This study examined the association between functional sequence variants (FSVs) of myosin heavy chain 3 (MYH3) genotypes and collagen content in a Landrace and Jeju native pig (JNP) crossbred population. Four muscles (Musculus longissimus dorsi, Musculus semimembranosus, Musculus triceps brachii, and Musculus biceps femoris) were used for the analysis of meat collagen content, and the same animals were genotyped for the FSVs of the MYH3 gene by using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). Three FSVs of MYH3 genotypes were identified and had genotype frequencies of 0.358, 0.551, and 0.091 for QQ, Qq, and qq, respectively. QQ animals for the FSVs of the MYH3 genotypes showed higher collagen content in their M. longissimus dorsi (p < 0.001), M. semimembranosus (p < 0.001), M. triceps brachii (p < 0.001), and M. biceps femoris (p < 0.001) than qq homozygous animals. After the validation of this result in other independent populations, the FSVs of MYH3 genotypes can be a valuable genetic marker for improving collagen content in porcine muscles and can also be applied to increase the amount of collagen for biomedical purposes.
We conducted a series of investigations in order to elucidate role of nutritional status in regulating GLUT expression and energy metabolism in porcine muscle. Firstly, the role of mild undernutrition in regulating muscle GLUT gene expression and function was studied in growing pigs (3 wk of age) on a high (H) or low (L) food intake (H = 2L) at $35^{\circ}C$ or $26^{\circ}C$. Low food intake selectively upregulates GLUT1 and GLUT4 gene expression; mRNA levels were elevated in longissimus dorsi (L. dorsi) and rhomboideus muscles but not in diaphragm or cardiac muscles. Our next step was to determine whether dietary lysine, a major primary limiting amino acid in diets for pigs, affects muscle GLUT4 expression. Pigs of 6 wk of age were pair-fed a control or low lysine (LL) diet. The control diet contained optimal amounts of all essential amino acids, including 1.15% lysine. The LL diet was similar but contained only 0.70% lysine. GLUT4 mRNA expression was upregulated by the LL diet in L. dorsi and rhomboideus muscles, whereas that in cardiac muscle was unaffected. GLUT4 protein abundance was also higher in rhomboideus muscle of animals on the LL diet. We conducted another investigation in order to elucidate effects of the LL diet on post-GLUT4 glucose metabolism. Activity of hexokinase was unaffected by dietary lysine levels while that of citrate synthase was higher both in L. dorsi and rhomboideus muscles of pigs fed on the LL diet. Glucose 6-phosphate content was higher in L. dorsi msucle in the LL group. Glycogen content was higher both in L. dorsi and rhomboideus muscles in the LL group. Further, we determined the effects of dietary lysine levels on accumulation of intramuscular fat (IMF) in L. dorsi muscle of finishing pigs. A low lysine diet (lysine content was 0.40%) meeting approximately 70% of the requirement of lysine was given to finishing pigs for two months. IMF contents in L. dorsi of the pigs given the low lysine diet were twice higher than those of the pigs fed on a control diet (lysine content was 0.65%). Finally, we proved that a well known effect of breadcrumbs feeding to enhance IMF of finishing pigs could be attributed to shortage of amino acids in diets including breadcrumbs.
This study evaluated the effects of preslaughter feed withdrawal and chiller ageing on objective meat quality traits in longissimus dorsi (LD), biceps femoris(BF), and triceps brachii(TB) muscles of Korean native black pigs. Twenty males were assigned into a 2(pre-slaughter feeding) ${\times}$ 2(pre-slaughter stress) ${\times}$ 4(chiller ageing) factorial. Pre-slaughter fasting for 18 h resulted in significantly(P < 0.05) higher pHs at 1.5 h for both LD and BF. On the other hand, muscle temperature did not differ between the fasted and fed animals. The result implied that pigs with different pre-slaughter feedings experienced different pH-temperature profiles during rigor development. This was reflected by the significan(P < 0.05) increase in cooking loss and hunter $L^*$ for LD of the fed pigs. However, WB-shear force of LD was not affected by the treatment. Furthermore, objective meat quality of BF and TB did not differ between the treatments. Hunter $L^*$ value and cooking loss for LD were constant for 7 d, followed by a significant(P < 0.05) increase at 14 d. BF and TB had significantly(P < 0.05) higher hunter $L^*$ value and cooking loss at 14 d than at 1 d. Significant(P < 0.05) linear reductions in LD WB-shear force took place from 1 to 7 d, while BF and TB WB-shear forces were significantly (P < 0.05) reduced at 14 d. Simple correlation for WB-shear force between LD and BF, and between LD and TB indicated that 6 kg of shear force for LD was equivalent to approximately 3.5 and 6 kg for TB and BF, respectively. On the basis of the current result, feeding until the morning of slaughter appeared to contribute to favourable meat color for LD. However, negative effect on palatability due to increase in cooking loss should be taken into account. A 7-d chiller ageing was likely the best practice for LD, while TB appeared not to require chiller ageing. A 14-d ageing could improve the tenderness of BF, but could likely reduce juiciness.
This study investigated the carcass characteristics and conjugated linoleic acid (CLA) content in Hanwoo steers that received supplementary rice bran (Rice bran group) and roasted soybeans (Roasted soybean group) into their finishing concentrates. The final body weight was 754.58, 783.33, and 755.67 kg, and the average daily gain was 0.50, 0.57, and 0.50 kg for the Control, Rice bran, and Roasted soybean group, respectively, showing no statistical differences. Feed requirements for the Rice bran group were 14.5% higher than the Control and 12.8% higher than the Roasted soybean group. No statistical differences were found in indices for carcass yield and quality grade between the groups. The composition of c9, t11 CLA in perirenal fats was significantly higher in the Roasted soybean group (0.21%) compared to the Rice bran group (0.15%) and Control (0.16%) groups (p<0.05). The composition of c9, t11 CLA in the M. Longissimus dorsi was also higher in the Roasted soybean group (0.21%) compared to the Control (0.16%) group. The composition of t10, c12 CLA in the M. Longissimus dorsi was statistically lower in the Roasted soybean group compared to the Control group (p<0.05). In perirenal fats, the composition of t11 trans-vaccenic acid (TVA) was significantly (p<0.05) higher in the Roasted soybean group compared to the control group. The TVA composition in the Roasted soybean group increased to 15.09 and 6.92%, respectively, in subcutaneous and M. Longissimus dorsi fats comparing to the Control group, without statistical differences between the treatment groups. In conclusion, rice bran is beneficial for improving feed efficiencies, while roasted soybeans are effective for increasing CLA in the M. Longissimus dorsi of Hanwoo steers.
Twelve intact and 12 docked Najdi lambs of equal numbers of males and females were utilized in the experiment. All lambs were raised under similar conditions until they attained 40 kg shorn and shrunk body weight. Thereafter, lambs were individually fed ad libitum on a diet formulated to contain 11.20 MJ ME/kg and slaughtered after 60 days feeding period. The results showed that Najdi rams averaged 6.14 kg more total gain (p < .05), required 6.80 kg less feed (p < .05) per kg of gain and produced 3.2 and 3.07 kg more (p < .05) carcass and salable cuts weights over the feeding period than comparable ewes. Body wall thickness and kidney and pelvic fat weight were greater (p < .05) for ewes than for rams; dressing percent, longissimus area and fat thickness were not significantly influenced by sex of lambs. Docked lambs kept for 60 days on feed required 1.80 kg less feed (p < .05) per kg of gain and produced 2.21 kg more (p < .05) salable wholesale cuts weight than intact lambs. Docking was not a significant source of variation for total gain, carcass weight, dressing percent, longissimus dorsi area, body wall thickness and fat thickness.
The distribution of water soluble free amino acids in various parts of sheep muscles were observed. amino acids of cystine, histidine, aspartic acid, arginine, hydroxy proline, threonine, glutamic acid alanine, proline, methionine, tryptophan, leucine, iso-leucine, glycine, creatine, and two or four different kinds of amino acid content in each tissues, M. longissimus. Overall, the distribution of content of amino acids are seemed to be different for each tissues, while for hydroxyproline the result was negative.
Interaction between carcass quality grade and end-point cooking temperature on eating quality of Hanwoo m. longissimus was investigated. Ten (10) of steers were sampled from a commercial population; carcasses with QG 1++ (n=5) and QG 1 (n=5) were chosen. Samples were cooked by electric oven at 60 or 82℃ and compared with uncooked control samples. The pH was not affected by cooking temperature but decreased the redness after cooking and steaks cooked at 60℃ were more reddish than steaks cooked at 82℃ in both QG groups. Higher cooking temperature greatly (p<0.05) increased the cooking loss, but there was no significant interaction between cooking temperature and QG on the cooking loss. Moisture is negatively correlated with temperature in both QG while the proportionate relationship between crude fat and end-point temperature found in QG 1++. WBSF values were significantly (p<0.05) high for QG 1, while that was significantly (p<0.05) increased when the temperature continues to increase. The increasing quality grade of beef resulted in significant higher (p<0.01) level of TBARS and cooking temperature increased TBARS content. Fatty acid composition was not altered by cooking at both temperatures and also the amount of fat intake was not changed. The current study indicates that eating quality of beef m. longissimus was greatly influenced by end-point temperature being interacted with QG. However, the amount and composition of fat were stable regardless of end-point temperatures. These results will provide a consumer reference to determine cooking conditions and intramuscular fat content.
Communications for Statistical Applications and Methods
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v.15
no.2
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pp.265-271
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2008
It is commonly believed that diseases of human or economic traits of livestock are caused not by single genes acting alone, but multiple genes interacting with one another. This issue is difficult due to the limitations of parametric-statistic methods of gene effects. So we introduce multifactor-dimensionality reduction(MDR) as a methods for reducing the dimensionality of multilocus information. The MDR method is nonparametric (i. e., no hypothesis about the value of a statistical parameter is made), model free (i. e., it assumes no particular inheritance model) and is directly applicable to case-control studies. Application of the MDR method revealed the best model with an interaction effect between the SNPs, SNP1 and SNP3, while only one main effect of SNP1 was statistically significant for LMA (p < 0.01) under a general linear mixed model.
Seo, Kang Seok;Shen, Y.N.;Salces, A.J.;Yoon, D.H.;Lee, H.G.;Kim, S.H.
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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v.19
no.10
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pp.1404-1408
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2006
In order to investigate the genetic marker associated with economic performance in Hanwoo (Korean Brown Cattle), proteomic approach was used. Breeding values were estimated from performance tested steers. The top 20 and bottom 19 steers based on carcass weight (CW), eye muscle area (EMA), backfat thickness (BF) and marbling score (MS) evaluation for one progeny testing period was used. Meat samples dissected from longissimus dorsi muscles were taken from the slaughter house and analyzed for two-dimensional gel electrophoresis. A total of 102 significant spots out of total 146 on each gel were detected and compared with the reference gel (synthetic gel) to be evaluated. Four candidate spots for marbling score were identified: 205, 84, 204 and 198. The study confirmed the relationship between breeding values of economic traits of Hanwoo cattle and spot intensity.
Objective: In recent years, long noncoding RNAs (lncRNAs) have been identified in many species, and some of them have been shown to play important roles in muscle development and myogenesis. However, the differences in lncRNAs between Kazakh cattle and Xinjiang brown cattle remain undefined; therefore, we aimed to confirm whether lncRNAs are differentially expressed in the longissimus dorsi between these two types of cattle and whether differentially expressed lncRNAs regulate muscle differentiation. Methods: We used RNA-seq technology to identify lncRNAs in longissimus muscles from these cattle. The expression of lncRNAs were analyzed using StringTie (1.3.1) in terms of the fragments per kilobase of transcript per million mapped reads values of the encoding genes. The differential expression of the transcripts in the two samples were analyzed using the DESeq R software package. The resulting false discovery rate was controlled by the Benjamini and Hochberg's approach. KOBAS software was utilized to measure the expression of different genes in Kyoto encyclopedia of genes and genomes pathways. We randomly selected eight lncRNA genes and validated them by quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR). Results: We found that 182 lncRNA transcripts, including 102 upregulated and 80 downregulated transcripts, were differentially expressed between Kazakh cattle and Xinjiang brown cattle. The results of RT-qPCR were consistent with the sequencing results. Enrichment analysis and functional annotation of the target genes revealed that the differentially expressed lncRNAs were associated with the mitogen-activated protein kinase, Ras, and phosphatidylinositol 3-kinase (PI3k)/Akt signaling pathways. We also constructed a lncRNA/mRNA coexpression network for the PI3k/Akt signaling pathway. Conclusion: Our study provides insights into cattle muscle-associated lncRNAs and will contribute to a more thorough understanding of the molecular mechanism underlying muscle growth and development in cattle.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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