• 제목/요약/키워드: MALDI-TOF/MS

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Proteome Analysis of Recombinant CHO Cells Under Hyperosmotic Stress

  • 이문수;김경욱;김영환;이균민
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2003년도 생물공학의 동향(XII)
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    • pp.311-314
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    • 2003
  • Under hyperosmotic stress, rCHO cells display decreased specific growth rate $({\mu})$ and increased specific antibody productivity $(q_{Ab})$. The effects of hyperosmotic stress on batch culture cellular dynamics are not well understood. To this end, we conducted a proteome profile of rCHO cells, using 2D-gel, MALDI-TOF-MS and MS/MS. As a result, the proteome profile of rCHO cells could be established using 41 identified proteins. Based on this proteome profile of rCHO cells, we have found at least 8 differently expressed spots at hyperosmotic osmolality (450 mOsm/kg). Among these spots, two metabolic enzymes were found to be up-regulated (pyruvate kinase and GAPDH), while down-regulated protein was identified as tubulin. It shows that hyperosmotic stress can alter metabolic state, by up-regulated activities of two glycolysis enzymes, which could lead to activate the generation of metabolic energy. Tubulin expression was down-regulated, suggesting a reduction of cell division. Finally, the increased conversion energy could leads to improve overall productivity.

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Identification of Diapause and Non-diapause Associated Proteins in the Eggs of Multivoltine Silkworm Bombyx mori by MALDI MS Analysis

  • Saravanakumar, Ragunathan;Ponnuvel, Kangayam M.;Velu, Dhanikachalam;Koundinya, Panguluri R.;Sinha, Randir K.;Qadri, Syed M. Hussaini
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제16권2호
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    • pp.37-48
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    • 2008
  • The diapause and non diapause associated proteins of multivoltine silkworm eggs were analysed by two dimensional (2D) gel electrophoresis. The study was made at 0 hr, 24 hrs and 48 hrs after oviposition. A total of four protein spots in diapause eggs at 24 hrs of oviposition and two protein spots in non diapause eggs at 0 hrs of oviposition were observed. All the six protein spots were considered to have association with diapause and non diapause characters. The molecular weight (MW) and isoelectric point (PI) of these 6 protein spots were calculated. The protein spots 1 and 2 observed in 0 hr of non diapause eggs were found to have the MW of 67 and 75 KDa and PI of 8.6 and 8.4 respectively. Similarly the four protein spots observed in diapause egg at 24 hrs of oviposition exhibited MW viz., 15, 17,20 and 25 KDa and PI of 5.3, 5.8, 6.5 and 6.0 respectively. All these 6 identified protein spots were subjected to in-gel digestion and resulted tryptic peptides were analyzed by Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of flight mass spectrometry (MALDI TOF-MS). Databases searched based on experimentally determined molecular weights of peptides for the determination of the identities of proteins. The identified proteins indicated homology of 34% to 95%. The results indicate that the proteins may playa role in development of diapause and non diapause eggs.

복제 소 태반과 IVF 소 태반의 protein pattern 분석

  • 김홍래;강재구;윤종택;성한우;조민래;박창식;진동일
    • 한국발생생물학회:학술대회논문집
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    • 한국발생생물학회 2003년도 제3회 국제심포지움 및 학술대회
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    • pp.90-90
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    • 2003
  • 체세포 핵이식에 의한 복제기술은 매우 낮은 성공률 나타내고 있어 실용화에 지장을 초래하고 있다. 이것은 후생적인 유전현상인 reprogramming이 불완전하게 이루어지기 때문인 것으로 추측되어지고 있다(Reik et al., Theriogenology 2003, 59: 21-32; Han et al, Theriogenology 2003, 59: 33-44). 체세포 핵이식 후에 태아사망의 원인이 태반의 비정상적인 기능과 관계가 있는 것으로 추정되는데 복제시 태아사망의 원인을 찾기 위해 본 연구를 시행하였다. 한우에서 체세포 복제 후 임신 말기에 태아가 사망한 태반조직 3개와 IVF 수정란 이식 후 동일한 시기에 제왕절개술을 실시한 태반조직 2개를 실험에 이용하였다. 태반 protein을 Two-Dimensional electrophoresis와 Mass spectrometer를 이용하여 분석 비교하였다. IPG-system을 이용하여 pH 4~7, pH 6~9에서 1차 전기영동을 한 후, 8~l6%의 SDS-PAGE gel에 2차 전기영동을 실시하였고 G-250 Coomassie로 염색하였다. gel 이미지는 Malanie III program을 이용하여 분석하였다. 전체 gel에서 약 1800개의 구분 가능한 protein spot이 나타났다. pH 4~7 범위에서 양적으로 차이나는 것 15개 중 복제한우 태반에서 증가되는 protein spot 5개와 감소하는 protein spot 10개를 골라 protein identification을 실시하였다. MALDI-TOF-MS를 이용하여 동정한 결과 phosphatidylinositol transfer protein-$\alpha$와 interleukin-18 등의 protein이 복제태반에서 발현이 증가되었고, 복제한우에서 발현이 감소되는 것으로는 vimentin, Rho-GDI-$\beta$, TRAST $\beta$-chain, ovarian sterol carrier protein 2, triosephosphate isomerase, tropemyosin beta chain, Aldose reductase 등으로 나타났다. 이러한 protein들은 inositol 지질 신호전달과 면역시스템, 세포분열, 산소 운반, steroidogenic 세포에서의 콜레스테롤 이동, 촉매 작용, 대사 작용 등에 중요한 역할을 하는 것으로 알려져 체세포 복제에 의한 태아사망 원인은 태반에서 이러한 protein들의 비정상적인 발현에 기인된 것으로 추정된다.

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쓴송이버섯으로부터 분리한 혈전용해 금속효소의 특성 연구 (Characterization of a Fibrinolytic Metalloenzyme from a Wild Mushroom, Tricholoma sejunctum)

  • 김준호;조승구
    • 한국균학회지
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    • 제32권2호
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    • pp.119-124
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    • 2004
  • 쓴송이버섯으로부터 분리한 혈전용해효소(TSFE)의 활성은 11.42 U/mg이었으며, N-terminal amino acid 서열은 Ala-Thr-Tyr-Lys-Ile-X-Ser-Ala-Thr-His-Gln-X-X-Leu-Val로 지금까지 발표되지 않은 새로운 효소였다. MALDI-TOF와 ICP/MS로 분자량은 18788.25 Da이며, $Zn^{2+}$을 함유하는 금속효소임을 알게 되었다. 이 효소는 $40^{\circ}C$까지 열에 안정하고, 특히 합성된 기질 Lys pNA를 강하게 분해하였다. $Zn^{2+}$$Co^{2+}$에 의해 활성이 증가되고, EDTA, 1,10-phenanthroline, $Hg^{2+}$에 의해서는 활성이 완전히 소멸되었다. 이 효소는 섬유소원의 $A{\alpha}$ chain은 분해하지만, $B{\beta}$ chain과 ${\gamma}$ chain은 분해하지 못했다.

Characteristics of Wood Tar Produced as Byproduct from Two Types of The Kiln in The Manufacture of Oak Charcoal

  • Yang, Bong Suk;Yang, Jiwook;Kim, Dae-Young;Kim, Jin-Kyu;Hwang, Won-Jung;Kwon, Gu-Joong
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제45권6호
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    • pp.772-786
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    • 2017
  • This study investigated the characteristics of wood tar, produced as a byproduct during the production of charcoal using oak wood by the modified traditional kiln and mechanical steel kiln. The wood tar was analyzed with a number of techniques, including Py-GC/MS, NMR, MALDI-TOF, FT-IR, TG and DSC. The Py-GC/MS analysis indicated that modified traditional kiln generated a higher hydrocarbon ratio in the wood tar than that of mechanical steel kiln. On the other hand, mechanical steel kiln resulted in a higher proportion of phenolic and aromatic hydrocarbon components than that of modified traditional kiln. Those results were also confirmed by NMR analysis. The MALDI-TOF analysis suggested that the wood tar produced in the mechanical steel kiln had a slightly higher molecular weight than the wood tar produced in the modified traditional kiln. In addition, the FT-IR analysis showed characteristic peak of symmetrical stretching vibration of $CH_3$ from the modified traditional kiln while characteristic peaks of the C-C and C-O stretching vibration were observed from the mechanical steel kiln. Moreover, TG and DSC analysis suggested that the mechanical steel kiln is more thermally stable than that of modified traditional kiln. Those findings clearly showed that the method of making charcoal greatly affects the properties of wood tar.

효소적 당전이 반응을 이용한 Alkyl β-Glucoside의 생산 (Enzymatic Production of Alkyl β-Glucoside Based on Transglycosylation Activity of Celluclast)

  • 용환웅;김선미;심재훈
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제41권10호
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    • pp.1417-1422
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    • 2012
  • Alkyl-glucoside의 생산을 위하여 상용화 cellulase인 Celluclast의 당전이 반응을 사용하였다. 5가지 종류의 알코올을 acceptor molecule로 하여 반응을 살펴본 결과 methyl alcohol, ethyl alcohol, isopropanol 그리고 butanol에서 당전이 반응이 일어남을 확인하였다. 반응 수율이 높았던, methyl alcohol과 ethyl alcohol의 반응산물을 MALDI-TOF MS와 효소적인 방법을 사용하여 각각의 산물이 methyl ${\beta}$-D-glucopyranoside와 ethyl ${\beta}$-D-glucopyranoside임을 확인하였다. 시간대별 methyl-glucoside와 ethyl-glucoside의 생산량을 비교하여 본 결과 9시간에서 최대 생산 수율 65% (mol/mol)와 59%(mol/mol)를 각각 보였으며, 이후 반응은 진행되지 않았다. Cellulose의 당전이 반응으로 생성된 부산물인 glucose를 제거하기 위하여 고정화 효모 system을 도입하였고, 그 결과 glucose를 모두 제거할 수 있었다. 이상의 결과에서 Celluclast를 이용한 alkyl-glucoside의 생산을 성공적으로 수행하였고, 고정화 효모 system을 도입하여 친환경적으로 부산물을 제거하여 고순도의 ethyl-glucoside를 생산하였다.