• 유기물자원화
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• 제2권2호
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• pp.31-37
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• 1994

퇴비화 과정의 미생물학적 연구를 위해 퇴비화 재료인 유기성 폐기물에 많이 존재하는 고분자 물질의 분해에 관여하는 미생물들과 이들이 분비하는 효소들을 손쉽게 선별, 정량하는 방법을 개발하였고 아울러 혐기적 상태에서의 퇴비화 가능성을 탐색하는 연구의 일환으로 혐기적 분해의 최종적 역할을 하는 황산 환원 균의 퇴비화 과정에서의 분포를 알아보았다. 고분자 물질의 분해 측정법 개발에 사용된 기질은 각각 다당류 및 단백질 중에서 ${\beta}-glucan$, xylan, dextran, CMC(carboxymethylcellulose), casein, collagen 등을 재료로 사용하였고 이들을 가교제를 써서 불용화시키고 색소를 결합시켜 색소기질을 제조하였다. 제조된 기질을 이용하여 실제의 퇴비에서 고분자 분해 세균을 분리할 수 있었으며 기존의 효소 정량법에 비해 민감하게 효소 활성을 정량할 수 있었다. xylan과 ${\beta}-glucan$ 색소기질의 경우 고체 배지 상에서 고분자 분해 미생물을 선별할 때 기존의 Congo red 법과는 달리 미생물 집락에 손상을 입히지 않고도 손쉽게 사용할 수 있었다. 실험에 쓰인 오니에 포함되어 있는 황산 환원 세균은 lactic acid, propionic acid, butyric acid, formic acid 등의 유기산에 대해 높은 활성을 보여 주었고, acetic acid, valeric acid도 이용할 수 있었다.

• Journal of Microbiology
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• 제41권2호
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• pp.148-151
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• 2003

Waterborne parasite infections are considered a reemerging threat. Most studies on the epidemiology of human cryptosporidiosis, giardiasis, and amebiasis have been carried out in developed countries, and there is little data on the occurrence of these infections in other areas. The objective of this study was to investigate the presence of waterborne parasites such as Cryptosporidium parvum, Giardia lamblia and Entamoeba histolytica in various water samples in Ankara, turkey. A total of 85 samples were examined, 43 from the municipal water supply, 34 from wells, 6 from the Ankara River, and 2 from two untreated dams; by conventional microscopy, immunologically and by polymerase chain reaction (PCR). Oocysts of C. parvum and cysts of G. lamblia were detected by using an indirect fluorescence (antigen) assay, whereas an enzyme linked immunosorbent assay was used to detect the cysts of E. histolytica and E. dispar. In addition, PCR was used for E. histolytica, E. dispar, C. parvum and G. lamblia detection. G. lamblia was found in 2 of the 34 well water samples, and parasites were found in 3 of the 6 Ankara River samples. The 1$\^$st/ contained E. histolytica cysts and Strongyloides stercoralis larvae. the 2$\^$nd/ E. histolytica cysts, and Trichuris trichiura eggs, and the 3$\^$rd/ C. parvum oocysts only. No parasite was observed in the municipal water samples and untreated dam water samples. These results extend our knowledge on waterborne parasites, such occurrence information on waterborne pathogens assists the management and treatment of municipal water.

• 미생물학회지
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• 제36권2호
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• pp.84-90
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• 2000

Psudomonas sp. RY-1이 생성하는 extracellular depolymerase system을 이용하여 단위체의 결가지에 서로 다른 탄소 길이와 불포와기를 함유하는 medium-chain-length polyhdroxyalkanoates (MCL-PHAs)의 생분해도를 시럼실 조건에서 조사하였다. 생분애도는 평파내지에서의 clear zone 형성, 효소 처리에 의한 고분자 현탁액의 탁도 감소 및 호흡량의 경시적 변화로 측정하였다. Pseudomonas sp. RY-1은 MCL-PHA depolymerase의 생성을 통하여 조사된 모든 종류의 MCl-PHAs를 분해할 수 있었으나, 이 효소의 생성은 쉽게 이용될수 있는 이차기질에 의해 저해받는 것으로 나타났다. MCl-PHAs의 분해율이 단위체의 탄소수가 홀수개로 구성된 고분자에 비하여 보다 높았다. 곁가지에 분포화기를 함유한 MCl-PHAs는 불포화기를 갖지 아니하는 고분자에 비하여 분해가 빠르게 이루어졌으며, 이들의 분해는 고분자의 결정화도와 밀접한 관련이 있는 것으로 나타났다.

• 약학회지
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• 제4권1호
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• pp.50-52
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• 1959

In order to know contents of vitamin B$_{12}$ in the fermented foods in Korea, the contents of this vitamin are studied on the following foods; kimchies (pickled vegetables) .................. 39 chukkals (fermented and salted sea foods) ...... 8 fermented soy-bean products .................... 5 the kimchies and fermented soybean products studied in this paper, are from individual homes and chukkals are from markets. The content of vitamin B$_{12}$ is estimated by the microbiological assay method using lactobacillus leichmannii ATCC 7830. Details for assay are indicated in the original part of this paper. The pseudo-vitamin B$_{12}$ substances as thymidine which is active to the growth of lactobacillus leichmannii, are eliminated by the alkali treatment method of sample solution. According to the results as indicated in the table, the following conclusions are summerized; 1. Vitamin B$_{12}$ contents of kimchies for winter season are 1.03 to 1.52 mcg% in average. The hobakk-kimchi which contain the highest content of vitamin B$_{12}$ is not popular one among Korean. 2. Chukkals contain much higher content of vitamin B$_{12}$ varying from 0.91 to 11.10mcg%. 3. The soybean fermented foods, as kanjang, denjang, kochojang, contain lower content of vitamine B$_{12}$ varying from 0.08 to 0.52 mcg% containing higher content of pseudo-vitamin. 4. Based on daily consumption of kimchi in winter season by Chai, the consumption of this vitamin through kimchi is about 3 mcgs daily per capita. This will be a quite source of this vitamin for Korean as vitamin C. as vitamin C.

• 약학회지
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• 제4권1호
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• pp.53-55
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• 1959

본 실험에 있어서는 우리가 일상 제일 많이 먹고 있는 발효식품의 1종이고 본보 제8보에 보고한 바와 같이 Vitamin $B_{12}$의 중요한 자원이 되고 있는 침채류가 그 발효기간중 Vitamin $B_{12}$의 함량에 대하여 어떠한 변화를 하고있으며 침채류발효에 있어서 발효에 관여하는 미생물에 의하여 Vitamin $B_{12}$가 새로 생성되는가 혹은 되지않는가를 알기 위하여 본 실험에 착수한 것이다. 그럼으로 본보고에 있어서는 보통방법으로 김치를 담그고 또한 김치를 멸균한 재료로서 무균조작으로 담그므로서 발효를 억제하면 Vitamin $B_{12}$ 함량은 별로 변화하지 않을 것이라고 추상하며 멸균김치를 따로 담거서 이 두 김치의 액부에 대하여 그 발효기간중 Vitamin $B_{12}$의 량적 변화를 조사하여 그 성적을 비교검토하고 이에 보고하는 바이다.

• Journal of Microbiology
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• 제42권2호
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• pp.117-125
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• 2004

Propionibacterium acnes (P. acnes) plays an important role in the disease pathogenesis of acne vulgaris, a disorder of pilosebaceous follicles, seen primarily in the adolescent age group. In the present study, the presence of antibodies against P. acnes (MTCC1951) were detected in acne patient (n=50) and disease free controls (n=25) using dot-ELISA and Western blot assay. The ability of P. acnes to induce pro-inflammatory cytokines by human peripheral blood mononuclear cells (PBMCs), obtained from acne patients and healthy subjects, were also analysed. The patients (n=26) who were culture positive for skin swab culture, were found to have a more advanced disease and higher antibody titres (1:4000 to >1:16000) compared to the P. acnes negative patients (n=24) and normal controls (n=25). An analysis of patients' sera by western blot assay recognized a number of antigenic components of P. acnes, rang-ing from 29 to 205 kDa. The major reactive component was an approximately 96 kDa polypeptide, which was recognised in 92％ (24 of 26) of the patients sera. Further, the P. acnes culture supernatant, crude cell lysate and heat killed P. acnes whole cells, obtained from 72-h incubation culture, were observed to be able to induce significant amounts of IL-8 and tumor necrosis factor alpha (TNF-${\alpha}$) by the PBMCs in both the healthy subjects and patients, as analysed by cytokine-ELISA. The levels of cytokines were significantly higher in the patients than the healthy subjects. A major 96 kDa polypep-tide reactant was eluted from the gel and was found to cause dose dependent stimulation of the pro-ductions of IL-8 and TNF-${\alpha}$. Thus, the above results suggest that both humoral and pro-inflammatory responses play major roles in the pathogenesis of acne.

• 미생물학회지
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• 제44권4호
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• pp.346-351
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• 2008

본 연구에서는 임신진단등의 간편 현장진단(point of care test, POCT)에 주로 사용되고 있는 멤브레인 측면흐름 분석기법을 사용하여 인유두종 바이러스(Human papillomavirus, HPV)의 특정 서열을 검출할 수 있는 DNA array를 개발하였다. HPV type 6, 11, 16, 18, 31, 45에 특이적인 DNA 탐침들을 측면흐름 분석용 멤브레인 표면에 고정하고, biotin이 label된 MY09/11 primer를 사용하여 얻어진 HPV PCR 반응 결과물과 탐침 사이에 hybridization 반응을 유도하였다. 이후 streptavidin이 label된 colloidal gold가 교잡물의 biotin과 반응함으로써 DNA hybridization 결과를 육안으로 확인할 수 있었다. 본 연구를 통해 개발된 HPV DNA lateral flow membrane array는 기존의 HPV DNA chip 기법과 비교하여 경제적이고 편리하게 주요 HPV type을 확인할 수 있음을 보여주었다.

• 미생물학회지
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• 제36권3호
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• pp.236-241
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• 2000

효모 Saccharomyces cerevisiae를 숙주 세포로 이용하여 활성형의 항균펩티드를 생산하기 위한 model system으로서 쉬파리 유래 defensin의 합성 유전자를 GAP promoter, mating factor $\alpha$1 (MF$\alpha$1)의 preprosequence 및 GAL7 transcription terminator의 조절하에 있는 재조합 plasmid pGMD18을 제작한 후 Saccharomyces cerevisiae에 형질전환하여 growth inhibtion zone assay를 통해 항균활성을 보유한 재조합 효모를 선별하였다. 재조합 효모의 성장 속도와 defensin의 분비능을 증가시키기 위하여 최적의 배지 조성과 배양조건을 결정하였다. 재조합 효모의 defensin 생산을 위한 최적 배양조건을 조사한 결과 0.4% yeast extract, 유기질소원 2% corn steep liquor, 탄소원 2.5% glucose, 0.05% $C_2CO_3$를 포함한 배지에서 초기 pH3 그리고 배양온도 $28^{\circ}C$의 경우가 세포성장과 defensin 의 항균활성이 가장 우수하였다. 이 조건으로 배양을 수행한 결과 YPD 배지에서 배양한 조건보다 약 2배의 세포 성장과 약 4배의 defenzin 생산을 확인하였다.

• 미생물학회지
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• 제55권1호
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• pp.46-51
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• 2019

이 연구에서는 유칼립투스, 유카와 차나무의 ethanol 추출물의 수지를 이용한 분획 혼합물에 대한 항균활성을 평가하였는데 여러 인간 피부 상재균에 낮은 최소저해농도(0.24~3.32 mg/ml)를 나타내었고 항생제 triclosan과 ampicillin보다 우수한 활성을 나타내었다. Time kill assay에서 식물 추출분획 혼합물은 4시간 이내에 미생물 균주의 개체수를 92% 이상 감소시켰고, 모든 미생물 균주의 뉴클레오티드를 상당량 유출시켰으며, 항균 효과는 이가 양이온($Mg^{2+}$과 $Ca^{2+}$)에 영향을 받지 않았다. 이러한 결과는 Eucalyptus sp., Yucca sp., 및 tea tree의 ethanol 추출물의 수지분획 혼합물이 중요한 인간 피부 상재균을 억제하는 효율적인 화장품 방부제로 이용될 수 있음을 시사한다.

• 미생물학회지
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• 제55권3호
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• pp.199-205
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• 2019

Yeast two-hybrid는 특정 단백질에 대한 상호작용 파트너 단백질의 선별을 위한 방법으로 개발되었다. 하지만 대규모 단백질 상호작용체 분석을 수행하기에 요구되는 노동과 대량의 한천배지 사용에 따른 문제에 의해 널리 사용되지 못하고 있다. 따라서 본 연구에서는 새로운 리포터 시스템을 yeast two-hybrid 방법에 도입하여 fluorescence-activated cell sorting (FACS) 또는 magnetic-activated cell sorting (MACS)를 이용하여 상호작용 파트너 단백질을 포함하는 효모 클론을 손쉽게 선별할 수 있도록 하였다. 새로운 리포터 시스템은 c-myc 항원 결정기가 총 10번 반복되는 형태로 효모 표면에 발현되도록 하였으며, p53과 SV40 T항원을 이용한 실험을 통하여 리포터 단백질의 정상적인 발현을 flow cytometry 분석을 통하여 확인하였다. 따라서, 새로운 리포터 시스템을 도입한 yeast two-hybrid 방법은 대규모 상호작용체 분석을 위해 필요한 노력을 현저히 줄일 수 있을 것으로 기대한다.