Essential hypertension is considered to be caused by a complicated combination of genetic and environmental factors. Alterations of lipid metabolism in plasma have been reported to be related to an increased risk of essential hypertension. The purpose of this study was to investigate the relationship between two genetic polymorphisms (Pvu II and Hind III RELPs) of the human lipoprotein lipase (LPL) gene and essential hypertension in korean population. In our result the Pvu II RFLP of LPL gene was significantly associated with essential hypertension (P < 0.05). Therefore, we suggest that the Pvu II RFLP of LPL gene may be useful as a genetic marker for essential hypertension in Korean population.
Polymorphism of the lipoprotein lipase (LPL) gene which plays an important role in regulation of lipid deposition was analysed in two red seabream (pagrus major) populations (KF4, cultured KORDI line, n=100 : JPN, imported from Japan, n=100). We amplified a DNA fragment (1,091 bp) including the exon 2 region of the LPL gene, and conducted PCR-RFLP analysis using MspI and AluI. The PCR products were also sequenced. Two alleles (A and B) were found in MspI digestion and Sve alleles (A, B, C, D and E) in AluI digestion. The sequenced data revealed four nucleotide substitutions including one transversion at the MspI recognition site (nt 2,235, $C{\rightarrow}10$) and three transitions at the AluI recognition sites (nt 1,721, $A{\rightarrow}G;$ nt 2,319, $C{\rightarrow}T;$ nt 2,319, $T{\rightarrow}C$). Among them, substitutions at the nt 2,235 and 2,319 sites which are located in the exon 2 were proved to be silent point mutations. MspI polymorphism resulted in 3 genotypes, and the allele frequency was significantly different between the two fish populations, KF4 and JPN. In the case of AluI polymorphism, the 5 alleles (A, B, C, D, E) comprised 12 genotypes of the 5 alleles. KF4 population, alleles D and I were specific to the LPL gene Polymorphisms would be useful DNA markers for red seabream population.
High-density lipoprotein (HDL) cholesterol levels are associated with decreased risk of coronary artery disease. Several genome-wide association studies (GWAS) for HDL cholesterol levels have implicated Lipoprotein lipase (LPL) as possibly being causal. Herein, the association between single nucleotide polymorphism (SNP) rs10503669 in the LPL gene and HDL cholesterol levels and triglyceride levels was tested in the Korean population. A total of 994 subjects from Seoul City were included in a replication study with LPL SNP rs10503669. SNP rs10503669 in the LPL gene was associated with mean HDL cholesterol levels (effect per allele 3.13 mg/dL, P<0.0001) and triglyceride levels (effect per allele -18.0 mg/dL, P=0.0026). Subjects with the CA/AA genotype had a 0.42-fold (range 0.23~0.77-fold) lower risk of having abnormal HDL cholesterol levels (<40 mg/dL) than subjects with the CC genotype. When analyzed by gender, the association of LPL was stronger in men than in women. This study clearly demonstrates that genetic variants in LPL influence HDL cholesterol levels and triglyceride levels in Korean adults.
The study was aimed at detecting polymorphism of the fifth intron in lipoprotein lipase (LPL) gene and analyzing association between the polymorphism and productive traits. A pair of primers was designed for amplifying the fifth intron. Sequence analysis indicated that a G1171C substitution existed in Large White breed. The mutation was detected by PCR-AfaI-RFLP. Polymorphism analysis in a pig resource family showed that there existed significant effects on carcass and meat quality traits. Thoraxwaist fat thickness of BB genotype was significantly higher (14.2%, p<0.05) than that of AA on carcass traits, while BB genotype was significantly lower (3.6% p<0.01, 4.1% p<0.01; 2.3% p<0.01, 1.9% p<0.01; 1.8% p<0.01, 1.4% p<0.05) than AA and AB genotype in pH of m. Longissimus Dorsi (LD), m. Biceps Femoris (BF), m. Semipinali Capitis (SC). The allelic frequencies were also significantly different between indigenous Chinese breeds and exotic breeds. Data analyzed revealed that the mutation locus affected production traits mostly by additive effects. Based on these results, it is necessary to do more studies on LPL gene before making the LPL locus into the application of marker-assisted selection (MAS) programs.
Journal of the Korean Data and Information Science Society
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v.24
no.6
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pp.1331-1339
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2013
The lipoprotein lipase (LPL) gene can be considered a functional candidate gene that regulates fatty acid composition. Oh etc (2013) investigated the relationship between unsaturated fatty acids and five novel SNPs, and had confirmed that three polymorphic SNPs (c.322G>A, c.329A>T and c.1591G>A) were associated with fatty acid composition. We have used generalized linear model for adjusted environmental effects and multifactor dimensionality reduction (MDR) method to identify gene-gene interaction effect of statistical model in general. We applied the MDR method on the identify major interaction effects of exonic single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the LPL gene for economic traits in Korean cattles population.
Lipoprotein lipase (LPL) plays an essential role in the regulation of high-density lipoprotein cholesterol (HDLC) and triglyceride levels, which have been closely associated with cardiovascular diseases. Genetic studies in European have shown that LPL single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are strongly associated with lipid levels. However, studies about the influence of interactions between LPL SNPs and lifestyle factors have not been sufficiently performed. Here, we examine if LPL polymorphisms, as well as their interaction with lifestyle factors, influence lipid concentrations in a Korean population. A two-stage association study was performed using genotype data for SNPs on the LPL gene, including the 3' flanking region from 7,536 (stage 1) and 3,703 (stage 2) individuals. The association study showed that 15 SNPs and 4 haplotypes were strongly associated with HDLC (lowest $p=2.86{\times}10^{-22}$) and triglyceride levels (lowest $p=3.0{\times}10^{-15}$). Interactions between LPL polymorphisms and lifestyle factors (lowest $p=9.6{\times}10^{-4}$) were also observed on lipid concentrations. These findings suggest that there are interaction effects of LPL polymorphisms with lifestyle variables, including energy intake, fat intake, smoking, and alcohol consumption, as well as effects of LPL polymorphisms themselves, on lipid concentrations in a Korean population.
Although elevated serum low-density lipoprotein-cholesterol (LDL-C) is without any doubts accepted as an important risk factor for cardiovascular disease (CVD), the role of elevated triglycerides (TGs)-rich lipoproteins as an independent risk factor has until recently been quite controversial. Recent data strongly suggest that elevated TG-rich lipoproteins are an independent risk factor for CVD and that therapeutic targeting of them could possibly provide further benefit in reducing CVD morbidity, events and mortality, apart from LDL-C lowering. Today elevated TGs are treated with lifestyle interventions, and with fibrates which could be combined with omega-3 fatty acids. There are also some new drugs. Volanesorsen, is an antisense oligonucleotid that inhibits the production of the Apo C-III which is crucial in regulating TGs metabolism because it inhibits lipoprotein lipase (LPL) and hepatic lipase activity but also hepatic uptake of TGs-rich particles. Evinacumab is a monoclonal antibody against angiopoietin-like protein 3 (ANGPTL3) and it seems that it can substantially lower elevated TGs levels because ANGPTL3 also regulates TGs metabolism. Pemafibrate is a selective peroxisome proliferator-activated receptor alpha modulator which also decreases TGs, and improves other lipid parameters. It seems that it also has some other possible antiatherogenic effects. Alipogene tiparvovec is a nonreplicating adeno-associated viral vector that delivers copies of the LPL gene to muscle tissue which accelerates the clearance of TG-rich lipoproteins thus decreasing extremely high TGs levels. Pradigastat is a novel diacylglycerol acyltransferase 1 inhibitor which substantially reduces extremely high TGs levels and appears to be promising in treatment of the rare familial chylomicronemia syndrome.
Peroxisome proliferator-activated receptor $\alpha$ (PPAR$\alpha$)에 대한 본격적인 연구는 고지혈증 치료제인 fibrate류의 약물들이 PPAR$\alpha$ activator로 작용한다는 사실이 밝혀짐으로써 크게 증대되었다. PPAR$\alpha$는 fibrate를 포함한 다양한 종류의 peroxisome proiferator (PP)에 의해 활성화되는데 이들을 쥐에 단기간 투여할 경우 간의 peroxisome수와 지 방산 산화효소의 유전자발현이 증가되고 장기간 투여 할 경우 간암을 발생시키지만, fibrate류의 약물들을 고지혈증 환자에게 투여 할 경우 간암을 발생시키지 않으므로써 PP에 대한 반응성에 있어서 species difference를 나타낸다 PPAR$\alpha$는 핵에 존재하는 orphan receptor로서 PP에 의해 활성화되어 9-cis-retinoic acid receptor(RXR)와 heterodimer를 이룬 후 target gene들의 upstream에 있는 peroxisome proliferator response element (PPRE)에 결합하여 target gene들의 발현을 조절한다. 지금까지 연구된 PPAR$\alpha$의 target gene들은 모두 lipid와 lipoprotein 대사를 조절하는 것으로 알려져 있으며, 이러 한 결과들을 기초로 lipid 대사 및 energy balance와 관련된 질병들 - 동맥경화증, 관상동맥질환, 비만, 제 2형 당뇨병 등에서 PPAR$\alpha$의 역할이 집중적으로 연구되고 있다. PPAR$\alpha$가 활성화되면 lipoprotein lipase와 HDL이 증가되고 apo C-III가 감소됨으로써 동맥경화증에 대한 예방적 기능을 나타내고, 몸무게를 감소시킴으로써 비만을 방지할 수 있으며, 인슐린 감수성을 증가시켜 제 2형 당뇨병의 치료효과를 가지는 것으로 보인다. 그러나 PPAR$\alpha$-null mouse에서는 이러한 효과들이 나타나지 않는 것으로 보아 이들 질병에서 PPAR$\alpha$가 중요한 역할을 하는 것으로 생각된다.
The objective of the current study was to investigate the effects of dietary ${\omega}-6/{\omega}-3$ polyunsaturated fatty acid (PUFA) ratios on lipid metabolism in goslings. One hundred and sixty 21-day-old Yangzhou geese of similar weight were randomly divided into 4 groups. They were fed different PUFA-supplemented diets (the 4 diets had ${\omega}-6/{\omega}-3$ PUFA ratios of 12:1, 9:1, 6:1, or 3:1). The geese were slaughtered and samples of liver and muscle were collected at day 70. The activities and the gene expression of enzymes involved in lipid metabolism were measured. The results show that the activities of acetyl coenzyme A carboxylase (ACC), malic enzyme (ME), and fatty acid synthase (FAS) were lower (p<0.05), but the activities of hepatic lipase (HL) and lipoprotein lipase (LPL) were higher (p<0.05), in the liver and the muscle from the 3:1 and 6:1 groups compared with those in the 9:1 and 12:1 groups. Expression of the genes for FAS (p<0.01), ME (p<0.01) and ACC (p<0.05) were higher in the muscle of groups fed diets with higher ${\omega}-6/{\omega}-3$ PUFA ratios. Additionally, in situ hybridization tests showed that the expression intensities of the high density lipoprotein (HDL-R) gene in the 12:1 and 9:1 groups were significantly lower (p<0.01) than that of the 3:1 group in the muscle of goslings. In conclusion, diets containing lower ${\omega}-6/{\omega}-3$ PUFA ratios (3:1 or 6:1) could decrease fat deposition by inhibiting fat synthesis in goslings.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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