Antifungal bacteria for biological control of plant diseases or production of novel antibiotics to plant pathogens were isolated in 1997 from various soils of Ansung, Chunan, Koyang, and Paju in Korea. Sixty-four bacterial strains pre-screened from approximately 1,400 strains were tested on V-8 juice agar against eight plant pathogenic fungi using in vitro bioassay technique for inhibition of mycelial growth. Test pathogens were Alternaria mali, Colletotrichum gloeosporioides, C. orbiculare, Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum, F. oxysporum f. sp. lycopersici, Magnaporthe grisea, Phytophthora capsici, and Rhizoctonia solani. A wide range of antifungal activity of bacterial strains was found against the pathogenic fungi, and strain RC-B77 showed the best antifungal activity. Correlation analysis between inhibition of each fungus and mean inhibition of all eight fungi by 64 bacterial strains revealed that C. gloeosporioides would be best appropriate for detecting bacterial strains producing antibiotics with potential as biocontrol agents for plant pathogens.
KIM, BUM-JOON;MOONJAE CHO;JIN-CHEOL KIM;KWANG YUN CHO;GYUNG JA CHO;CHUL-HOON LEE;YOONGHO LIM
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제11권6호
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pp.1120-1123
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2001
Screening tests against six plant pathogenic fungi were performed in order to develop biopesticides. Actinomycetes were used to discriminate Bacillus thuringiensis for wide use as a microbial pesticide. From more than 100 actinomycetes tested, twelve strains showed potent antifungal activities. We report in vivo screening results from fermentation broths of these twelve strains and identification of the strain taxa.
An isolate 90-GT-302, identified as Kitasatosporia kimorexae, was found to produce antibiotics that induce mycelial swelling in Magnaporthe grisea, and Fusarium solani. The strain produced at least 5 antibiotics. Among them, the main active compound designated as kimorexin A was isolated and its physico-chemical properties and biological activities were examined, and as a result was found to be of the thiopeptide antibiotic. A comparison between the properties of kimorexin A and those of the known thiopeptide antibiotics led us to conclude that kimorexin A was a new thiopeptide polythiazolyl antibiotic. Kimorexin A showed a narrow antimicrobial spectrum against very limited genus of phytopathogenic fungi. It prevented host plants from infections of Rhizoctonia solani and absolute parasitic fungi, such as Sphaerotheca fuliginea and Puccinia recondita, almost completely at the treatment concentration of approximately 20 ppm.
An isolate, 90-GT-302, was found to produce antibiotics inducing typical mycelial swelling in Magnaporthe grisea and Fusarium solani. This isolate formed yellow substrate and white rectiflexbiles aerial mycelia in the early stages of growth. The aerial mycelium gradually changed its color to white and finally formed a gray spore mass. Analysis of the cell wall acid hydrolysate revealed the presence of LL- and meso-diaminopimelic acids, glycine, and galactose, which indicated cell wall type X. This result placed our isolate in genus Kitasatosporia. A comparison of isolate 9O-GT-302 with reference strains of Kitasatosporia spp., which not only demonstrated several differences in their physiological properties but also novelty of the active compounds produced by this isolate, led us to designate the isolate as Kitasatosporia kimorexae.
The saprophytic fungus Ulocladium atrum Preuss is a promising biological control agent for Botrytis cinerea in greenhouse- and field-grown crops. However, despite its known potent antifungal activity, no antifungal substance has yet been reported. In an effort to characterize the antifungal substance from U. atrum, we isolated an antibiotic peptide. Based on extensive spectroscopic analyses, its structure was established as a cyclopeptolide with a high portion of N-methylated amino acids, and its $^1H$ and $^{13}C$ chemical shifts were completely assigned based on extensive 1D and 2D NMR experiments. Compound 1 exhibited potent antifungal activity against the plant pathogenic fungus Botrytis cinerea and moderate activity against Alternaria alternate and Magnaporthe grisea.
The Pi-b is the rice gene conferring race specific resistance to the blast fungus Magnaporthe grisea race having a corresponding avirulence gene, AVR-Pi-b. All resistant cultivars have two copies of the Pi-b gene, but susceptible cultivars have a single copy of the gene. About 1 Kbp insertion sequence was detected in the open reading frame of the Pi-b gene from the susceptible cv. Nipponbare. The nature of insertion sequence was identified as a solo long terminal repeat (LTR) of new rice Tyl-copia-like retrotransposon. LTR was widely distributed in the rice genome. Various types of different patterns of restriction fragment length polymorphism of LTR were detected in indica cultivars, whereas a single type was detected from japonica cultivars. The insertion of LTR sequence in the Pi-b gene in the susceptible cultivar suggested that retrotransposon-mediated insertional mutation might played an important role in the resistance breakdown as well as evolution of resistance genes in rice.
We isolated and characterized an antifungal peptide from the seeds of Phytolacca americana. Growth inhibition assay with Botrytis cinerea was used to screen inhibitory proteins from 60 different plant species. A 4 kDa antifungal peptide (Pa-AFP) inhibitory to hyphal growth of B. cinerea was found in the seeds of P. americana. The peptide Pa-AFP was purified to homogeneity by chromatographies of Sephadex G-50, DEAE-Sepharose, Sephacryl S-300, and C18 reverse-phase HPLC. Western blot analysis showed that a polyclonal antibody raised against the purified peptide cross-reacted with a 4 kDa protein in seeds but not in root and leaf tissues of P. americana. Pa-AFP inhibited the hyphal growth of Botrytis cinerea, Rihzoctonia solani, Fusarium oxysporum, and Magnaporthe grisea. Pa-AFP exhibited growth inhibition of Saccharomyces cerevisiae strain BWG7a, which was sensitive to osmotin.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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