• 제목/요약/키워드: Moderately halophile

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Genomic Analysis of the Moderately Haloalkaliphilic Bacterium Oceanobacillus kimchii Strain X50T with Improved High-Quality Draft Genome Sequences

  • Hyun, Dong-Wook;Whon, Tae Woong;Kim, Joon-Yong;Kim, Pil Soo;Shin, Na-Ri;Kim, Min-Soo;Bae, Jin-Woo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제25권12호
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    • pp.1971-1976
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    • 2015
  • Oceanobacillus kimchii is a member of the genus Oceanobacillus within the family Bacillaceae. Species of the Oceanobacillus possess moderate haloalkaliphilic features and originate from various alkali or salty environments. The haloalkaliphilic characteristics of Oceanobacillus advocate they may have possible uses in biotechnological and industrial applications, such as alkaline enzyme production and biodegradation. This study presents the draft genome sequence of O. kimchii X50T and its annotation. Furthermore, comparative genomic analysis of O. kimchii X50T was performed with two previously reported Oceanobacillus genome sequences. The 3,822,411 base-pair genome contains 3,792 protein-coding genes and 80 RNA genes with an average G+C content of 35.18 mol%. The strain carried 67 and 13 predicted genes annotated with transport system and osmoregulation, respectively, which support the tolerance phenotype of the strain in high-alkali and high-salt environments.

호염성 제균 Listeria denitrificans HB-38 균주의 분리 및 생리적 성질 (Isolation and Physiological Properties of a Moderately Halophilic Bacterium Listeria denitrificans HB-38)

  • 홍용기;서정훈
    • 한국수산과학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.68-74
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    • 1983
  • 부산 수영만의 조간대 저질에서 moderate halophile인 Listeria denitrificans HB-38을 분리하여 생육에 필요한 NaCl 요구도를 조사한바, 해양환경조건의 배지에서는 $4\%$ NaCl에서 육상환경조건의 배지에서는 $10\%$ NaCl에서 최적농도였으며, 균생육 최적 온도는 $40^{circ}C$였고, 생육최적 pH는 7.5이었다. 그리고 비호염성인 E.coli, KPM 105와 protoplast안정성을 비교해본 결과, 더 높은 stabilizer의 농도를 요구하지는 않았으며, stabilizer로서 NaCl이sorbitol이나 sucrose보다 protoplast에 더 안정성을 주는 것으로 나타났다. HB-38균주의 succinic dehydrogenase 활성에는 NaCl 농도가 증가함에 따라 그 활성 이 증가하다가 $9\%$에서 최대에 달하였다. 반면에 이 호염성효소의 $(NH_4)_2\;SO_4$와 NaCl에 의한 염석은 비호염성인 E.coli 및 bovine liver 세포의 경우보다 더 높은 농도의 염에 의하는 것은 아니였다. 그리고 ethidium bromide에 의한 curing과 agarose gel 전기영동의 결과 HB-38은 extrachromosomal DNA를 가지지 않는 것으로 나타났다.

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