• 제목/요약/키워드: Principal component tree

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Reproductive Maturity Onset and Tree Size in a Garcinia kola (Heckel) Coastal Humid Tropical Climate Plantation

  • Henry Onyebuchi Okonkwo;Olubunmi Ayokunle Koyejo;Joseph Okechukwu Ariwaodo;Nsien Iniobong Bruno
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제39권2호
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    • pp.73-80
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    • 2023
  • Little is known of the life history of Garcinia kola; the objective of this study, therefore, was to assess the fruiting age and tree size of the species in a coastal humid tropical climate plantation condition. A total 103 trees were used in the study viz; 80 ten-year-old trees at reproductive maturity onset and 13 thirty-year-old trees with several cycles of reproduction that constitute two independent variables. Data collected were age of onset of flowering and size at reproductive maturity onset. Relative size at reproductive maturity onset (RSOM) was estimated as size at reproductive maturity onset (SOM) divided by asymptotic maximal size (AMS). Data analysis was conducted using pairwise t-test and principal component analysis (PCA). Reproductive maturity onset (flowering) was recorded in the ten-year-old stand eight (8) years after planting. Mean size at reproductive maturity onset (SOM) was height 5.32±1.7 m, dbh 0.11±0.03 m, total number of branches was 29.6±7.3, crown depth 5.24±1.05 m, crown diameter was 4.78±0.7 m, branch diameter 0.098±0.01 m, leaf length 0.13±0.02 m, leaf breadth 0.37±0.01 m, twig length 0.35±0.11 m and leaf per twig 6±0.84 and asymptotic maximal size (AMS) was height 19.85±0.76 m, dbh 0.95±0.09 m, total number of branches 62±5, crown depth 18.83±0.7 m, crown diameter 12.5±1.64 m, branch diameter 0.5±1.6 m, leaf length 0.16±0.023 m, leaf breadth 0.45±0.12 m, twig length 0.37±0.11 m and leaf per twig 19±7.5. Pairwise t-test analysis showed there was significant differences between SOM and AMS in all growth factors except leaf length, leaf breadth, and twig length. Highest relative size at reproductive maturity onset (RSOM) was recorded in leaf length 0.82, twig length 0.82, and leaf breadth 0.80, while, the lowest was branch diameter 0.11. Four components out of the total of eleven were extracted to explain the relationship in RSOM: Principal component one (PC1) explained 37.23%; PC2 26.4%, PC3 22.73%, and PC4 13.64%.

계층적 트리 구조를 이용한 라만스펙트럼 판별 성능 개선 (Improvement in the classification performance of Raman spectra using a hierarchical tree structure)

  • 박준규;백성준;서유경;서성일
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제15권8호
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    • pp.5280-5287
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    • 2014
  • 본 논문에서는 라만스펙트럼의 효과적인 판별을 위해 계층 트리 구조로 클래스를 그룹화 하는 방식을 제안하였다. 실험데이터로는 28종 화학물질의 라만 스펙트럼을 준비하였고 잡음제거, 정규화 등의 전처리 수행하였다. 다음으로 사전실험을 통해 서로 간에 분류오류를 발생시키는 물질들을 그룹화 하여 계층 구조의 클래스를 구성하였고, 각각의 상위, 하위 클래스에 PCA(principal component analysis) 특징추출과 MAP(maximum a posteriori probability) 방식의 분류실험을 수행하였다. 실험 결과에 의하면 계층 구조의 클래스를 적용한 경우 평균 2.7개의 특징을 사용하여 분류가 100% 이루어짐을 확인할 수 있었다. 계층 구조를 적용하지 않는 기존의 방식에서 6개의 특징을 사용할 때 동일한 분류결과를 보였음을 감안해 보면, 제안한 방식이 전체 계산 복잡도의 측면에서 훨씬 뛰어남을 알 수 있다. 따라서 제안한 방식이 실제 응용에 보다 적합하다고 할 수 있다.

가침박달의 열매, 종자 및 발아특성 변이 (The Variation of Fruit, Seed and Germination Characteristics of Exochorda serratifolia)

  • 송정호;임효인
    • 한국산림과학회지
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    • 제101권4호
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    • pp.619-625
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    • 2012
  • 본 연구는 국내 분포하는 가침박달 집단의 열매, 종자 및 발아 특성에 대한 변이를 조사하였다. 5개 자연집단의 96개 개체목에서 열매를 채취하여 5가지 열매특성, 7가지 종자특성 및 3가지 발아특성을 분석하였다. 평균발아 일수를 제외한 14가지 특성들에서 집단간 및 집단내 개체간에 유의적인 차이가 인정되었다. 열매와 종자 특성은 대체적으로 전체 분산 가운데 집단이 차지하는 비율이 높은 것으로 나타났다. 변이계수 값을 보면 열매특성은 열매무게 27.0%, 종자특성은 종자길이/두께 28.1%, 발아특성은 발아속도 52.5%로 가장 높은 값을 나타냈다. 가침박달 집단의 평균 발아특성은 발아율 62.9%, 평균발아일수 64.0일, 발아속도 0.40개/일로 나타났다. 상관분석결과 평균발아일수는 종자두께와 발아속도는 모수의 수고 및 위도와 각각 정의 상관관계를 나타냈다. 또한 위도가 높을수록 열매가 무겁게 나타나는 정의 상관관계를 나타냈다. 군집분석결과 집단의 분포에 따른 지리적인 경향은 나타나지 않았다. 주성분분석 결과 제1주성분의 기여도가 전체변이의 63%를 설명하였으며, 고유값(Eigenvalue)이 1 이상인 제3주성분까지의 기여도는 97%로 가침박달 열매, 종자 및 발아특성 분류에 중요한 정보를 주는 요인으로 나타났다.

Use of the Quantitatively Transformed Field Soil Structure Description of the US National Pedon Characterization Database to Improve Soil Pedotransfer Function

  • Yoon, Sung-Won;Gimenez, Daniel;Nemes, Attila;Chun, Hyen-Chung;Zhang, Yong-Seon;Sonn, Yeon-Kyu;Kang, Seong-Soo;Kim, Myung-Sook;Kim, Yoo-Hak;Ha, Sang-Keun
    • 한국토양비료학회지
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    • 제44권5호
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    • pp.944-958
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    • 2011
  • Soil hydraulic properties such as hydraulic conductivity or water retention which are costly to measure can be indirectly generated by soil pedotransfer function (PTF) using easily obtainable soil data. The field soil structure description which is routinely recorded could also be used in PTF as an input to reduce the uncertainty. The purposes of this study were to use qualitative morphological soil structure descriptions and soil structural index into PTF and to evaluate their contribution in the prediction of soil hydraulic properties. We transformed categorical morphological descriptions of soil structure into quantitative values using categorical principal component analysis (CATPCA). This approach was tested with a large data set from the US National Pedon Characterization database with the aid of a categorical regression tree analysis. Six different PTFs were used to predict the saturated hydraulic conductivity and those results were averaged to quantify the uncertainty. Quantified morphological description was successively used in multiple linear regression approach to predict the averaged ensemble saturated conductivity. The selected stepwise regression model with only the transformed morphological variables and structural index as predictors predicted the $K_{sat}$ with $r^2$ = 0.48 (p = 0.018), indicating the feasibility of CATPCA approach. In a regression tree analysis, soil structure index and soil texture turned out to be important factors in the prediction of the hydraulic properties. Among structural descriptions size class turned out to be an important grouping parameter in the regression tree. Bulk density, clay content, W33 and structural index explained clusters selected by a two step clustering technique, implying the morphologically described soil structural features are closely related to soil physical as well as hydraulic properties. Although this study provided relatively new method which related soil structure description to soil structure index, the same approach should be tested using a datasets containing the actual measurement of hydraulic properties. More insight on the predictive power of soil structure index to estimate hydraulic properties would be achieved by considering measured the saturated hydraulic conductivity and the soil water retention.

울산지역 모자익 경관에서의 조류 다양성 (Bird Diversity on Area around the Ulsan Mosaic Landscape)

  • 이원호;장지덕;최병인;강성룡;권기정
    • The Korean Journal of Ecology
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    • 제27권6호
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    • pp.325-333
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    • 2004
  • 울산지역의 조류 다양성을 위한 자연경관 구성을 파악하기 위해서 2002년 5월부터 11월까지 센서스를 하였다. 서식지 변수를 1)산림의 형태와 범위, 2)산림이나 농작물로 분류되지 않는 잔류지, 3)경작지 변수의 3가지 주된 범주에 연관시켜 평가하였다. 산림이나 서식지 간의 식생 차이에 대한 군집의 분석은 춘($79.06\%$)${\cdot}$추($57.77\%$)계 모두 산림지역의 군집 구성이 가장 높게 나타났으며, 잔류지는 군집구성($17.98{\sim}23.16\%$)이 거의 비슷하게 나타났고, 경작지는 춘계($2.94\%$)보다는 추계($18.47\%$)에 군집 구성이 보다 높게 나타났다. 196개 지점의 요인 분석에서, 춘계에서 첫 번째 축(component I, $54.8\%$)은 산림지역의 변수인 침염수림과 활엽수림에 강하게 연관되어 있으며, 종과 개체는 첫 번째 축을 따라 좋아하는 활엽수림, 침염수림 및 혼유림으로 분명히 나누어져 있다. 두번째 축(component II, $19.8\%$)은 경작지에 영향을 받는 것으로 나타났다. 추계에서 요인 I($34.8\%$)과 요인II($23.6\%$)는 경작지 주변의 활엽수, 혼유림, 과수원, 저수지, Island에 거의 비슷한 수준으로 연관되어 있으며 종은 좋아하는 소서식지 별로 분명히 나누어져 있다. 53종 1,700여 개체가 기록되었으며, 춘${\cdot}$추계 모두 직박구리, 붉은머리오목눈이, 박새, 참새, 까치 5종이 전체 개체수의 $60\%$ 이상을 차지하였다. 춘${\cdot}$추계 모두 붉은머리오목눈이, 참새, 직박구리, 박새가 중요 종으로 나타났으며, 이들 4개 지역의 종다양성 지수와 종수의 기대치 등을 분석하였는데, 종의 풍부성이란 의미에서 볼 때 춘계에는 원효산($E[S_{59}]=19$)이 가장 높게 나타났으며, 문수산($E[S_{59}]=17$)이 가장 낮게 나타났다. 추계는 거남산($E[S_{63}]=16$)이 가장 높게 나타났으며, 문수산($E[S_{63}]=12$)이 가장 낮게 나타났다. 종의 유${\cdot}$무와 개체수를 비교하여 양 방향 유사도를 분석한 결과 춘계에는 문수산-원효산[0.62]이 비슷한 종과 개체수를 가지고 있었으며, 추계에는 문수산-정족산[0.53]의 조류군집이 매우 유사하게 나타났다.

Diversity and Genetic Relationships among Seven West African Goat Breeds

  • Missohou, A.;Talaki, E.;Laminou, I. Maman
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권9호
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    • pp.1245-1251
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    • 2006
  • This study was carried out to determine the genetic relationships among seven west African goat breeds : Casamance Goat (Kolda, Senegal), Labe Goat (Fouta Djallon, Guinea), three Sahel Goat (Djoloff, Senegal ; Maradi, Niger; Gorgol, Mauritania) red Sokoto Goat (Maradi, Niger) and Guera goat (Atar, Mauritania).The polymorphism of six microsatellites and the ${\alpha}_{s1}$-casein locus was analysed. The six microsatellite loci were polymorphic with a mean number of alleles ranging from 2.71 to 4.0. At the ${\alpha}_{s1}$-casein locus, A and B were the most frequent alleles, which are known to be associated with a high level of protein synthesis. A neighbour-joining tree and a Principal Component Analysis were performed and the reliability of both methods was tested. Our study shows that the genetic relationships among the breeds analysed correspond to their geographical distribution and in addition, that the Labe Goat is strongly separated from the other breeds. Among the seven markers used, four have an effect on the distribution of breeds while three seem to be non-informative.

Genetic Structure in Wild Populations of Ayu Plecoglossus altivelis in Korea and Japan

  • Han, Hyon-Sob;Taniguchi, Nobuhiko;Lee, Jong-Ha;Yoon, Moon-Geun
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제14권4호
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    • pp.295-301
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    • 2011
  • We investigated the genetic structure of Korean and Japanese ayu Plecoglossus altivelis populations by examining 669 individuals from 14 populations using three microsatellite loci. Genetic variation did not differ significantly among the populations examined in terms of allelic number and heterozygosity. Korean populations were genetically close to each other, implying that persistent gene flow has occurred in these populations. This suggests that eastern populations in Korea form a single large population and all of the Korean populations are distinct from the Japanese populations. Pairwise population $F_{ST}$ estimates, principal component analyses, and a neighbor-joining tree showed that genetic separation between the southern and pooled eastern coast populations was probably influenced by restricted gene flow. Hierarchical analysis of molecular variance (AMOVA) revealed a weak but significant genetic structure among three ayu groups (eastern and southern coasts of Korea and the Japan coast), and no genetic variation within groups. The estimated genetic population structure and potential applications of microsatellite markers may aid in the proper management of ayu populations.

Using Machine Learning Techniques for Accurate Attack Detection in Intrusion Detection Systems using Cyber Threat Intelligence Feeds

  • Ehtsham Irshad;Abdul Basit Siddiqui
    • International Journal of Computer Science & Network Security
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    • 제24권4호
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    • pp.179-191
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    • 2024
  • With the advancement of modern technology, cyber-attacks are always rising. Specialized defense systems are needed to protect organizations against these threats. Malicious behavior in the network is discovered using security tools like intrusion detection systems (IDS), firewall, antimalware systems, security information and event management (SIEM). It aids in defending businesses from attacks. Delivering advance threat feeds for precise attack detection in intrusion detection systems is the role of cyber-threat intelligence (CTI) in the study is being presented. In this proposed work CTI feeds are utilized in the detection of assaults accurately in intrusion detection system. The ultimate objective is to identify the attacker behind the attack. Several data sets had been analyzed for attack detection. With the proposed study the ability to identify network attacks has improved by using machine learning algorithms. The proposed model provides 98% accuracy, 97% precision, and 96% recall respectively.

기하학 정보를 이용한 3차원 모델 검색 (3D Model Retrieval Using Geometric Information)

  • 이기호;김낙우;김태용;최종수
    • 한국통신학회논문지
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    • 제30권10C호
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    • pp.1007-1016
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    • 2005
  • 본 논문은 3차원 모델의 모양 기반 검색을 하기 위한 모델의 특징을 추출하는 방법을 제시한다. 3차원 모델의 특징 기술자는 모델에 대한 위치, 회전, 크기 변환에서 그 특징이 불변해야 하기 때문에, 모델을 정규 좌표계로 표시하기 위한 선(先)처리 작업이 필요하다. 우리는 선처리 작업을 위해서 주성분 분석 방법을 사용하였으며, 이 방법은 최소 경계 상자와 외접구의 생성을 위해서도 이용되었다. 제안한 알고리즘은 다음과 같다. 반지름 1인 외접구를 만들고, 구의 중심에 3차원 모델을 위치시킨 후, 반지름이 다른 동심구($r_i=i/n,\;i=1,2,{\ldots},n$)를 생성하고, 이 동심구들과 모델이 접하는 면을 구한 다음 그 면에 대한 곡률을 계산한다. 여기서 구한 곡률을 3차원 모델의 특징 기술자로 사용하게 된다. 실험 결과는 타 알고리즘에 비해 제안하는 방법이 상대적으로 적은 빈(bin) 수를 가졌음에도 불구하고 ANMRR 평가 함수에 의해 최소 0.1에서 0.6 이상의 성능 개선 효과가 나타나고 있음을 보여 준다. 본 논문은 색인 기법으로 $R{^*}-tree$를 사용하였다.

QuickBird 위성영상을 이용한 수종분류에서 픽셀과 분할기반 분류방법의 정확도 비교 (A Comparison of Pixel- and Segment-based Classification for Tree Species Classification using QuickBird Imagery)

  • 정상영;임종수;신만용
    • 한국산림과학회지
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    • 제100권4호
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    • pp.540-547
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    • 2011
  • 본 연구는 고해상도 위성영상인 QuickBird 영상을 이용한 픽셀 및 분할기반의 분류방법의 정확도를 비교하여 적합한 수종 분류방법을 선정하기 위해 수행하였다. 이를 위해 연구대상지인 충청북도 옥천군과 영동군의 산림을 대상으로 현지조사를 실시하여 총 398개 토지피복정보를 수집하였다. 총 14개의 토지 피복 등급(4개의 침엽수종과 7개의 활엽수종, 그리고 3개의 비산림지)으로 구분된 현지조사 자료를 훈련자료로 이용하였다. 픽셀기반 분류에 있어서 위성영상이 가지고 있는 원 화소값, tasseled cap 분석에 의한 3개의 지수, 그리고 주성분 분석을 통한 3개의 성분값을 이용한 3가지의 밴드조합 영상을 생성하여 분류정확도를 비교한 결과, 위성영상의 원 화소값을 이용한 분류 정확도가 가장 높은 것으로 평가되었다. 분할기반 분류에서는 3개의 축척계수에 따른 정확도를 비교한 결과, 축척계수 50%을 적용하였을 때 전체 정확도는 76%, 그리고 ${\hat{k}}$ 값은 0.74로 다른 축척계수에 의한 정확도보다 높은 것으로 나타났다. 결과적으로 QuickBird 영상의 원 화소값과 50%의 축척계수를 이용한 분할기반의 수종분류 결과가 정확도가 가장 높은 것으로 평가되었다.