• 한국어류학회지
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• 제19권4호
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• pp.274-285
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• 2007

자리돔과(Teleostei: Pomacentridae) 어류는 열대 및 아열대 해역에 널리 분포하고 있으며 특히 산호해역의 해양생물 군락을 이루는 주요구성 어류이다. 현재 우리나라에는 본과에 5종이 분포하는 것으로 알려져 있는데 본 논문에서는 genus Chromis와 Dascyllus 2속을 대상으로 분자계통학적 위치를 규명하는데 그 목적이 있다. 분자계통분석에서 일본산 D. aruanus는 계통도상에서 폴리네시아산 D. aruanus와 함께 유집되었고, 우리나라의 Chromis fumea는 호주의 C. nitida와 함께 유집되었으며, 두 종간의 유전적 거리를 표시하는 P 값은 0.047로 상대적으로 매우 낮았다. 우리나라의 C. notatus는 뉴칼레도니아산 C. flavomaculata와 함께 유집되었는데, 특히 제주의 D. melanurus와 인도-태평양의 D. melanurus 사이에는 유전자 염기서열의 차이가 전혀 관찰되지 않았다. 그러나 이 두 지역의 D. melanurs와 인도네시아의 D. melanurus간에는 한개의 염기서열 차이가 있었다. 일본산 Dascyllus aruanus의 염기서열은 폴리네시아산 Dascyllus aruanus와 2개의 염기서열 차이가 있었고, 한국산 Chromis fumea와 C. notatus 사이에는 다소 많은 수의 염기서열 차이가 있었다. 본 논문에서 도입한 미토콘드리아 cytochrome DNA의 염기서열 정보 및 분석은 이 유전자가 종 수준에서 뿐만 아니라 지역집단의 구분 및 확인을 위한 DNA 바코드로서 이용될 수 있음을 보여준다.

• 한국진공학회:학술대회논문집
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• 한국진공학회 2016년도 제50회 동계 정기학술대회 초록집
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• pp.384.1-384.1
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• 2016

We reported that amorphous silicon (a-Si) thin film provide sample plate exhibiting a multimodality to measure biomolecules by secondary ion mass spectrometry (SIMS) and laser desorption/ionization mass spectrometry (LDI-MS). Kim et al.1 reported that a-Si thin film were suitable to detect small molecules such as drugs and peptides by SIMS and LDI-MS. Recently, bacterial identification has been required in many fields such as food analysis, veterinary science, ecology, agriculture, and so on.2 Mass spectrometry is emerging for identifying and profiling microbiology samples from its advantageous characters of label-free and shot-time analysis. Five species of bacteria - S. aureus, G. glutamicum, B. kurstaki, B. sphaericus, and B. licheniformis - were sampled for MS analysis without lipid extraction in sample preparation steps. The samples were loaded onto the a-Si thin film with a thickness of 100 nm which did not only considered laser-beam penetration but also surface homogeneity. Mass spectra were recorded in both positive and negative ionization modes for more analytical information. High reproducibility and sensitivity of mass spectra were demonstrated in a mass range up to mass-to-charge ratio(m/z) 1200 by applying the a-Si thin film in mentioned above MS. Principle component analysis (PCA) - a popular statistical analysis widely used in data processing was employed to differentiate between five bacterial species. The PCA results verified that each bacterial species were readily distinguished and differentiated effectively from our MS approach. It shows a new opportunity to rapid bacterial profiling and identification in clinical microbiology. More details will be discussed in the presentation.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제16권4호
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• pp.251-257
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• 2001

Listeria monocytogenes와 L. ivanovii는 인간과 동물에 대한 식품 유래성 병원성 세균이다. Listeria 속에는 이들 병원균 외에 비병원성세균인 L. innocua, L, welshimeri, L. seeligeri, L.grayi 등 이 포함되어 있기에, 식품검사에서 배양법을 사용하는 종래의 Listeria의 검출방법은 시간과 많은 실험을 필요로 한다. 이런 이유 등으로 Literia의 종동정과 검출을 위한 신속한 검출법으로 Lis-mix multiplex PCR검출법 (Bubert et al., 1999)이 개발되었다. 본 연구에서는 식품검사에 활용하기 위한 실용적인 Lis-mix multiplex PCR 방법을 개발하고, 아울러 새로운 Siw-mixIII PCR 검출법을 개발하였다. 이 방법을 사용하여 식품에서 분리된 총 69개의 Listeria 균주를 성공적으로 종동정할 수 있었으며, Siw-mixIII multiplex PCR방법을 사용하여 L. ivanovii, L.welshimeri, L.seeligeri를 한번의 PCR로 검출 및 종동정을 할 수 있었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권2호
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• pp.284-289
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• 2004

A PCR assay for the rapid detection of Vibrio vulnificus strains was developed using a virulence gene for elastase found in various Vibrio species. The DNA sequences in the elastase gene facilitated the identification of a species-specific probe for pathogenic V. vulnificus strains from both clinical and environmental sources. Using an elastase gene-based PCR reaction, a species-specific 507-bp PCR product was visualized by agarose gel electrophoresis. Three different DNA extraction methods were then compared to improve the simplicity and rapidity of detection. A PCR assay using the conventional DNA extraction or boiling method was able to detect as few as 25 V. vulnificus cells, making the detection limits at least 1-log-scale lower than that for the EDT A-treated DNA extraction method. In particular, the boiling method, which does not require purification of the chromosomal DNA, was very effective in terms of simple and rapid detection. Meanwhile, the detection limit in a mixed bacterial culture that included other bacteria, such as Escherichia coli or Bacillus subtilis, was two V. vulnificus cells, which was 1-log-scale lower than that for the control. Accordingly, when coupled with a new DNA extraction method, the elastase gene-based PCR can provide a rapid, specific, and sensitive method for identifying V. vulnificus in clinical and environmental samples.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제12권12호
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• pp.5564-5569
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• 2011

본 연구는 U-Learning을 위한 안드로이드 플랫폼에서의 증강 현실 도입에 대한 것이다. 안드로이드는 모바일 컴퓨팅 및 개방형 기술의 새로운 기반이며, 안드로이드는 모바일 전화에만 국한되지 않고 다양한 장치에 적용이 가능하다. 또한 개발자의 기술을 활용할 수 있는 기회를 제공하며, 활동적이고 흥미로운 커뮤니티를 구축할 기회를 제공한다. 증강현실은 카메라, GPS 등 대부분 애플리케이션에 적용될 수 있으며, 점차 스마트 폰에서 일반화되고 있다. 증강현실은 웹 접속이 가능한 유비쿼터스 장비를 통해 개인들이 유연하게 정보들을 수신, 발신, 검토할 수 있는 교육도구가 될 수 있다. 본 논문에서는 형식 정의에 증강 현실을 이용한 안드로이드 스마트 폰을 사용하여 형식 식별을 위한 증강 현실을 제안한다. 본 연구는 학생들의 외부 공간 실습 활동, 즉 동물원, 식물원 등이 방문 시에 유용할 것이다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제40권1호
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• pp.16-29
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• 2024

The Colletotrichum gloeosporioides species complex includes many phytopathogenic species, causing anthracnose disease on a wide range of host plants and appearing to be globally distributed. Seventy-one Colletotrichum isolates in the complex from different plants and geographic regions in Korea were preserved in the Korean Agricultural Culture Collection (KACC). Most of them had been identified based on hosts and morphological features, this could lead to inaccurate species names. Therefore, the KACC isolates were re-identified using DNA sequence analyses of six loci, comprising internal transcribed spacer, gapdh, chs-1, his3, act, and tub2 in this study. Based on the combined phylogenetic analysis, KACC strains were assigned to 12 known species and three new species candidates. The detected species are C. siamense (n = 20), C. fructicola (n = 19), C. gloeosporioides (n = 9), C. aenigma (n = 5), C. camelliae (n = 3), C. temperatum (n = 3), C. musae (n = 2), C. theobromicola (n = 2), C. viniferum (n = 2), C. alatae (n = 1), C. jiangxiense (n = 1), and C. yulongense (n = 1). Of these, C. jiangxiense, C. temperatum, C. theobromicola and C. yulongense are unrecorded species in Korea. Host plant comparisons showed that 27 fungus-host associations are newly reported in the country. However, plant-fungus interactions need to be investigated by pathogenicity tests.

• 한국산림과학회지
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• 제110권2호
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• pp.155-164
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• 2021

자연환경에 대한 국민들의 관심 증가로 스마트폰과 같은 휴대용 기기를 이용한 수목 동정의 자동화에 대한 요구가 증가하고 있다. 최근 딥러닝 기술의 발전에 힘입어, 외국에서는 수목 인식 분야에의 적용이 활발하게 이루어지고 있다. 수목의 분류를 위해 꽃, 잎 등 다양한 형질들을 대상으로 연구가 진행되고 있지만, 접근성을 비롯한 여러 장점을 가진 수피의 경우 복잡도가 높고 자료가 부족하여 연구가 제한적이었다. 본 연구에서는 국내에서 흔히 관찰 가능한 수목 54종의 사진자료를 약 7,000 여장 수집 및 공개하였고, 이를 해외의 20 수종에 대한 BarkNet 1.0의 자료와 결합하여 학습에 충분한 수의 사진 수를 가지는 53종을 선정하고, 사진들을 7:3의 비율로 나누어 훈련과 평가에 활용하였다. 분류 모델의 경우, 딥러닝 기법의 일종인 합성곱 신경망을 활용하였는데, 가장 널리 쓰이는 VGGNet (Visual Geometry Group Network) 16층, 19층 모델 두 가지를 학습시키고 성능을 비교하였다. 또한 본 모형의 활용성 및 한계점을 확인하기 위하여 학습에 사용하지 않은 수종과 덩굴식물과 같은 방해 요소가 있는 사진들에 대한 모델의 정확도를 확인하였다. 학습 결과 VGG16과 VGG19는 각각 90.41%와 92.62%의 높은 정확도를 보였으며, 더 복잡도가 높은 모델인 VGG19가 조금 더 나은 성능을 보임을 확인하였다. 학습에 활용되지 않은 수목을 동정한 결과 80% 이상의 경우에서 같은 속 또는 같은 과에 속한 수종으로 예측하는 것으로 드러났다. 반면, 이끼, 만경식물, 옹이 등의 방해 요소가 존재할 경우 방해요소가 자치하는 비중에 따라 정확도가 떨어지는 것이 확인되어 실제 현장에서 이를 보완하기 위한 방법들을 제안하였다.

• ALGAE
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• 제33권2호
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• pp.143-156
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• 2018

Dolichospermum is a filamentous and heterocytous cyanobacterium that is one of the commonly occurring phytoplanktons in the Han River of Korea. Morphological observations led to the identification of D. planctonicum-like filaments in seasonal water samples. In the present study, we successfully isolated these filaments using culture methods, and examined its morphology using light and scanning electron microscopy. The morphology of the D. planctonicumlike species differed from that of typical D. planctonicum; it had thin cylindrical-shaped akinetes, which were narrower towards the ends than at the center. This morphology is firstly described in the genus Dolichospermum. In addition, the akinetes in the filament developed solitarily and were distant from the heterocytes. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA sequences showed that our Dolichospermum clustered with D. planctonicum and D. circinale, which have coiled trichome. However, phylogenetic analysis of the gene encoding rivulose-1,5-bisphosphate carboxylase (rbcLX) clearly separated our species from other Dolichospermum, forming a unique clade. Additionally, structures of D. planctonicum and D. hangangense strains were different type in Box-B and V3 region. These results demonstrated that the new Dolichospermum species was unique in morphology and molecular traits. Therefore, we propose this to be a new species belonging to genus Dolichospermum with the name Dolichospermum hangangense sp. nov.

• 혜화의학회지
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• 제4권2호
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• pp.333-333
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• 1996

Chinese medicine is a precious treasure inherited from ancient ancestors. It is accredited for the prosperous growth of the Chinese nations. However, the descriptions of the herbs in the ancient herbal are not in detail and the great numbers of herbs used which grows in wide geographic areas together with various local folk names, new substitutes and new folk medicines had increased, many Chinese herbs are composed of herbs that are labeled with identical names but actually are of different origins and different grades. Similar situation had occurred in China, japan and Korea In Taiwan, misused Chinese crude drugs are also very common in the past. This phenomenon had caused a lot of confusion and had great influence the clinical efficacy of the treatment. In the past, Professor Hong Yen Hsu, Na Chi, Woei Song Kan and Kung Yin Yen had studied the origins of Chinese crude drugs in Taiwan based on the morphological identification and found that the origins of Ma-Tou-Ling, Pu-Kung-Yin, Tu-Chung, Wang-Pu-Liu-Hsing, Pan-lan-Ken, Niu-Chi, Fang-Chi, Huang-Chi, PienHsiu and Sha Wan-Tzi are different from that of the species used in mainland China. In order to assure the quality and clinical efficacy of the crude drugs, besides the traditional morphological methods, we bad recently combined modem chemical and pharma-cological methods to assess drug quality. Drugs that have been evaluated without effects should be abandoned. The species of those commonly misued crude drugs used in compound formula preparations are also identified Based on the pharmacological results, a suitable species is recommended so as to improve the clinical efficacy of those preparations. In this paper, we like to report our recent studies on Niu Chi(Achyranthis Bidentatae Radix, Cyathulae Radix and Strobilanthis Radix). Fang-Chi(Arstolochiae Fangchi Radix, Stephaniae Tetrandrae Radix and Cocculus Radix) and Huang-Chi(Astragali Radix and Hedysari Radix) using comparative pharmacognosy methods.

• 한국응용과학기술학회지
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• 제37권6호
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• pp.1698-1705
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• 2020

나이가 20-25세인 남녀 성인들 20명(남성 5명, 여성 15명)의 엄지손가락 표면에 상재하는 세균을 채취하고 Luria-Bertani agar에서 배양하였다. 배양된 세균들의 16S rDNA를 polymerase chain reaction을 통하여 증폭하고, 그 염기서열을 분석하였다. 이렇게 얻어진 염기서열을 genbank의 자료들과 비교하여 세균들을 동정한 결과, 총 14종의 세균들이 확인되었다. 개인별로는 평균 2.5종의 배양 가능한 세균들을 손의 피부에 보유하는 것으로 확인되었다. 확인된 세균 중에서는 Staphylococcus 종들이 가장 널리 존재하고 있었으며, 다음으로는 Micrococcus luteus이었다. Staphylococcus 종들의 경우에는 그 분포에 있어서 성별에 따른 차이가 적었으나, Micrococcus luteus의 경우에는 남자보다 여자에게서 훨씬 더 많이 분리되는 경향을 보였다. 이러한 결과는 피부 질환에 대한 연구, 피부질환에 대한 치료제 개발, 피부에 사용하는 화장품개발 등의 분야에 도움이 될 것으로 사료된다.