid and pyrophosphate, was purified 32.7-folds to homogeneity from a cell-free extract of Cellulomonas sp. AP-7. The combination of DEAE- Sephacel ion exchange chromatography and Sephacryl S-200 get filtration was used for their purification. The molecular weight of the native protein was estimated to be 96.lkDa on high performance gel filtration chromatography. The SDS-PAGE analysis indicated that the protein consisted of four identical subunits of 24.6 kDa. The purified enzyme showed the optimal tempeature of 40$\circ$C and optimal pH of 4.5. The Km for ascorbic acid and pyrophosphate were 119 mM and 11.9 mM, respectively. The addition of 5,5'-dithiobis-(2-nitrobenzoic acid) into the reaction mixture resulted in the reduction of the enzyme activity at 51%. The enzyme also had a phosphatase activity at weakly acidic pH and the Km for ascorbic acid-2-phosphate in phosphatase activity was 7.9 mM.
A previous study on a yeast protein tyrosine phosphatase, YPTP1, using synthetic phosphotyrosine-containing peptides with various sequences as substrates revealed that DADEpYDA exhibits high affinity ($K_m=4{\mu}M$) toward the enzyme. A modified version of this peptide, GDADEpmFDA, immobilized on a resin, was used in this study as an affinity ligand for the purification of YPTP1. Phosphonomethyl-phenylalanine (pmF) was used as a nonhydrolyzable analog of the phosphotyrosine (pY) residue, with properties similar to pY. A protected form of pmF, $Fmoc-pmF(^{t}Bu)_{2}-OH$, was chemically synthesized and introduced during solid-phase peptide sythesis. YPTP1 was onrexpressed in an E. coli strain carrying a plasmid pT7-7-ptpl. Affinity chromatography of the crude lysate afforded PTPI (39 kDa) of about 50% purity.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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