• 제목/요약/키워드: Marker-Density Function

검색결과 20건 처리시간 0.027초

자유표면 유동 시뮬레이션을 위한 고정확도 수치도식의 검토 (Study on High Accurate Schemes for Simulation of Free-surface Flow)

  • 박종천;이병혁;김정후
    • 한국해양공학회지
    • /
    • 제20권4호
    • /
    • pp.31-36
    • /
    • 2006
  • Numerical schemes for spacing and time are tested to accurately simulate the wave propagation. The tested numerical schemesinclude 2nd-order central differencing, l-order upwind scheme, 2nd-order Leith scheme, 3rd-order MUSCLE, QUICK and QUICKEST schemes in spacing and the Euler and 4th-order Runge-Kutta(R-K) schemes in time. It is seen that more accurate results are expected when the higher-order schemes, especially the schemes combined with a TVD control limiter, are used for solving the wave equation. The 3rd-order upwind scheme with limiter and the 4th-order R-K scheme in tim£ are finally applied to the wave-making simulation in a digital wave tank.

비알코올성지방간의 유관 인자 임상 연구: 종양표지자, 심박변이도, 사상체질 (Clinical Study on Nonalcoholic Fatty Liver Disease Related Factors: Tumor Marker, Heart Rate Variability, Sasang Constitution)

  • 곽시라;신뢰;박수정;권영미;주종천
    • 사상체질의학회지
    • /
    • 제31권2호
    • /
    • pp.22-30
    • /
    • 2019
  • Objectives The aim of this study is to investigate the related factors of nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD). Methods The subjects were 187 persons diagnosed as fatty liver by abdominal ultrasonography. They were divided into three groups according to the severity of fatty liver: control, mild, moderate or severe. The three groups' general characteristics, laboratory results, liver function indexes, metabolic syndrome indexes, tumor markers, heart rate variability values and Sasang constitution distribution were compared and analyzed. Results Male ratio, height, weight, body mass index, red blood cell count, hemoglobin level and creatinine level were higher in NAFLD groups than in control group. The levels of sodium and amylase were higher in control than in NAFLD. In liver function, the levels of aspartate transaminase, alanine transaminase and gamma-glutamyl transpepsidase of NAFLD were higher. In metabolic syndrome index, systolic blood pressure, diastolic blood pressure, waist circumference, total cholesterol, triglyceride and low density lipoprotein cholesterol levels were higher in NAFLD, while high density lipoprotein cholesterol level was higher in control. The alpha-feto protein level was higher in NAFLD, and the heart rate variability was not different between NAFLD and control groups. In Sasang constitution, Taeeumin ratio of NAFLD was higher than of control. Conclusions The results suggest that nonalcoholic fatty liver is clinically related to liver dysfunction, metabolic syndrome, tumor markers, and Sasang constitution. Further studies are needed to control nonalcoholic fatty liver disease and prevent severe disease such as cirrhosis and cancer caused by fatty liver.

복잡한 해면효과익선 계산 모형 주위의 3차원 유동장의 수치계산 (Three-Dimensional Flow Simulations around a Numerical Model of Wing-In-Ground(WIG) Effect Ship having the complex geometry)

  • 박종천;신명수
    • 한국전산유체공학회:학술대회논문집
    • /
    • 한국전산유체공학회 1996년도 춘계 학술대회논문집
    • /
    • pp.85-92
    • /
    • 1996
  • Numerical simulations are made for the three-dimensional flow around a wing in ground effect craft haying the complex geometry. A numerical tool is developed for the primary design of hull and wing shape of practical Wing-In-Ground effect(WIG) stop. The finite-difference method is utilized to descretize the governing equations and pressure field is obtained by using Marker-And-Cell(MAC) method. The air and water flows are simultaneously simulated in the time-marching solution procedure for the Navier-Stokes equation. The porosity technique and the density function are devised for the implementation of the three-dimensional body-boundary and the free-surface conditions, respectively. In this paper, a craft is modeled simply by three blocks containing a wing mounted on a main body horizontally, with the endplate. The numerical calculations of a WIG advancing in a calm water are performed and the WIG-generated wave profiles are also obtained. In the final paper, details of the numerical methods employed for the present study and calculated results are discussed.

  • PDF

Can denosumab be a substitute, competitor, or complement to bisphosphonates?

  • Kim, Su Young;Ok, Hwoe Gyeong;Birkenmaier, Christof;Kim, Kyung Hoon
    • The Korean Journal of Pain
    • /
    • 제30권2호
    • /
    • pp.86-92
    • /
    • 2017
  • Osteoblasts, originating from mesenchymal cells, make the receptor activator of the nuclear factor kappa B ligand (RANKL) and osteoprotegerin (OPG) in order to control differentiation of activated osteoclasts, originating from hematopoietic stem cells. When the RANKL binds to the RANK of the pre-osteoclasts or mature osteoclasts, bone resorption increases. On the contrary, when OPG binds to the RANK, bone resorption decreases. Denosumab (AMG 162), like OPG (a decoy receptor), binds to the RANKL, and reduces binding between the RANK and the RANKL resulting in inhibition of osteoclastogenesis and reduction of bone resorption. Bisphosphonates (BPs), which bind to the bone mineral and occupy the site of resorption performed by activated osteoclasts, are still the drugs of choice to prevent and treat osteoporosis. The merits of denosumab are reversibility targeting the RANKL, lack of adverse gastrointestinal events, improved adherence due to convenient biannual subcutaneous administration, and potential use with impaired renal function. The known adverse reactions are musculoskeletal pain, increased infections with adverse dermatologic reactions, osteonecrosis of the jaw, hypersensitivity reaction, and hypocalcemia. Treatment with 60 mg of denosumab reduces the bone resorption marker, serum type 1 C-telopeptide, by 3 days, with maximum reduction occurring by 1 month. The mean time to maximum denosumab concentration is 10 days with a mean half-life of 25.4 days. In conclusion, the convenient biannual subcutaneous administration of 60 mg of denosumab can be considered as a first-line treatment for osteoporosis in cases of low compliance with BPs due to gastrointestinal trouble and impaired renal function.

Theracurmin Ameliorates Cognitive Dysfunctions in 5XFAD Mice by Improving Synaptic Function and Mitigating Oxidative Stress

  • Kim, Jihyun;Kim, Jaehoon;Huang, Zhouchi;Goo, Nayeon;Bae, Ho Jung;Jeong, Yongwoo;Park, Ho Jae;Cai, Mudan;Cho, Kyungnam;Jung, Seo Yun;Bae, Soo Kyung;Ryu, Jong Hoon
    • Biomolecules & Therapeutics
    • /
    • 제27권3호
    • /
    • pp.327-335
    • /
    • 2019
  • As the elderly population is increasing, Alzheimer's disease (AD) has become a global issue and many clinical trials have been conducted to evaluate treatments for AD. As these clinical trials have been conducted and have failed, the development of new theraphies for AD with fewer adverse effects remains a challenge. In this study, we examined the effects of Theracurmin on cognitive decline using 5XFAD mice, an AD mouse model. Theracurmin is more bioavailable form of curcumin, generated with submicron colloidal dispersion. Mice were treated with Theracurmin (100, 300 and 1,000 mg/kg) for 12 weeks and were subjected to the novel object recognition test and the Barnes maze test. Theracurmin-treated mice showed significant amelioration in recognition and spatial memories compared those of the vehicle-treated controls. In addition, the antioxidant activities of Theracurmin were investigated by measuring the superoxide dismutase (SOD) activity, malondialdehyde (MDA) and glutathione (GSH) levels. The increased MDA level and decreased SOD and GSH levels in the vehicle-treated 5XFAD mice were significantly reversed by the administration of Theracurmin. Moreover, we observed that Theracurmin administration elevated the expression levels of synaptic components, including synaptophysin and post synaptic density protein 95, and decreased the expression levels of ionized calcium-binding adapter molecule 1 (Iba-1), a marker of activated microglia. These results suggest that Theracurmin ameliorates cognitive function by increasing the expression of synaptic components and by preventing neuronal cell damage from oxidative stress or from the activation of microglia. Thus, Theracurmin would be useful for treating the cognitive dysfunctions observed in AD.

Brassica A genome의 최근 연구 동향 (Current status of Brassica A genome analysis)

  • 최수련;권수진
    • Journal of Plant Biotechnology
    • /
    • 제39권1호
    • /
    • pp.33-48
    • /
    • 2012
  • 작물의 구조와 기능을 이해하려는 과학적 탐구심과 이를 작물 육종에 적용하려는 실험적 노력의 일환으로 다양한 작물에서 유전자 지도가 개발되었다. 특히, 배추과 작물의 경우 모델식물인 애기장대의 유전체 정보가 공개된 이후 다양한 정보 (염기서열 정보, 유전자 구조 및 기능정보 등)의 이용이 가능해져 유전자 지도 작성이 가속화 되었으며 이는 최근 $B.$ $rapa$ A genome (배추)유전체 해독이라는 결과를 가져왔다. 배추과 작물의 유전자 지도 작성에 있어서 초기에는 RFLP 마커들이 사용되었으나 이후 분자마커, 즉, RAPD, AFLP, SSR 등과 같이 비교적 사용이 간단하고 시간적 제약이 없는 PCR 마커의 형태로 점차 바뀌었다. 배추과 작물의 경제적, 학문적 가치가 고려되어 $B.$ $rapa$ (배추)를 표준재료로 A genome 유전체 염기서열 해독이라는 목표로 다국적 유전체 프로젝트가 결성되었고 2011년 국내연구진이 주도적으로 참여한 국제 컨소시엄 (BrGSPC, $B.$ $rapa$ Genome Sequencing Project Consortium)에 의해 배추 (10개 염색체)의 유전자 영역(gene space), 약 98% (83.8 Mb)의 염기서열이 해독되어 발표되었다. 유전체 해독 과정에서 축적된 염기서열 정보는 대량의 SSR, SNP, IBP 마커의 개발을 가능하게 하였고 이들 마커는 $B.$ $rapa$ A genome 유전자 지도와 물리 지도 작성에 이용되어 이후 배추과 작물연구 전반에 널리 적용되고 있다. 대량의 분자마커 개발은 유전자 지도 작성을 가속화하여 더욱 정밀한 유전자 지도를 가능하게 하였고 공통의 분자마커 정보는 애기장대와 배추과 작물 간 비교유전체 연구를 통해 농업적 우수 형질의 클로닝, 마커도움선발 (MAS)등의 방법으로 분자육종의 기반을 제공하고 있다. 뿐만 아니라. 최근 등장한 NGS 유전체 해독 기술로 생산된 대량의 정보는 분자육종 실현 가능성을 높여 분자육종 실용화에 박차를 가하는 계기가 되고 있다. 본 논문에서는 $B.$ $rapa$에서 분자마커를 이용한 유전자 지도 개발의 과정과 농업적 유용형질 탐색을 위한 양적 형질 유전자좌 (QTLs)의 연구 현황에 대하여 알아보고 유전체연구에서 유전자 지도의 중요성과 육종에의 응용에 대하여 서술하였다. 또한 다양한 유전체 정보와 오믹스 정보를 국내 배추과 분자육종에 효율적으로 활용하여 분자육종 실용화를 가능하게 하기 위해 사용자가 쉽게 사용할 수 있는 데이터베이스를 구축함으로서 연구자와 육종가 간의 간격을 좁히고 원활한 정보교환의 필요성을 제기하였다.

감귤 유전체 연구 동향 및 전망 (Current status and prospects of citrus genomics)

  • 김호방;임상현;김재준;박영철;윤수현;송관정
    • Journal of Plant Biotechnology
    • /
    • 제42권4호
    • /
    • pp.326-335
    • /
    • 2015
  • 감귤은 전 세계적으로 가장 많이 생산되는 주요 과수작물이고 비타민 C와 구연산 및 감귤 고유의 플라보노이드를 비롯한 다양한 기능성 성분으로 인해 건강 기능성 식품 소재로도 각광받고 있다. 그러나 긴 유년기와 배우체 불임, 주심배 발생 및 고도의 유전적 잡종성 등 감귤 특유의 생식생물학적 특성으로 인해 교배를 통한 전통 육종의 품종개발에 있어서는 가장 어려운 작물에 속한다. 지구 온난화, 소비자 욕구 변화 등으로 인해 고품질 감귤의 안정적 생산과 품종 다양화를 위한 체계적 육종 프로그램의 도입이 시급한 실정이다. 감귤에서도 분자 육종 프로그램을 통한 품종 육성을 위해 세계적으로 가장 많이 재배되는 스위트 오렌지와 클레멘타인 만다린에 대한 고품질 표준 유전체 정보가 최근에 확보되었다. 표준유전체 서열을 기반으로 다양한 품종 및 교배집단들에 대한 유전체 해독, 비교유전체 분석, GBS 등을 통해 형질연관 마커 발굴, 유전자 기능 연구 등이 이루어질 것으로 전망된다. 아울러 다양한 전사체 분석이 이루어지고 있으며, 유전자 기능 및 유전자 co-expression 네트워크의 이해를 증진할 수 있을 것이다. 유전체 및 전사체 분석을 통해 확보한 대규모 SNP, InDel 및 SSR의 다형성 분자마커 big data를 이용한 고밀도 연관 및 물리 지도 작성이 이루어지고 있고, 궁극적으로 통합지도 작성이 이루어지게 될 것이다. 이를 통해 가까운 장래에 감귤 특이 주요 농업형질 연관 유전자의 정확도 높은 map-based 클로닝 및 빠르고 효율적인 분자표지 선발육종이 이루어질 것이다.

비만 쥐(ob/ob mouse)의 간 세포막과 핵에 있는 $T_{3}$ 수용체의 결합능력에 관한 연구 (Liver Plasma Membrane and Nuclear $T_{3}$ Receptor Binding in the Obese (ob/ob) Mouse)

  • 김경아
    • Journal of Nutrition and Health
    • /
    • 제24권4호
    • /
    • pp.356-365
    • /
    • 1991
  • 유전에 의해 비만증을 타고나는 비만쥐 (ob/ob mouse)의 간으로 부터 유리된 세포막과 핵의 $L-triiodothyronine(T_3)$ 결합 능력이 그들과 한 배에서 태어난 정상 체중의 쥐들의 것들과 비교되었다. 세포막이 hypotonic 용액과 discontinuous sucrose density를 사용하여 원심분리기로 분리되었으며, 세포 각 부분의 marker enzyme들의 activity로 세포막의 순도가 측정되었다. 핵은 $Triton{\times}100$를 사용하여 윈심분리기로 얻어졌다. $T_3$ 수용체의 Bmax(최대결합용량)와 Kd(dissociation constant)가 세포막 혹은 핵을 여러 농도의 $^{125}I-T_3$와 함께 일정시간 incubation 시킨 후, 그 binding이 reverse Scatchard analysis에 의하여 계산하여 얻어졌다. 모든 실험과정은 비만쥐와 정상쥐에 대하여 평행으로 진행되었다. 간 핵의 $T_3$ 수용체의 최대결함용량은 비만쥐가 정상 체증의 쥐 보다 유의적으로 적었으나(p<0.001), $T_3$에 대한 친화력에는 차이가 없었다. 이는 이전의 보고들의 결과를 확인해 주는 것이다. 세포막에 있는 $T_3$ 수용체의 최대결합 능력과 친화력은 비만쥐와 정상쥐 간에 유의적인 차이가 없는 것으로 밝혀졌다. 이는 비만쥐의 세포막에 있는 $T_3$수용체의 기능에는 결함이 없음을 나타내며, 비만쥐의 말초조직에서 손상된 갑상선 홀몬의 작용은 세포막 수용체에 결합한 이후에 일어나는 과정에 원인이 있다는 것을 의미하고, 따라서 핵에 있는 $T_3$수용체의 결함이 비만쥐 (ob/ob mouse)의 비만증의 근본적인 원인일 수 있다는 제안을 뒷받침하여 주고 있다.

  • PDF

Aged garlic extract enhances exercise-mediated improvement of metabolic parameters in high fat diet-induced obese rats

  • Seo, Dae Yun;Lee, SungRyul;Figueroa, Arturo;Kwak, Yi Sub;Kim, Nari;Rhee, Byoung Doo;Ko, Kyung Soo;Bang, Hyun Seok;Baek, Yeong Ho;Han, Jin
    • Nutrition Research and Practice
    • /
    • 제6권6호
    • /
    • pp.513-519
    • /
    • 2012
  • Aged garlic extract (AGE) is known to have a protective effect against immune system, endothelial function, oxidative stress and inflammation. We examined the effects of exercise with and without aged garlic extract administration on body weight, lipid profiles, inflammatory cytokines, and oxidative stress marker in high-fat diet (HFD)-induced obese rats. Forty-five Sprague-Dawley rats were fed either a HFD (HFD, n = 40) or a normal diet (ND, n = 5) for 6 weeks and thereafter randomized into ND (n = 5), HFD (n = 10), HFD with AGE (n = 10), HFD with Exercise (n = 10), or HFD with Exercise+AGE (n = 10) for 4 weeks. AGE groups were administered at a dose of 2.86 g/kg body weight, orally. Exercise consisted of running 15-60 min 5 days/week with gradually increasing intensity. AGE (P<0.01), Exercise, and Exercise+AGE (P<0.001) attenuated body weight gain and food efficiency ratio compared to HFD. Visceral fat and liver weight gain were attenuated (P<0.05) with all three interventions with a greater effect on visceral fat in the Exercise+AGE than AGE (P<0.001). In reducing visceral fat (P<0.001), epididymal fat (P<0.01) and liver weight (P<0.001), Exercise+AGE was effective, but exercise showed a stronger suppressive effect than AGE. Exercise+AGE showed further additive effects on reducing visceral fat and liver weight (P<0.001). AGE significantly attenuated the increase in total cholesterol and low-density lipoprotein-cholesterol compared with HFD (P<0.05). Exercise+AGE attenuated the increase in triglycerides compared with HFD (P<0.05). Exercise group significantly decrease in C-reactive protein (P<0.001). These results suggest that AGE supplementation and exercise alone have anti-obesity, cholesterol lowering, and anti-inflammatory effects, but the combined intervention is more effective in reducing weight gain and triglycerides levels than either intervention alone.

비치매 노인 우울증 환자에서 대뇌 아밀로이드 병리 예측을 위한 정량화 뇌파 지표: 예비연구 (Quantitative Electroencephalogram Markers for Predicting Cerebral Amyloid Pathology in Non-Demented Older Individuals With Depression: A Preliminary Study)

  • 박선영;채수현;박진식;이동영;박지은
    • 수면정신생리
    • /
    • 제28권2호
    • /
    • pp.78-85
    • /
    • 2021
  • 목 적 : 노년기 우울증 환자에서 우울증상이 알츠하이머병의 전구 증상으로 나타났는지를 감별하는 것은 중요한 임상적 과제이다. 본 연구에서는 정량화 뇌파(quantitative EEG) 지표가 노년기 우울증 환자의 알츠하이머병 병리를 예측할 수 있는 바이오마커로 기능할 수 있는지 확인하고자 하였다. 방 법 : 치매로 진단 받지 않은 55세 이상의 우울증 환자 63명이 본 연구에 포함되었다(여성 76.2%; 평균 연령 ± 표준편차 73.7 ± 6.87세). 연구 대상자들은 [18F] florbetabenPET 결과에 따라 아밀로이드 양성(Aβ+, n = 32)과 음성으로(Aβ-, n = 31) 분류하였다. 뇌파는 7분 간의 눈을 감은 상태(eye-closed, EC)와 3분 간의 눈을 뜬 상태(eye-open, EO)로 촬영하였으며, 푸리에 변환(Fourier transform)을 이용하여 스펙트럼 분석을 시행하였다. 선행연구 결과에 따라 안구 개폐 알파파 반응성 지표(EC-to-EO alpha reactivity index)가 노년기 우울증 환자의 아밀로이드 침착을 예측할 수 있는 신경생리학적 마커가 될 수 있는지 검증하였다. 알파 밴드 파워에서 아밀로이드 침착 여부(Aβ+ vs. Aβ-), 안구 개폐 조건(EC vs. EO), 지형학적 요인(laterality, polarity) 간의 상호작용을 확인하고 사후 분석을 시행하였다. 결 과 : Aβ+군과 Aβ-군에서 각 주파수 밴드의 평균 파워 스펙트럼 밀도 중 EO phase의 알파 밴드 파워에서만 유의미한 차이가 관찰되었다(F = 6.258, p = 0.015). 알파 밴드에서의 Group (Aβ+ vs. Aβ-) × Condition (EC vs. EO) × Laterality (Left, midline, or right) 3-way interaction이 연령, 성별, 교육 연수, 전반적 인지 기능, 약물 사용, MRI상 백질 고신호강도를 보정한 뒤에도 유의하였다(F = 3.720, p = 0.030). 하지만 대뇌 관심영역 별로 아밀로이드 침착에 따른 알파파 반응성을 비교한 사후 분석에서는 유의한 수준의 차이가 관찰되지 않았다. 결 론 : 노년기 우울증 환자에서 EO phase의 알파 밴드 파워 증가가 대뇌 아밀로이드 침착과 관련이 있었다. 하지만 본 연구에서 검증하고자 했던 안구개폐 알파파 반응성 지표는 알츠하이머병 병리를 예측하지는 못했다. 보다 많은 대상자를 포함한 추후 연구로 해당 결과를 재검증할 필요가 있다.