• 제목/요약/키워드: Marker enzyme

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A Molecular Marker Specific to Metarhizium anisopliae var. majus

  • YOON, CHEOL-SIK;GI HO SUNG;JAE MO SUNG;JAEANG OON LEE
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제9권3호
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    • pp.334-339
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    • 1999
  • More innovative molecular markers were investigated for rapid and consistent differentiation of Metarhizium anisopliae var. majus from M. anisopliae var. anisopliae. A total of 28 isolates were obtained from various countries and hosts: 13 isolates of M. anisopliae var. anisopliae, 12 isolates of M. anisopliae var. majus, and 3 isolates of M. anisopliae collected in Korea. This study involved restriction enzyme digestions of a PCR product amplified from nuclear internally transcribed spacer (ITS) and a portion of the 28S rDNA regions. Among 11 different restriction enzymes used in this study, MboⅠ digestion particularly produced a restriction pattern that had characteristics of M. anisopliae var. majus. This restriction pattern was consistent in all isolates of M. anisopliae var. majus regardless of their geographic origins and insect hosts. Mapping experiments revealed that MboⅠ sites of M. anisopliae var. majus are identical to those of M. anisopliae var. anisopliae with an exception for the presence of an additional site in the PCR product. Results from this study provide an additional method for identification and differentiation of isolates of these two varieties of M. anisopliae for use in the field and laboratory experiments.

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Induction of Quinone Reductase and Glutathione S-Transferase in Murine Hepatoma Cells by Flavonoid Glycosides

  • Kim, Jung-Hyun;Lee, Jeong-Soon;Kim, Young-Chan;Chung, Shin-Kyo;Kwon, Chong-Suk;Kim, Young-Kyoon;Kim, Jong-Sang
    • Preventive Nutrition and Food Science
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    • 제8권4호
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    • pp.365-371
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    • 2003
  • The potential of seven flavonoid glycosides to induce quinone reductase (QR), an anticarcinogenic marker enzyme, in murine hepatoma cells (hepalc1c7) and its mutant cells (BPRc1) was evaluated. Among test compounds, kaempferol-3-O-glucoside, luteolin-6-c-glucoside, and quercetin-3-O-glucoside (Q-3-G) induced QR in hepalc1c7 cells in a dose-dependent manner. However, in BPRc1 cells lacking arylhydrocarbon receptor nuclear translocator (ARNT), only Q-3-G caused a significant induction of quinone reductase at the concentration range of 0.5 to 8 ug/mL, suggesting that it is a monofunctional inducer. Q-3-G induced not only phase 2 enzymes, including QR and glutathione-S-transferase, but also nitroblue tetrazolium reduction activity in HL-60 cells, a biochemical marker for cell differentiation promoting agents. In conclusion, Q-3-G merits further study to evaluate its cancer chemopreventive potential.

CAPS 마커를 이용한 국내 개발 양송이 품종 구분 (Discrimination of Korean Agaricus bisporus cultivars using CAPS markers)

  • 이화용;안혜진;오연이;장갑열;정종욱
    • 한국버섯학회지
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    • 제19권4호
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    • pp.336-340
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    • 2021
  • 본 연구에서는 국내에서 개발된 국내에서 개발된 10개의 양송이 품종을 CAPS 마커를 이용하여 구분하였다. An 등(2021)이 개발한 CAPS 마커 AB-gCAPs-017, AB-gCAPs-047, AB-gCAPs-055, AB-gCAPs-071을 이용하여 새아, 새도, 새한, 새연, 새정, 도담, 설강, 다향, 호감, 하담을 구분할 수 있었다. 본 연구의 결과는 국내 개발 양송이 품종에 대하여 품종간의 구별성과 유전적 다양성을 부여하여 품종보호에 대한 분자생물학적 근거를 마련하였다.

벼 배발생 세포의 특성과 배발생 관련 유전자의 분이 - 배발생 세포에 관련된 동이효소 특성 - (Characterization and Cloning of Genes Related to Embryogenic Cells in Rice - Characterization of Isozymes Related to Embryogenic Cells -)

  • 정병균;백윤웅;고경민;남백희;황백
    • Journal of Plant Biology
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    • 제38권1호
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    • pp.55-62
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    • 1995
  • 벼(Oryza sativa L. cv. Kye Hwa) 성숙종자에서 유도한 배발생 세포(embryogenic cell, EC)의 동위효소 발현양상과 효소활성을 조사하였다. 배발생 캘러스로부터 확립된 EC 현탁배양은 세포가 둥글며 세포질이 충만한 세포들로 이루어졌으나 비배발생 세포(nonembryogenic cell, NEC)의 현탁배양은 크게 신장한 액포화된 세포들로 구성되었다. 이러한 EC와 NEC의 peroxidase, esterase, acid phosphatase 그리고 malate dehydrogenase의 동위효소 양상과 활성도를 분석한 결과 밴드의 수와 특이성 그리고 밴드 활성 등에 현저한 차이를 보여주었으며 또한 이들 동위효소의 효소 활성도 측정 결과 EC에서 훨씬 더 높게 나타났다. NEC에는 나타나지 않은 EC의 특이 밴드와 강한 밴드 활성 그리고 높은 효소 활성 등은 EC의 형태적, 분화능과의 관련성을 내포하고 있다. 이러한 결과들은 이들 효소의 특이 밴드들이 벼에서 EC의 생화학적 표지자로서 사용될 수 있음을 내포하고 있다.

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AFLP 마커를 이용한 국내수집 염생식물 번행초 유전다양성 평가 (Genetic variation of halophyte New Zealand spinach (Tetragonia tetragonioides) accessions collected in Korea using an AFLP marker)

  • 전용삼;진용태;최서희;박누리;김인경;이가연;최종진;이긍주
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제43권2호
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    • pp.157-163
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    • 2016
  • 본 연구는 국내 동, 서 및 남해안 바닷가 근처 사구지역에서 자생하는 번행초 55개체를 수집하여 AFLP 마커시스템을 적용하고 이들 유전자원들간의 유전다양성 차이를 알아보기 위하여 실시하였다. 우선 전체 게놈의 특이적 부위를 절단하기 위하여 제한효소로 EcoRI과 MseI 12개 조합을 활용하였고, 그 결과 총 1,279 절편을 확보할 수 있었다. 이 결과는 제한효소 조합당 평균 107개의 절편이 생산된 것으로 이 중 평균 62개(약 58%)가 유전자원간에 다형성을 나타냈다. 이와 같이 유전자원간에 다형성을 보인 게놈 절편을 대상으로 유전다양성을 분석한 결과 조사된 55개체 번행초 유전자원 집단은 29%의 유전적 차이를 보이는 것을 알 수 있었다. 또한 군집분석을 통해 유전적 차이를 보이는 그룹을 분류한 결과 국내 자생 번행초 유전자원은 총 7개의 집단으로 나누어짐을 알 수 있었다. 본 연구에서 국내외 최초의 번행초 유전 다양성 평가 정보는 향 후 품종 육성을 위한 교배친의 선발에 적용하여 다양한 유전적 차이를 보이는 분리집단을 확보하는 데 활용이 가능할 것으로 생각된다.

분자유전학적인 기술을 이용한 육 감별법

  • 김태헌
    • 한국축산식품학회:학술대회논문집
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    • 한국축산식품학회 2000년도 국제심포지엄 및 제26차 추계학술발표회
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    • pp.59-75
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    • 2000
  • 본 연구는 한우고기를 수입육 및 젖소고기 등의 쇠고기를 판별할 수 있는 DNA marker를 개발 하기 위하여 수행하였다. 첫 번째 실험으로 RAPD 기법을 이용한 종 특이 marker 개발 및 이 marker의 SCAR marker로의 개발을 목표로 수행되었다. Random primer 300개에 대하여 PCR 수행하여 품종 특이적인 양상을 나타내는 14개 primer를 선별하였고 그 중 MG-3, MG-6, MG-12의 primer는 각각 0.9 kb, 1.0 kb, 2.0kb의 위치에서 홀스테인, 한우,헤어포드 특이적인 RAPD 단편을 나타내었다. 이들 단편들 중 한우 특이적인 단편을 클로닝한 후 random primer가 포함된 부분의 염기서열을 결정하였다. 10bp의 RAPD random primer에 10 bp의 염기를 추가하여 SCAR primer를 제작하였다. SCAR marker의 PCR수행 결과, RAPD marker와 같은 1.0 kb의 크기에서 한우에서만 특이적으로 하나의 밴드로 증폭이 되었다. 이러한 결과는 젖소 DNA와의 비교실험에서와 같이 Holstein에서는 나타나지 않으면서 한우에서만 단일밴드가 증폭되어 한우와 젖소의 판별에 이용이 가능할 것으로 판단된다. 두 번째 실험으로 포유동물의 모색과 연관된 MC1R 유전자 변이와 소 품종간의 유전자형 빈도를 파악하고 한우와 흑모를 가진 홀스테이나 앵거스와의 판별 가능한 DNA marker로서의 이용성을 알아보기를 위하여 수행하였다. MC1R 유전자의 변이부분을 증폭시킬 수 있는 한쌍의 primer를 제작하여 350 bp 크기의 PCR 산물를 얻어 제한효소 BsrF I 과 MspA1 I 으로 각각 절단한 후 2.5%의 Metaphore agarose gel에 전기영동하여 유전자형을 결정하였다. 소 품종별 유전자형 빈도를 분석한 결과 한우에서는 $E^+e$와 ee 유전자형이 각각 0.10과 0.90로 나타난 반면 젖소(홀스테인)에서는 유전자형 $E^DE^D,\;E^DE^+$$E^De$가 각각 0.86, 0.00 및 0.14, 앵거스에서는 각각 0.57, 0.26 및 0.17의 빈도를 보여 젖소와 앵거스 두 품종 모든 개체가 대립유전자 $E^D$를 가지고 있어 한우와는 분명한 차이를 보였다. 그러나 수입육의 경우 분석시료 43%만이 $E^D$를 가지고 있었다. 따라서 MC1R 유전자의 유전자형을 PCR-RFLP 방법을 이용한다면 현재 젖소고기가 한우고기로 둔갑 판매되는 부정유통을 방지할 수 있는 하나의 DNA 지표인자로서 활용될 수 있을 것으로 판단되었다. 결론적으로 본 연구에서 개발한 한우 특이 SCAR marker와 MC1R 유전자를 이용한다면 국내에서 사육하고 있는 젖소고기가 한우고기로 둔갑 판매되는 부정유통사례를 근접할 수 있는 방법이 될 것으로 판단되나 다양한 품종이 교잡된 수입쇠고기와의 판별기술 개발을 위해서는 보다 많은 연구가 필요할 것으로 사료된다.

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Pepstatin- Insensitive Carboxyl Proteinase: A Biochemical Marker for Late Lysosomes in Amoeba proteus

  • Hae Kyung Kwon;HyeonJung Kim;Tae In Ahn
    • Animal cells and systems
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    • 제3권2호
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    • pp.221-228
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    • 1999
  • In order to find a biochemical marker for late Iysosomes, we characterized two cDNAs which were cloned by using a monoclonal antibody (mAb) against Iysosomes in Amoeba proteus as a probe. The two cDNAs, a 1.3-kb cDNA in pBSK-Iys45 and a 1.6-kb cDNA in pBSK-Iys60, were found to encode proteins homologous to pepstatin-insensitive carboxyl proteinases (PICPs). E. coli transformed with pBSK-Iys45 produced two immunopositive polypeptides (45 and 43 kDa) and the cDNA in 1274 bases encoded a 44,733-Da protein (Lys45) of 420 amino acids containing one site for a core oligosaccharide. On the other hand, E. coli transformed with pBSK-Iys60 produced several polypeptides (64, 54, 45, 41, and 37 kDa) reacting with the mAb. The cDNA contained 1629 bases and encoded a 59,231-Da protein (Lys60) of 530 amino acids containing two sites for asparagine-linked core oligosaccharides. These two cDNAs showed identities of 60.3% in nucleotide sequences and 23.6% in amino acid sequences. Lys45 and Lys60 appeared to share XXEFQK as a common antigenic domain. The amino acid sequence of the Lys45 protein showed 17.4% identity and 40.9% similarity to that of PICP from Pseudomonas sp. 101. On the other hand, Lys60 showed a 24.3% identity and 51.9% similarity with human Iysosomal PICP in the amino acid sequence. A putative active center for serine protease, GTS*xxxxxFxG, was found to be conserved among PICP homologues. The two PICPs are the first reported enzymatic markers for late Iysosomes.

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Glycyrrhiza uralensis (licorice) extracts increase cell proliferation and bone marker enzyme alkaline phosphatase activity in osteoblastic MC3T3-E1 cells

  • Cho, Young-Eun;Kwun, In-Sook
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제51권4호
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    • pp.316-322
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    • 2018
  • Purpose: The Glycyrrhiza uralensis species (Leguminosae) as a medicinal biocompound, and one of its root components, isoliquritigenin (ISL), which is a flavonoid, has been reported to have anti-tumor activity in vitro and in vivo. However, its function in bone formation has not been studied yet. In this study, we tested the effect of Glycyrrhiza uralensis (ErLR) and baked Glycyrrhiza uralensis (EdLR) extracts on osteoblast proliferation, alkaline phosphatase (ALP) activity, and bone-related gene expression in osteoblastic MC3T3-E1 cells. Methods: MC3T3-E1 cells were cultured in various levels of ErLR (0, 5, 10, 15, $20{\mu}g/mL$), EdLR (0, 5, 10, 15, $20{\mu}g/mL$), or ISL (0, 5, 10, 15, $20{\mu}M$) in time sequences (1, 5, and 20 days). Also, isoliquritigenin (ISL) was tested for comparison to those two biocompound extracts. Results: MTT assay results showed that all three compounds (ErLR, EdLR, and ISL) increased osteoblastic-cell proliferation in a concentration-dependent manner for one day. In addition, both ErLR and EdLR compounds elevated the osteoblast proliferation for 5 or 20 days. Extracellular ALP activity was also increased as ErLR, EdLR, and ISL concentration increased at 20 days, which implies the positive effect of Glycyrrhiza species on osteoblast mineralization. The bone-related marker mRNAs were upregulated in the ErLR-treated osteoblastic MC3T3-E1 cells for 20 days. Bone-specific transcription factor Runx2 gene expression was also elevated in the ErLR- and EdLR-treated osteoblastic MC3T3-E1 cells for 20 days. Conclusion: These results demonstrated that Glycyrrhiza uralensis extracts may be useful for preventing osteoporosis by increasing cell proliferation, ALP activity, and bone-marker gene expression in osteoblastic cells.

흰나리(Lilium formosanum Wallace) 식별을 위한 CAPS 마커의 개발 (Development of CAPS marker for identifying a Formosan lily (Lilium formosanum))

  • 정성진;이가연;윤아라;장지영;김진국;이긍주
    • 농업과학연구
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    • 제41권2호
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    • pp.101-106
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    • 2014
  • This study was conducted to identify lily species native to Korea from formosan lily (Lilium formosanum) belonging to Longiflorum section. Due to flowering time, flower color and orientation, long shelf life and resistant to diseases, the native lily species can be valuable genetic resources for interspecific hybrids. One of the chloroplast genes, matK, was used to clone and sequence to explore any base changes. The matK was successfully amplified into 1,539 bp (94% of the gene) and phylogenetic tree demonstrated 6 clades for those 11 lily species used in this study. There were one or two base substitutions among 10 lilies native to Korea, while formosan lily native to Taiwan exhibited 6 base substitutions in matK gene, rendering it genetically distant. A restriction enzyme NruI recognized one of the six base changes, and digested the matK gene of 10 native lily species only, but not in formosan lily. The confirmed cleavage characteristic of the target region in matK gene was designed into a CAPS (cleaved amplified polymorphic sequences) marker which will be available to estimate compatibility of interspecific hybridization and to trace the pedigree when those native lilies are crossed with the formosan lily.

Relationship between Preoperative Serum CA15-3 and CEA Levels and Clinicopathological Parameters in Breast Cancer

  • Moazzezy, Neda;Farahany, Tahereh Zarnoosheh;Oloomi, Mana;Bouzari, Saeid
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권4호
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    • pp.1685-1688
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    • 2014
  • Background: CEA and CA 15.3 serum tumor markers are currently used in clinical practice for monitoring therapy. The aim of this study was to evaluate serum level of these markers among healthy females and invasive breast carcinoma (IBC) patients and to determine any relationships with clinicopathological factors. Materials and Methods: 60 Iranian females were enrolled in this study, 30 healthy and 30 diagnosed with breast cancer who had not received any preoperative chemotherapy or hormone therapy. Enzyme linked immunosorbent assays were used for the quantitative determination of the cancer associated antigens, CEA and MUC1 (CA15-3). Results: The serological levels of CEA and CA15-3 ($5.0033{\pm}0.49{\mu}g/L$ and $178.1667{\pm}15.11$ U/ml) in the breast cancer patients were significantly higher (p=0.00) than the serum levels of normal controls ($1.1237{\pm}0.11{\mu}g/L$ and $21.13{\pm}3.058$ U/ml). Regarding the CEA marker, a significant correlation with grade of tumor was shown. Furthermore, there was a low correlation between CA15-3 and CEA marker with correlation coefficient r=0.08. Conclusions: Collectively, markedly high levels of CEA and CA15-3 were found in our patients, pointing to their use as additional tools after clinical diagnosis.