• Title/Summary/Keyword: PHB

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Mutational Analysis of Prohibitin - A Highly Conserved Gene in Indian Female Breast Cancer Cases

  • Najm, Mohammad Zeeshan;Akhtar, Md. Salman;Ahmad, Istaq;Sadaf, Sadaf;Mallick, Mohd Nasar;Kausar, Mohd Adnan;Chattopadhyay, Shilpi;Ahad, Amjid;Zaidi, Shuaib;Husain, Syed Akhtar;Siddiqui, Waseem Ahmad
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권10호
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    • pp.5113-5117
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    • 2012
  • Prohibitin (PHB) is a chaperone protein which is highly conserved evolutionarily. It shows significant homology with the Drosophila cc gene which is considered important for development and differentiation of Drosophila melanogaster. Investigations have revealed an involvement of PHB in cellular proliferation and development, apoptosis, signal transduction, mitochondrial function and regulation of the estrogen and androgen receptors. Therefore, we conducted the present study to analyze mutations in the highly conserved region in Indian female breast cancer patients. Conventional PCR-SSCP and Automated DNA sequencing were performed with a total of 105 breast cancer samples along with adjacent normal tissue. Of the total, 14.2% (15/105) demonstrated a mutation status of prohibitin observed in our study population. We identified a novel missense mutation (Thr>Ser), a novel deletion of T nucleotide in an intron adjacent to intron-exon boundary and a previously determined missense mutation (Val>Ala). A statistically significant correlation was obtained which suggested that prohibitin may be associated with tumor development and/or progression of at least some proportion of breast cancers.

MPLS 네트워크를 위한 간략화된 QoS 모델 (A Simplified QoS Model for MPLS Networks)

  • 석승준;강철희
    • 한국통신학회논문지
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    • 제30권4B호
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    • pp.235-245
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    • 2005
  • 본 논문에서는 MPLS 기반의 백본 망에서 손쉽게 구현될 수 있는 서비스 차별화 방안을 제안한다. MPLS에서 QoS를 구현하기 위해 지금까지 가능성 있게 고려되고 있는 방안으로는 IETF 차등 서비스 모델을 MPLS 망에 그대로 구현하는 방법이 있다. 하지만 이는 지금의 MPLS 시스템에 대한 전체적인 변화를 필요로 한다. 이러한 문제로 인해서 논문에서는 백본 MPLS 네트워크를 위한 가상 링크(Virtual Link) 모델을 제안하고, 이를 사용해서 MPLS 서비스 차별화를 손쉽게 구현할 수 있음을 보인다. 제안하는 가상 링크는 입구와 출구 MPLS 라우터간에 설정된 LSP들의 집합으로 정의되고 있으며, 가상 링크의 업스트림(입구) 라우터에서는 LSP별로 입력 트래픽에 대해서 PHB를 적용한다. 하지만 기존 방안과는 달리 망 내부의 코어 라우터에서는 Behavior Aggregation별 서비스 품질이 아닌 LSP별 대역폭만을 보장하도록 한다. 이러한 LSP대역폭 보장 서비스는 기존 CR-LDP가 적용된 기존 MPLS 네트워크에서 이미 제공되고 있는 서비스이다. 논문에서는 가상 링크의 구현을 위해 두 라우터간에 입력되는 플로우들을 가상 링크를 구성하는 여러 LSP들에 적절하게 할당하기 위한 Flow Allocation Mechanism을 정의 한다. 마지막으로 제안하는 방안이 백본 MPLS 망에서 서비스 차별화를 제공할 수 있음을 시뮬레이션 결과를 통해서 입증한다.

In vitro Polymerization and Copolymerization of Poly-3-hydroxypropionyl-CoA with the PHB Synthase from Ralstonia eutropha

  • 송재준
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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    • pp.48-51
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    • 2000
  • The poly(3-hydroxybutyrate) (PHB) synthase of Ralstonia. eutropha, which was produced by a recombinant strain E. coli and purified in one-step with a methyl-HIC column to a purity of more than 90%, was used to polymerize 3-hydroxypropionyl-CoA (3HPCoA) and to copolymerize 3HPCoA with 3-hydroxybutyryl-CoA (3HBCoA) in vitro. A $K_m$ of $189\;{\mu}M$ and a $k_{cat}$ of $10\;sec^{-1}$ were determined for the activity of the enzyme in the polymerization reaction of 3HPCoA based on the assumption that the dimer form of PHB synthase was the active form. Free coenzyme A was found to be a very effective competitive inhibitor for the polymerization of 3HPCoA with a $K_i$ of $85\;{\mu}M$. The maximum degree of conversion of 3HPCoA to polymer was less than 40 %. In the simultaneous copolymerization reactions of these two monomers, both the turnover number for the copolymerization reaction and the maximum degree of conversion of 3HPCoA and 3HBCoA to copolymers increased with an increase in the amount of 3HBCoA in the monomer mixture. However, the maximum conversion of 3HPCoA to a copolymer was less than 35 % regardless of the ratio of 3HPCoA to 3HBCoA. Block copolymers were obtained by the sequential copolymerization of the two monomers and these copolymers had a much narrower molecular weight distribution than those obtained by the simultaneous copolymerization of the same molar ratio of 3HPCoA and 3HBCoA.

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메탄올로부터 Methylobacterium organophilum에 의한 Poly-$\beta$-hydroxybutyric Acid의 생산과 배지성분의 최적화 (Optimization of Growth Medium and Poly-$\beta$-hydroxybutyric Acid Production from Methanol in Methylobacterium organophilum)

  • Choi, Joon-H;Kim, Jung H.;M. Daniel;J.M. Lebeault
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제17권4호
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    • pp.392-396
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    • 1989
  • Facultative methylotroph인 Methylobacterium organophilum을 유일한 탄소원으로 메탄올을 0.5% (v/v) 함유한 최소 합성배지를 이용하여 pH 6.8과 3$0^{\circ}C$에서 배양하였다. 세포의 증식은 배지 내의 여러 성분들에 의해 영향을 받았으며 이로부터 최대증식속도를 얻을 수 있는 최적 합성배지 조성을 확립하였다. 배지조성 중 질소원이 결핍되면 세포의 증식이 감소하며 Fe$^{+2}$ 또는 Mn$^{+2}$ 이온의 결핍은 세포의 비증식속도를 감소시켰다. 탄소원인 메탄올은 농도를 증가시킬수록 세포의 비증식속도가 감소하는 메탄올의 기질 저해성을 확인하였으며, 4%(v/v) 이상의 메탄을 농도에서는 세포의 증식이 완전히 저해되었다. 이러한 메탄올의 기질 저해성은 간헐식 유가배양법을 이용하여 극복하고 PHB의 축적을 촉진하는 영양분 제한(nutrient-deficiency) 실험을 수행하였다. 합성배지의 영양분 중 NH$_{4}^{+}$, SO$_{4}^{-2}$, $K^+$ 또는 PO$_{4}^{-3}$ 이온을 결핍시켰을 때 M. organophilum의 PHB 생산이 증가하였으며 칼륨이온을 결핍시켰을때 세포의 건조 중량에 대한 PHB 함량은 최대 58%를 얻었다.

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한국 해산 남조류 (II) (Marine Blue-green Algae in Korea (II))

  • 유순애;채승문;이기완
    • 자연과학논문집
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    • 제6권1호
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    • pp.5-39
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    • 1993
  • 한국 해산 남조류(Cyanophyta) 의 목록을 작성하고 분류학적 위치를 확인하기 위하여 우리나라 전해역에서 채집된 남조류를 대상으로 형태분류학적 연구를 시도하였다. 그 결과 동정된 한국 해산 남조류는 총 3목 6과 20속 36종이며, 이 중 14종이 우리나라에서 그 생육이 처음으로 확인된 미기록종 (Chroococcus minutus ($K\"{u}$tzing) $N\"{a}$geli, Merismopedia punctata Meyen, Microcystis ichtyoblabe $K\"u$zing, Dermocarpa leibleiniae (Reinsch) Born. et Thur., Hydrocoleum confluens (Setchell et Gardner) Drouet, Lyngbya sordida (Zanard.) Gomont, Phormidium forveolarum (Mont.) Gomont, Phormidium hansgieri Schmidle, Skujaella hildebrandtii (Gomont.) de Toni, Sphaeronema lithophila (Ercegovic) Umezaki, Spirulina tenerrima $K\"u$tzing, Hormothamnion enteromorphoides Grunow, Michrochaete aeruginea Batters, Michrochaete grisea Thuret ex Born. et flah.)이었다. 본 연구에서는 간섭현미경과 위상차현미경을 이용하여 체형이 미소한 남조류의 현미사진을 작성하였다. 형태학적으로 분류된 각 종을 대상으로 세포내 함유물을 관찰하여 그 중 PHB ($poly-\SS$-hydroxybutyrate) granule의 존재 유무를 조사하였으며, Lyngbya confervoides, Lyngbya semiplena, Phormidium corium, Sirocoleum kurzii, Hormothanmnion enteromorphoides, Calothrix crustacea들은 PHB를 함유하고 있음이 확인되었다. 이 결과는 생리생화학적 특성을 기초로한 남조류의 분류체계를 정립하기 위한 자료로 활용될 수 있을 것이다.

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DiffServ망에서 프리미엄 서비스가 적용된 UDP, TCP플로우의 성능평가

  • 정상길;변옥환
    • 지식정보인프라
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    • 통권7호
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    • pp.128-133
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    • 2001
  • 본 논문에서는 DiffServ망의 EF PHB를 이용해 구현한 프리미엄 서비스를 UDP및 TCP 플로우에 적용하였을 때 나타나는 특성을 측정 및 분석함으로써, DiffServ망을 이용하여 고품질의 서비스를 제공받고자 하는 서비스 사용자에게 미치는 영향을 제시하였다.

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FPGA를 이용한 single rate Rate Adaptive Shaper 설계 (Design of single rate Rate Adaptive Shaper Using FPGA)

  • 박천관
    • 한국항행학회논문지
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    • 제10권1호
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    • pp.70-78
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    • 2006
  • 본 논문은 RFC2963에서 제안된 single rate Rate adaptive Shaper (srRAS)를 설계한 것이다. srRAS는 RFC2693에서 제안된 하향의 single rate Three Color Marker (srTCM)과 함께 사용된 쉐이퍼이다. 그것은 가변 속도로 출력되는 tail-drop FIFO (First Input First Out) 큐이다. srTCM은 srRAS로부터의 IP 패킷 스트림을 측정한 후 그 패킷을 green, yellow, 또는 red로 마킹해 준다. 이 쉐이퍼는 AF PHB (Per Hop Behavior)를 제공하는 DS (Differentiated Service) 네트워크의 입력에서 사용되도록 제안되었다. 그리고 srRAS는 srTCM의 상향 트래픽의 버스트성을 줄여줄 수 있다. 본 논문은 srRAS의 알고리즘, 구조, 그리고 FPGA 및 관련 기술을 통하여 구현할 수 있는 방안을 언급하였다.

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Performance Analysis of Random Early Dropping Effect at an Edge Router for TCP Fairness of DiffServ Assured Service

  • 허경
    • 한국통신학회논문지
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    • 제31권4B호
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    • pp.255-269
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    • 2006
  • The differentiated services(DiffServ) architecture provides packet level service differentiation through the simple and predefined Per-Hop Behaviors(PHBs). The Assured Forwarding(AF) PHB proposed as the assured services uses the RED-in/out(RIO) approach to ensusre the expected capacity specified by the service profile. However, the AF PHB fails to give good QoS and fairness to the TCP flows. This is because OUT(out- of-profile) packet droppings at the RIO buffer are unfair and sporadic during only network congestion while the TCP's congestion control algorithm works with a different round trip time(RTT). In this paper, we propose an Adaptive Regulating Drop(ARD) marker, as a novel dropping strategy at the ingressive edge router, to improve TCP fairness in assured services without a decrease in the link utilization. To drop packets pertinently, the ARD marker adaptively changes a Temporary Permitted Rate(TPR) for aggregate TCP flows. To reduce the excessive use of greedy TCP flows by notifying droppings of their IN packets constantly to them without a decrease in the link utilization, according to the TPR, the ARD marker performs random early fair remarking and dropping of their excessive IN packets at the aggregate flow level. Thus, the throughput of a TCP flow no more depends on only the sporadic and unfair OUT packet droppings at the RIO buffer in the core router. Then, the ARD marker regulates the packet transmission rate of each TCP flow to the contract rate by increasing TCP fairness, without a decrease in the link utilization.