• 생물환경조절학회지
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• 제30권4호
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• pp.393-400
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• 2021

가축의 체중은 사료 요구량과 영양 상태를 평가하는 데 필요한 주요 지표에 해당한다. 본 연구는 한우의 3-D 영상으로부터 몸통 체적을 산출한 후 체중을 추정하고자 시도되었다. 한우의 3-D 영상 획득에 640×480 픽셀의 해상도, 44fps의 프레임속도 및 47°(H)×37°(V)의 화각을 갖는 TOF 카메라가 사용되었다. 획득된 3-D 영상에서 배경과 몸통 분리, 이상치 제거 등의 전처리 과정을 거쳐서 몸통에 대한 격자 영상을 얻었다. 또한 각각의 격자에 깊이 정보를 적용한 수치적분으로 몸통 체적을 결정하였다. Calibration dataset에서 체중과 몸통체적의 선형회귀에 대한 결정계수는 0.8725로 나타났다. 한편 몸통 체적에 월령을 설명 변수로 추가한 체중 추정의 중회귀 모형에서 결정계수는 0.9083으로 나타났다. Validation dataset에서 중회귀 모형을 이용한 체중 추정의 MAPE와 RMSE는 각각 8.2%, 24.5kg으로 나타났다. 결과적으로 체중 추정을 위한 회귀 모형의 성능이 개선되고, 체중 추정에 소요되는 노력이 절감됨을 고려한다면 3-D 영상에서 결정된 몸통 체적이 한우의 체중 추정에 유효한 변수로 사용될 것이다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제62권4호
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• pp.429-437
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• 2020

This study was conducted to construct basic data for the selection of elite cows by analyzing the estimated breeding value (EBV) and accuracy using the pedigree of Hanwoo cows in Gyeongnam. The phenotype trait used in the analysis are the carcass weight (CWT), eye muscle area (EMA), backfat thickness (BFT) and marbling score (MS). The pedigree of the test group and reference group was collected to build a pedigree structure and a numeric relationship matrix (NRM). The EBV, genetic parameters and accuracy were estimated by applying NRM to the best linear unbiased prediction (BLUP) multiple-trait animal model of the BLUPF90 program. Looking at the pedigree structure of the test group, there were a total of 2,371 cows born between 2003 to 2009, of these 603 cows had basic registration (25%), 562 cows had pedigree registration (24%) and 1,206 cows had advanced registration (51%). The proportion of pedigree registered cows was relatively low but it gradually increased and reached a point of 20,847 cows (68%) between 2010 to 2017. Looking at the change in the EBV, the CWT improved from 4.992 kg to 9.885 kg, the EMA from 0.970 ㎠ to 2.466 ㎠, the BFT from -0.186 mm to -0.357 mm, and the MS from 0.328 to 0.559 points. As a result of genetic parameter estimation, the heritability of CWT, EMA, BFT, and MS were 0.587, 0.416, 0.476, and 0.571, respectively, and the accuracy of those were estimated to be 0.559, 0.551, 0.554, and 0.558, respectively. Selection of superior genetic breed and efficient improvement could be possible if cow ability verification is implemented by using the accurate pedigree of each individual in the farms.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권5호
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• pp.499-506
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• 2002

본 연구는 1994년부터 2000년까지 축산기술연구소 종축개량부에서 사육된 Yorkshire종 돼지 2,111두의 자료를 근거로 하여 주요 경제형질인 일당증체량, 90kg 도달 일령, 등지방두께에 대한 유전력, 유전상관, 표현형상관을 추정하기 위하여 MTDFREML Package에서 Animal model를 이용하여 분석하였다. 본 연구에서 얻은 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 분석한 돼지의 주요 경제형질의 평균치는 등지방두께가 1.476 0.241cm, 일당증체량이 0.871 0.124kg, 90kg 도달 일령이 145.397 11.718일이었다. 2. 분석한 형질들의 유전력은 등지방두께가 0.55, 일당증체량이 0.55, 90kg 도달 일령이 0.56으로 전체적으로 고도의 유전력을 보였다. 3. 분석한 형질들의 유전상관은 일당증체량과 90kg 도달 일령에서는 －0.82, 일당증체량과 등지방두께 에서는 0.10, 90kg 도달 일령과 등지방두께 사이에서는 －0.25로 나타났다. 조사된 형질들의 표현형상관은 일당증체량과 90kg 도달 일령에서는 －0.77, 일당증체량과 등지방두께 에서는 0.02, 90kg 도달 일령과 등지방두께 사이에서는 －0.05로 나타났다. 등지방두께에 대한 일당증체량과 90kg 도달 일령사이의 표현형상관은 낮게 나타났지만 유전상관은 다소 높게 나타나 개량시 이점에 대하여 고려하여야 할 것이라 사료된다. 유전력에 있어서는 주요 경제형질 모두 고도의 유전력을 나타내어 적절한 선발 및 사양관리가 이루어진다면 Yorkshire종에 대한 유전적 개량량이 높을 것으로 사료된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제28권7호
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• pp.926-935
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• 2015

The efficiency of genome-wide association analysis (GWAS) depends on power of detection for quantitative trait loci (QTL) and precision for QTL mapping. In this study, three different strategies for GWAS were applied to detect QTL for carcass quality traits in the Korean cattle, Hanwoo; a linkage disequilibrium single locus regression method (LDRM), a combined linkage and linkage disequilibrium analysis (LDLA) and a $BayesC{\pi}$ approach. The phenotypes of 486 steers were collected for weaning weight (WWT), yearling weight (YWT), carcass weight (CWT), backfat thickness (BFT), longissimus dorsi muscle area, and marbling score (Marb). Also the genotype data for the steers and their sires were scored with the Illumina bovine 50K single nucleotide polymorphism (SNP) chips. For the two former GWAS methods, threshold values were set at false discovery rate <0.01 on a chromosome-wide level, while a cut-off threshold value was set in the latter model, such that the top five windows, each of which comprised 10 adjacent SNPs, were chosen with significant variation for the phenotype. Four major additive QTL from these three methods had high concordance found in 64.1 to 64.9Mb for Bos taurus autosome (BTA) 7 for WWT, 24.3 to 25.4Mb for BTA14 for CWT, 0.5 to 1.5Mb for BTA6 for BFT and 26.3 to 33.4Mb for BTA29 for BFT. Several candidate genes (i.e. glutamate receptor, ionotropic, ampa 1 [GRIA1], family with sequence similarity 110, member B [FAM110B], and thymocyte selection-associated high mobility group box [TOX]) may be identified close to these QTL. Our result suggests that the use of different linkage disequilibrium mapping approaches can provide more reliable chromosome regions to further pinpoint DNA makers or causative genes in these regions.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제46권2호
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• pp.145-154
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• 2004

본 연구에서는 57,316두의 농장 검정된 돼지 자료를 이용하여 유전 모수를 추정하였다. 현재 돼지 등급 제도가 도체 위주로 진행되고 있어 농장의 경제적 이익을 고려한다면, 향후 경제 가치를 고려한 정확한 선발 지수를 설정하여 정확히 추정된 육종가를 바탕으로 국가 단위 개량체계가 확립되어야 유전적 개량을 이룰 수 있을 것으로 사료된다. 조사된 형질들에 대한 유전력은 품종에 따라 다소의 차이는 있었지만, 평균 등지방 두께에 대하여 0.46${\sim}$0.65, 최후 늑골 등지방 두께에 대하여 0.42${\sim}$0.61, 등심 깊이에 대하여 0.28 ${\sim}$0.31, 정육율에 대하여 0.50${\sim}$0.60, 일당 증체량에 대하여 0.45${\sim}$0.55, 90kg 도달 일령에 대하여 0.38${\sim}$0.50 및 100kg 도달 일령에 대하여 0.40～0.50의 범위에서 추정되었다. 추정된 유전력이 일반적으로 알려진 형질들의 유전력과 유사하고, 성별 및 품종별로 뚜렷한 일관성을 나타내는 것으로 미루어 다형질 개체 모형 하에서 DF-REML에 의한 유전력의 추정이 효과적인 것으로 생각된다. 조사된 형질의 유전력은 도체 형질에 대해서는 중도의 유전력을 보였으며 나머지 성장 형질에 있어서는 고도의 유전력을 나타냈다. 본 연구의 결과로 미루어 성장 형질에 대한 개량이 유의적으로 이루어 질 수 있음을 나타내었다. 등지방 두께, 일당 증체량 및 90kg 도달 일령간의 유전 상관은 그다지 높지는 않았지만 이들 형질간에 유전적 관계가 있는 것으로 나타났으나, 이들간의 작용 방향이 서로 바람직하지 않은 상관 관계를 가지는 경우가 있어, 어느 한 형질에 치우친 선발은 다른 형질을 불량하게 할 수 있음을 보였다. 등 부위 등지방 두께와 등심 깊이간의 상관이 Duroc 종과 타 품종간에 차이가 있을 뿐 다른 형질에서는 품종간의 차이를 나타내지 않았다. 등심 깊이의 경우 성장 형질이 우수할 수록 넓은 경향을 보였으나 정육율의 경우는 정 반대의 상관을 나타냈다. 반면에 등심 깊이와 정육율의 경우에는 낮은 정의 상관 관계를 나타내어 이들 형질을 다같이 개량하기 위해서는 선발 지수식에 의한 조화있는 개량이 필요한 것으로 사료된다. 표현형 상관에 있어서도 유전 상관과 비슷한 결과가 추정되었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권5호
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• pp.507-518
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• 2002

가축 육종 체계 또는 선발방법의 상호 비교를 할 수 있도록 다형질 컴퓨터 모의실험을 위한 확률모형을 개발하고, 기존 연구결과로부터 얻어진 평균과 상가적 유전효과 및 잔여오차의 분산 및 공분산 값을 실험 모수로 사용하여 모의실험 축군을 생성하였고, 선발방법은 임의교배, 표현형가, 참육종가 및 추정육종가에 의한 선발 중에서 선택할 수 있도록 하였다. 개체의 육종가는 MTDFREML package를 사용하여 추정하였다. 모의실험 프로그램의 정확성을 검증하기 위하여 크기가 다른 세 축군을 20년간 임의교배하여 모의실험한 결과, 평균값과 분산 및 공분산 값은 모의실험 모수로 주어진 값과 비슷하였고, 축군의 크기가 클수록 모의실험 모수로 주어진 값에 더욱 근접하였으며 표준오차가 작아졌다. 임의교배를 계속함에 따른 근교계수와 축군 평균 및 분산의 변화를 확인하기 위하여 종모우 1두, 종빈우 10두를 유지하는 소축군 10개를 500년간 모의실험 한 결과, 근교계수의 변화는 이론적 추정함수와 비슷하였으며, 평균값은 작은 축군에서 세대에 따라 임의부동현상을 보였지만 근교계수가 증가하여 1에 가까워지면 일정한 값으로 수렴하였다. 축군내 분산은 근교계수의 증가에 따라 감소하였다. 이상의 결과를 보면, 모의실험 모형에 의해 생성된 축군의 자료는 모의실험 모수와 같은 통계적 특성을 유지하는 것으로 사료된다.