• 한국균학회지
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• 제43권3호
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• pp.191-195
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• 2015

A new species of Neosartorya was recovered during investigation of the fungal community in soil samples collected from different locations in Korea; Neosartorya aureola KNU14-7 was isolated for the first time from field soil in Korea and identified based on the internal transcribed spacer region of rDNA and morphological characteristics. The species has not been officially reported from Korea and we report it here with description and figures.

• 한국균학회지
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• 제44권4호
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• pp.207-219
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• 2016

인간의 삶에 큰 영향을 끼치는 Aspergillus, Penicillium 및 그들의 완전세대 속에 속하는 곰팡이의 국내 보고 종 목록을 작성하였다. 기존의 국가 생물종 목록집에는 Aspergillus 14종, Eurotium 4종, Neosartorya 8종, Penicillium 47종, Talaromyces 5종이 보고되었다. 본 논문에서는 국제조류 균류 식물명명규약(ICN)에 따른 일균일명 체계에 따라 Eurotium과 Neosartorya은 Aspergillus 속으로 합치고 Penicillium과 Talaromyces도 새로운 속 개념에 따라 정리하였다. 또한 기존의 국가 생물종 목록에 빠져 있던 77종을 추가하여 Aspergillus, Penicillium 및 그들의 완전세대에 속하는 곰팡이의 국내 보고 종 목록을 Aspergillus 55종, Penicillium 82종, Talaromyces 18종으로 정리하였다.

• Mycobiology
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• 제38권1호
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• pp.1-6
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• 2010

63 strains of Aspergillus section Fumigati were isolated from 17 samples of arable soil in a central province of Korea. Based on the results of genotypic and phenotypic analyses, they were identified as Aspergillus fumigatus, A. lentulus, Neosartorya coreana, N. fennelliae, N. fischeri, N. glabra, N. hiratsukae, N. laciniosa, N. pseudofischeri, N. quadricincta, N. spinosa and N. udagawae. Among these, N. fennelliae, N. hiratsukae, N. quadricincta, and N. udagawae had not been previously recorded in Korea. The diversity of Aspergillus section Fumigati species from arable soil in Korea is also addressed.

• 한국균학회소식:학술대회논문집
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• 한국균학회 2006년도 추계학술대회 및 정기총회
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• pp.7-9
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• 2006

• 한국균학회지
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• 제42권1호
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• pp.79-85
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• 2014

태안반도에 자생하는 해안식물인 해국(Aster sphathulifolius Maxim.), 갯개미취(Aster tripolium L.), 갈대(Phragmites australis), 갯꾸러미풀(Puccinellia nipponica Ohwi) 의 뿌리로부터 총 42주의 내생진균이 분리되었다. 그리고 분리된 내생진균의 ITS지역의 염기서열을 이용하여 동정한 결과 모두 자낭균문에 속하며, 8종류의 목(Botryosphaeriales, Capnodiales, Diaporthales, Dothideales, Eurotiales, Helotiales, Hypocreales, and Pleosporales)과 13종류의 속(Alternaria, Aureobasidium, Cadophora, Cladosporium, Davidiella, Diaporthe, Fusarium, Gibberella, Macrophomina, Metarhizium, Neosartorya, Penicillium, and Phoma)으로 분류되었으며, Eurotiales목의 Penicillium속의 분포비율이 가장 높게 존재하였다. Shannon 다양성지수를 비교한 결과 4종의 해안식물 중 갯개미취에서 분리한 내생진균의 다양성이 가장 높게 확인되었다.

• 한국균학회지
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• 제15권3호
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• pp.187-195
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• 1987

두가지 열처리법에 의한 균 분리방법을 사용하여, 보통균을 제외한 토양균의 분리와 그의 논토양중의 수직 및 계절별 분포를 파악하기 위하여 역곡동과 신원동의 논토양을 시료로 사용하였다. $42^{\circ}C$에서 2일간 배양후 $37^{\circ}C$로 배양하는 방법과 $70^{\circ}C$에서 15분간 열처리하는 방법을 사용하였다. $42^{\circ}C$ 배양법에서는 두 장소에서 분리된 토양균은 거의가 mesophile이었으며 thermotolerant fungi는 Asergillus fumigatus, thermophile로는 Sporotrichum thermophile과 Malbranchea pulchella var. sulfrea이었고, 이들 중 우점종은 Asergillus fumigatus이었다. 두 장소에서 9속, 14종이 분리동정되었으며 Sporotrichum thermophile, Talaromyces ucrainicus, Malbranchea pulchella var. sulfrea는 한국 미기록 종이다. $72^{\circ}C$ 열처리방법으로 분리한 경우 두 장소에서 10속, 20종이 분리동정되었으며, 분리된 균은 거의가 mesophile이었으며 thermotolerant fungi는 Asergillus fumigatus이었고, 우점종은 Talaromyces stipitatus이었다. 또한 Talaromyces helicus var. major, Emericella nidulans var. nidulans, Chaetomium subspirale, Neosartorya fishiri var. fischeri는 한국 미기록 종이다. 두가지 분리방법으로 분리된 토양균의 계절적 분포는 여름과 봄이 가을과 겨울보다 높았으며, 전체 균의 수와 우점종 균수, 그리고 나타나는 종의 빈도는 그 수직분포에 있어서 상층에서 가장 높았으나 하층으로 내려갈수록 감소하였다.

• 생명과학회지
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• 제22권10호
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• pp.1384-1391
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• 2012

본 연구에 사용된 해안식물은 울릉도의 해안지역으로부터 채집하였다. 그리고 식물은 큰비쑥, 해국, 갯질경이, 땅채송화, 갯강아지풀 등 5종류의 식물이 채집되었다. 울릉도에서 채집된 해안식물의 뿌리로부터 36주의 내생진균이 분리되었다. 모든 내생진균류는 ITS영역에 의해 분석 및 동정되었다. 그리고 계통분석 결과, 분리된 내생진균류는 모두 자낭균문에 속하고 4종류의 목(Capnodiales, Eurotiales, Hypocreales and Pleosporales)으로 분류되었으며, 이 중 Eurotiales 목이 가장 분포 비율이 높은 것으로 확인되었다. 그리고 내생진균류를 속으로 분류하였을 때, 9종류의 속(Alternaria, Aspergillus, Cladosporium, Exserohilum, Fusarium, Neosartorya, Penicillium, Phoma and Pyrenochaeta)으로 분류되었으며, Penicillium 속과 Aspergillus 속이 가장 우점종으로 확인되었다. 그리고 Shannon's diversity index (H')는 0.684에서 1.609의 분포로 나타났으며, 땅채송화에서 분리된 내생진균류의 다양성이 다른 식물에 비하여 높은 것으로 확인되었다.

• 대한임상검사과학회지
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• 제41권4호
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• pp.158-166
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• 2009

On the basis of morphological characteristics, of total 128 strains of from sputum of tuberculos inpatient were identified as A. fumigatus (61 strains), A. niger (37), A. flavus (26), A. versicolor (1), A. nidulans (1), A. clavatus (1) and Neosartorya fennelliae (1). These strains were re-identified according to recent Aspergillus classification system which is mainly based on molecular characteristics. The strains were grouped by randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) techniques. The representative strains from each group were sequenced with partial ${\beta}$-tubulin gene and compared with those of reference strains in the Aspergillus and were identified by the sequence. The identification was confirmed by morphology examination. As the results, they are reidentified as A. fumigatus (58), A. niger (11), A. tubingensis (26), A. flavus (27), A. sydowii (3), A. nidulans (1), A. clavatus (1) and Neosatorya fennelliae (1). This is the first report of A. tubuingensis in clinical field in Korea.

• 한국균학회소식:학술대회논문집
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• 한국균학회 2014년도 추계학술대회 및 정기총회
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• pp.49-49
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• 2014

In order to find indigenous beneficial fungal species from crop field soils of Nigeria, 23 soil samples were collected from various places of Nigeria in June, 2013 and fungi were isolated through serial dilution technique. Isolated fungi were purified and differentiated according to their morphological and microscopic characteristics. In total, 38 different representative isolates were recovered and the genomic DNA of each isolates was extracted using QIAGEN$^{(R)}$ Plasmid Mini Kit (QIAGEN Sciences, USA) and the identification of fungi was carried out by sequence analysis of internal transcribed spacer (ITS) region of the 18S ribosomal DNA (18S rDNA). Recovered isolates belonged to 9 fungal genera comprising Fusarium, Aspergillus, Chaetomium, Coniothyrium, Dipodascaceae, Myrothecium, Neosartorya, Penicillium and Trichoderma. Aspergillus spp., Penicillium spp. and Trichoderma spp. were the most dominant taxa in this study. The antagonistic potentiality of species belonged to Trichoderma against 10 phytopathogenic fungi (F. oxysporum, C. gloesporoides, P. cytrophthora, A. alternata, A. solani, S. rolfsii, F. solani, R. solani, S. sclerotiorum and P. nicotiana) was assessed in vitro using dual culture assay. The dual culture assay results showed varied degree of antagonism against the tested phytopathogens. The potential Trichoderma spp. will be further evaluated for their antagonistic and plant growth promotion potentiality under in vivo conditions.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제31권1호
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• pp.8-15
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• 2021

More and more available fungal genome sequence data reveal a large amount of secondary metabolite (SM) biosynthetic 'dark matter' to be discovered. Heterogeneous expression is one of the most effective approaches to exploit these novel natural products, but it is limited by having to clone entire biosynthetic gene clusters (BGCs) without errors. So far, few effective technologies have been developed to manipulate the specific large DNA fragments in filamentous fungi. Here, we developed a fungal BGC-capturing system based on CRISPR/Cas9 cleavage in vitro. In our system, Cas9 protein was purified and CRISPR guide sequences in combination with in vivo yeast assembly were rationally designed. Using targeted cleavages of plasmid DNAs with linear (8.5 kb) or circular (8.5 kb and 28 kb) states, we were able to cleave the plasmids precisely, demonstrating the high efficiency of this system. Furthermore, we successfully captured the entire Nrc gene cluster from the genomic DNA of Neosartorya fischeri. Our results provide an easy and efficient approach to manipulate fungal genomic DNA based on the in vitro application of Cas9 endonuclease. Our methodology will lay a foundation for capturing entire groups of BGCs in filamentous fungi and accelerate fungal SMs mining.