• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제11권3호
• /
• pp.508-514
• /
• 2001

A stuructural gene (ycl) encoding novel yeast cell wall hydrolase, YCL, was cloned from alkalophilic Bacillus alcalophilus subsp. YB380 by PCR, and transformed into E. coli JM83. Based on the N-terminal and internal amino acid sequences of the enzyme, primers were designed for PCr. The positive clone that harbors 1.8 kb of the yeast cell wall hydrolase gene was selected by the colony hybridization method with a PCR fragment as a probe. According to the computer analysis, this gene contained a 400-base-paired N-terminal domain of the enzyme. Based on nucletide homology of the cloned gene, a 850 bp fragment was amplified and the C-terminal domain of the enzyme was sequenced. With a combination of the two sequences, a full nucleotide sequence for YCL was obtained. This gene, ycl, consisted of 1,297 nucleotides with 27 nucleotides with 27 amino acids of signal sequence, 83 redundant amino acids of prosequence, and 265 amino acids of the mature protein. This gene was then cloned into the pJH27 shuttle vector and transformed into the Bacillus subtilis DB104 to express the enzyme. It was confirmed that the expressed cell wall hydrolase that was produced by Bacillus subtilis DB104 was the same as that of the donor strain, by Western blot using polyclonal antibody (IgY) prepared from White Leghorn hen. Purified yeast cell wall hydrolase and expressed recombinant protein showed a single band at the same position in the Western blot analysis.

• Journal of Microbiology
• /
• 제45권4호
• /
• pp.358-363
• /
• 2007

Multi-drug resistant Pseudomonas aeruginosa has been implicated in a variety of serious therapeutic problems in clinical environments. Among the 968 P. aeruginosa isolates obtained from two hospitals in Daegu, Korea, we acquired 17 isolates that were resistant to all available tested antimicrobial agents, with the exception of colistin (colistin-only sensitive). We characterized the antimicrobial susceptibilities, $metallo-{\beta}-lactamases$, and epidemiological relatedness among the colistin-only sensitive P. aeruginosa isolates. All colistin-only sensitive isolates were positive in the modified Hodge test and imipenem-EDTA synergy test, thereby indicating the production of $metallo-{\beta}-lactamases$. 11 isolates from the secondary hospital and six isolates from the tertiary teaching hospital harbored $bla_{VIM-2}$ and $bla_{IMP-1}$, respectively. The pulsed-field gel electrophoretic analysis of the SpeI-digested DNA from P. aeruginosa isolates indicated that two different clones of colistin-only sensitive P. aeruginosa originated from each hospital, and had spread within the hospital environment. Overall, colistin-only sensitive P. aeruginosa was detected in Korea for the first time, but no pan-drug resistant bacteria were identified. Nationwide surveillance is required in order to monitor the emergence of colistin-only sensitive or pan-drug resistant bacteria.

• 한국수산과학회지
• /
• 제35권6호
• /
• pp.676-681
• /
• 2002

우리나라 주요 해산 어종인 쥐노래미 (Hexagrammos otakii)로부터 성장호르몬 유전자 CDNA를 클로닝하고 이의 염기서열과 발현 특성을 분석하였다. 뇌하수체 조직으로부터 CDNA library를 제작하였으며 membrane filter hybridization 및 expressed sequence tag기술을 이용하여 성장호르몬 CDNA transcript들을 대량 발굴하였다. 총 확보된 full-length clone 39개중 31개가 동일한 형태로 나타났으나 나머지 클론들에서는 5'쪽의 염기서열 변이, ORF내의 염기서열 삽입, 3'쪽의 여기서열의 변이 등이 검출되었다. RT-PCR과 RNA dot blot 분석을 수행한 결과 본 연구에서 얻어진 쥐노래미 성장호르몬 transcript들은 뇌하수체 특이적인 전형적인 어류 성장호르몬 발현 특성을 나타내었다.

• Toxicological Research
• /
• 제25권1호
• /
• pp.35-40
• /
• 2009

TCDD (2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin) and related halogenated aromatic hydrocarbons elicit a diverse spectrum of biochemical and toxic responses in laboratory animals and mammalian cells in culture. Toxicity and carcinogenicity of TCDD is well established but the molecular mechanism is still poorly understood. Here, we found the noble responsive genes to TCDD using the differential display analysis. Treatment of HepG2 cells with TCDD showed a significantly different mRNA expression pattern from the untreated cells in differential display analysis. The differentially displayed bands were isolated and used as probes in dot blot and Northern blot analyses. Of thirty-five isolated differentially displayed bands, only two bands were confirmed as positive in dot blot and Northern blot analyses. The nucleotides sequences of these clones were analyzed and the search of Genebank database revealed that one clone is highly homologous with RanBP2 (Ras-related nuclear protein binding protein2; 92%) and the other is an unknown gene. RanBP2 is a nucleoporin with SUMO E3 ligase activity that functions in both nucleocytoplasmic transport and mitosis and its role as a novel tumor suppressor has been recently proposed. Thus, these results may suggest the clue elucidating the toxic mechanism of TCDD through RanBP2.

• Animal Bioscience
• /
• 제36권6호
• /
• pp.829-839
• /
• 2023

Objective: The aim of this study was to clone the mRNA sequence of the Acyl-CoA dehydrogenase long chain (ACADL) gene of goats and explore the effect of ACADL on the differentiation of subcutaneous fat cells on this basis. Methods: We obtained the ACADL gene of goats by cloning and used quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) to detect the ACADL expression patterns of different goat tissues and subcutaneous fat cells at different lipid induction stages. In addition, we transfect intramuscular and subcutaneous adipocytes separately by constructing overexpressed ACADL vectors and synthesizing Si-ACADL; finally, we observed the changes in oil red stained cell levels under the microscope, and qPCR detected changes in mRNA levels. Results: The results showed goat ACADL gene expressed in sebum fat. During adipocyte differentiation, ACADL gradually increased from 0 to 24 h of culture, and decreased. Overexpression of ACADL promoted differentiation of subcutaneous adipocytes in goat and inhibited their differentiation after interference. Conclusion: So, we infer ACADL may have an important role in positive regulating the differentiation process in goat subcutaneous adipocytes. This study will provide basic data for further study of the role of ACADL in goat subcutaneous adipocyte differentiation and lays the foundation for final elucidating of its molecular mechanisms in regulating subcutaneous fat deposition in goats.

• 농업과학연구
• /
• 제23권1호
• /
• pp.80-89
• /
• 1996

본 연구에서는 인간에게 유용한 여러 생리적 기능을 갖는 Human lactoferrin (hLf)을 대량생산할 목적으로 동물 세포의 단백질을 안정하게 생산 및 분비할 수 있는 진핵생물인 효모 sacduraromyces diastaticus YIY345에 hLf 유전자를 도입하여 hLf의 발현 및 분비를 시도하였다. 1. hLf의 발현 및 분비를 위하여 STA1 (S. diasticus glucoamylase) 유전자의 promoter 및 분비 신호와 hLf 전사 종결을 위한 GAL7(galactose utilizing gene) transcriptional terminator하에 재조합 plasmid pYEGLf를 제작하였다. 2. 제작한 plasmid를 선별하고 증폭하기 위하여 대장균에 형질 전환하였고 대장균 형질전환체로부터 plasmid를 분리하여 적당한 제한 효소로 처리하고 크기를 확인하였다. 최종적으로 선별된 plasmid는 효모 S. diastaticus YIY345에 형질 전환시켜 효모 형질전환체를 얻었다. 3. 효모 형질전환체를 Western hybridization으로 단백질 수준에서 분석한 결과 pYEGLf가 도입된 형질전환체에서 hLf가 생산되어 세포외로 분비되었다. 4. hLf가 발현된 효모 형질전환체의 배양상등액을 paper disc법을 이용하여 E.coli에 대한 항균 효과를 측정하였으나 관찰할 수 없었다. E.coli에 대한 hLf의 MIC (minimal inhibitory concentration)는 약 $3000{\mu}g/m{\ell}$에 비해 효모에서 분비하는 hLf의 양은 상당히 적으므로 항균효과를 측정하기 불가능하다. 그러므로 정제 단계를 거쳐 더 높은 농도로 처리해야 할 것이다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제15권14호
• /
• pp.5867-5872
• /
• 2014

Background: Cervical cancer is listed as one of high-incidence endemic diseases in Xinjiang. Our study aimed to evaluate the expression of TLR9 in uterine cervical tissues of Uyghur women and examine associations with clinicopathological variables. We further characterized the direct effects of TLR9 upon the selective silencing of human papillomavirus (HPV) E6 and E7 oncoprotein expression in HPV 16-positive human cervical carcinoma cells treated with siRNA in vitro. Materials and Methods: Immunohistochemistry was applied to evaluate TLR9 expression in 97 formalin-fixed paraffin-embedded cervical samples from Uyghur women; 32 diagnosed with cervical squamous cell carcinomas (CSCC), 14 with low-grade cervical intraepithelial neoplasias (CINI), 10 medium-grade (CINII), 24 high-grade (CINIII), and 17 chronic cervicitis. $BLOCK-iT^{TM}$ U6 RNAi Entry Vector $pENTR^{TM}$/U6-E6 and E7 was constructed and transfected the entry clone directly into the mammalian cell line 293FT. Then the HPV 16-positive SiHa human cervical carcinoma cell line was infected with RNAi recombinant lentivirus. RT-PCR and Western blotting were used to determine the expression of TLR9 in both SiHa and HPV 16 E6 and E7 silenced SiHa cells. Results: Immunohistochemical staining showed that TLR9 expression was undetectable (88.2%) or weak (11.8%) in chronic cervicitis tissues. However, variable staining was observed in the basal layer of all normal endocervical glands. TLR9 expression, which was mainly observed as cytoplasmic staining, gradually increased in accordance with the histopathological grade in the following order: chronic cervicitis (2/17, 11.8%)

• 미생물학회지
• /
• 제39권4호
• /
• pp.272-276
• /
• 2003

본 연구에서는 삽교호의 요인 분석과 주변 지류의 영향과 계절에 따른 세균 군집구조의 변화를 분자생태학적 접근 방법을 통해 조사하였다. 시료 채취는 5월과 8월 삽교호 방조제 앞 표층수에서 실시하였으며, 분자생태학적 접근을 위해 시료로부터 DNA를 직접 추출하고, 16S rDNA를 증폭한 후 pGEM-T easy vector에 삽입하여 클로닝을 수행하였다. 획득한 클론 라이브러리를 이용하여 RFLP (restriction fragment length polymorphism)를 분석하였으며, OTUs (operating taxonomy units)로 그룹화하였다. 측정된 종다양성 지수가 8월에 더 높게 나타났으며, 5월의 153개중 34개의 클론과 8월의 131개중 38개의 클론들을 염기서열 분석하였다. 그 결과 Proteobacteria, Cytophaga, Gram positive bacteria와 Verrucomicrobia가 5월과 8월에 공통적으로 분포하는 것으로 나타났으며, 특히 Planctomyces, 시안세균과 엽록체가 조류 대발생이 일어난 8월에 분포하는 것으로 조사되었다. 전반적인 조사결과 삽교호는 전형적인 하구지역의 특성을 나타내었으며 주변 하천으로부터 유입되는 종속영양물질의 영향을 받는 것으로 생각된다.

• 생명과학회지
• /
• 제17권2호통권82호
• /
• pp.167-173
• /
• 2007

생쥐 신경교세포 유래 신경영양인자 유도성 전사인자(mGIF)의 발현조절에 필요한 전사기작을 연구하기 위하여 mGIF cDNA를 탐침자로 이용하여 genomic clone을 분리하였다. 전체 유전자 13-kb 영역 중 전사개시점에서 4-kb 상류영역의 유전자 서열을 파악한 결과, 프로모터 영역에서 TATA box와 CAAT box는 발견할 수 없었으며 G+C content는 높은 것으로 나타났고 여러 개의 Sp1 전사인자 결합영역이 있었다. 또한 mGIF 유전자는 AP2 결합에 필요한 보존적 영역이 있었다. mGIF 유전자의 프로모터 영역의 단편들을 프로모터가 없는 pGL2-Basic 플라스미드의 luciferase 유전자의 상류에 연결하여 서로 다른 5종류의 결손 돌연변이체를 제조하고 NB41A3 세포주를 이용하여 전사활성을 측정하였다. Transient expression assays 결과, 모든 결손 돌연변이체에서 전사활성이 나타났으며 -213과 -129사이에 전사촉진 영역이 존재하며 -806과 -214사이에 전사억제 영역이 있는 것으로 나타났다. 신경세포주인 NB41A3과 신경교세포주인 C6 그리고 간세포주인 HepG2에서 mGIF 유전자 프로모터의 높은 활성이 관찰되었으며, 근육세포주인 C2C12에서는 낮은 활성이 관찰되었다. 따라서 mGIF 유전자는 조직특이적으로 발현하며 도파민 수용체 유전자와 구조적, 기능적 유사성이 있는 것을 알 수 있었다.

• KSBB Journal
• /
• 제18권1호
• /
• pp.55-61
• /
• 2003

항균 및 항암성 물질을 탐색하기 위하여 도꼬마리 열수 추출액을 ether 및 ethylacetate를 이용하여 중성, 산성, 염기성조건에서 추출한 후, 각각의 추출물을 세균 16균주 및 곰팡이와 효모 2균주를 대상으로 항균활성을 조사하였다. Ether 중성 추출물(XE-N)은 항균효과가 가장 우수하였으며, 특히 그람 양성세균(7균주), 그람 음성세균(7균주)을 비롯하여 진균중 Cryptococcus neoformans에도 뚜렷한 항균효과를 나타내었다. XE-N 및 XEA-N을 대상으로 FDA method에 의한 항균효과를 검토한 결과, p. aeruginosa를 제외한 3균주에 대해 30 ng/mL에서도 저해효과를 나타내었다 XE-N으로부터 XE-N-S1, XE-N-S3을, Ether 산성 추출물(XE-A)로부터 XE-N-S3 을, ethylacetate 중성 추출물(XEA-N)로부터 XEA-N-S2를 항균, 항암성 물질로 정제하였으나, XE-N-S1을 제외한 다른 물질들은 빠른 시간 내에 모두 분해되었다 도꼬마리 추출물 및 정제된 생리활성물질에 대한 항암효과를 검토한 결과, HeLa 자궁암 세포에 대해서는 XE-N-S1이 가장 우수하였다. HepG2간암세포에 대한 항암효과는 XE-N-S, XE-N-S3가 우수하였고, HT29 대장암세포에 대한 항암효과는 XE-N, XE-N-S1이 우수하였다. Saos2 골육종 암세포, NCI H522 폐선 암세포, NCI H1703 폐 편평세포 암세포와 Clone M3 흑색종 암세포에 대한 항암효과는 XE-N-S1이 가장 우수하였다. LN CAP 전립선 암세포에 대한 항암효과는 XE-N-S3가 가장 우수한 효과를 나타내었다. 또한 HSF 인간 정상 피부 섬유아세포에 대한 각종 추출물 및 정제물의 세포독성을 기존의 항암제인 etoposide와 cisplatin과 비교·검토한 결과, XE-A, XEA-A 및 XEA-B가 가장 독성이 낮았으며, XE-B도 etoposide에 비해 독성이 낮았다. 한편 XE-N-S1, XE-N-S3은 etoposide보다 높은 독성을 나타내었으며, XE-A-S3은 etoposide보다는 독성이 높았으나, cisplatin보다는 낮았다.