• 제목/요약/키워드: Molecular characterization

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버섯의 품종 육성과 종균 산업의 동향 (Trends of commercial strain development and spawn industry in mushrooms)

  • 유영복;공원식;장갑열;오세종;정종천;전창성
    • 한국버섯학회지
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    • 제4권1호
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    • pp.1-32
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    • 2006
  • 우리는 UPOV 협약에 의해 2009년 이후 품종시장을 개방해야 한다. 2005년 현재 23종류 179품종을 보급하였으나 품종보호등록 품종 수는 느타리 9개 이다. 이러한 품종등록 수는 선진국에 비해 아주 적은 편이다. 종균은 넓은 의미에서 품종도 포함한다. 품종개발을 하는데 몇 가지 문제점이 있는데 복잡하고 어려운 버섯의 성 양식, 값비싼 특수 실험기구와 자실체 생육시설이 필요하다. 이러한 문제를 해결하고 품종(종균)을 육성하기 위해서는 다음 사항들이 필요하다. 즉, 유전자원의 수집 및 평가, 게놈분석과 유용형질에 대한 분자생물학적 해석, 한국 고유의 품종 육성으로 품종보호등록, 별도지원의 가칭 "산학연 품종개발 연구단"에 의한 품종개발 연구 강화, 종균배양소의 컨소시엄에 의한 종균연구소 설립 운영, 버섯 종합상사 출현, 소비 촉진, 그리고 국제경쟁력 향상이 필요하다. 여기서는 이러한 것에 대해 논의 하고자 한다.

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Characterization of Pv92, a Novel Merozoite Surface Protein of Plasmodium vivax

  • Lee, Seong-Kyun;Wang, Bo;Han, Jin-Hee;Nyunt, Myat Htut;Muh, Fauzi;Chootong, Patchanee;Ha, Kwon-Soo;Park, Won Sun;Hong, Seok-Ho;Park, Jeong-Hyun;Han, Eun-Taek
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제54권4호
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    • pp.385-391
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    • 2016
  • The discovery and understanding of antigenic proteins are essential for development of a vaccine against malaria. In Plasmodium falciparum, Pf92 have been characterized as a merozoite surface protein, and this protein is expressed at the late schizont stage, but no study of Pv92, the orthologue of Pf92 in P. vivax, has been reported. Thus, the protein structure of Pv92 was analyzed, and the gene sequence was aligned with that of other Plasmodium spp. using bioinformatics tools. The recombinant Pv92 protein was expressed and purified using bacterial expression system and used for immunization of mice to gain the polyclonal antibody and for evaluation of antigenicity by protein array. Also, the antibody against Pv92 was used for subcellular analysis by immunofluorescence assay. The Pv92 protein has a signal peptide and a sexual stage s48/45 domain, and the cysteine residues at the N-terminal of Pv92 were completely conserved. The N-terminal of Pv92 was successfully expressed as soluble form using a bacterial expression system. The antibody raised against Pv92 recognized the parasites and completely merged with PvMSP1-19, indicating that Pv92 was localized on the merozoite surface. Evaluation of the human humoral immune response to Pv92 indicated moderate antigenicity, with 65% sensitivity and 95% specificity by protein array. Taken together, the merozoite surface localization and antigenicity of Pv92 implicate that it might be involved in attachment and invasion of a merozoite to a new host cell or immune evasion during invasion process.

Molecular Characterization of Taenia multiceps Isolates from Gansu Province, China by Sequencing of Mitochondrial Cytochrome C Oxidase Subunit 1

  • Li, Wen Hui;Jia, Wan Zhong;Qu, Zi Gang;Xie, Zhi Zhou;Luo, Jian Xun;Yin, Hong;Sun, Xiao Lin;Blaga, Radu;Fu, Bao Quan
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제51권2호
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    • pp.197-201
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    • 2013
  • A total of 16 Taenia multiceps isolates collected from naturally infected sheep or goats in Gansu Province, China were characterized by sequences of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) gene. The complete cox1 gene was amplified for individual T. multiceps isolates by PCR, ligated to pMD18T vector, and sequenced. Sequence analysis indicated that out of 16 T. multiceps isolates 10 unique cox1 gene sequences of 1,623 bp were obtained with sequence variation of 0.12-0.68%. The results showed that the cox1 gene sequences were highly conserved among the examined T. multiceps isolates. However, they were quite different from those of the other Taenia species. Phylogenetic analysis based on complete cox1 gene sequences revealed that T. multiceps isolates were composed of 3 genotypes and distinguished from the other Taenia species.

Molecular Cloning and Characterization of a P38-Like Mitogen-Activated Protein Kinase from Echinococcus granulosus

  • Lu, Guodong;Li, Jing;Zhang, Chuanshan;Li, Liang;Bi, Xiaojuan;Li, Chaowang;Fan, Jinliang;Lu, Xiaomei;Vuitton, Dominique A.;Wen, Hao;Lin, Renyong
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제54권6호
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    • pp.759-768
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    • 2016
  • Cystic echinococcosis (CE) treatment urgently requires a novel drug. The p38 mitogen-activated protein kinases (MAPKs) are a family of Ser/Thr protein kinases, but still have to be characterized in Echinococcus granulosus. We identified a 1,107 bp cDNA encoding a 368 amino acid MAPK protein (Egp38) in E. granulosus. Egp38 exhibits 2 distinguishing features of p38-like kinases: a highly conserved T-X-Y motif and an activation loop segment. Structural homology modeling indicated a conserved structure among Egp38, EmMPK2, and H. sapiens $p38{\alpha}$, implying a common binding mechanism for the ligand domain and downstream signal transduction processing similar to that described for $p38{\alpha}$. Egp38 and its phosphorylated form are expressed in the E. granulosus larval stages vesicle and protoscolices during intermediate host infection of an intermediate host. Treatment of in vitro cultivated protoscolices with the p38-MAPK inhibitor ML3403 effectively suppressed Egp38 activity and led to significant protoscolices death within 5 days. Treatment of in vitro-cultivated protoscolices with $TGF-{\beta}1$ effectively induced Egp38 phosphorylation. In summary, the MAPK, Egp38, was identified in E. granulosus, as an anti-CE drug target and participates in the interplay between the host and E. granulosus via human $TGF-{\beta}1$.

Characterization of Caveola-Vesicle Complexes (CVCs) Protein, PHIST/CVC-8195 in Plasmodium vivax

  • Wang, Bo;Lu, Feng;Han, Jin-Hee;Lee, Seong-Kyun;Cheng, Yang;Nyunt, Myat Htut;Ha, Kwon-Soo;Hong, Seok-Ho;Park, Won Sun;Han, Eun-Taek
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제54권6호
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    • pp.725-732
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    • 2016
  • Plasmodium vivax produces numerous caveola-vesicle complex (CVC) structures beneath the membrane of infected erythrocytes. Recently, a member helical interspersed subtelomeric (PHIST) superfamily protein, $PcyPHIST/CVC-81_{95}$, was identified as CVCs-associated protein in Plasmodium cynomolgi and essential for survival of this parasite. Very little information has been documented to date about $PHIST/CVC-81_{95}$ protein in P. vivax. In this study, the recombinant $PvPHIST/CVC-81_{95}$ N and C termini were expressed, and immunoreactivity was assessed using confirmed vivax malaria patients sera by protein microarray. The subcellular localization of $PvPHIST/CVC-81_{95}$ N and C termini in blood stage parasites was also determined. The antigenicity of recombinant $PvPHIST/CVC-81_{95}$ N and C terminal proteins were analyzed by using serum samples from the Republic of Korea. The results showed that immunoreactivities to these proteins had 61% and 43% sensitivity and 96.9% and 93.8% specificity, respectively. The N terminal of $PvPHIST/CVC-81_{95}$ which contains transmembrane domain and export motif (PEXEL; RxLxE/Q/D) produced CVCs location throughout the erythrocytic-stage parasites. However, no fluorescence was detected with antibodies against C terminal fragment of $PvPHIST/CVC-81_{95}$. These results suggest that the $PvPHIST/CVC-81_{95}$ is localized on the CVCs and may be immunogenic in natural infection of P. vivax.

소 반추위 메타게놈에서 새로운 carboxylesterase 유전자 클로닝 및 유전산물의 특성 (Cloning and Characterization of a Novel Carboxylesterase Gene from Cow Rumen Metagenomic Library)

  • 아스라풀 이스람;김민근;아라디아;스리니 래디;김은진;김정호;김훈;윤한대
    • 생명과학회지
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    • 제20권9호
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    • pp.1306-1313
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    • 2010
  • 한우의 반추위에서 게놈 DNA를 분리하여 메타게놈 은행을 구축한 다음 carboxylesterase를 암호화하는 유전자를 클로닝 및 유전자를 선별하였다. 선별된 유전자의 DNA 염기서열 및 아미노산 서열을 분석하고 유전산물의 생화학적인 특성을 조사하였다. est1R 유전자는 2,465 bp로 366개의 아미노산 잔기를 가진 단백질을 암호화하였으며 이 단백질의 이론적인 분자량은 61,166 Da이었다. Est1R단백질은 PNB carboxylesterase (P37967), acetylcholinesterase (1EEAA) 및 chain A (1H23A)와 각각 5.9%, 6.1%, 6.1% 상동성을 가지고 있었다. 이러한 검색 결과 기존의 알려진 lipase 및esterase와의 상동성이 낮은 것으로 보아 새로운 그룹의 효소로 추정된다. Est1R효소의 최적 pH는 7.0 근방이었으며 최적 온도는 $40^{\circ}C$ 부근이었다. 한편 10% 유기용매를 함유한 기질의 효소활성측정에서 대조구에 비해 methanol은 95%의 상대적인 활성을 가진 반면에 hexane 용액에서는 그 활성이 반으로 감소하였다. 따라서 유기용매 농도의 작용성에 따라 이 효소의 산업적 이용성도 가능하리라 추정된다.

부산지역 호흡기감염증 환자로부터 분리한 아데노바이러스와 보카바이러스의 유행양상 분석 (Epidemiological Characterization of Adenovirus and Human Bocavirus Detected Acute Respiratory Patients in Busan)

  • 황수정;김남호;박동주;구평태;이미옥;진성현
    • 생명과학회지
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    • 제27권3호
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    • pp.275-282
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    • 2017
  • 부산지역 급성호흡기감염증으로 내원한 환자에서 호흡기바이러스 검사를 시행하여 아데노바이러스 및 보카바이러스의 특징적인 임상증상 및 유행양상을 알아보고자 하였다. 3,230명의 환자에서 총 1,485건(46.0%)의 호흡기바이러스가 검출되었고 이 중 아데노바이러스 257건(8.0%), 보카바이러스 68건(2.1%)을 확인하였다. 성별 발생양상은 남자가 여자보다 아데노바이러스, 보카바이러스로 인한 호흡기감염증에 취약하였으며, 모두 1~5세 연령군에서 높은 검출률을 보여 영 유아의 주요 감염요인임을 확인할 수 있었다. 주요 임상증상으로 아데노바이러스는 발열, 두통이 보카바이러스는 천명음이 통계적으로 유의하였다. 아형분석결과, 아데노바이러스는 1~6, 8형의 혈청형을 확인하였고 기존 분리주와 97% 이상의 상동성을 보였다. 연도별 유행 혈청형은 2011년 아데노바이러스 1형, 2012년 3형과 4형, 2013년에는 3형이 우점적으로 유행하였다. 아데노바이러스 3형의 경우, 대유행을 유발하는 아형으로 보인다. 보카바이러스는 모두 1형으로 나타났다.

Benzothiadiazole-benzodithiophene을 기반으로 한 D/A구조의 공액 고분자 합성 및 광전변환 효율 특성 개선 연구 (Synthesis and Characterization of Power Conversion Efficiency of D/A Structure Conjugated Polymer Based on Benzothiadiazole-Benzodithiophene)

  • 성기호;윤대희;우제완
    • 공업화학
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    • 제24권5호
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    • pp.537-543
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    • 2013
  • 본 연구에서는 유기박막태양전지로 적용 가능한 push-pull 구조의 고분자를 합성하여 그 특성을 확인하였다. 전자주개 물질로는 benzodithiophene 유도체를 도입하였고, 전자받개물질은 benzothiadiazole 유도체를 사용하여 Stille coupling 반응으로 poly{4,8-didodecyloxybenzo[1,2-b;3,4-b]dithiophene-alt-5,6-bis(octyloxy)-4,7-di(thiophen-2-yl)benzo[c][1,2,5]-thiadiazole} (PDBDT-TBTD)를 합성하였다. 각 합성 단계별 단량체의 확인은 $^1H-NMR$과 GC-MS를 통해 이루어졌으며, 합성된 conjugated polymer는 GPC, TGA, UV-Vis, cyclic voltammetry를 이용하여 물리적, 광학적 및 전기화학적 특성을 확인하였다. PDBDT-TBTD의 수평균 분자량은 6200이였으며, 초기 분해온도(5% weight loss temperature, $T_d$)값은 $323^{\circ}C$로 측정 되었다. 박막형태에서의 최대 흡수파장은 599 nm이며, 광학적 밴드갭(${E_g}^{opt}$)은 1.70 eV으로 확인되었다. 유기박막태양전지 소자는 ITO/PEDOT : PSS/PDBDT-TBTD : $PC_{71}BM/BaF_2/Ba/Al$ 구조로 제작하였으며, PDBDT-TBTD와 $PC_{71}BM$를 1 : 2 (w/w)의 비율로 블렌딩하여 광활성층으로 사용하였다. 제작된 소자는 solar simulator으로 광전변환효율을 확인하였고, 최대 광전변환효율은 2.1%이었다.

NF용 중공사 분리막의 발전 (Progress of Nanofiltration Hollow Fiber Membrane)

  • 장한나;김성중;이용택;이규호
    • 공업화학
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    • 제24권5호
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    • pp.456-470
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    • 2013
  • 중공사형 막은 지난 수십 년간 빠르게 성장하고 있는 새로운 기술의 하나이다. 또한, 고분자 소재를 이용한 분리막은 기체분리, 연료전지, 수처리, 폐수처리, 유기물 분리 등 여러 분야에서 주목 받고 있다. 그중에서도 액체분리용 역삼투(RO)와 한외여과(Ultrafiltration)막의 중간 특성을 갖는 나노여과(Nanofiltration)막은 상대적으로 역삼투 막에 비하여 낮은 투자비와 낮은 운전압력, 높은 투과 성능을 가지며 다가 음이온 염과 $200{\sim}1000gmol^{-1}$사이의 유기물에 대한 높은 제거율을 갖는 막이다. 본 논문에서는 NF 중공사 분리막의 소재, 제조 방법(상전이법과 계면중합법)에 따른 멤브레인의 구조 제어 및 다양한 특성 평가에 관한 연구동향을 살펴보고자 한다. 현재 대부분의 NF용 분리막은 평막형(plate and frame type)이나 나권형(spiral wound type)으로 제품화 되고 있는데, 중공사형(hollow-fiber type)의 제품화가 지연되고 있는 것은 기존 소재를 바탕으로 제조할 경우 강도면에서 안정적이지 못한 면이 있으므로 새로운 소재를 개발하거나 기존 소재의 개선이 필요할 것으로 보인다. 이러한 부분을 보완할 수 있을 만한 제조 기술이 확보된다면 중공사 형태의 나노여과막이 점차 나권형막을 대체하여 시장에서 높은 점유율을 나타낼 수 있을 것이다.

Penicillium sp. 유래 Inulinase의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of Inulinase from Penicillium sp.)

  • Seok-Yong Kim;Seok-Jong Suh;Seon-Hwa Ha;Seon-Kap Hwang;Joo-Hyun Nam;Dong-Sun Lee;Soon-Duck Hong;Jong-Guk Kim
    • 생명과학회지
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    • 제8권5호
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    • pp.614-621
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    • 1998
  • 열안정성 inulinase를 분비하는 Penicillium sp.를 돼지 감자 서식지의 토양으로부터 분리하여 이 균주의 inulinase를 50%-80% 염석, DEAE-Sephacel column chromatography, Toyopearl HW 65 F column chromatography에 의해 정제하여 inulinase 활성을 가진 단일 band를 얻었다. 이 band의 단백질을 polya-cryamide gel electrophoresis 후 추출하여 inulinase 활성을 가지는 것으로 확인되었다. 이 단백질의 분자량은 SDS-PAGE에 의해 약 77,000 dalton으로 추정되었고, 최종 정제도는 53.3배이었다. 정제된 효소의 효소학적 성질을 조사한 결과, 최적온도는 약 6$0^{\circ}C$이었고, 열 안정성은 30-5$0^{\circ}C$에서 비교적 안정하였다. pH 4에서 가장 높은 활성을 나타냈으며, pH 4-5에서는 비교적 안정했고 염기성에서는 아주 낮은 활성을 나타내었다. 금속이온과 다른 화학물질의 영향을 조사한 결과 1mM의 $MnCl_2$$CaCl_2$에 의해 활성이 증가했으며 특히, $MnCl_2$는 1.7배까지 활성을 증가시켰다. 그러나, 1mM의 $CuCl_2$,$HgCl_2$와 1mM EDTA 시에는 활성이 저해되었다. TLC분석결과 모든 산물이 monosaccharide였으므로 이 효소는 exo-acting inu-linase로 추정되었고, inulin에 대한 이 효소의 $K_M$치는 $2.2\times10^{-3}$이었다. 이 효소의 결정된 N-terminal 아미노산 배열은 $NH_2$-X-Glu-Tyr-Thr-Glu-Lys/Leu-Tyr-Arg-Pro이다.

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