• 제목/요약/키워드: MTC application

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하둡 기반 대규모 작업처리 프레임워크에서의 Adaptive Parallel Computability 기술 연구 (A Study on Adaptive Parallel Computability in Many-Task Computing on Hadoop Framework)

  • 김직수
    • 방송공학회논문지
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    • 제24권6호
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    • pp.1122-1133
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    • 2019
  • 본 연구팀에서는 YARN 기반의 하둡 플랫폼에서 대규모의 태스크들로 구성된 Many-Task Computing(MTC) 응용들을 효율적으로 지원할 수 있는 신규 프레임워크로서 MOHA(Mtc On HAdoop)를 연구/개발해왔다. MTC 응용들은 수십만 개에서 수백만 개 이상의 대규모 태스크들로 구성되고 각 응용별로 자원의 사용 패턴이 다를 수 있기 때문에, 전체적인 시스템 성능 향상을 위해 MOHA-TaskExecutor(MTC 응용 태스크를 실행하는 주체)의 Adaptive Parallel Computability 기술 연구를 수행하였다. 이는 한 번에 하나의 태스크를 실행하던 기존의 처리 모델을 고도화하여 하나의 TaskExecutor가 동시에 여러 개의 태스크들을 실행함으로써 YARN Container의 병렬 컴퓨팅 능력을 극대화하기 위함이다. 이를 위해 각각의 TaskExecutor들이 "독립적이고, 동적으로" 동시에 실행시키는 MTC 응용 태스크들을 조정할 수 있도록 하였으며, 최적의 동시 실행 태스크 숫자를 찾기 위해서 Hill-Climbing 알고리즘을 활용하였다.

분산 슈퍼컴퓨팅 기술에 기반한 신약재창출 시뮬레이션 사례 연구 (A Case Study of Drug Repositioning Simulation based on Distributed Supercomputing Technology)

  • 김직수;노승우;이민호;김서영;김상완;황순욱
    • 정보과학회 논문지
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    • 제42권1호
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    • pp.15-22
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    • 2015
  • 본 논문에서는 대규모의 계산 작업을 고성능으로 처리해야 하는 신약재창출 시뮬레이션 분야에 분산 슈퍼컴퓨팅 기술을 적용한 사례에 대해 논의하고자 한다. 신약재창출이란 기존에 알려진 약물의 새로운 적응증을 규명하는 것을 의미하며, 이러한 신약재창출은 비교적 짧은 수행시간을 갖는 대규모의 도킹(docking) 연산들을 고성능으로 처리해야한다는 점에서 Many-Task Computing (MTC) 성격을 지니고 있다. 이러한 MTC 응용들의 대표 사례로서 신약재창출 시뮬레이션을 분산 슈퍼컴퓨팅 환경 기반의 HTCaaS 시스템에 적용하였으며, 이를 통해 효율적인 작업 배포, 동적인 자원 할당 및 로드 밸런싱, 안정성 및 다양한 자원들의 효율적인 통합 등이 이러한 과학 응용들을 지원하는 데 있어 필수적인 기능임을 확인할 수 있었다.

하둡 기반 대규모 작업 배치 및 처리 기술 설계 (Design of a Large-scale Task Dispatching & Processing System based on Hadoop)

  • 김직수;구엔 카오;김서영;황순욱
    • 정보과학회 논문지
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    • 제43권6호
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    • pp.613-620
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    • 2016
  • 본 논문에서는 대규모의 작업을 고성능으로 처리하기 위한 Many-Task Computing(MTC) 기술을 기존의 빅데이터 처리 플랫폼인 Hadoop에 적용하기 위한 MOHA(Many-Task Computing on Hadoop) 프레임워크에 대해 기술한다. 세부적으로는 MOHA의 기본 개념과 개발 동기, 분산 작업 큐에 기반한 PoC(Proof-of-Concept) 수행 결과를 제시하고 향후 연구 방향에 대해서 논의하고자 한다. MTC 응용은 각각의 태스크들이 요구하는 I/O 처리량은 상대적으로 많지 않지만, 동시에 대량의 태스크들을 고성능으로 처리해야하고 이들이 파일을 통해서 통신한다는 특징을 가지고 있다. 따라서 기존의 상대적으로 큰 데이터 블록 사이즈에 기반한 Hadoop 응용과는 또 다른 패턴의 데이터 집약형 워크로드라고 할 수 있다. 이러한 MTC 기술과 빅데이터 기술의 융합을 통해 멀티 응용 플랫폼으로 진화하고 있는 Hadoop 생태계에 신규 프레임워크로서 대규모 계산과학 응용을 실행할 수 있는 MOHA를 추가하여 기여할 수 있을 것이다.

하지 근골격계질환 평가를 위한 삼차원 근.건모델의 임상적용 (A Clinical Application of 3D Muscle-Tendon Complex Model for the Estimation of Lowerbody Musculoskeletal Disorders)

  • 임용훈;최재일;최안렬;민경기;윤태선;박광용;문정환
    • Journal of Biosystems Engineering
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    • 제34권1호
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    • pp.57-62
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    • 2009
  • Kinematic analysis of MTC (Muscle-Tendon Complex) units is a key indicator for diagnosis of patients with musculoskeletal disorders because the contracture or shortening of musculo-tendinous units is known to produce pathological gaits. Therefore, the principal objective of this study was to assess the length change in the triceps surae prior to and after wearing an AFO (Ankle-Foot Orthoses) in patients with musculoskeletal disorders during a gait. In this study, analyses were conducted using a Muscle Tendon Complex model coupled with the trajectory data from markers attached to anatomical landmarks. As a result, the maximum length change in the triceps surae during a gait was 4.87% when a barefoot walking group and a walking group with AFO were compared. In particular, the difference in length changes between both groups in Soleus MTC units was found to be statistically significant in all gait phases. Our results revealed that MTC length in the AFO walking group was clearly increased over that of the barefoot walking group. In the future, further studies will be required in order to more adequately assess musculoskeletal disorders using many cases studies with regard to agricultural working conditions because this study deals with the kinematic analysis of musculo-tendinous units in the case of clinical experiments.

미네랄 골질환 합병증을 가진 투석환자에서 다학제 팀 서비스의 임상적 성과 (Clinical Outcomes of Multidisciplinary Team Care on the Regulation of Chronic Kidney Disease - Mineral and Bone Disorder (CKD-MBD) in Patients Undergoing Dialysis)

  • 한나영;이상민;홍진이;노혜진;지은희;송윤경;송지윤;김인화;김연수;오정미
    • 한국임상약학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.318-323
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    • 2016
  • Background: Multidisciplinary team care (MTC) is a collaborative approach to treatment plan and ongoing care. We aimed to evaluate the clinical effect of MTC on the regulation of chronic kidney disease-mineral and bone disorder (CKD-MBD) complications in dialysis patients. Methods: This retrospective observational study was approved by the institutional review board. Among patients who have undergone dialysis at admission, the patients admitted to the nephrology ward were allocated to MTC group, and the others to usual care (UC) group. The MTC group had collaborative care by nephrologists, nurses, pharmacists, and nutritionists. The endpoints were the regulation of corrected calcium (cCa) and phosphate (P), the percent of patients in target level of cCa-P product ($cCa{\times}P$), and the prescription rate of non-calcium based P-binders. Results: A total of 163 patients were included from January to December 2009. A significant difference was shown in the percentage of patients in target $cCa{\times}P$ level at admission (MTC vs. UC, 81.40% vs. 91.67%; P = 0.038), but there was no significant difference at discharge. During admission, the cCa and P levels of patients in only UC group were significantly changed. In addition, compared with UC group, patients in MTC group were more likely prescribed appropriate P-binders, when they had higher $cCa{\times}P$ levels than $55mg^2/dL^2$ (P <0.001). Conclusion: It was found that MTC had beneficial effect on improving the regulation of CKD-MBD and the appropriate phosphate binder uses. Therefore, application of the MTC is anticipated to enhance quality of clinical care in chronic diseases.

Dual priming oligonucleotide system for the multiplex detection of tuberculosis in Hanwoo

  • Shin, Jong-Bong;Park, Nam-Yong;Kim, Yong-Hwan;Cho, Ho-Seong
    • 한국동물위생학회지
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    • 제30권4호
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    • pp.527-532
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    • 2007
  • In present study, we described the reliability of the dual priming oligonucleotide (DPO) multiplex polymerase chain reaction (PCR) for the detection of Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) and non-Mycobacterium tuberculosis (NMT) in blood samples of the Korea native cattle, Hanwoo. Among 340 samples 22 (6.5%) were positive in using DPO multiplex PCR, 21 (6.2%) were positive in PCR. The relative agreement between 2 tests was 99.7%, and the agreement quotient (kappa), was 0.95 (excellent). In these results, we demonstrated the successful application of DPO multiplex PCR for the diagnosis of bovine tuberculosis in Hanwoo. Multiplex PCR, using DPO primers, can be useful for the simple diagnosis of bovine tuberculosis in bovine blood samples.

On the use of time-dependent success criteria within risk-informed analyses. Application to LONF-ATWS sequences in PWR reactors

  • Jorge Sanchez-Torrijos;Cesar Queral;Carlos Paris;Maria Jose Rebollo;Miguel Sanchez-Perea;Jose Maria Posada
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • 제54권12호
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    • pp.4601-4619
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    • 2022
  • The classical Probabilistic Safety Analysis (PSA) does not include any time dependence explicitly. However, the success criteria (SC) could evolve during the cycle for some initiating events. In that sense, there is a type of sequence in which this time-dependency is quite important, the family of Anticipated Transient without Scram (ATWS) sequences in Pressurized Water Reactors. Therefore, a new risk-informed approach is proposed in this paper, which makes it possible to obtain the time-dependent SC evolution of the safety functions affected by the Moderator Temperature Coefficient (MTC) value. Then, the evolution of the ATWS conditional core damage probability (CCDP) could be obtained using a PSA model. To quantify the CCDP, the average values of the time-dependent failure probabilities must be computed. Finally, the comparison between the CCDP obtained through the application of the classical PSA approach and the new one makes it possible to quantify the impact of time-dependence on the SC of the headers that this new risk-informed ATWS approach can provide.

대규모 과학응용을 위한 효율적인 분산 슈퍼컴퓨팅 자원관리 기술 연구 (Effective Distributed Supercomputing Resource Management for Large Scale Scientific Applications)

  • 노승우;김직수;김상완;김서영;황순욱
    • 정보과학회 논문지
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    • 제42권5호
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    • pp.573-579
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    • 2015
  • 국가 슈퍼컴퓨팅 인프라는 국내 여러 지역에 분산된 슈퍼컴퓨팅 클러스터들로 이루어져 있으며, 본 연구팀에서는 이러한 이기종의 지리적으로 분산된 클러스터들을 대규모 과학 응용 연구자들에게 효율적으로 제공하기 위해 대규모 계산처리 시스템인 HTCaaS(High-Throughput Computing as a Service)를 자체 개발하였다. 본 논문에서는 이러한 대규모 계산처리 시스템(HTCaaS)을 활용하여 각 계산 자원을 동적으로 관리하는 방법에 대해서 논의하고, 신약재창출이라는 실제 과학 응용을 통해 그 효율성을 검증한다. 특히 유효 자원 식별을 위한 대기시간 및 성공률 개념을 이용한 동적 계산 자원 관리 기술을 적용함으로써 자원 활용률과 정확성, 신뢰성, 편의성이 향상될 수 있으며, 그 결과 전체적인 작업 시간의 단축과 작업 처리량도 향상될 수 있음을 확인할 수 있었다.