• 한국독성학회:학술대회논문집
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• 한국독성학회 1998년도 국제심포지움 및 추계학술대회
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• 1998

Polyoma Virus Enhancer core Binding Protein (PEBP2)는 유전자의 전사를 조절하는 hetero-dimeric transcription factor로서 $\alpha$와 $\beta$ subunit으로 구성되어 있다. $\alpha$ subunit을 coding 하는 유전자중 하나인 PEBP2aB는 급성백혈병과 관련되어있는 t(8;21) 또는 t(12;21)에 의하여 변형됨으로서 백혈병 발병의 원인이 되고 있다 (Miyoshi et al., 1993; .Romana et al., 1995). $\beta$ subunit을 coding 하는 PEBP2$\beta$도 inv(16)에 의하여 변형됨으로서 백혈병을 유도하는 주요 원인이 되고 있다 (Liu et al., 1993). 이 유전자들의 생물학적 활성을 밝히기 위한 연구가 gene targeting에 의한 knockout mouse 생산 방법으로 수행되었다. 그 결과 PEBP2$\alpha$B와 PEBP2$\beta$ 유전자가 definitive hematopoiesis에 있어서 결정적으로 중요한 역할을 하고 있음이 관찰되었다 (Okuda et al., 1996, Wang et al., 1996a, 1996b), 이는 이들 유전자가 bematopoietic master switch 유전자임을 밝힌 중요한 결과로서 이로부터 혈액학 연구 분야의 새로운 장이 열리게 되었다. 또한 이러한 연구 결과들은 PEBP2 family에 속하는 다른 유전자의 생물학적 활성의 연구를 촉진하는 계기가 되었다. 최근 PEBP2$\alpha$A 유전자가 결손된 마우스가 생산되었는데 이 유전자의 경우에는 모든 종류의 뼈의 생성이 완전히 결손됨이 관찰되었다 (Komori et al., 1997). 이는 PEBP2$\alpha$A 유전자가 뼈의 생성을 지배하는 master switch 유전자임을 보여주는 중요한 관찰로서 bone biologist 들의 큰 관심을 모으고 있다. 본 연구팀은 PEBP2 family 유전자 중 유일하게 아직 생물학적 활성이 규명되지 않은 PEBP2$\alpha$C 유전자의 활성을 knockout 마우스를 생산하는 방법에 의하여 분석하였으며 소화기관의 형성에 중요한 역할을 하고 있음을 확인하였다.

• 한국자기공명학회논문지
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• 제6권1호
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• pp.54-68
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• 2002

PEBP2/CBF (Polyomavirus Enhancer-core Binding Protein 2/Core Binding Factor), represents a new family of heterodimeric transcription factor. Those members play important roles in hematopoiesis and osteogenesis in mouse and human. PEBP2/CBF is a sequence-specific DNA binding protein. Each member of the PEBP2/CBF family of transcription factors is composed of two subunits, ${\alpha}$ and ${\beta}$. The evolutionarily conserved 128 amino acid region in ${\alpha}$ subunit has been called the Runt domain, which harbors two different activities, the ability to bind DNA and interact with the ${\beta}$ subunit. Recently, cDNA clones encoding the C. elegans Runt domain were isolated by screening a cDNA library. This gene was referred to run (Runt homologous gene). In this study, the basic experiments for the structural characterization of RUN protein were performed using spectroscopic methods. We have identified the structural properties of RUN using bioinformatics, CD and NMR. The limit temperature of the structural stability was up to 60$^{\circ}C$ with irreversible thermal process, and the structure of RUN seems to adopt ${\alpha}$ helices and one or more ${\beta}$ sheet or turn. The degree of NMR peak dispersion and intensity was increased by addition of glycine. Therefore, glycine could be used to alleviate the aggregation property of RUN in NMR experiment.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권9호
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• pp.1334-1341
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• 2007

This study identified hepatic differentially expressed genes (DEGs) affecting the marbling of muscle. Most dietary nutrients bypass the liver and produce plasma lipoproteins. These plasma lipoproteins transport free fatty acids to the target tissue, adipose tissue and muscle. We examined hepatic genes differentially expressed in a differential-display reverse transcription-polymerase chain reaction (ddRT-PCR) analysis comparing high- and low-marbled Hanwoo steers. Using 60 arbitrary primers, we found 13 candidate genes that were upregulated and five candidate genes that were downregulated in the livers of high-marbled Hanwoo steers compared to low-marbled individuals. A BLAST search for the 18 DEGs revealed that 14 were well characterized, while four were not annotated. We examined four DEGs: ATP synthase F0, complement component CD, insulin-like growth factor binding protein-3 (IGFBP3) and phosphatidylethanolamine binding protein (PEBP). Of these, only two genes (complement component CD and IGFBP3) were differentially expressed at p<0.05 between the livers of high- and low-marbled individuals. The mean mRNA levels of the PEBP and ATP synthase F0 genes did not differ significantly between the livers of high- and low-marbled individuals. Moreover, these DEGs showed very high inter-individual variation in expression. These informative DEGs were assigned to the bovine chromosome in a BLAST search of MS marker subsets and the bovine genome sequence. Genes related to energy metabolism (ATP synthase F0, ketohexokinase, electron-transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase and NADH hydrogenase) were assigned to BTA 1, 11, 17, and 22, respectively. Syntaxin, IGFBP3, decorin, the bax inhibitor gene and the PEBP gene were assigned to BTA 3, 4, 5, 5, and 17, respectively. In this study, the in silico physical maps provided information on the specific location of candidate genes associated with economic traits in cattle.

• BMB Reports
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• 제43권5호
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• pp.337-343
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• 2010

Fenofibrate, an agonist of $PPAR{\alpha}$, plays an important role in activating many proteins catalyzing lipid metabolism, and it also has a considerable effect on improvement of insulin sensitivity in the diabetic condition. To investigate fenofibrate-dependent expression of peripheral tissue proteins in diabetes, we analyzed whole muscle or fat proteins of fenofibrate-fed OLETF rats, an animal model of type II diabetes, using 2-dimensional gel electrophoresis. We found that many proteins were specifically expressed in a fenofibrate-dependent manner in these diabetic rats. In particular, a functionally unknown C11orf59 protein was differentially expressed in the muscle tissues (about 5-fold increase) in fenofibrate-fed OLETF rats as compared to control rats. Additionally, the signal proteins phosphatidylethanolamine binding protein and IkB interacting protein were differentially regulated in the fenofibrate-treated adipose tissues. We suggest here that these proteins might be involved in controlling lipid or carbohydrate metabolism in diabetes via $PPAR{\alpha}$ activation.

• 대한소아치과학회지
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• 제30권4호
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• pp.643-653
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• 2003

막내골화와 연골내골화 등의 정상적인 골격 성장은 섬유아세포 성장인자 (FGF) 와 이들 수용체들 (FGFR) 에 의한 신호 전달체계에 의해 조절된다. 또한 전사조절인자인 Runx2 ($Cbfa1/Pebp2{\alpha}A/AML3$) 는 골아세포분화 뿐만 아니라 골형성에도 필수적인 유전자로 알려져 있다. FGF signaling이 mouse의 두개관과 하악에서의 연골 형성에 어떤 영향을 미치고 있으며, 이 과정에서 Runx2의 연관성을 알아보고자 in vivo 및 in vitro 실험을 시행하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 두개관과 하악을 Alcian blue 염색한 결과 시상두개봉합부 연골은 태생 16일부터, Meckel's 연골은 태생11일부터 형성되기 시작하였다. 이들 연골세포들의 성상을 알아보기위한 in situ hybridization 결과 시상두개봉합부 연골 및 Meckel's 연골 모두에서 type II collagen은 발현되었으나, Type X collagen은 발현되지 않았다. Runx2 mRNA는 시상두개봉합부 연골과 Meckel's 연골 모두에서 발현되지 않았지만, 이들 연골들의 가장자리를 둘러싸고 있는 독특한 발현양상을 나타내었다. 두개봉합부에서의 FGF2 protein의 국소적 적용은 두개봉합부 하방의 연골형성을 억제하였다. 또한 하악의 Meckel's 연골 발생 부위에 FGF2 protein의 국소적 적용 역시 Meckel's 연골의 형성을 억제하였다. FGF2 protein은 시상두개봉합부상의 bead 주위로 Runx2의 발현을 유도하였다. 이 결과들을 종합해볼 때, FGF signaling은 골아세포와 연골아세포가 공존하고 있는 조직에서의 연골 형성을 억제하고 있음을 시사해 주고 있으며, 이 과정에서 FGF signaling은 부분적으로 Runx2 유전자의 발현을 조절하므로써 연골세포의 증식과 분화에 관여할 것으로 사료된다.