• 해양환경안전학회지
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• 제16권4호
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• pp.321-337
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• 2010

1979년부터 2009년까지 31년 동안 목포연안 수질환경의 특성과 장기변동 경향을 조사하였다. 5개 정점에서 수층(표층과 저층)별 계절별로 년 4회 수온, 염분, 부유물질, 화학적산소요구량, 용존산소, 영양염류에 대해 조사한 결과, 표층수와 저층수 간에는 수소이온농도 및 인산인을 제외한 모든 조사항목에서 표 저층 간의 차이가 컸었다. 공간적 분포특성은 수온과 수소이온농도 및 용존산소는 표층과 저층 공히, 인산인과 질산질소는 저층에서 정점 간 차이가 없었으나, 그 외 조사항목에서는 정점 간 차이가 컸으며 주성분 분석결과 영산강 하구역인 정점 1과 중간인 정점 2~4 및 비교적 외해 측인 정점 5의 세 그룹으로 구분되었다. 계절별로는 질산질소를 제외한 전조사 항목에서 유의성이 입증되었고, 정점별로 차이가 있어 내측은 계절에 따른 변화가 큰 상태이었고 외해 측으로 갈수록 변화폭이 줄어드는 경향이었다. 30년 동안 수질의 장기 변동은 표층 네 그룹, 저층 두 그룹으로 구분되어 항목에 따라 부분적으로 차이가 있었으나 전반적으로 수온, 수소이온농도 및 화학적산소요구량은 점차 증가하는 경향이었고 용존산소는 불규칙한 변곡선 형태이며, 영양염류는 증가하는 경향으로 1990년 후반부터 그 폭이 커지는 경향으로 2009년에는 약간 안정화되는 특정을 보였으나, 경인연안, 아산연안, 천수만 및 군산연안과 마찬가지로 육수 유업의 원인에 기인한 것으로 사료된다.

• 미생물학회지
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• 제54권4호
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• pp.448-452
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• 2018

제주도 성산리 앞 바다 속 해면체로부터 분리한 Bacillus safensis KCTC 12796BP의 유전체를 분석하였다. 그 결과 3,935,874 bp의 환형 염색체와 36,690 bp의 plasmid 염기 서열을 확인하였다. 염색체는 G + C 함량이 41.4%로 75개의 위유 전자를 포함한 3,980개의 코딩 서열을, plasmid는 G + C 함량이 37.3%로 36개의 코딩 서열을 포함하고 있었다. 염색체 코딩 서열 중에는 81개의 tRNA 유전자, 24개 rRNA 유전자와 1개의 tmRNA 유전자가 있었다. 또한 포자 생성에 필요한 30개의 유전자, 포자피를 지령하는 16개의 유전자, 그리고 발아에 필요한 20개의 유전자도 발견되었다. 이외에 협막 다당체 생합성에 필요한 유전자와 편모 생합성 및 주화성에 필요한 유전자, 그리고 염 내성에 필요한 glycine-choline betaine 수송체에 관한 유전자도 존재하였다. 무엇보다도 항알러지활성을 보이는 이차대사산물 seongsanamide의 생합성을 지령하는 비리보좀성 펩타이드 합성효소 유전자를 확인할 수 있었다.

• 한국항해항만학회지
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• 제41권6호
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• pp.445-450
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• 2017

항로 설정은 통항 선박들의 안전을 위해 교통 흐름을 반영할 필요가 있으며, 선박들이 항로를 잘 준수하는지 지속적인 경과 분석이 필요하다. 본 연구에서는 완도항 인근해역 추천항로의 문제점을 도출하고 이에 대한 개선안을 제시하였다. 효율적인 항로 중앙선을 설정하기 위해 선박 항적을 기반으로 서포트 벡터 머신을 이용하였다. 추천항로 중앙선을 기준으로 우측으로 항해해야 하므로 통항 선박들의 항적이 2개의 군집으로 분할된다. 서포트 벡터 머신은 패턴 인식 등 많은 분야에서 이용되고 있으며, 특히 이진 분류 기능이 뛰어나다. 연구 결과 장죽수도 방향의 2.4 NM 추천항로 구간에서 동진하는 상선은 약 79.5%가 추천항로를 준수하지 않는 것으로 나타나 선박 충돌 사고 위험이 상존하는 것을 확인하였다. 추천항로를 현 위치에서 북쪽으로 약 300 m 재설정할 경우, 동진하는 상선은 항로를 역주행할 비율이 79.5%에서 30.9%로 낮아지는 것으로 나타났다. 본 연구에서 적용한 서포트 벡터 머신은 선박 항적을 두 군집으로 분류가 가능하므로 항로 중앙선을 효과적으로 설정하는데 응용할 수 있을 것으로 기대된다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제51권6호
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• pp.677-681
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• 2013

Paragonimiasis is an important food-borne parasitic zoonosis caused by infection with lung flukes of the genus Paragonimus. Of the 7 members of the genus known in Thailand until recently, only P. heterotremus has been confirmed as causing human disease. An 8th species, P. pseudoheterotremus, has recently been proposed from Thailand, and has been found in humans. Molecular data place this species as a sister species to P. heterotremus, and it is likely that P. pseudoheterotremus is not specifically distinct from P. heterotremus. In this study, we collected metacercariae of both nominal species (identification based on metacercarial morphology) from freshwater crabs from Phetchabun Province in northern Thailand, Saraburi Province in central Thailand, and Surat Thani Province in southern Thailand. In addition, we purchased freshwater crabs imported from Myanmar at Myawaddy Province, western Thailand, close to the Myanmar-Thailand border. The DNAs extracted from excysted metacercariae were PCR-amplified and sequenced for ITS2 and cox1 genes. The ITS2 sequences were nearly identical among all samples (99-100%). Phylogenies inferred from all available partial cox1 sequences contained several clusters. Sequences from Indian P. heterotremus formed a sister group to sequences from P. pseudoheterotremus-type metacercariae. Sequences of P. heterotremus from Thailand, Vietnam, and China formed a separate distinct clade. One metacercaria from Phitsanulok Province was distinct from all others. There is clearly considerable genetic variation in the P. heterotremus complex in Thailand and the form referred to as P. pseudoheterotremus is widely distributed in Thailand and the Thai-Myanmar border region.

• 한국패류학회지
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• 제24권1호
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• pp.11-24
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• 2008

GDNA was isolated from the jedo venus clam (Protothaca jedoensis, Lischke) from Boryeong (jedo venus clam from Boryeong JVCB) and Wonsan (jedo venus clam from Wonsan; JVCW) located in the West Sea and the East Sea of Korean Peninsula, respectively and we performed clustering analyses, DNA polymorphisms and the populations genetic variations. In the present study, the seven decamer primer generated the one hundred and eleven major/minor specific bands in JVCB population and ninety four-specific bands in JVCW population. Seven primers generated the unique shared bands to each population of one hundred and seventy-six, on average of 25,1, in JVCB population from Boryeong and three hundred thirty, on average of 47,1, in JVCW population from Wonsan, respectively. The dendrogram obtained by the seven oligonucleotides primers, indicates two genetic clusters. Especially, two Protothaca between the individual WONSAN no. 12 and BORYEONG no. 10 showed the longest genetic distance (0.537) in comparison with other individuals used. Accordingly, RAPD analysis showed that the JVCB was a little more genetically diverse than the JVCW population. This result implies the genetic similarity owing to rearing in the same and/or similar circumstances or inbreeding within the JVCW population. So to speak, JVCB population may have high levels of genomic DNA variability owing to the introduction of the wild individuals from the other sites to sampling sites although it may be the geographically diverse distribution of this species. However, it was confirmed that it did not appear like that really in this study. We feel convinced that RAPD analysis discovered a significant genetic distance between two Protothaca population pairs (P<0.001). The existence of population discrimination and genetic diversity between two Protothaca populations was identified by RAPD analysis.

• 한국양식학회지
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• 제19권2호
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• pp.67-76
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• 2006

Genomic DNA isolated from two Porphyra species, P. tenera and P. dentate from Wando located on the southern coast of Korean peninsula was amplified by PCR reaction. The amplified products were separated by agarose gel electrophoresis (AGE) with decamer primer and stained with ethidium bromide. The eight arbitrarily selected primers OPA-04, OPA-06, OPB-01, OPB-08, OPB-10, OPB-11, OPB-14 and OPC-10 generated the shared loci, polymorphic, and specific loci. The size of DNA bands varies from 100 bp to 2,200 bp. The complexity of the banding patterns varies dramatically between the primers and two Porphyra species. A total of 528 loci observed were identified in P. tenera and 443 in P. dentata: 22 polymorphic loci (4.2%) in P. tenera and 30 (6.8%) in P. dentata. 154 shared loci observed, the average 19.3 per primer, were identified in P. tenera and 143 loci, the aver-age 17.9 per primer, in P. dentata species. The number of specific loci in P. tenera and P. dentata was 73 and 77, respectively. The average bandsharing value was $0.623{\pm}0.008$ with P. tenera and $0.560{\pm}0.009$ within P. dentata. The average bandsharing value between two Porphyra species was $0.408{\pm}0.004$, ranged from 0.305 to 0.564. The dendrogram obtained by the eight primers indicates four genetic clusters. The genetic distance between two Porphyra species ranged from 0.076 to 0.627. The individual no. 02 of P. tenera was genetically closely related to no. 01 of P. tenera(genetic distance=0.082). Especially, two entities between the individual DENTATA no.21 and DENTATA no. 19 of P. dentata showed the longest genetic distance (0.627) in comparison with other individuals used. In this study, RAPD-PCR analysis has revealed the significant genetic distance between two Porphyra species pairs (P<0.001).

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제14권3호
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• pp.163-170
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• 2010

The gDNA isolated from Korean cuttle fish (Sepia esculenta Hoyle) from Sockcho (SOCKCHO), Seocheon (SEOCHEON), Incheon (INCHEON) and Vietnamese cuttle fish (VIETNAM), were amplified by PCR. Here, the seven selected primers (BION-A07, BION-A09, BION-A11, BION-A20, BION-B04, BION-B06, and BION-B14) were used to generate the unique shared loci to each population and shared loci by the four cuttle fish populations. In this study, the primer BION-A11 detected 112 shared loci by the four populations, major and/or minor fragments of sizes 300 bp, 400 bp, 700 bp and 1,000 bp, respectively, which were identical in all samples. The dendrogram obtained by the seven primers indicates five genetic clusters: cluster 1 (SOCKCHO 01-SOCKCHO 07), cluster 2 (SEOCHEON 08-SEOCHEON 10), cluster 3 (SEOCHEON 11-SEOCHEON 14), cluster 4 (INCHEON 15-INCHEON 21), and cluster 5 (VIETNAM 22-VIETNAM 28). The shortest genetic distance that displayed significant molecular differences was between individuals 25 and 26 from the Vietnamese cuttle fish (0.025), while the longest genetic distance among the twenty-eight cuttle fishes that displayed significant molecular differences was between individuals SOCKCHO no. 02 and SEOCHEON no. 12 (0.640). Individual of Seocheon and Incheon cuttle populations was somewhat closely related to that of Vietnamese cuttle fish population. Even though it could not be affirmed by a single case, such a result seems to be closely connected that the Korean peninsula is subject to climate changes by global warming. In conclusion, our PCR analyses revealed a significant genetic distance among the four cuttle fish populations.

• 해양환경안전학회지
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• 제15권4호
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• pp.315-328
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• 2009

1997년부터 2008년까지 12년 동안 가로림연안 수질환경의 특성과 장기변동 경향을 조사하였다. 3개 조사정점에서 수층(표층, 저층)별 및 계절별로 년 4회 수온, 염분, 부유물질, 화학적산소요구량, 용존산소, 영양염류, 클로로필 a에 대해 조사한 결과, 표층수와 저층수 간에 수온을 제외한 진조사항목에서 표 저층간의 차이가 없었다. 공간적 분포특성은 모든 조사항목에서 정점간 유의적인 차이가 없어 가로림만 중간부터 외측으로 원활한 해수교환이 이루어지고 있었다. 계절별로는 수소이온농도와 암모니아질소을 제외한 조사 항목에서는 유의성이 입증되었고, 정점별로 대체로 비슷한 변화폭을 나타내었다. 12년 동안 수질의 장기 변동은 네 그룹으로 구분되어 항목에 따라 부분적으로 차이가 있으나 전반적 장기 변동을 조사한 결과 근래에 들어 염분은 높아진 반면, 용존무기질소, 질산질소 및 화학적산소요구량 등이 감소하고 있어 담수의 유입이 거의 없는 대체로 양호한 수질상태를 유지하고 있으며 수산학적으로 매우 중요한 연안으로 앞으로 지속적인 보전이 요구된다.

• 해양환경안전학회지
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• 제27권4호
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• pp.483-491
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• 2021

수역 내 충돌 위험 식별은 항해의 안전을 위해 중요하다. 본 연구에서는 거리 요인을 기반으로 한 군집화 방법인 계층 클러스터링을 포함하는 새로운 충돌 위험 평가 방법을 도입했으며, 주변의 선박이 많은 경우 실시간 데이터, 그룹 방법론 및 예비 평가를 사용하여 선박을 분류하고 충돌위험평가를 기반으로 평가하였다(HCAAP 처리라 부른다). 조우하는 선박들의 군집은 계층 프로그램에 의해 모아지고, 예비 평가와 결합되어 상대적으로 안전한 선박을 걸러내었다. 그런 다음, 각 군집 내에서 조우하는 선박 사이의 최근접점(DCPA) 및 최근접점까지의 도착시간(TCPA)까지의 시간을 계산하여 충돌위험지수(CRI)와의 관계를 비교하였다. 조우하는 선박들간의 군집에서 CRI와 DCPA 및 TCPA 수학적 관계는 음의 지수 함수로 구성되었다. 이러한 CRI로부터 운영자는 명시된 해역에서 항해하는 모든 선박의 안전성을 보다 쉽게 평가할 수 있으며, 프레임워크는 해상운송의 안전과 보안을 개선하고 인명 및 재산 손실을 줄일 수 있다. 본 연구에서 제안된 프레임워크의 효과를 설명하기 위해 국내의 목포 연안 해역에서 실험 사례 연구를 수행하였다. 그 결과, 본 연구의 프레임워크가 각 군집 내에서 조우 선박 간의 충돌 위험 지수를 탐지하고 순위를 매기는 데 효과적이고 효율적이라는 것을 보여 주었으며, 추가연구를 위한 자동 위험 우선순위를 지정할 수 있게 해주었다.

• 한국수산과학회지
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• 제53권6호
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• pp.823-833
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• 2020

The Manila clam Ruditapes philippinarum, is an important marine bivalve that is widely distributed along the west and north coasts of South Korea. It has been used in a variety of Korean foods owing to its superior umami taste. In the present study, we developed a flavoring with an excellent sensory preference from Manila clam using extrusion cooking processing. Optimization of extrusion cooking conditions was performed using response surface methodology (RSM). Barrel temperature (X1, 140-160℃) and screw speed (X2, 400-560 rpm) of the extruder were chosen as independent variables. The dependent variable was overall acceptance (Y, points). The estimated optimal conditions were as follows: overall acceptance (Y): X1=140℃ and X2=560 rpm. The indicated value of the dependent variable overall acceptance (Y) under the optimal conditions was 8.94 points, which was similar to the experimental value (8.82 points). Overall acceptance of the Manila clam flavoring was related to its umami and Manila clam tastes. The electronic nose and tongue results successfully segregated different clusters of the samples between the lowest and highest sensory scores. The sample with the highest sensory score had higher sourness, umami, and sweetness intensities, and the lowest sensory scored sample showed more off-flavor compounds.