• 제목/요약/키워드: Non-Metric Multidimensional Scaling

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보성강 유역에 위치한 호수에서의 식물플랑크톤의 시공간적 군집 비교 분석 (Comparison of Spatio-temporal Variations of Phytoplankton Communities in Lakes in the Boseong River Basin)

  • 조현진;나정은;이학영
    • 생태와환경
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    • 제53권1호
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    • pp.11-21
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    • 2020
  • 본 연구는 보성강 유역에 위치한 호수들에서 식물플랑크톤 군집의 시공간적 차이를 비교하고 이러한 군집 구조의 차이에 영향을 미치는 요인들을 확인하고자 2014년 3월부터 2017년 11월까지 분기별 조사를 시행하였다. 조사 결과, 보성호는 다른 호수들에 비해 식물플랑크톤의 다양성이 풍부하고 밀도 역시 높은 수준으로 확인되어 시공간적으로 큰 차이를 보였다. 또한 3월 조사에서 확인된 식물플랑크톤 군집은 다른 조사시기와 우점종을 포함한 규조류와 녹조류의 군집에서 구분되는 특성을 나타냈다. Indicator species analysis를 통해 확인된 각 그룹 간 지표종을 확인한 결과, 계절에 따른 식물플랑크톤 천이와 영양 농도에 따른 다양성 및 밀도 변화를 반영한 것으로 산출되어 호수들의 식물플랑크톤 군집이 시공간적으로 구분되었음을 나타냈다. Non-metric multidimensional scaling을 통해 보성강 유역 내 호수들의 식물플랑크톤 군집 구조에 있어 Secchi depth, 수온, 전기전도도, DO 등이 중요한 요인임을 확인하였고, 영양염을 포함한 다양한 환경요인과 함께 식물플랑크톤 군집 차이에 영향을 끼친 것으로 분석되었다.

한국 남부 지역별 돼지 장내 미생물생태 비교분석 (Differences in swine gut microbiota in southern region of Republic of Korea)

  • 김정만;;;운노타쯔야
    • 미생물학회지
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    • 제51권1호
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    • pp.81-85
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    • 2015
  • 성장촉진제로 항생제 사용이 금지가 된 이후, 가축들의 사망률이 증가되어 항생제 대체제를 개발해야 하는 것이 시급하다. 그러한 대체제 개발에 새로운 접근 중 하나는 숙주의 신체적 기능에 영향을 준다고 알려진 장내미생물생태를 조절하는 것이다. 하지만 가축의 장내미생물에 대한 이해가 인간과 비교하여 볼 때 많이 부족한 실정이다. 본 연구에서는 돼지장내미생물생태가 지역적 차이가 있음에 대한 기본적인 정보를 제공한다. 돼지 분변샘플은 제주(n=40), 광주(n=28), 해남(n=30) 농가로부터 채취하였으며, MiSeq을 이용하여 16S rRNA V4 지역을 시퀀싱하였다. 또한 Mothur 파이프라인을 이용하여 MiSeq으로부터 얻은 데이터를 처리하였다. 총 5,642,125 reads를 얻었으며, 에러시퀀스들을 제거한 후 최종적으로 3,868,143 reads가 남았다. Phylum 수준의 taxonomic composition 분석에서는 제주 돼지들이 Firmicutes를 가장 많이 포함하고 있었으며, Operational Taxonomic Units 분포분석에서 또한 지역적 차이에 따라 돼지장내미생물생태가 다르다는 것을 확인하였다. Non-metric multidimensional scaling과 Phyla의 풍부함 사이의 상관관계분석에서는 Actinobacter, Verrucomicrobia, Firmicutes, Fibrobacteres이 세 개의 지역에 있는 돼지들의 장내미생물생태 차이를 나타나게 하는 장내 미생물 요소라는 것을 확인하였다. 그러한 가축의 장내미생물생태는 농장에서 사용하는 사료와 사양관리에 의해 많은 영향을 미치는 것으로 생각된다. 본 연구결과는 돼지장내미생물생태가 지역적으로 많은 차이가 있다는 것을 나타내며, 추후에 가축의 장내미생물생태에 관한 연구는 지역적 차이가 있다는 것을 고려하여 설계해야 될 것이다.

비메트릭 다변량 척도법과 네트워크 분석을 통한 멸종위기 국내 담수어류 20종의 먹이원 분석 (Analysis of Food Resources of 20 Endangered Fishes in Freshwater Ecosystems of South Korea using Non-metric Multidimensional Scaling and Network Analysis)

  • 지창우;이대성;이다영;박영석;곽인실
    • 생태와환경
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    • 제54권2호
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    • pp.130-141
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    • 2021
  • 국내 멸종위기 어류 25종의 먹이원을 문헌 조사한 결과, 먹이원은 20문, 31강, 58목, 116과, 154속으로 나타났다. 먹이원 중 가장 많은 어류가 섭식한 먹이원은 분류군에 따라 절지동물문, 곤충강, 파리목, 깔따구과로 조사되었으며, 식물류 먹이원은 돌말문, 윷돌말강, 반달돌말목, 반달돌말과로 조사되었다. 계층적 군집분석과 NMDS를 이용하여 멸종위기 어류 20종의 먹이원 유형화 결과, 어류를 주로 포식하는 충식성 어류와 식물플랑크톤을 섭식하는 어류 2가지 유형으로 나타났다. 네트워크 분석의 허브 점수가 높은 먹이원은 파리목, 하루살이목, 날도래목, 강도래목, 딱정벌래목으로 나타났으며 식물류 먹이원 중 허브 점수가 높은 쪽배돌말목과 반달돌말목, 김발돌말목으로 조사되었다. 먹이원 폭이 큰 어류는 연준모치(PP)와 열목어, 좀수수치, 가는돌고기, 꼬치동자개, 퉁사리, 묵잡자루, 미호종개로 Bi 지수 값이 0.3 이상으로 조사되어 다양한 먹이를 먹는 것으로 조사되었다. 반면, 금강모치, 부안종개, 감돌고기, 흰수마자, 다묵장어, 돌상어, 얼룩새코미꾸리, 북방종개는 Bi 지수 값이 0.1 이하로 조사되어 먹이원 다양성이 낮게 조사되었다.

위내용물 분석과 안정동위원소 분석을 이용한 겨울철 동해 북부 연안에 출현하는 명태(Gadus chalcogrammus)와 대구(G. macrocephalus)의 먹이분할 연구 (Winter Food Resource Partitioning between Sympatric Gadus macrocephalus and G. chalcogrammus in the Northern Coast of East Sea, South Korea Inferred from Stomach Contents and Stable Isotopes Analyses)

  • 박주면;정해근;이충일;박현제
    • 한국어류학회지
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    • 제34권2호
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    • pp.102-112
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    • 2022
  • 본 연구는 위내용물 분석과 안정동위원소(δ13C and δ15N) 분석을 통하여 우리나라 동해 북부 연안에 출현하는 명태(Gadus chalcogrammus)와 대구(G. macrocephalus)의 종내 및 종간 먹이자원 분할을 조사하였다. 두 종은 중층성 육식성 어종으로 명태는 저서성 및 중층성 갑각류를 주로 섭식하였고, 대구는 어류를 주로 섭식하였다. 위내용물 분석 결과에 대한 Non-metric multidimensional scaling (nMDS) ordination과 permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA)은 두 종의 종내 및 종간 먹이조성의 차이와 먹이자원 분할을 보여줬다. 안정동위원소 분석 결과 δ15N 값은 종간 유사하였지만, δ13C 값은 대구가 높은 값을 나타내어 두 종간 생태지위 차이를 보여줬다. 명태는 체장 증가에 따라 큰 체장군에서 새우류와 두족류를 더 많이 섭식하는 먹이 전환을 나타냈지만, 대구는 체장군 간 먹이조성이 유사하였다. 안정동위원소 분석에서도 체장군 간 차이를 보였는데, 두 종의 큰 체장군은 작은 체장군에 비해 더 높은 δ15N 값을 나타낸다. 결론적으로 본 연구는 명태와 대구의 위내용물 분석과 안정동위원소 분석을 통하여 종내 및 종간 먹이 차이와 생태지위 분할의 증거를 보여줬다.

Long-term impacts of Argentine ant invasion of urban parks in Hiroshima, Japan

  • Park, Sang-Hyun;Hosoishi, Shingo;Ogata, Kazuo
    • Journal of Ecology and Environment
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    • 제37권3호
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    • pp.123-129
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    • 2014
  • Ant communities are well suited for monitoring changes in ecosystems. Although numerous studies have examined the responses of ant communities to environmental disturbance, relatively few long-term studies on ant communities have been undertaken in urban environments. We examined species richness in nine urban parks in Hiroshima, Japan, and compared the survey results with data collected at the same sites by using the same methods in 1999. In both surveys, total of 25 species was recorded: 23 species in 1999 and 20 species in 2012. Non-metric multidimensional scaling analysis revealed that the ant communities consisted of two distinct groups, which could in turn be characterized by three patterns of ant community changes in between the two groups. The first of these community change patterns was characterized by a shift within group 1, but the number of species remained constant (approx. 10 species). The second pattern was characterized by a shift within group 2, but the number of species remained low (approx. 4 species). The third pattern was characterized by a shift from group 1 to group 2 as the abundance of Linepithema humile (Mayr) increased over time. Unlike the first and second patterns, the number of ant species in communities of the third type decreased significantly. These findings suggest that L. humile has a marked effect on the species diversity of indigenous ant communities in urban environments.

동해 남부 연안에서 출현하는 저어류 군집구조의 변화 (Variations in Demersal Fish Assemblage in the Southern Coast of East Sea, Korea)

  • 박주면;백근욱;허성회
    • 한국수산과학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.426-434
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    • 2018
  • We investigated temporal and depth-related variation in species composition and abundance of the fish assemblage in the southern East Sea. Fish samples were collected seasonally between 2007 and 2008 using a demersal trawl off the southern coast of Korea. We identified 59 fish species belonging to 41 families. The most frequently occurring species was Coelorinchus multispinulosus, followed by Lophius litulon, Acropoma japonicum and Apogon lineatus. The five most abundant species were A. lineatus, A. japonicum, Myctophum nitidulum, Engraulis japonicus and C. multispinulosus, accounting for 87.04% of the total number of individuals collected. The number of species, abundance and diversity fluctuated with sampling location and time. Permutational multivariate analyses of variance revealed that the assemblage structure was influenced by year, season and water depth, with season being the main indicator. These changes were visually emphasized using non-metric multidimensional scaling ordination plots. Fluctuations in assemblage structure were due to differential contributions of the dominant species.

Comparison of Ground Beetle Communities (Coleoptera: Carabidae) between Coniferous and Deciduous Forests in Agricultural Landscapes

  • Jung, Jong-Kook;Kim, Seung-Tae;Lee, Sue-Yeon;Yoo, Jung-Sun;Lee, Joon-Ho
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제29권3호
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    • pp.211-218
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    • 2013
  • This study was conducted to examine the community structure of ground beetles between coniferous- and deciduous-dominant forest in agricultural landscapes, in Miryang-si, Yeongdong-gun, Icheon-si, and Cheolwon-gun during April to October in 2009. A total of 19 species belonging to 15 genera of 9 subfamilies were identified from 6,253 collected ground beetles. Dominant species from 4 regions were Synuchus nitidus (3,715 individuals, 59.4% of total) and Synuchus cyloderus (1,783 individuals, 28.5%) respectively. Non-metric multidimensional scaling based on Bray-Curtis similarity showed that ground beetle assemblage was not different between forest stands, but it was significantly different among regions. Overall, forest stands of secondary forests may not show a different community structure of ground beetle assemblages in our study. However, monitoring on the ground beetle fauna as well as other arthropods of secondary forests in agricultural landscapes is still important for the management and conservation of biodiversity, because forests provides important habitats for many predatory arthropods, such as ground beetles, spiders and rove beetles.

전문영역의 주제구조분석 - 저자공인용에 근거하여 - (Analysis of Intellectual Structure of Subject Specialty through Author Co-citation)

  • 조명희
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제22권
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    • pp.331-360
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    • 1992
  • This research presents author co-citation analysis of the subject area in the humanities - Korean history. Three approaches to multivariate analyses were used to display the inter-author relationships in the similarity matrix. Data on co-citation of sixty seven authors for the period of 1980­1989 were extracted from the database constructed by author. The author's name, here refers to a body of writings by a person, is the unit of analysis. The data were subjected to non-metric multidimensional scaling program create two-dimensional map of authors. Authors with similarity are clustered using hierarchical agglomerative procedure and it is found that five clusters in Korean history represent primarily research specializations. Author map of Korean history reveals the first dimension corresponding to subject orientation of authors and the second dimension corresponds to research method or research style. In factor analysis, each factor reflects research specialty made up of authors, and factor locadings demonstrate the breadth or concentration of sixty seven authors' scholarly contributions on Korean history. It is demonstrated that the· specific methodology employed by this research, author co-citation analysis, is useful to represent the intellectual structure of Korean history.

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Microhabitat Characteristics Determine Fish Community Structure in a Small Stream (Yudeung Stream, South Korea)

  • Choi, Jong-Yun;Kim, Seong-Ki;Kim, Jeong-Cheol;Lee, Hyeon-Jeong;Kwon, Hyo-Jeong;Yun, Jong-Hak
    • Proceedings of the National Institute of Ecology of the Republic of Korea
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    • 제2권1호
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    • pp.53-61
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    • 2021
  • Distribution of fish community depends largely on environmental disturbance such as habitat change. In this study, we evaluated the impact of environmental variables and microhabitat patch types on fish distribution in Yudeung Stream at 15 sites between early May and late June 2019. We used non-metric multidimensional scaling to examine the distribution patterns of fish in each site. Gnathopogon strigatus, Squalidus gracilis majimae, Zacco koreanus, and Zacco platypus were associated with riffle and boulder areas, whereas Iksookimia koreensis, Acheilognathus koreensis, Coreoleuciscus splendidus, Sarcocheilichthys nigripinnis morii, and Odontobutis interrupta were associated with large shallow areas. In contrast, Cyprinus carpio, Carassius auratus, Lepomis macrochirus, and Micropterus salmoides were found at downstream sites associated with large pool areas, sandy/clay-bottomed areas, and vegetated areas. On the basis of these results, we suggest that microhabitat patch types are important in determining the diversity and abundance of fish communities, since a mosaic of different microhabitats supports diverse fish species. As such, microhabitat patches are key components of freshwater stream ecosystem heterogeneity, and a suitable patch composition in stream construction or restoration schemes will support ecologically healthy food webs.

한국 남해에 출현하는 가고시마샛멸(Argentina kagoshimae)의 섭식생태 (Feeding Ecology of Smallmouth Argentine Argentina kagoshimae in Coastal Waters of the South Sea, Korea)

  • 정재묵;이승종;백근욱
    • 한국수산과학회지
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    • 제55권5호
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    • pp.590-597
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    • 2022
  • We analyzed the diet composition of smallmouth argentine Argentina kagoshimae, which were collected via bottom trawl in the South Sea during February, April, August, and October 2021. Their size range was 8.1-21.4 cm total length. A. kagoshimae are mesopelagic carnivores, mainly consuming benthopelagic Euphausiacea and Caridea crustaceans. Polychaetes were the second largest prey component in their diet, which also included small quantities of copepods, amphipods, and arrow worms. Stomach content compositions substantially differed among body size levels in A. kagoshimae. The results of non-metric multidimensional scaling ordination and permutational multivariate analysis of variance of dietary data revealed no significant dietary differences. The results of a graphical analysis of the diet composition showed that A. kagoshimae are specialized feeders characterized by strong individual feeding specialization.