Cupredoxin-like proteins are mainly copper-binding proteins that conserve a typical rigid Greek-key arrangement consisting of an eight-stranded β-sandwich, even though they share as little as 10-15% sequence similarity. The electron transport function of the Cupredoxins is critical for respiration and photosynthesis, and the proteins have therapeutic potential. Despite their crucial biological functions, the identification of the distant Cupredoxin homologs has been a difficult task due to their low sequence identity. In this study, the overlapped conserved residue (OCR) fingerprint for the Cupredoxin superfamily, which consists of conserved residues in three aspects (i.e., the sequence, structure, and intramolecular interaction), was used to detect the novel Cupredoxin homologs in the NCBI non-redundant protein sequence database. The OCR fingerprint could identify 54 potential Cupredoxin sequences, which were validated by scanning them against the conserved Cupredoxin motif near the Cu-binding site. This study also attempted to model the 3D structures and to predict the functions of the identified potential Cupredoxins. This study suggests that the OCR-based approach can be used efficiently to detect novel homologous proteins with low sequence identity, such as Cupredoxins.
Cell proliferation is a delicately regulated process that couples growth signals and metabolic demands to produce daughter cells. Interestingly, the proliferation of tumor cells immensely depends on glycolysis, the Warburg effect, to ensure a sufficient amount of metabolic flux and bioenergetics for macromolecule synthesis and cell division. This unique metabolic derangement would provide an opportunity for developing cancer therapeutic strategy, particularly when other diverse anti-cancer treatments have been proved ineffective in achieving durable response, largely due to the emergence of resistance. Recent advances in deeper understanding of cancer metabolism usher in new horizons of the next generation strategy for cancer therapy. Here, we discuss the focused review of cancer energy metabolism, and the therapeutic exploitation of glycolysis and OXPHOS as a novel anti-cancer strategy, with particular emphasis on the promise of this approach, among other cancer metabolism targeted therapies that reveal unexpected complexity and context-dependent metabolic adaptability, complicating the development of effective strategies.
Park, Yeong-Seop;Park, Jae-Yeong;Jeong, Dong-Geon;Choe, Cha-Yong;Ju, Hyeon
한국생물공학회:학술대회논문집
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2002.04a
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pp.543-547
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2002
DNA vaccines use eukaryote expression vectors to produce immunizing proteins in the vaccinated host and it represents a novel approach to vaccine and immuno-therapeutic development. We constructed a 2.9 kb compact plasmid vector (pVAC) which contains CMV promoter, polycloning site, BGH poly A terminator, ampicillin resistance gene and PBR322 origin. Enriched unmathlyated CpG motifs have introduced into pVAC-ISS1 and pVAC-ISS2 which are derived from pVAC for enhancing Thl responses. These plasmid DNAs rapidly induced interleukin 6 secretion in vivo. It is expected that these vectors will contribute to the DNA inoculation against infectious disease and various cancers without adjuvant.
Obesity is a chronic disorder that is a significant risk factor for diabetes, cardiovascular diseases, malignancy, and other chronic diseases. Lifestyle modifications form the basis of most treatments for obesity, but it has become clear that such modifications alone are not enough for many obese patients. When a behavioral approach is insufficient, pharmacological treatment may be recommended. In recent years, the US Food and Drug Administration (FDA) has withdrawn several therapeutic options for obesity due to their side effects, but has approved four novel anti-obesity agents. Until recently, orlistat was the only drug approved for the management of long-term obesity, but the US FDA approved the novel anti-obesity drugs lorcaserin and phentermine/topiramate in 2012, and naltrexone/bupropion and liraglutide in 2014. The present review discusses the different pharmacotherapeutic options for the treatment of obesity.
Therapeutic use of anti-inflammatory steroids is limited due primarily to their systemic suppressive effects on pituitary function and the immune system.. To overcome the clinical limitation, a new approach toward the discovery of non-systemic anti-inflammatory steroids is based upon the antedrug concept introduced by this laboratory. The new concept describes locally active agents which are designed to undergo a predictable biotransformation to inactive metabolites upon entry into systemic circulation from the applied site. Thus, true antedrugs are devoid of systemic adverse effects. In a continuing effort, 16$\alpha$-carboxylate and isoxazoline derivatives of prednisolone have been synthesized and screened. In the croton oil-induced ear edema bioassay, the following relative potencies were obtained setting hydrocortisone=1.0; 3a, 1.5; 3b, 3.1; 4a, 4.0; 4b, 12.2; 5b, 8.2; 6b, 11.2; 7a, 1.9; 7b, 4.1; 8a, 3.3; 8b 6.8; 9a, 0.7; 9b 8.6; 10a 2.6; 10b, 7.4. Results of the five-day bioassay indicated that, in contrast to the parent compound, the novel steroidal antedrugs did not significantly alter body weight gain, thymus weights, adrenal weights or plasma corticosterone levels. Taken together, the antedrug concept appears to be a fundamentally sound strategy for the separation of local anti-inflammatory activity form systemic adverse effects.
Human chorionic gonadotropin(hCG) and intravenous immunoglobulin(IVIG) treatment were attempted as a novel therapeutic approach for unexplained recurrent spontaneous abortion(RSA). Forty-four and 3 women with a history of RSA were treated with hCG and IVIG, respectively, during pregnancy. Of these patients, serum blocking factor assay was performed before and after each treatment, in 15 patients; 12 cases with hCG and 3 cases with IVIG. The results were as follows: 1. Of 44 women who receive hCG during pregnancy, 24 delivered healthy infants at term, 10 patients suffered repeat abortion, and 10 women are still pregnant under 28 weeks. Over all success rate of hCG treatment was 70.6% (24/34). Although there is no statistical significance, absolute serm blocking level was decreased after treatment(N=12). 2. Of 3 women who receive IVIG during pregnancy, all 3 women are still pregnant under 28 weeks. Serum blocking level was increased after treatment, however, this increment was not statistically significant. Although no conclusion could be extracted from the patients who received IVIG, the therapeutic effect of hCG is comparable to that of the other therapeutic regimens, such as allogeneic leukocytes. It was postulated that actual etiology of unknown RSA would be classified as hormonal origin although combined etiologies are common in Korean women.
Gastric cancer (GC) is one of the deadliest malignancies in the world. Currently, clinical treatment decisions are mostly made based on the extent of the tumor and its anatomy, such as tumor-node-metastasis staging. Recent advances in genome-wide molecular technology have enabled delineation of the molecular characteristics of GC. Based on this, efforts have been made to classify GC into molecular subtypes with distinct prognosis and therapeutic response. Simplified algorithms based on protein and RNA expressions have been proposed to reproduce the GC classification in the clinical field. Furthermore, a recent study established a single patient classifier (SPC) predicting the prognosis and chemotherapy response of resectable GC patients based on a 4-gene real-time polymerase chain reaction assay. GC patient stratification according to SPC will enable personalized therapeutic strategies in adjuvant settings. At the same time, patient-derived xenografts and patient-derived organoids are now emerging as novel preclinical models for the treatment of GC. These models recapitulate the complex features of the primary tumor, which is expected to facilitate both drug development and clinical therapeutic decision making. An integrated approach applying molecular patient stratification and patient-derived models in the clinical realm is considered a turning point in precision medicine in GC.
Stem cells can be applied usefully in basic research and clinical field due to their differentiation and self-renewal capacity. The aim of this study was to establish an effective novel therapeutic cellular source and create its molecular expression profile map to elucidate the possible therapeutic mechanism and signaling pathway. We successfully obtained a mesenchymal stem cell population from human embryonic stem cells (hESCs) cultured on chemically defined feeder-free conditions and treated with connective tissue growth factor (CTGF) and performed the expressive proteomic approach to elucidate the molecular basis. We further selected 12 differentially expressed proteins in CTGF-induced hESC-derived mesenchymal stem cells (C-hESC-MSCs), which were found to be involved in the metabolic process, immune response, cell signaling, and cell proliferation, as compared to bone marrow derived-MSCs(BM-MSCs). Moreover, these up-regulated proteins were potentially related to the Wnt/β-catenin pathway. These results suggest that C-hESC-MSCs are a highly proliferative cell population, which can interact with the Wnt/β-catenin signaling pathway; thus, due to the upregulated cell survival ability or downregulated apoptosis effects of C-hESC-MSCs, these can be used as an unlimited cellular source in the cell therapy field for a higher therapeutic potential. Overall, the study provided valuable insights into the molecular functioning of hESC derivatives as a valuable cellular source.
Hyperlipidemia, which is closely associated with a fatty diet and aging, is commonly observed in the western and aged society. Therefore, a novel therapeutic approach for this disease is critical, and an immunological view has been suggested as a novel strategy, because hyperlipidemia is closely associated with inflammation and immune dysfunction. In this study, the effects of an aqueous extract of Rubus occidentalis (RO) in obese mice were investigated using immunological indexes. The mice were fed a high-fat diet (HFD) to induce hyperlipidemia, which was confirmed by biochemical analysis and examination of the mouse physiology. Two different doses of RO and rosuvastatin, a cholesterol synthesis inhibitor used as a control, were orally administered. Disturbances in immune cellularity as well as lymphocyte proliferation and cytokine production were significantly normalized by oral administration of RO, which also decreased the elevated serum tumor necrosis factor $(TNF)-{\alpha}$ level and total cholesterol. The specific immune-related actions of RO comprised considerable improvement in cytotoxic T cell killing functions and regulation of antibody production to within the normal range. The immunological evidence confirms the significant cholesterol-lowering effect of RO, suggesting its potential as a novel therapeutic agent for hyperlipidemia and associated immune decline.
With advances in the understanding of the biology and genetics of colorectal cancer (CRC), diagnostic biomarkers that may predict the existence or future presence of cancer or a hereditary condition, and prognostic and treatment biomarkers that may direct the approach to therapy have been developed. Biomarkers can be ascertained and assayed from any tissue that may demonstrate the diagnostic or prognostic value, including from blood cells, epithelial cells via buccal swab, fresh or archival cancer tissue, as well as from cells shed into fecal material. For CRC, current examples of biomarkers for screening and surveillance include germline testing for suspected hereditary CRC syndromes, and stool DNA tests for screening average at-risk patients. Molecular biomarkers for CRC that may alter patient care and treatment include the presence or absence of microsatellite instability, the presence or absence of mutant KRAS, BRAF or PIK3CA, and the level of expression of 15-PGDH in the colorectal mucosa. Molecularly targeted therapies and some general therapeutic approaches rely on biomarker information. Additional novel biomarkers are on the horizon that will undoubtedly further the approach to precision or individualized medicine.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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