생리학적 활성을 가지고 있을 것으로 예측되는 디-아세틸렌 결합으로 연결된 oligodeoxyribonucleotide를 합성하였다. Pd(0)촉매를 사용한 Heck-type C-C 결합반응을 통하여 2'-deoxyuridine의 5-위치에 acetylene 기를 도입하고, 5'-OH를 t-butyldimethylsilyl로 보호한 후, Glaser oxidative coupling 반응을 이용하여 dimerization을 시켰다.
Attempts were made to develop new protecting groups for 1,6-lactam function of 2-N-acyl guanine in oligodeoxyribonucleotide synthesis. Several acyl groups, aryl groups, and carbamoyl groups were tested. Dimethylcarbamoyl and phenylacetyl groups are shown to be a good combination for guanine residue. 6-O-Di-methylcarbamoyl-2-N-pheylacetyl-2'-deoxy guanosine have been successfully used in the synthesis of d[AAGCTT], which is Hind Ⅲ recognition sequence.
Whatmann chromatography paper(3MM)을 지지체로 사용하여 phosphite-triester법에 의해 미량의 염기가 부착된 5'-d(GAATTCCGGCCA)와 5'-d(GGAGCTGTC)의 두 oligodeoxyribonucleotide를 합성 하였다. Trityl yield 분석에 의하면 76.1${\%}$와 86.5${\%}$의 평균 coupling 수율을 각각 얻었다.두 oligodeoxyribonucleotide들을 HPLC를 이용하여 분리 정제할 수 있었고 snake venom phosphodiesterase와 bacterial alkaline phosphatase에 의해 분리 정량화할 수 있었으며 이때의 염기의 수는 합성을 시도한 염기수와 일치했다. 이처럼 paper를 지지체로 이용한 oligodeoxyribonucleotide의 합성은 값싸고 동시에 많은 염기가 부착된 미량의 DNA를 빠르고 짧은 기간에 수행할 수 있는 장점이 있다.
Base의 아미노기와 5'-산소가 아실 및 dimethoxytrityl기로 각각 보호된 deoxyribonucleosidedml 3'-산소를 인산화시약인 o-chlorophenylphosphoroditriazole과 반응시켜 인산화중간체를 합성함에 있어서 수득률을 증가시킬 수 있는 반응조건을 조사하였다. 이 과정에서 주로 이용하고 있는 디옥산단일용매 보다 디옥산에 소량(5%)의 피리딘을 포함시키면 반응속도가 크게 증가하였으며, 단일용매 사용에서의 단점인 부반응도 일어나지 않았다. 인산화방법이 개선되므로 인산화중간체의 합성을 포함한 몇 단계의 반응을 쉽게 수행하여 모두 보호된 이량체를 합성하는 방법을 개발했다. 이렇게 개선된 방법으로 합성한 5종의 이량체들로부터 Hind Ⅲ인식자리를 지닌 십이량체를 합성하였다.
"Phosphotriester Method"에 따라 모형 oligodeoxyribonuclotide로서 EcoRI인식자리를 지닌 육량체 GpApApTpTpCp를 화학적으로 합성하면서, 이 과정에 포함되는 반응물의 보호, 축합 보호기의 제거, 생성물의 정제, 정량 및 확인작업의 전반에 걸쳐 기존 방법에 대한 평가와 개선을 수행하였다. 소량체합성의 기본 단위는 이량체로 함이 효유적이며, 착합단계의 수득율은 이량체>사량체>육량체의 순으로 감소함을 알았다. UV/IR분광법 및 hplc/tlc크로마토그래피법을 이용함으로써 미량의 시료를 사용하여 Oligonucleotide를 합성함에 수반되는 정량/확인의 난점을 해결하였다. 또한 5'-OH가 노출된 nucleotide 중 전자를 과량 사용하여 반응시키고 산처리하여 탄산수소나트륨 수용액으로 세척하는 것이 양호한 방법임을 알았다. 아울러 합성에 관련된 nucleotide와 그 유도체를 분광학적 크로마토 그래피자료를 수록하였다.
효모에서 대랑의 물질생산계를 구축하기 위하여 먼저 여러 종류의 베터의 이용이 가능한 다양한 영양요구성 marker를 지니며 형질전환율이 향상된 효모숙주를 선별 개량하였다. 벡터의 제작에 사용되는 프로모터로는, 효모의 여러 유전자 중에서 그 활성이 매우 높은 해당계의 효소 GAP-DH의 구조 유전자 GAP를 이용하기로 하여, 효모염색체 DNA중에서 GAP 프로모터를 분리하여 이용하기 쉽게 변형하였다. 분리된 GAT promoter의 기능을 검토하기 위하여, reporter로 APase의 구조유전자 PHO5'를 이용하여 세포내의 copy수가 상이한 발현 벡터를 제작하여 GAP 프로모터에 의한 APase의 활성 및 전사산물을 측정한 결과, 정상적인 전사가 이루어 졌으며, 효소활성도 높게 나타났으며, 벡터의 copy수에 의한 효소활성의 차이도 감지되었다.
7- Bromomethylbenz[a]anthracene is a known mutagen and carcinogen. The two major DNA adducts produced by this carcinogen, i.e., $N^2$-(benz[a]anthracen-7-yl methyl)-2'-deoxyguanosine (2, b[a]$a^2$G) and $N^6$-(benz[a]anthracen-7-ylmethyl)-2'-deoxyadenosine (4, b[a]$a^6$/A), as wel 1 as the simpler benzylated analogs,$N^2$-benzyl-2'deoxyguanosine (1, $bn^2$G) and $N^6$-benzyl-2'-deoxyadenosine (3, $bn^6$/A), were prepared by direct aralkylation of 2'-deoxyguanosine and 2'-deoxyadenosine. To determine the site-specific mutagenicity of these bulky exocyclic amino-substituted adducts, the suitably protected nucleosides were incorporated into 16-base oligodeoxyribonucleotides in place of a normal guanine or adenine residues which respectively are part of the ATG initiation codon for the lac Z' \alpha-complementation gene by using an in situ activation approach and automated phosphite triester synthetic methods. The base composition and the incorporation of the bulky adducts into synthetic oligonucleotides were characterized after purification of the modified oligonucleotides by enzymatic digestion and HPLC analysis.
Insulin-like growth factors(IGF)s-I과 -II ligands와 이들의 receptors 및 6종류의 IGF-binding proteins(IGFBPs)로 구성된 IGF systim은 여러 종류의 세포의 생존, 증식 및 분화에 있어서 매우 중요한 역할을 한다. 리튬은 in vitro에서 여러 종류의 세포의 생존과 증식의 조절제로 알려져 있다. 본 연구는 IGF-I, IGF-I receptor 및 IGF carrier로서 주로 IGFBP-3를 발현하는 rat C6 glioma cell에서 LiCl로 유도된 세포 생존 및 증식의 변화와 IGF system components의 발현간의 관계를 구명하고자 수행되었다. 10%혈청을 함유하는 배양액에서 0, 2mM, 혹은 5mM LiCl을 첨가하여 C6 cell을 24시간 배양했을 시 세포의 생존률과 세포 수는 리튬 첨가에 의해 영향을 받지 않았다. 그러나 72시간 배양 했을 때 C6 cell은 명백히 리튬의 첨가수준에 따라 반응하였다. 0, 2m, 5mM LiCl 첨가수준에서 72시간 배양한 C6 cell은 각각 전형적인 세포분열, 세포분열 중지 및 세포사멸 양상을 보였다. 더욱이 사멸돼가는 세포는 reverse transcription-polymerase chain reaction으로 조사한 IGF-I, IGF receptor 및 IGFBP-3의 발현수준이 저하되었다. 흥미롭게도 혈청을 첨가하지 않은 배양조건 하에서 IGFBP-3에 대한 antisense oligodeoxyribonucleotide를 10${\mu}M$ 수준의로 첨가하여 배양했을 때도 표적 mRNA는 물론 세포 수도 줄었다. 종합하자면, C6 cell에서 리튬의 독성 효과의 일부는 이 제제에 의한 IGF system components의 발현 억제 효과에 의해 매개될 소지가 크다. 이러한 관점에서 IGRBP-3는 적어도 이 세포의 정상적인 증식을 위해 꼭 필요한(‘prrmissive') 역할을 할 수 있다는 점을 시사한다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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