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Tamoxifen Resistance and CYP2D6 Copy Numbers in Breast Cancer Patients

  • Motamedi, Sahar;Majidzadeh, Keivan;Mazaheri, Mahta;Anbiaie, Robab;Mortazavizadeh, Seyed Mohammad Reza;Esmaeili, Rezvan
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권12호
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    • pp.6101-6104
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    • 2012
  • Background: Breast cancer accounts about one million from total annual ten million new diagnosed cases of neoplasia worldwide and is the main cause of death due to cancer in women. Tamoxifen is the most popular selective estrogen receptor modulator used in anti estrogen treatments. Tamoxifen must be converted into its metabolite endoxifen for biologic effects; this conversion process is catalysed by highly polymorphic cytochrome P450 2D6 (CYP2D6). This study surveyed copy number variation of the CYP2D6 gene and its possible correlation with Tamoxifen resistance in breast cancer patients. Methods: This case control study was performed on samples taken from 79 patients with breast cancer who used tamoxifen in Yazd and Tehran Cities, Iran. Real time reactions were conducted for 10 healthy samples using the comparative $C_t$ (Cycles threshold) method, each pair of genes being compared and samples with ratios around 1 were taken as control samples. Proliferation reactions were done by Real-Time PCR ABI Prism 7500. All registered data were transformed into SPSS 15 program and analyzed. Results: Efficiency of PCR for both CYP2D6 and ALB genes was 100%. From all 23 drug resistant patients 21.7% had one copy, 47.8% two copies and 30.4% had three copies. Also from all 56 drug sensitive patients, 26.8% had one copy, 51.8% two copies and 21.4% had three copies. The percentage of patients with one and two copies was similar between two groups but patients with three copies were more likely to belong to the drug resistant group more. Odd ratios for one and two copies were 0.759 and 0.853 respectively, indicating possible protective effects while that for three copies was 1.604. Conclusions: Based on our study there is no significant link between CYP2D6 gene copy numbers and tamoxifen resistance in women with breast cancer. But more studies considering other influencing factors appear warranted.

폐경기 여성에서 폐경 및 불안 증상과 구강자각 증상과의 관련성 (Relationship between Menopause, Anxiety Symptoms and Perceived Oral Symptoms in Menopausal Woman)

  • 유현주;오진영;강지원;김보미;김세희;이은지;이지연;최민정;한경순
    • 치위생과학회지
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    • 제13권1호
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    • pp.53-61
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    • 2013
  • 폐경 전후의 만 45세 이상부터 60세 이하의 여성을 대상으로 폐경 및 불안 증상, 구강자각 증상을 파악하고 관련성을 검토하며, 구강자각 증상에 영향을 미치는 요인을 확인한 결과는 다음과 같다. 1. 폐경 증상은 10.61점, 불안 증상은 9.13점, 구강자각 증상은 6.60점이었다. 2. 구강자각 증상 하위요인인 점막염증 증상, 치주질환 증상, 구강건조 증상은 폐경 증상(p<0.001)과 불안 증상(p<0.001)에 따라 차이를 나타냈고, 이들 요인들은 모두 유의한 양의 상관관계를 나타냈다(p<0.001). 3. 구강자각 증상 관련요인은 폐경 증상(odd ratio [OR]=3.72), 불안 증상(OR=2.14), 음주(OR=1.37), 배우자 동거(OR=0.83)이었다(p<0.05). 폐경기 여성들의 폐경 증상과 불안 증상을 적절히 대처할 수 있는 건강프로그램이 제공되어야 하며, 이때 구강건강관리와 절주 프로그램도 포함시켜야 할 것으로 사료된다.

Risk Factors for Lung Cancer in the Pakistani Population

  • Luqman, Muhammad;Javed, Muhammad Mohsin;Daud, Shakeela;Raheem, Nafeesa;Ahmad, Jamil;Khan, Amin-Ul-Haq
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권7호
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    • pp.3035-3039
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    • 2014
  • Background: Lung cancer is one of the most prevalent malignancies in the world and both incidence and mortality rates are continuing to rise in Pakistan. However, epidemiological studies to identify common lung cancer determinants in the Pakistani population have been limited. Materials and Methods: In this retrospective case-control study, 400 cases and 800 controls were enrolled from different hospitals of all provinces of Pakistan. Information about socio-demographic, occupational, lifestyle and dietary variables was extracted by questionnaire from all subjects. Odd ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated. and dose-response associations were also assessed for suitable factors. Results: Strong associations were observed for smoking (OR=9.4, 95%CI=6.9-12.8), pesticide exposure (OR=5.1, 95%CI=3.1-8.3), exposure to diesel exhaust (OR=3.1, 95%CI=2.1-4.5), red meat consumption (OR=2.9, 95%CI=1.8-4.7) and chicken consumption (OR=2.8, 95%CI=1.7-49). Other associated factors observed were welding fumes (OR=2.5, 95%CI=1.0-6.5), sedentary living (OR=2.0, 95%CI=1.6-2.6), family history (OR=2.0, 95%CI=0.8-4.9), wood dust (OR=1.9, 95%CI=1.2-3.1), tea consumption (OR=1.8, 95%CI=1.2-2.6), coffee consumption (OR=1.8, 95%CI=1.1-2.8), alcoholism (OR=1.7, 95%CI=1.1-2.5) and asbestos exposure(OR=1.5, 95%CI=0.5-4.4). Consumption of vegetables (OR=0.3, 95%CI=0.2-0.4), juices (OR=0.3, 95%CI=0.3-0.4), fruits (OR=0.7, 95%CI=0.5-0.9) and milk (OR=0.6, 95%CI=0.5-0.8) showed reduction in risk of lung cancer. Strongest dose-response relationships were observed for smoking ($X^2=333.8$, $p{\leq}0.0000001$), pesticide exposure ($X^2=50.9$, $p{\leq}0.0000001$) and exposure to diesel exhaust ($X^2=51.8$, $p{\leq}0.0000001$). Conclusions: Smoking, pesticide exposure, diesel exhaust and meat consumption are main lung cancer determinants in Pakistan. Consuming vegetables, fruits, milk and juices can reduce the risk of lung cancer risk, as in other countries.

The DNA Repair Gene ERCC6 rs1917799 Polymorphism is Associated with Gastric Cancer Risk in Chinese

  • Liu, Jing-Wei;He, Cai-Yun;Sun, Li-Ping;Xu, Qian;Xing, Cheng-Zhong;Yuan, Yuan
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권10호
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    • pp.6103-6108
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    • 2013
  • Objective: Excision repair cross-complementing group 6 (ERCC6) is a major component of the nucleotide excision repair pathway that plays an important role in maintaining genomic stability and integrity. Several recent studies suggested a link of ERCC6 polymorphisms with susceptibility to various cancers. However, the relation of ERCC6 polymorphism with gastric cancer (GC) risk remains elusive. In this sex- and age-matched case-control study including 402 GC cases and 804 cancer-free controls, we aimed to investigate the association between a potentially functional polymorphism (rs1917799 T>G) in the ERCC6 regulatory region and GC risk. Methods: The genotypes of rs1917799 were determined by Sequenom MassARRAY platform and the status of Helicobacter pylori infection was detected by enzyme-linked immunosorbent assay. Odd ratios (ORs) and 95% confidential interval (CI) were calculated by logistic regression analysis. Results: Compared with the common TT genotype, the ERCC6 rs1917799 GG genotype was associated with increased GC risk (adjusted OR=1.46, 95%CI: 1.03-2.08, P=0.035). When compared with (GT+TT) genotypes, the GG genotype also demonstrated a statistical association with increased GC risk (adjusted OR=1.38, 95%CI: 1.01-1.89, P=0.044). This was also observed for the male subpopulation (GG vs. TT: adjusted OR=1.71, 95%CI: 1.12-2.62, P=0.013; G allele vs. T allele: adjusted OR=1.32, 95%CI: 1.07-1.62, P=0.009). Genetic effects on increased GC risk tended to be enhanced by H. pylori infection, smoking and drinking, but their interaction effects on GC risk did not reach statistical significance. Conclusions: ERCC6 rs1917799 GG genotype might be associated with increased GC risk in Chinese, especially in males.

성덕대왕 신종의 음향적 특성을 고려한 종각복원의 고찰 (Restoration of the bell pavilion of King Song-Dok Bell with a view of its acoustical characteristics)

  • 한찬훈
    • 한국음향학회지
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    • 제37권5호
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    • pp.378-386
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    • 2018
  • 본 연구는 우리나라의 귀중한 문회유산인 성덕대왕 신종의 종각 복원을 위하여 신종에 대한 역사적 고찰과 문헌을 통한 자료조사와 더불어 음향적 특성에 대한 연구결과를 정리하였다. 전통적인 한국종과 신종의 음향적 특성을 고려할 때 성덕대왕 신종을 위한 종각의 모형은 다음과 같이 제안한다. 첫째, 종각은 종의 아래 움통구조를 가지고 있으며 둘째, 종의 고유진동수가 64 Hz대와 168 Hz에 분포되어 있음으로 인하여 저주파수대역의 흡음이 많은 판재보다는 기둥과 보와 같은 각재 및 선재로 종각의 구조가 이루어 졌을 것으로 판단된다. 셋째, 동시대의 종각구조를 감안할 때, 직달일광과 해풍의 영향을 줄이기 위하여 상방과 중방사이의 공간을 판재로 마감하는 형태도 제안되었으며 넷째, 종의 무게와 크기를 고려하여 전통적으로 종각에 일반적으로 많이 쓰이는 3칸이나 5칸의 홀수칸으로 된 정사각형 형태를 제안하였다. 마지막으로 다섯째, 지붕은 팔작지붕의 형태가 가장 원형에 근접하리라 판단된다.

RAPD 분석법에 의한 한국형 대장균파아지와 미국형 대장균파아지의 분자적 계통분류 (Molecular Phylogeny of Korean-type Coliphages and American-type Coliphages Determined by a RAPD Analysis)

  • 권오식
    • 대한의생명과학회지
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    • 제6권2호
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    • pp.131-139
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    • 2000
  • 분리한 한국형 대장균파아지군($\phi$C1, $\phi$C2, $\phi$C3 및 $\phi$C4)과 잘 알려진 미국형 대장균파아지군($\phi$T2, $\phi$T4, $\phi$T5, $\phi$T7 및 ${\phi}{\lambda}$)의 유전적 유연관계를 조사하기 위하여 분자적 계통분류를 위한 방법인 RAPD-PCR을 실시하고 컴퓨터분석을 하였다. 그 결과, 9개의 대장균파아지들은 5개의 그룹으로 나위어지면서 한국형 대장균파아지들만이 그들간의 유전적 유사도가 매우 높으면서 하나의 클러스터를 형성하였다. 반면 이국형 대장균파아지들은 오직 하나의 서브클러스터를 가지며 나누어졌다. 즉, 미국형 대장균파아지 중 $\phi$T2와 $\phi$T4($T_{even}$ 파아지)만이 하나의 서브클러스터를 형성하면서 $\phi$T5, $\phi$T7 및 ${\phi}{\lambda}$들과 뚜렷히 구분되고 있었다. 그리고 한국형 대장균파아지들은 미국형 대장균차이지 중 오직 ${\phi}{\lambda}$와 유전적 유연관계를 갖고 있음을 확인하였다. 한편 한국형 대장균파아지의 게놈의 크기는 25,000 bp~35,000 bp 정도 였으며, 이 중 $\phi$C2가 그 크기가 가장 작고 $\phi$C1이 가장 컸다. 그리고 $\phi$C3과 $\phi$C4의 게놈은 중간 크기로 비슷하였다.

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써픽스 배열 합병을 이용한 일반화된 써픽스 배열의 효율적인 구축 알고리즘 (Efficient Construction of Generalized Suffix Arrays by Merging Suffix Arrays)

  • 전정은;박희진;김동규
    • 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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    • 제32권6호
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    • pp.268-278
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    • 2005
  • 본 논문에서는 A와 B의 써픽스 배열이 주어졌을 때 두 배열을 합병하여 이들의 일반화된 써픽스 배열을 구축하는 방법을 연구하였다. 흘수 써픽스와 짝수 써픽스같이 특별한 경우의 두 써픽스를 합병하는 알고리즘은 이미 발표되었지만, A와 』가 임의의 문자열인 일반적인 경우 두 써픽스 배열을 합병하는 효율적인 알고리즘은 아직 개발되지 않았다. 따라서 현재까지는 A와 B의 써픽스 배열을 합병하기 위해서 A와 B의 써픽스 배열이 이미 주어져 있음에도 불구하고 A$\#$B$\$$라는 문자열에 대한 써픽스 배열을 다시 구축해야했다. 본 논문에서는 상수 문자집합이나 정수 문자집합에서 정의된 임의의 두 문자열 A와 B에 대한 써픽스 배열을 합병하는 효율적인 알고리즘을 제시한다. 실험결과 상수문자집합의 경우 A$\#$B$\$$에대한 써픽스 배열을 다시 구축하는 것보다 합병하는 것이 5배 정도 빨랐다. 여기서 제시한 알고리즘은 써픽스 배열 A에서 스트링 B의 모든 써픽스를 검색하여야 한다. 이를 위해 써픽스 배열에서 정의한 써픽스 링크를 사용하였고, 또 써픽스 링크를 계산하는 효율적인 알고리즘도 개발하였다. 써픽스 링크는 생물정보학에서 사용되는 매칭 통계나 최장 공통 부분 문자열 검색처럼 다른 스트링의 써픽스 배열에서 주어진 스트링의 모든 써픽스를 찾는 데 이용할 수 있으므로, 이를 계산하는 효율적인 방법을 제시한 것 역시 많은 의미를 가진다. 실험을 통해 여기서 제시한 방법이 기존 알고리즘 중 가장 빠른 방법보다 3$\~$4배 정도 빠르다는 것을 보였다.

2-아닐리노 피리딘을 배위자로 하는 이핵 로듐착물의 두 산소첨가 생성물에 대한 합성 및 전기화학적 성질 (Synthesis, ESR and Electrochemical Characterization of Dioxygen Binding to Dirhodium Complexes with 2-anilinopyridinato Bridging Ligand)

  • 박광하;전무진
    • 대한화학회지
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    • 제33권6호
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    • pp.633-643
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    • 1989
  • 두 개의 아닐린계 질소와 두 개의 피리딘계 질소가 각각의 로듐이온에 트란스형으로 결합된 $Rh_2(ap)_4$(2,2-trans) 이성질체는 -0.40 V vs SCE에서 디 옥시젼의 한 전자를 환원시킬 수 있음을 보여주고 있다. 123K에서의 ESR 스펙트럼에 의하면 한 로듐이온에 산소 1분자가 측쇄 결합하여 $[Rh_2(ap)_4(O_2)]^-$이온을 형성하고, 착물은 $Rh_2^{III}$ 산화수를 가짐을 알 수 있다. 이 착물은 시안화메틸/염화메틸렌 혼합용액에서 Rh-$O_2^-$결합의 분열없이 [$Rh_2(ap)_4(O_2)(CH_3CN)]^-$을 형성한다. -0.25, 0.55V에서 산화되었을 때 [$Rh_2(ap)_4(O_2)]^-$$Rh_2(ap)_4(O_2)$와 [$Rh_2(ap)_4(O_2)]^+$을 형성하기 위하여 두 단계의 한 전자 산화과정이 일어난다. 두 화학종은 모두 초산소가 측쇄 결합되어 있지만, 전자는 $Rh^{II}Rh^{III}$, 후자는 $Rh_2^{III}$의 산화수를 갖는다. 반면에, ESR 스펙트럼과 $CH_3CN$ 부가 연구에서 보면 후자 착물이 로듐이온에 위치한 부대전자와 함께 [$Rh^{II}Rh^{III}(ap)_4(O_2)]^+$로 기술되고 그 착물은 측쇄 배위결합된 산소분자를 가지고 있음을 보여주고 있다. 또한 전기화학적, ESR 연구는 디 옥시젼의 활동도가 전기화학적 산화환원전위와 관계 있음을 보여주고 있다.

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한국인의 허혈성 뇌경색 발생과 플라스미노겐 활성 억제인자-1(PAI-1) 유전자 다형성과의 관계 (The Association of the -675 4G/5G and A-844G Polymorphisms of the Plasminogen Activator Inhibitor-1 Gene with a Risk of Ischemic Stroke in Korean Population)

  • 이병철;변상혁;김순일;강기훈;안세영;두호경;서정철;임강현;조성호;;안영민
    • 대한한방내과학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.18-24
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    • 2004
  • 연구배경 : 플라스미노겐 활성 억제인자-1 (plasminogen activator inhibitor-1; PAI-1)은 허혈성 뇌경색의 발생의 원인이 되는 섬유소 용해작용의 저하를 매개하는 인자로서, PAI-1의 작용이 촉진되면 섬유소 용해기능이 저하되어 관상동맥 및 뇌혈관질환의 발생을 증가시키게 된다. PAI-1 유전자의 촉진자(promoter) 영역에는 -675 4G/5G (4G/5G)와A -844G (A/G)의 두 개의 유전자 다형성이 존재하며, 이는 PAI-1의 유전자 전사과정에 영향을 미쳐 혈청 PAI-1의 농도를 증가시키고 결과적으로 허혈성 뇌경색의 발생확률을 높이는 작용을 하게 된다. 연구방법 : 허혈성 뇌경색으로 진단 받은 167명의 환자와 173명의 건강인의 말초혈액에서 DNA를 분리한 후 PAI-1의 4G/5G와 A/G 유전자 다형성에 대한 연쇄중합반응 및 제한효소 절편길이 다형성 (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism; PCR-RFLP) 방법을 이용하여 허혈성 뇌경색 발생과 유전자 다형성과의 관계를 비교 분석하였다. 결과 : 허혈성 뇌경색 환자에서의 4G/4G의 유전자형의 빈도는 15.0%으로 정상 대조군의 33.5%에 비해 현저하게 낮게 나타났다 (P < 0.0001). 각각의 유전자형과 허혈성 뇌경색의 발생 위험도 (odd ratio ; OR)와의 관계를 분석했을 때 4G/4G 유전자형을 가질 경우 위험도는 0.35배로 현저하게 낮아졌으며, (P < 0.0001), 5G/5G 유전자형을 가질 경우 위험도는 4.49배 로 현저하게 높아졌다 (P < 0.0001). 그러나, A/G 유전자 다형성과 허혈성 뇌경색의 발생과는 유의한 연관성을 발견하지 못하였다. 결론 : 이상의 결과로 볼 때 PAI-1 유전자의 4G/4G 유전자형은 허혈성 뇌경색의 발생 비율을 감소시키는 작용을 하는 것으로 여겨진다.

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펜타-O-4-{4'-(시아노페닐아조)펜옥시}알킬-D-글루코피라노오스들의 열방성 액정 거동 (Thermotropic Liquid Crystalline Behavior of Penta-O-4-{4'-(cyanophenylazo)phenoxy}alkyl-D-glucopyranoses)

  • 정승용;김인수;마영대
    • 공업화학
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    • 제20권6호
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    • pp.603-611
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    • 2009
  • 펜타-O-4-{4'-(시아노페닐아조)펜옥시}알킬-D-글루코피라노스 동족체들(CAGETn, n = 2~10, 유연격자 중의 메틸렌 단위들의 수)의 열방성 액정 특성을 검토하였다. n = 2, 7인 CAGETn은 쌍방성 네마틱 상들을 형성하는 반면 나머지 유도체들은 단방성 네마틱 상들를 형성하였다. 이것이 글루코오스 유도체가 네마틱 상들을 형성한다고 하는 최초의 보고이다. CAGETns의 액체 상에서 네마틱 상으로의 전이온도들($T_{iNS}$) 그리고 $T_{iN}$에서의 엔트로피 변화는 n의 함수로서 홀수-짝수 효과를 나타냈다. 이러한 거동은 유연격자의 홀수-짝수의 변화에 기인한 곁사슬들의 평균적인 형태변화의 견지에서 합리적으로 설명된다. CAGETns에서 관찰되는 네마틱 상에서 결정 상으로의 전이온도들($T_{NkS}$) 그리고 $T_{Nk}$에서의 엔트로피 변화도 동일한 관점에서 설명된다. $T_{iN}$ 혹은 $T_{Nk}$에서의 엔트로피 변화는 n = 4에서 재차 증가하기 전에 n = 3에서 최소를 나타냈다. 이러한 사실은 곁사슬 그룹들의 배열의 차이에 의해 초래되는 것으로 생각된다. CAGETns의 액정 상의 특성은 글루코오스에 알킬 그룹을 에테르 결합으로 부분적으로 혹은 완전치환시켜 얻은 유도체들에 대해 보고된 결과와 전혀 달랐다. 본 연구결과는 치환기들의 치환도와 화학구조가 액정들의 구조형성에 있어서 중요한 역할을 함을 시사한다.