• 제목/요약/키워드: Nuclear DNA

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R3V6 Amphiphilic Peptide with High Mobility Group Box 1A Domain as an Efficient Carrier for Gene Delivery

  • Ryu, Jaehwan;Jeon, Pureum;Lee, Minhyung
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권12호
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    • pp.3665-3670
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    • 2013
  • The R3V6 peptide includes a hydrophilic arginine stretch and a hydrophobic valine stretch. In previous studies, the R3V6 peptide was evaluated as a gene carrier and was found to have low cytotoxicity. However, the transfection efficiency of R3V6 was lower than that of poly-L-lysine (PLL) in N2A neuroblastoma cells. In this study, the transfection efficiency of R3V6 was improved in combination with high mobility group box 1A domain (HMGA). HMGA is originated from the nuclear protein and has many positively-charged amino acids. Therefore, HMGA binds to DNA via charge interaction. In addition, HMGA has a nuclear localization signal peptide and may increase the delivery efficiency of DNA into the nucleus. The ternary complex with HMGA, R3V6, and DNA was prepared and evaluated as a gene carrier. First, the HMGA/DNA complex was prepared with a negative surface charge. Then, R3V6 was added to the complex to coat the negative charges of the HMGA/DNA complex, forming the ternary complex of HMGA, R3V6, and DNA. A physical characterization study showed that the ternary complex was more stable than the PLL/DNA complex. The HMGA/R3V6/DNA complex had a higher transfection efficiency than the PLL/DNA, HMGA/DNA, or R3V6/DNA complexes in N2A cells. Furthermore, the HMGA/R3V6/DNA complex was not toxic to cells. Therefore, the HMGA/R3V6/DNA complex may be a useful gene delivery carrier.

인체세포주 A431에서 방사선 조사 후 DNA수선 유전자 발현과 세포고사와의 관계에 관한 연구 (Relationship between Radiation Induced Activation of DNA Repair Genes and Radiation Induced Apoptosis in Human Cell Line A431)

  • 범희승;민정준;최근희;김경근
    • 대한핵의학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.144-153
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    • 2000
  • 목적: 피부세포인 A431세포주에서 방사선 조사에 의한 세포고사가 방사선량과 방사선 조사 후 경과시간에 따라서 어떻게 변하는지를 밝혀보고, 방사선에 의해 유도된 수선유전자의 발현을 방사선량별, 조사 후 경과시간별로 분석하여 세포고사와 어떤 관계가 있는지 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 한국 세포주은행으로부터 분양받은 피부상피암 세포의 일종인 A431을 Cs-137 세포조사기를 이용하여 5 Gy, 25 Gy씩 조사하고 4, 12, 48시간이 지난 다음 세포를 모아 유세포계측법을 이용하여 고사세포를 계수하였다. 또한 이 세포들을 Northern blot analysis, Western blot analysis를 시행하여 방사선량별, 경과시간별로 유전자의 변화를 분석하였다. 각 실험군간의 통계적 유의성은 SPSS 통계프로그램을 사용하여 MANOVA test에 의해 검정하였으며, p값 0.05 미만을 유의한 수준으로 판정하였다. 결과: 유세포 계측기로 측정한 고사세포의 비율은 방사선 조사 후 12시간째에 가장 유의하게 증가하였다 (p<0.01). DNA수선유전자의 발현은 5 Gy 조사 후 p53, p21, hRAD 유전자가 12시간째에 증가하였고, 25 Gy 조사 후에는 hRAD50과 p21이 12시간에 증가하였으며, p53과 GADD45는 12시간까지 별 변화가 없었으나 이후 증가하여 48시간에 가장 높은 발현을 보였다. 결론: 피부상피암세포에서 방사선에 의해 유도되는 세포고사는 방사선 조사 후 12시간에 가장 현저해지는 것을 알 수 있었으며, 이 세포고사에 DNA수선 유전자가 밀접한 관련이 있을 것으로 보이는데, 특히 최근에 발견된 hRAD50 유전자도 세포고사와 밀접한 관련이 있을 것으로 사료되었다.

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생쥐의 수정란 배아줄기세포와 체세포핵이식 배아줄기세포에서 각인유전자, H19, Igf2r, Snrpn의 메틸화 경향 (Methylation Patterns of Imprinting Genes, H19, Igf2r, and Snrpn, in Mouse Embryonic Stem Cells and Nuclear Transferred Embryonic Stem Cells)

  • 이민호;주진영;조율희;심성한
    • 한국발생생물학회지:발생과생식
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    • 제14권4호
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    • pp.253-259
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    • 2010
  • DNA 메틸화 (DNA methylation)는 유전자의 발현을 조절하는 대표적인 후생학적 조절기작 (epigenetic regulation) 중에 하나이다. DNA 메틸화 양상은 생식세포 형성과정 및 배 발생단계에서 탈메틸화 (demethylation)와 de novo 메틸화의 드라마틱한 변화가 일어난다. 또한 이러한 DNA 메틸화는 배아줄기세포 (embryonic stem cells, ESCs)에서 특징적인 양상을 보이는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 생쥐 수정란 유래 배아줄기세포와 체세포핵이식 배아줄기세포 (nuclear transplanted ESCs)를 이용해서 대표적 각인유전자 (imprinting genes)로 알려진 Snrpn, Igf2r, H19 유전자들에 대한 메틸화 양상을 알아보고자 하였다. 연구 결과 H19 유전자에 대해서는 DNA 메틸화 양상은 수정란 유래 배아줄기세포와 체세포핵이식 배아줄기세포에서 비슷한 경향을 보였으나, Snrpn과 Igf2r의 경우에는 체세포핵이식 배아줄기세포에서 과메틸화 (hypermethylation) 경향을 보였다.

추출 방법에 따른 대두 배인자 3 역가 (Effect of the Extraction Method on the Soybean Embryo Factor 3 Activity)

  • 이경훈;정동효;김성산;송윤호;김우연
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제38권1호
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    • pp.63-66
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    • 1995
  • 본 실험에서는 대두 ${\beta}-conglycinin$${\alpha}'$ subunit 유전자의 발현에 관여하리라 추정되는 대두 배인자 3(SEF3) 역가를 가지는 대두 핵 추출물 조제 방법에 대하여 조사하였다. 역가 조사를 위한 DNA의 표지 반응 후에 추가로 1 mM dATP를 첨가하여 반응을 지속한 경우가 첨가하지 않은 경우보다 약 4배 높은 방사능 역가의 DNA 탐침을 얻을 수 있었다. 이러한 DNA 탐침을 이용하여 핵 추출물 조제 방법에 따른 대두 배인자 3의 역가를 gel mobility shift assay로 조사한 결과, 조제 중 glycerol 첨가가 배인자 3을 안정화시켰고, polyethylenimine을 이용한 대두 핵 추출물 조제법이 배인자 3의 비역가를 증가시키는 데 이용될 수 있음을 알 수 있었다.

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Ectopic Expression of Mitochondria Endonuclease Pnu1p from Schizosaccharomyces pombe Induces Cell Death of the Yeast

  • Oda, Kaoru;Kawasaki, Nami;Fukuyama, Masashi;Ikeda, Shogo
    • BMB Reports
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    • 제40권6호
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    • pp.1095-1099
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    • 2007
  • Endonuclease G (EndoG) is a mitochondrial non-specific nuclease that is highly conserved among the eukaryotes. Although the precise role of EndoG in mitochondria is not yet known, the enzyme is released from the mitochondria and digests nuclear DNA during apoptosis in mammalian cells. Schizosaccharomyces pombe has an EndoG homolog Pnu1p (previously named SpNuc1) that is produced as a precursor protein with a mitochondrial targeting sequence. During the sorting into mitochondria the signal sequence is cleaved to yield the functionally active endonuclease. From the analogy to EndoG, active extramitochondrial Pnu1p may trigger cell killing by degrading nuclear DNA. Here, we tested this possibility by expressing a truncated Pnu1p lacking the signal sequence in the extramitochondrial region of pnu1-deleted cells. The truncated Pnu1p was localized in the cytosol and nuclei of yeast cells. And ectopic expression of active Pnu1p led to cell death with fragmentation of nuclear DNA. This suggests that the Pnu1p is possibly involved in a certain type of yeast cell death via DNA fragmentation. Although expression of human Bak in S. pombe was lethal, Pnu1p nuclease is not necessary for hBak-induced cell death.

Re-description of Chrysaora pacifica (Goette, 1886) (Cnidaria, Scyphozoa) from Korean Coastal Waters: Morphology and Molecular Comparisons

  • Lee, Hye Eun;Yoon, Won Duk;Chae, Jinho;Ki, Jang-Seu
    • Ocean and Polar Research
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    • 제38권4호
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    • pp.295-301
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    • 2016
  • The nomenclature of the sea nettle jellyfish from Korea was initially described as Dactylometra quinquecirrha Agassiz, 1862. However its identity has been questioned on the basis of its local distribution and molecular data. Here, we examined morphology and DNA sequences of nuclear rDNA using specimens collected from southern Korean waters in August 2014. Based on morphological characteristics (bell size, umbrella pattern, number of tentacles and lappets) and distribution locality, we reassign the Korean D. quinquecirrha to Chrysaora pacifica (Goette, 1886), and provide a re-description accordingly. The molecular identity of C. pacifica was further confirmed by comparison of nuclear ribosomal DNA sequences.

Mitochondria Control Protein as a Novel Therapeutic Target for Metabolic Syndrome

  • KimPak, Young-Mi
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 2008년도 Proceedings of the Convention
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    • pp.23-30
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    • 2008
  • Mitochondria biogenesis requires a coordination of two genomes, nuclear DNA (nDNA) and mitochondrial DNA (mtDNA). Disruption of mitochondria function leads to a loss of mitochondrial membrane potential and ATP generating capacity and consequently results in chronic degenerative diseases including insulin resistance, metabolic syndrome and neurodegenerative diseases. Although PPAR-${\gamma}$ coactivator-$1{\alpha}$ (PGC-$1{\alpha}$) was discovered as a central regulator of mitochondria biogenesis and a transcriptional co-activator of nuclear respiratory factor (NRF) and mitochondrial transcription factor A (Tfam), the expressions of PGC-$1{\alpha}$, NRF and Tfam were not significantly altered in tissues showing abnormal mitochondria functions. This observation suggests that there should be another regulator(s) for mitochondria function. Here, we demonstrate microRNAs (miRNAs) can modulate mitochondria function. Overexpression of microRNA dissipated mitochondrial membrane potential and increased ROS production in vitro and in vivo. It will be discussed the target of microRNA and its role in metabolic syndrome.

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한국 해산 패류 15종의 DNA 함량 (Nuclear DNA content determinations in 15 seawater shellfish species in Korea)

  • 박인석;최희정
    • 환경생물
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    • 제38권3호
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    • pp.343-349
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    • 2020
  • 본 연구에서는 한국 연안에 서식하는 대표적인 15종 패류의 핵DNA 함량을 조사하였다. 복족류에서 DNA 함량(pg DNA nucleus-1 )은 3.3±0.08 (Haliotis discus hannai)과 2.4±0.18 (Batillus cornutus)이었다. 이매패류에서 DNA 함량(pg DNA nucleus-1)은 2.0±0.15 (Scapharca broughtonii), 3.0±0.12 (Mytilus galloprovincialis), 2.9±0.05 (Meretrix lusoria), 2.2±0.03 (M. lamarkii), 2.6±0.05 (Fulvia mutica), 1.8±0.18 (Tegillarca granosa), 3.3±0.01 (Solen corneus), 2.2±0.04 (Barnea manilensis), 2.5±0.32 (Crassostrea gigas), 3.9±0.24 (Atrina pectinate), 3.5±0.15 (Patinopecten yessoensis), 1.9±0.16 (Amygdala philippinarum) 및 2.3±0.14 (Pseudocardium sachalinensis)이었다. 본 연구 결과는 본 연구에 사용된 패류의 genomic 진화과정을 더욱 잘 이해하는 새로운 정보를 제공한다.