• 대한치과보철학회지
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• 제50권2호
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• pp.112-118
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• 2012

연구 목적: 이 연구의 목적은 실란과 인산 모노머를 혼합한 프라이머인 Monobond plus (Ivoclar Vivadent, Schaan, Liechtenstein)를 사용했을 때 레진 시멘트와 수복물 간의 전단 결합 강도가 귀금속, 비귀금속, 글라스 세라믹과 지르코니아 네 가지 재료 모두에서 기존의 프라이머를 사용했을 때의 결합 강도와 비교하여 유의한지 평가하는 것이다. 연구 재료 및 방법: 디스크 모양(${\phi}\;9mm{\times}3mm$)의 귀금속(Argedent Euro) 시편 16개, 비귀금속(T-4) 시편 20개, 지르코니아(Cercon) 시편 20개, 글라스 세라믹(IPS e.max press) 시편 20개를 제작한 후 아크릴릭 레진(${\phi}\;15mm{\times}15mm$)에 포매하였다. 귀금속 시편에 airborne-particle abrasion을 시행하고 대조군으로 사용한 8개 시편에는 귀금속용 프라이머(Metal primer II)를, 나머지 8개 시편에는 Monobond plus를 도포하였다. 비귀금속 시편과 지르코니아 시편은 airborne-particle abrasion 후 각각 두 그룹으로 나누어 대조군 10개 시편에는 비귀금속 및 지르코니아용 프라이머(Alloy primer)를, 나머지 10개에는 Monobond plus를 도포하였다. 글라스 세라믹 시편은 4% 불산으로 부식한 후, 대조군 10개 시편에는 실란(Monobond-S)을, 나머지 10개에는 Monobond plus를 적용했다. 표면 처리된 시편 위에 디스크 형태(${\phi}\;5mm{\times}2mm$)로 레진 시멘트(Multilink N)를 위치시키고 중합하였다. 제작된 모든 시편을 열순환($5^{\circ}C$와 $55^{\circ}C$, 1분씩 2060회)시킨 후 전단 결합 강도를 측정하였다. 전단 결합 강도의 유의차를 살펴보기 위해 Shapiro-Wilk test를 이용하여 모집단의 분포에 대한 검정을 하고 그 결과에 따라 Two sample $t$-test 또는 Mann-Whitney U test를 실시하였다(${\alpha}$=.05). 파절된 시편을 확대경으로 관찰하여 그 양상을 분류하였다. 결과: 귀금속과 글라스 세라믹 군에서는 두 프라이머간의 전단 결합 강도에 유의한 차이가 존재하지 않았으나($P$>.05) 비귀금속 군과 지르코니아 군에서는 기존 프라이머(Alloy primer)를 사용했을 때 레진 시멘트와 수복물간의 전단 결합 강도가 Monobond plus를 사용한 군보다 통계적으로 유의하게 높았다(비귀금속 군$P$=.004, 지르코니아 군$P$=.001). 결론: 실란과 인산 모노머를 혼합한 다용도 프라이머는 귀금속과 글라스 세라믹 군에서는 기존의 프라이머를 대신하여 사용할 수 있을 것이다. 그러나 비귀금속과 지르코니아 세라믹에서는 10-MDP 프라이머에 비해 접착 강도가 낮아 기존 프라이머를 대신하여 적용하기 위해서는 좀 더 연구가 필요할 것이다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제31권3호
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• pp.285-292
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• 1993

간흡충 total RNk에는 많은 량의 185 rRNA가 함유되어 있었지만 285 rRNA는 그 양이 매우 적었다. 약 $8{\;}{\mu\textrm{g}}의{\;}poly{\;}(A)^{+}$ mRNAS부터 합성된 double-stranded CDNA는 대부분이 0.4-4.2 kb 크기이었으며 9.5 kb에 달하는 것도 있었다. 이미 보고되어 있는 tropomyosin의 amino산 서열을 기준하여 5개의 degenerated oligonucleotide (sense primer 2개와 antisense primer 3개)를 합성하였다. TotalcDNA를 template로 하고 sense primer와 antisense primer를 조합하여 실시한 PCR 산물 중에서 580 bp 크기의 특이 유전자가 나타났다. 만손주혈흡충의 tropomyosin CDNA를 탐색자로 써서 Southern hybridization했을 때 이 유전자만이 검출되어서. 이 유전자는 간횹충 tropomyosin (CSTM) CDNA의 일부분일 가능성이 높다고 생각되어 sequencing vector인 POEM-3Zf(-)에 cloning한 다음 염기서열을 결정하였다. nRf 증폭된 CSTM CDNA는 크기가 575 bp이었으며 191개의 predicted amino산 서열은 한 개의 open reading frame을 갖고 있었다 CSTM CDNA의 amino산 서열은 만손주혈흡충 tropomyosln과 86.3%. Trichosoonvk: colhnfornis tropomyosin과 51.1% 의 유사성을 갖고 있었다. 이 CSTM cDNA fragment는 앞으로 간흡충 cDNA library를 screening하여 완전한 CnM CDNA를 cloning하기에 좋은 probe로 쓰일 것으로 예상된다.

• BMB Reports
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• 제40권4호
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• pp.511-516
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• 2007

A glutathione S-transferase (GST) related to the phi (F) class of enzymes only found in plants has been cloned from the Oryza sativa. The GST cDNA was cloned by PCR using oligonucleotide primers based on the OsGSTF5 (GenBank Accession No. $\underline{AF309382}$) sequences. The cDNA was composed of a 669-bp open reading frame encoding for 223 amino acids. The deduced peptide of this gene shared on overall identity of 75% with other known phi class GST sequences. On the other hands, the OsGSTF5 sequence showed only 34% identity with the sequence of the OsGSTF3 cloned by our previous study (Cho et al., 2005). This gene was expressed in Escherichia coli with the pET vector system and the gene product was purified to homogeneity by GSH-Sepharose affinity column chromatography. The expressed OsGSTF5 formed a homo-dimer composed of 28 kDa subunit and its pI value was approximately 7.8. The expressed OsGSTF5 displayed glutathione conjugation activity toward 1-chloro-2,4-dinitrobenzene and 1,2-epoxy-3-(p-nitrophenoxy)propane and glutathione peroxidase activity toward cumene hydroperoxide. The OsGSTF5 also had high activities towards the herbicides alachlor, atrazine and metolachlor. The OsGSTF5 was highly sensitive to inhibition by S-hexylGSH, benastatin A and hematin. We propose from these results that the expressed OsGSTF5 is a phi class GST and appears to play a role in the conjugation of herbicide and GPOX activity.

• 한국균학회지
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• 제38권2호
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• pp.112-119
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• 2010

느타리속에 속하는 버섯은 예로부터 인체에 이로운 생리 활성물질을 많이 함유한 버섯으로 알려져 왔다. 최근 우리나라에서 노랑느타리와 분홍느타리의 재배가 증가함에 따라 이들 버섯의 유전적 다양성과 유연관계의 규명이 필요하게 되었다. 이에 우리나라와 해외 지역에서 수집한 노랑느타리4균주, 분홍느타리 3균주 그리고 느타리 4균주를 대상으로 rDNA의 ITS region 염기서열과 genomic DNA의 RAPDPCR을 수행하였다. ITS1과 ITS2 영역의 염기의 수는 각각 167에서 254쌍, 156에서 213쌍으로 계통에 따라 변이가 있었고 5.8S 영역의 염기의 수는 노랑느타리 균주는 158쌍이었고, 분홍느타리와 느타리 균주는 157쌍으로 동일하였다. 각각의 균주 간 유연관계를 알아보기 위해 본 실험에 사용한 11균주와 NCBI GenBank에 염기서열이 등록되어있는 노랑느타리 3균주, 분홍느타리 2균주, 느타리 1균주의 ITS 영역의 염기서열을 이용하여 분지도를 작성한 결과, 4개의 클러스터로 나눠지는 것으로 나타났다. 분홍느타리와 느타리의 균주는 큰 클러스터 내에서는 하나의 클러스터에 속했지만 각각의 종은 이 클러스터 내에서 각기 서로 다른 2개의 소그룹으로 나누어졌다. 또한 20 종류의 primer를 이용하여 RAPD를 수행한 결과 10개의 primer가 효과적으로 염색체 DNA를 증폭하는 것으로 나타났다. 증폭의 양상은 느타리속의 계통과 primer의 종류에 따라 다르게 나타났는데, 증폭된 DNA의 단편 수는 균주 당10개, 단편의 크기는 0.1 kb에서 2.0 kb까지 다양하였다. 본 실험 결과 실험에 사용한 느타리속 균주의 계통과 품종간의 유연관계는 높았고 느타리속의 동일한 종은 우리나라, 중국 및 일본에서 수집한 장소와 상관없이 상동성이 높았다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권11호
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• pp.6961-6964
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• 2013

Human papillomavirus (HPV) is a major cause of cervical cancer. More than 100 HPV genotypes have been identified; however the distribution varies geographically and according to ethnicity. The purpose of this study was to investigate the prevalence and distribution of HPV subtypes among Northeast Thai women. Subjects included 198 cases of SCCA and 198 age-matched, healthy controls. HPV-DNA was amplified by PCR using the consensus primers GP5+/6+ system followed by reverse line blot hybridization genotyping. The prevalence of high-risk HPV infection was 21 (10.1%) and 152 (76.8%) in the controls and in the cases, respectively. High-risk HPV significantly increased the risk for cervical cancer with an OR of 42.4 (95%CI: 22.4-81.4, p<0.001) and an adjusted OR of 40.7-fold (95%CI: 21.5-76.8, p <0.001). HPV-16 was the most prevalent HPV type in the SCCA (56.2%) followed by HPV-58 (17.8%) and HPV-18 (13.6%); whereas HPV-58 (46.4%) was a prominent genotype in the controls followed by HPV-16 (39.3%) and unidentified HPV types (25.0%). These findings indicate that HPV infection remains a critical risk factor for SCCA; particularly, HPV-16, HPV-58 and HPV-18. In order to eradicate cervical cancer, sustained health education, promoted use of prophylactics and a HPV-58 vaccine should be introduced in this region.

• Mycobiology
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• 제37권3호
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• pp.183-188
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• 2009

The molecular phylogeny in nine different commercial cultivated strains of Pleurotus nebrodensis was studied based on their internal transcribed spacer (ITS) region and RAPD. In the sequence of ITS region of selected strains, it was revealed that the total length ranged from 592 to 614 bp. The size of ITS1 and ITS2 regions varied among the strains from 219 to 228 bp and 211 to 229 bp, respectively. The sequence of ITS2 was more variable than ITS1 and the region of 5.8S sequences were identical. Phylogenetic tree of the ITS region sequences indicated that selected strains were classified into five clusters. The reciprocal homologies of the ITS region sequences ranged from 99 to 100%. The strains were also analyzed by RAPD with 20 arbitrary primers. Twelve primers were efficient to applying amplification of the genomic DNA. The sizes of the polymorphic fragments obtained were in the range of 200 to 2000 bp. RAPD and ITS analysis techniques were able to detect genetic variation among the tested strains. Experimental results suggested that IUM-1381, IUM-3914, IUM-1495 and AY-581431 strains were genetically very similar. Therefore, all IUM and NCBI gene bank strains of P. nebrodensis were genetically same with some variations.

• 한국자원식물학회지
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• 제26권5호
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• pp.613-618
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• 2013

우리나라에서 안면도에만 분포하는 먹넌출 집단의 생명자원보존을 위하여 엽의 형태적 특성과 I-SSR 표지자를 이용한 유전변이를 조사하였다. 10가지 엽특성에 대한 ANOVA 분석결과 모든 특성에서 개체 간에 통계적인 유의성이 인정되었다. 조사된 39개체의 평균특성은 엽신장 11.8 cm, 최대엽폭 7.1 cm, 엽지수 1.67, 상1/3폭 5.4 cm, 하1/3폭 6.2 cm, 엽병길이 3.6 cm, 엽두께 0.19 mm, 엽맥수(좌) 11.5개, 엽맥수(우) 11.4개, 엽면적 61.7 $cm^2$로 나타났다. 변이계수 값은 엽두께, 엽병길이, 엽면적이 각각 18.8%, 21.7%, 22.0%로 높게 나타났으며, 나머지 특성들에서는 15% 이내의 비교적 낮은 변이를 나타냈다. 선발된 8개 I-SSR Primer에서 총 50개의 증폭산물을 얻었으며, 유효대립 유전자의 수 1.719개, 다형적 유전자좌의 비율 26.0%, 이형접합도의 기대치 0.410 및 Shannon의 다양성지수 0.598로 각각 나타났다. 안면도 먹넌출 집단은 제한된 지역에 분포하며 개체수가 적음에도 불구하고 높은 유전다양성을 유지하는 것으로 나타났다.

• 미생물학회지
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• 제38권2호
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• pp.74-80
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• 2002

단일 탄소원 및 에너지원으로 benzoate를 이용하는 Acinetobacter sp. KS-1에서 분리 정제한 catechol 1,2-dioxygenase (Cl,2O)의 특성과 아미노산 서 열을 분석하였다. Cl,2O는 catechol과 4-methylcatechol에 대해서 효소활성을 나타내었으며, 활성 최적온도는 $35^{\circ}C$이고, 활성 최적 pH는 7.5-9.0의 범위 내에 있었다. 효소활성 저해제로서 은, 수은, 그리고 구리는 Acinetobacter sp. KS-1의 Cl,2O 활성을 억제하였다. SDS-PAGE에 의해 측정된 Cl,2O의 분자량은 약 36 kDa 였으며, N-말단 아미노산 서 열을 분석한 결과, $^{1}MNYQQIDALVKQMNVDTAKG^{20}$로 Acinetobacter radioresistens의 Cl,2O와 95%의 유사성을 보여주었다. In-gel 아미노산 서열 분석을 위하여 trypsin 처리와 peptide mapping을 실시하였다. MALDI-TOF를 이용하여 trypsin으로 처리된 세 개의 peptide flagmen써 분자량을 분석한 결과 966.3 Da, 2081.7 Da, 그리고 1933.8 Da으로 각각 나타났는데, 이는 A. radioresistens의 Cl,2O와 내부 서 열$^{1}SQSDFNLRR^{9}\, ^{1}HGNRPSHVHYFNSAPGYR^{18}\, ^{1}TIEGPLYVAGAPESVGFAR^{19}$ 이 일치하는 것으로 분석되었다. N-말단 서열과 내부 서열을 바탕으로 primer를 제작하여 polymerase chain reaction을 실시하였다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권4호
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• pp.1321-1324
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• 2012

Background: DNA polymerase beta ($pol{\beta}$) is a key enzyme in the base excision repair pathway. It is 39kDa protein, with two subunits, one large subunit of 31 kDa having catalytic activity between exon V to exon XIV, and an 8 kDa smaller subunit having single strand DNA binding activity. Exons V to VII have double strand DNA binding activity, whereas exons VIII to XI account for the nucleotidyl transferase activity and exons XII to XIV the dNTP selection activity. Aim: To examine the association between $pol{\beta}$ polymorphisms and the risk of ovarian cancer, the present case control study was performed using 152 cancer samples and non-metastatic normal samples from the same patients. In this study, mutational analysis of $pol{\beta}$ genomic DNA was undertaken using primers from exons IX to XIV - the portion having catalytic activity. Results: We detected alteration in DNA polymerase beta by SSCP. Two specific heterozygous point mutations of $pol{\beta}$ were identified in Exon 9:486, A->C (polymorphism 1; 11.18%) and in Exon 11:676, A->C (polymorphism 2; 9.86%). The correlation study involving polymorphism 1 and 4 types of tissue showed a significant correlation between mucinous type with a Pearson correlation value of 4.03 (p=0.04). The association among polymorphism 2 with serous type and stage IV together have shown Pearson ${\chi}^2$ value of 3.28 with likelihood ratio of 4.4 (p=0.07) with OR =2.08 (0.3-14.55). This indicates that there is a tendency of correlation among polymorphism 2, serous type and stage IV, indicating a risk factor for ovarian cancer. Conclusion: Hence, the results indicate that there is a tendency for $pol{\beta}$ polymorphisms being a risk factor for ovarian carcinogenesis in India.

• 생명과학회지
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• 제21권5호
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• pp.626-630
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• 2011

세계적 멸종위기종인 따오기(Nipponia nippon)는 2008년 10월에 중국에서 1쌍이 도입된 후 한국최초로 인공번식에 성공하였다. 본 연구는 따오기의 sex-related gene과 Chromodomain Helicase DNA Binding Protein gene (CHD gene)을 가지고 polymerase chain reaction (PCR)을 수행하여 새로 태어난 따오기 유조의 성별을 확인하고자 하였다. 본 연구에서는 따오기의 성별 확인을 위해 PCR후 제한효소의 처리 방법과 P2과 P8를 이용한 PCR 방법을 실시하였을 때 더 정확한 결과가 나타남을 알 수 있었다. 그리고 CHD gene의 염기서열을 선행연구와 비교해 본 결과, 암컷의 염기서열에서 1~2 base pairs 차이가 나타남을 알 수 있었다.