• 제목/요약/키워드: Northern blotting

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자궁경부암세포에서 방사선조사시 차등 발현되는 유전자 동정 (Identification of Differentially Expressed Radiation-induced Genes in Cervix Carcinoma Cells Using Suppression Subtractive Hybridization)

  • 김준상;이영숙;이증훈;이웅희;성은영;조문준
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제23권1호
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    • pp.43-50
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    • 2005
  • 목적 : 자경경부암세포에서 polymeric chain reaction (PCR)원리를 이용한 suppression subtractive hybridization (SSH) 방법으로 방사선조사 시 차등 발현되는 유전자를 동정하고자 하였다. 대상 및 방법 : 자궁경부암세포주인 HeLa세포주에 방사선조사 전과 후 총 RNA와 poly $(A)^+$ mRNA를 분리였다. SSH방법으로 forward 및 reverse-subtracted cDNA libraries를 만들었다. 차등 발현된 유전자를 screening하기 위해 reverse Northern blotting (dot blot analysis)을 이용하여 각각의 library에서 88개의 클론을 선택하였고 Nothern blotting으로 확인 후 sequencing하였다. 결과 : screening상 176개 클론 중 forward-subtracted library에서 10개의 유전자가 reverse-subtracted library에서 9개의 유전자가 동정되었다. forward-subtracted library로부터 3개의 유전자가 Northern blotting에 의하여 확인되었고 이중 telomerase catalytic subunit and sodium channel-like protein 유전자와 1개의 ESTs (expressed sequence tags) 유전자가 방사선선량에 따라 증가하쳐다. 결론 : 본 연구를 통해 자궁경부암세포주에서 방사선에 의해 유도되는 유전자를 SSH 방법을 통해 동정할 수 있었다. 그러나 이러한 유전자가 어떤 생물학적인 기능을 갖고 있는지에 대한 계속적인 연구가 필요하다

Methylotrophic Yeast, Pichia pastoris에서 사람 락토페린의 발현 및 항균성 연구 (Expression and Antibacterial Activity of Recombinant Human Lactoferrin in Methylotrophic Yeast, Pichia pastoris)

  • 이상오;임은미;남은주;이현환
    • 미생물학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.348-354
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    • 2004
  • 사람의 모유에 많이 함유된 human lactoferrin(hLF)은 항균 및 항 바이러스 작용이 있는 것으로 보고되고 있다. 본 연구에서는 hLf를 메탄올자화 효모인 Pichia pastoris에 cloning하고 그 발현을 RT-PCR, Northern blotting, SDS-PAGE및 Western blotting으로 확인하였다. 그 결과 2.1 kb의 hLf 유전자가 P.pastoris의 염색체 DNA로 끼어들어가 안정적으로 hLf를 발현하였다. 이 재조합 P.pastotis로부터 hLf를 포함하는 세포 추출액을 얻어 항균 작용을 연구하였다. 발현된 재조합 hLf는 Staphylococcus aureus, Micrococcus flavus 등의 그람 양성균에 대해 강력한 항균작용을 보일 뿐만 아니라 그람 음성 동물성 병원균인 Pseudomonas fluorescens ID 9631, E. coli ATCC8739, 25922,35 등과 Salmonella typhimurium 114,115 등 다양한 균에 대해서도 강력한 항균작용을 보였다. 이는 재조합 hLf가 생물학적 활성이 있다는 것을 보여준다.

Aspergillus nidulans내에서 Aspergillus awamori의 Glucoamylase 유전자 발현 (Expression of Aspergillus awamori Glucoamylase Gene in Asperillus nidulans)

  • 김석준;유준희;정구홍
    • 미생물학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.136-140
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    • 1993
  • A awamori 의 glucoamylase 유전자와 A. nidolans 의 trpC maker 유전자를 가진 A. nidulans 의 expression vector 를 만들었다. 이재조합 plasmid 를 트립토판 영양요구주의인 A. nidulans B17 에 형질전환시켰다. Southern blotting 으로 vector DNA 가 A. nidulans 의 chromosomal DNA 에 integration 된 것을 확인하였다. Northern blotting 의 결과, glucoamylase 유전자는 induction 조건에서 mRNA 를 합성하였다. glucoamylase 의 역가가 형질전환체에서 증가하였으며, nondenaturing polyacrylamide gel 에서 glucoamylase 의 활성이 나타났다.

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Gene Expression Analysis of Pregnant Specific Stage in the Miniature Pig Ovary

  • Yun, Seong-Jo;Noh, Won-Gun;Yoon, Jong-Taek;Min, Kwan-Sik
    • Reproductive and Developmental Biology
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    • 제33권4호
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    • pp.249-255
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    • 2009
  • The miniature pig is considered to be a better organ donor breed for xenotransplantation than other pig breeds because the size of the organs of the miniature pig is similar to that of humans. In this study, we aimed at identifying differentially expressed genes in the miniature pig ovary during pregnancy. For this, we used the miniature pig ovary model, annealing control primer-based reverse transcription polymerase chain reaction (PCR), quantitative real-time PCR (qRT-PCR), and northern blotting analysis. We identified 13 genes showing differential expression on the based of pregnancy status and validated 8 genes using qRT-PCR. We also sequenced the full-length cDNA of ephrin receptor A4 (EphA4), which had a significant difference in expression level, and validated it by northern blotting. These genes may provide a better understanding of the cellular and molecular mechanisms during pregnancy in miniature pig ovary.

흰쥐 간장에 있어서 아실-CoA 합성효소4의 기능연구 (Functional Studies of Acyl-CoA Synthetase 4 in the Rat Liver)

  • 정영희;문승주;강만종
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제36권4호
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    • pp.376-381
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    • 2003
  • 본 연구에서는 흰쥐 간장에 있어서 아실-CoA 합성효소 4의 세포내 소기관의 존재 여부를 확인함과 동시에 fasting, high fat diet, fat-free high sucrose diet, 퍼옥시솜 증식 인자인 DEHP [Di-(2-ethylhexyl)phthalate]를 급여한 흰쥐 간장에 있어서 ACS4의 발현에 대하여 조사하였다. ACS4는 ACSI과 마찬가지로 흰쥐 간장의 마이크로솜, 미토콘드리아와 퍼옥시솜에 존재하는 것으로 생각되며 미토콘드리아에서 가장 많은 단백질이 검출되었다. ACS4 mRNA는 절식하였을 때와 high fat diet, fat-free high sucrose diet을 급여하였을 때는 대조군에 비하여 2.3배 발현이 증가하였으며 DEHP을 급여하였을 때는 3.9배 mRNA의 증가를 나타내었다. 이러한 결과를 종합하여 보면 간장에 있어서 ACS4는 기본적인 $\beta$-산화뿐만 아니라 호르몬에 의한 조절과 간접적으로는 인슐린에 의한 조절도 받는 것으로 생각되며 다양한 기능을 수행하고 있음을 추측할 수 있다.

기계적 자극에 대한 백서 치주인대 섬유아세포의 변화 (Analysis of PDL Fibroblast Change During Mechanical Stimuli in the Rats)

  • 김태균;김창성;조규성;채중규;김종관;최성호
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제31권2호
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    • pp.277-285
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    • 2001
  • Periodontal disease is characterized by inflammation and subsequent loss and/or damage to tooth-supporting tissues such as bone, cementum,and periodontal ligament. Periodontal ligament and cementum are the key tissues in the initial process of regeneration following periodontal disease. Therefore, studies on cementoblasts, which form cementum are emphasized. It is still unclear which cells cementoblast differentiate from. This study was conducted under the hypothesis that PDL fibroblast can differentiate into either cementoblast or osteoblast depending on the conditions of surrounding tissue. Clinically, with excessive traction force of orthodontic appliances or excessive occlusion hypercementosis is observed, and this has been confirmed histologically. Consequently, activation of cementoblast can be expected in rats when mechanical stimuli are given to PDL fibroblast. Therefore, the purpose of this article is to prove that PDL fibroblast differentiates into cementoblast in rats under mechanical stimuli using histologic and molecular methods. In this study, twenty rats were given hard diet. Ten of them were sacrificed after 1 week, and the others were sacrificed after two weeks. Slides were made from tooth specimen, and they were studied under the microscope. In addition, PDL fibroblast and cementum from the extracted teeth were analyzed with Northern blotting. In histologic examination, as time passed, PDL fibroblast migrated to the dentin side, differentiated into cementoblast, and formed new cementum. In Northern blotting, it was found that mRNA expression of cementoblast-specific proteins such as BSP, OC, OPN, and type I collagen were more prominent in rats sacrificed after 2 weeks of hard-diet than rats sacrificed after 1 week. From these findings we can conclude that PDL fibroblast can differentiate into cementoblast under mechanical stimuli. We think that 'Rat Models' used in this study will be beneficial to future studies regarding cementoblast.

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EST Clustering 방법으로 동정한 새로운 유전자의 생쥐 난소 및 정소에서의 발현 (Identification of a Novel Gene by EST Clustering and its Expression in Mouse Ovary and Testis)

  • 황상준;박창은;황규찬;이경아
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제33권4호
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    • pp.253-263
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    • 2006
  • 목 적: 본 연구에서는 EST Clustering 방법을 이용하여 이전의 연구에서 발굴한 B357 EST의 염기서열을 포함하는 유전자를 동정하고, 이 유전자의 발현을 생쥐의 난소와 정소를 포함한 여러 가지 조직들에서 살펴보고자 하였다. 연구방법: EST Clustering으로 얻어진 전체 염기서열을 5-day-ovary-specific gene-1 (5DOS1)이라고 명명하여 GenBank에 등록하였으며 (AY751521), northern blotting, real-time RT-PCR, in situ hybridization, western blotting, immunohistochemistry 등의 방법을 이용하여 생쥐 난소와 고환의 발달단계에 따라 그 발현양상을 관찰하였다. 결 과: 5DOS1의 전사체는 성장한 정소, 뇌, 근육에서 높게 발현하였으며, 난소의 경우에서는 원시난포시기부터 모든 난자에서 발현하였으며 특히 생후 5일째 높게 발현하였고 그 이후로는 점차 감소하였다. 반면 정소의 경우는 발달과 함께 계속 증가하였으며, 정모세포를 제외한 모든 발달단계별 정자에서 발현함을 관찰하였다. 결 론: 본 연구결과는 5DOS1에 대한 발견과 동정에 대한 첫 보고로써, 유전자 및 단백질이 생쥐의 난소 및 정소의 생식세포에서 발현하는 것을 관찰하였다. 앞으로 생식세포 발생 및 분화에 관련된 5DOS1의 기능에 대한 심층 연구가 더 필요하다고 사료된다.

신장발육 및 재생에 따른 insulin-like growth factor(IGF)-I 및 IGF-binding protein의 변화 (Alteration of Insulin-like Growth Factor(IGF)-I and IGF-Binding Proteins in Renal Development and Regeneration)

  • 박성광;고규영;이대열
    • Childhood Kidney Diseases
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    • 제3권2호
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    • pp.109-116
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    • 1999
  • 목적 : Insuln-like growth factor(IGF)-I및 -II는 성장인자로 일군의 IGF-binding protein(IGFBP)에 의하여 그 작용이 조절된다. IGF-I은 백서 신장에서 발견되고 대사효과와 성장효과를 갖고 있다. 이번 연구는 백서에서 신장발육과 허혈성 신손상 후 재생과정 동안에 IGFBP의 발현이 변화하는지를 보고자 한다. 방법 : 태생 15주부터 성숙 할때까지 백서 신장에서 IGFBP 발현의 변화를 알아보기 위해 Northern blotting을 시행하였고, 급성신부전 백서의 신장에서 IGF-IGBP axis의 변화를 보기 위해 Northern blotting과 Immunohisto-chemistry를 이용하였다. 결과 : IGFBP-1과 -3는 태생기에는 거의 발현되지 않다가 출생 후 7일째부터 성숙이 끝날 때까지 점진적으로 증가하였다. 반면에 IGFBP-2와 -5는 태생기에 많이 발현되고, IGFBP-2는 출생 후 7일째까지 IGFBP-5는 30일째까지 높은 농도를 유지하다가 급격히 감소하였다. 한편 IGFBP-4는 태생기에 중등도로 발현되는데 출생 후 증가하기 시작하여 7일째 가장 많이 발현되다가 급격히 감소하였다. 신손상 후 IGFBP의 변화를 보면 IGFBP-1과 -4는 재생기간 동안 3-5배 증가되다가 정상으로 회복된 반면 IGFBP-3와 IGFBP Related Protein-1(IGFBPrP-1) 은 신손상 1일째에는 약간 감소하다가 그후 증가하여 정상보다 약간 높은 수준을 유지하였다. 결론 : 백서 신장에서 신장구조나 기능의 발달, 분화 및 재생에 대한 IGF의 작용을 조절할 수 있는 IGFBP 발현에 현저한 변화가 있었다.

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초파리에서 HSP23 유전자발현과 20-Hydroxyecdysone 합성의 발생학적 변화 (Developmental Changes of HSP23 Gene Expression and 20-Hydroxyecdysone Synthesis m Drosophila melanogaster)

  • 정기화;오현석;정연두;남궁용;김경진;이정주
    • 한국동물학회지
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    • 제36권3호
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    • pp.373-379
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    • 1993
  • 초파리에서 정상 발생동안 HSP23의 합성과 생리적 기능이 20-hydroxyecdysone과 어떤 연관을 가지는지를 조사하였다. HSP23 유전자의 발현을 Northern blotting과 Western blotting으로 조사하였고, 20HE의 분비 양상은 radioimmunoassay 법으로 조사하였다. HSP23은 3령기 초기부터 발현이 시작되어 pupariation 시기에 급격한 증가를 보인 후 감소하였다. HSP23과 20HE의 합성을 비교하였을 때, 3령기-초기 pupa 시기에 두 분자가 모두 합성의 최고치를 보이며 유사한 합성 양상을 보였지만 그 외 시기는 일치하지 않았다. 따라서 20HE는 larva에서 pupa로의 변태 시기에 HSP23 유전자의 발현을 조절하며, 또 HSP23을 이용하여 변태과정의 일부를 조절하는 것으로 보인다.

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