Objective: A set of microsatellite markers with high polymorphism from Tsaiya duck were used for the genetic monitoring and genetic structure analysis of Brown and White Tsaiya duck populations in Taiwan. Methods: The synthetic short tandem repeated probes were used to isolate new microsatellite markers from the genomic DNA of Tsaiya ducks. Eight populations, a total of 566 samples, sourced from Ilan Branch, Livestock Research Institute were genotyped through novel and known markers. The population genetic variables were calculated using optional programs in order to describe and monitor the genetic variability and the genetic structures of these Tsaiya duck populations. Results: In total 24 primer pairs, including 17 novel microsatellite loci from this study and seven previously known loci, were constructed for the detection of genetic variations in duck populations. The average values for the allele number, the effective number of alleles, the observed heterozygosity, the expected heterozygosity, and the polymorphism information content were 11.29, 5.370, 0.591, 0.746, and 0.708, respectively. The results of analysis of molecular variance and principal component analysis indicated a contracting Brown Tsaiya duck cluster and a spreading White Tsaiya duck cluster. The Brown Tsaiya ducks and the White Tsaiya ducks with Pekin ducks were just split to six clusters and three clusters when K was set equal to 6 and 3 in the Bayesian cluster analysis. The individual phylogenetic tree revealed eight taxa, and each individual was assigned to its own population. Conclusion: According to our study, the 24 novel microsatellite markers exhibited a high capacity to analyze relationships of inter- and intra-population in those populations with a relatively limited degree of genetic diversity. We suggest that duck farms in Taiwan could use the new (novel) microsatellite set to monitor the genetic characteristics and structures of their Tsaiya duck populations at various intervals in order to ensure quality breeding and conservation strategies.
This study investigated the effect of adding poultry litter additive containing probiotics and amino acids to the litter on weight gain in ducks and ammonia content in poultry litter. Nine hundred 1-day-old ducks (Pekin) were randomly distributed into three groups (300 birds per treatment divided into three replicates) using a randomized block design. Treatments were top-dressed on the litter surface at rates of 2 kg poultry litter additives (T1) and 2 kg macsumsuk (T2) per m2, and untreated poultry litter was used as the control. Overall, a significant difference (p<0.05) in weight gains was observed at 3 and 4 weeks, but not at 5 and 6 weeks. After 4 weeks, when compared to other treatments, the addition of poultry litter additive tended to increase the average body weight gain (90-130 g). The ammonia content was affected by all treatments (p<0.05) over time except at 3 weeks, however, compared to other treatments, the poultry litter additive decreased the ammonia content. In particular, the rate of ammonia reduction by the poultry litter additives over time was approximately 20.2%-49.2%. Regarding temperature, a significant difference was observed in all treatment groups (p<0.05), except at 3 weeks. In conclusion, considering poultry litter additives and temperature, the increase in duck weight gain was associated with a decrease in ammonia content in the poultry litter.
Objective: Choline deficiency, one main trigger for nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD), is closely related to lipid metabolism disorder. Previous study in a choline-deficient model has largely focused on gene expression rather than gene structure, especially sparse are studies regarding to alternative splicing (AS). In modern life science research, primary hepatocytes culture technology facilitates such studies, which can accurately imitate liver activity in vitro and show unique superiority. Whereas limitations to traditional hepatocytes culture technology exist in terms of efficiency and operability. This study pursued an optimization culture method for duck primary hepatocytes to explore AS in choline-deficient model. Methods: We performed an optimization culture method for duck primary hepatocytes with multi-step digestion procedure from Pekin duck embryos. Subsequently a NAFLD model was constructed with choline-free medium. RNA-seq and further analysis by rMATS were performed to identify AS events alterations in choline-deficency duck primary hepatocytes. Results: The results showed E13 (embryonic day 13) to E15 is suitable to obtain hepatocytes, and the viability reached over 95% by trypan blue exclusion assay. Primary hepatocyte retained their biological function as well identified by Periodic Acid-Schiff staining method and Glucose-6-phosphate dehydrogenase activity assay, respectively. Meanwhile, genes of alb and afp and specific protein of albumin were detected to verify cultured hepatocytes. Immunofluorescence was used to evaluate purity of hepatocytes, presenting up to 90%. On this base, choline-deficient model was constructed and displayed significantly increase of intracellular triglyceride and cholesterol as reported previously. Intriguingly, our data suggested that AS events in choline-deficient model were implicated in pivotal biological processes as an aberrant transcriptional regulator, of which 16 genes were involved in lipid metabolism and highly enriched in glycerophospholipid metabolism. Conclusion: An effective and rapid protocol for obtaining duck primary hepatocytes was established, by which our findings manifested choline deficiency could induce the accumulation of lipid and result in aberrant AS events in hepatocytes, providing a novel insight into various AS in the metabolism role of choline.
Goose hemorrhagic polyomavirus (GHPV) is not a naturally occurring infection in geese in China; however, GHPV infection has been identified in Pekin ducks, a domestic duck species. Herein, we investigated the prevalence of GHPV in five domestic duck species (Liancheng white ducks, Putian black ducks, Shan Sheldrake, Shaoxing duck, and Jinyun Sheldrake) in China. We determined that the Jinyun Sheldrake duck species could be infected by GHPV with no clinical signs, whereas no infection was identified in the other four duck species. We sequenced the complete genome of the Jinyun Sheldrake origin GHPV. Genomic data comparison suggested that GHPVs share a conserved genomic structure, regardless of the host (duck or geese) or region (Asia or Europe). Jinyun Sheldrake origin GHPV genomic characterization and epidemiological studies will increase our understanding of potential heterologous reservoirs of GHPV.
Kim, Do-Hee;Kim, Kyung-Won;Kim, Young-Hoon;Kim, Joo-Ah;Kim, Jun;Moon, Kwang-Deog
Food Science and Preservation
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v.22
no.5
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pp.644-651
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2015
To enhance the consumption of horse meat, its nutritional composition was analyzed and compared to that of white meat (i.e., chicken and duck), which consumers consider healthy. Horse meat samples used in the experiment were classified by breed and grade as follows: Jeju horse (grade $1^+$ and 1), Jeju crossbred horse (grade 1 and 2), Thoroughbred (no grade), and cuts (loin, chuck roll, and arm picnic). In an analysis of general components and cholesterol, the horse meat was confirmed as a low-fat, high-protein, and low-cholesterol food material. In an amino acid analysis, horse meat contained a higher proportion of essential amino acids than white meat. The fatty acid compositions were also analyzed. The content of linolenic acid, an essential fatty acid, was significantly higher in all horse meat groups than in Ross chicken and Pekin duck meat. The content of palmitoleic acid showed similar results. In a mineral analysis, the levels of Fe and Zn in horse meat were higher than those of white meat. The mineral content was as follows except for the leg of shite meat: K > P > Na > Mg > Ca > Zn > Fe.
We conducted two experiments to evaluate effects of feeding various types of red ginseng marc and Houttuynia cordata (H.cordata) on blood profiles of poultry in a completely randomized design. In experiment 1 (28 d), a total of 240 broilers (Arbor acres) were used. Four dietary treatments (15 broilers per pen with four replicate pens per treatment) were included: (1) control, (2) 2% red ginseng marc, (3) 1% fermented red ginseng marc with red koji, and (4) 2% liquid red ginseng. There were no significant differences in HDL and LDL-cholestrol among treatments (P > 0.05), but total cholesterol and triglyceride decreased in diets supplemented with red ginseng marc and 1% fermented red ginseng marc with red koji compared to that in the control treatment (P < 0.05). In experiment 2 (38 d), a total of 240 Pekin ducks were randomly divided into 4 groups by dietary treatments (control, 1% fermented H. cordata powder with red koji, 1% fermented H. cordata pelleted with red koji, and 1% fermented H. cordata coated with red koji) with 4 replicates of 15 ducks in each group. Total cholesterol and VLDL-cholesterol were not affected by diet with various types of H. cordata. However, increase in HDL-cholesterol and decrease in LDL and VLDL-cholesterol were greater in treatments with different types of H. cordata than in the control treatments (P < 0.05). In conclusion, using various types of red ginseng marc and H. cordata in poultry diets was effective for increasing HDL-cholesterol and decreasing total, LDL, and VLDL-cholestrol or triglyceride.
Kim, Ji-Hyuk;Kang, Hwan-Gu;Bang, Han-Tae;Hwangbo, Jong;Choi, Hee-Cheol;Kim, Dong-Wook;Hong, Eui-Chul
Korean Journal of Poultry Science
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v.42
no.1
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pp.69-75
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2015
This work was carried out to evaluate the feces and ileal digestibility of canola meal and wheat bran in ducks. Ninety Pekin ducks (6-week-old, average 3.4 kg) were divided into three treatments (6 replications/treatment, 5 birds/replication) by feedstuffs (basal diet, canola meal, and wheat bran) and were fed on these diets in individual metabolic cages for one week. After one week, the samples for analysis were collected from feces and ileum. On comparison of treatments and collected sites, the feces digestibility of basal diet was the highest among treatments on chemical compositions except crude protein and crude fat and ileal digestibility of canola meal was the lowest (P<0.01). On comparison of treatments, the digestibility of basal diet was higher and that of wheat bran was lower when compared to other treatments (P<0.05). The feces digestibility was lower than the ileal digestibility in crude protein (P<0.05) and crude fat (P<0.01). The digestibility of amino acid was the highest at feces of control group among treatments (P<0.01). No significant difference was detected in terms of digestibility of isoleucine, leucine and phenylalanine among essential amino acids, and alanine, glycine and tyrosine among non-essential amino acids between control and wheat bran, and wheat bran and canola meal. However amino acid digestibility was higher in control group when compared to canola meal group (P<0.05). Other amino acid digestibilities were not significantly differ by treatments. These results may provide the basic data on amino acid digestibility of ducks to evaluate feedstuffs and to formulate optimum diet for commercial Pekin duck.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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